MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 plasmid pST75

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016942	TTC	3	9	34	42	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016942	ATA	2	6	91	96	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016942	ATA	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016942	ATG	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
5	NC_016942	GAT	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
6	NC_016942	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793807
7	NC_016942	TAA	2	6	503	508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
8	NC_016942	TAA	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
9	NC_016942	TAA	2	6	655	660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
10	NC_016942	TTC	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793807
11	NC_016942	TTG	2	6	728	733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793807
12	NC_016942	ATG	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
13	NC_016942	TAG	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
14	NC_016942	AAT	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
15	NC_016942	TAT	2	6	892	897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016942	GAA	2	6	1131	1136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016942	CAA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016942	ATC	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016942	TTG	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016942	TAA	2	6	1319	1324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016942	AAG	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016942	TGT	2	6	1463	1468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016942	TGG	2	6	1646	1651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016942	TGA	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016942	GAA	2	6	1743	1748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016942	ATT	3	9	1795	1803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016942	TGA	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016942	TAT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016942	ATT	2	6	2388	2393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016942	GAC	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016942	GAA	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016942	CAT	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016942	GTT	2	6	2891	2896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016942	TAA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
35	NC_016942	AAT	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
36	NC_016942	ATG	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793808
37	NC_016942	TCT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793808
38	NC_016942	ATA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
39	NC_016942	TCT	2	6	3202	3207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793808
40	NC_016942	ATC	2	6	3251	3256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793808
41	NC_016942	AAT	3	9	3392	3400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
42	NC_016942	AAT	2	6	3422	3427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
43	NC_016942	CAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793809
44	NC_016942	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793809
45	NC_016942	ATC	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793809
46	NC_016942	ATA	2	6	3822	3827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
47	NC_016942	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
48	NC_016942	TAA	2	6	3908	3913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
49	NC_016942	CTG	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793809
50	NC_016942	CAG	3	9	3940	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793809
51	NC_016942	CAA	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793809
52	NC_016942	TAT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016942	AAT	2	6	4020	4025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016942	TTC	2	6	4155	4160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016942	TTA	2	6	4222	4227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016942	ATA	2	6	4716	4721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016942	CTT	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016942	TCA	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016942	CCA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016942	CGT	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016942	GAT	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016942	ATT	2	6	5013	5018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793811
63	NC_016942	TTC	2	6	5074	5079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793811
64	NC_016942	AAG	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793811
65	NC_016942	TAA	2	6	5311	5316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793811
66	NC_016942	ATC	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793811
67	NC_016942	ATT	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793811
68	NC_016942	TCT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793811
69	NC_016942	CGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793811
70	NC_016942	TCA	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793811
71	NC_016942	TAA	2	6	6028	6033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016942	ATT	2	6	6089	6094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016942	TTA	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016942	AGT	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016942	TAT	2	6	6202	6207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016942	ATC	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016942	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016942	TGA	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016942	GAA	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
80	NC_016942	TAA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
81	NC_016942	AGA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
82	NC_016942	TAC	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
83	NC_016942	ATA	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
84	NC_016942	TAG	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793812
85	NC_016942	AAT	2	6	6702	6707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
86	NC_016942	GTC	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793812
87	NC_016942	ACA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793812
88	NC_016942	TAA	2	6	6818	6823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
89	NC_016942	CTA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
90	NC_016942	TAC	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
91	NC_016942	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
92	NC_016942	CGA	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793812
93	NC_016942	GAA	2	6	7038	7043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
94	NC_016942	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
95	NC_016942	AGA	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
96	NC_016942	GAA	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
97	NC_016942	AAT	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016942	ATC	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016942	AGA	2	6	7264	7269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016942	CAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793813
101	NC_016942	AAT	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
102	NC_016942	TCA	2	6	7483	7488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
103	NC_016942	AGT	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793814
104	NC_016942	AAT	3	9	7677	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
105	NC_016942	TAA	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
106	NC_016942	TAA	2	6	7872	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
107	NC_016942	CTA	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
108	NC_016942	TCA	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
109	NC_016942	ATC	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016942	TTA	2	6	8056	8061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016942	TAA	2	6	8066	8071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016942	ATT	2	6	8072	8077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016942	ATT	2	6	8095	8100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016942	TAA	3	9	8132	8140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016942	GAA	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016942	AGG	2	6	8379	8384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016942	AGT	2	6	8426	8431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016942	ATA	2	6	8484	8489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016942	ATT	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016942	AAT	2	6	8522	8527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016942	ACC	2	6	8532	8537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016942	TCT	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793815
123	NC_016942	TTG	2	6	8829	8834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793815
124	NC_016942	TCA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793815
125	NC_016942	ATT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
126	NC_016942	TAG	2	6	8875	8880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793815
127	NC_016942	GTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793815
128	NC_016942	ACA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793815
129	NC_016942	CAA	2	6	9173	9178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793815
130	NC_016942	ATT	2	6	9239	9244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
131	NC_016942	TAA	2	6	9277	9282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
132	NC_016942	GTA	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793815
133	NC_016942	TAA	2	6	9355	9360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
134	NC_016942	AAG	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793815
135	NC_016942	GGT	2	6	9397	9402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379793815
136	NC_016942	ATA	2	6	9410	9415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
137	NC_016942	GCA	2	6	9421	9426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793815
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265	NC_016942	ATT	2	6	18278	18283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793823
266	NC_016942	AGA	2	6	18330	18335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793823
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269	NC_016942	ATA	2	6	18612	18617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793823
270	NC_016942	ATA	2	6	18644	18649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793823
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287	NC_016942	ATA	2	6	19955	19960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016942	ATC	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_016942	TAT	2	6	19986	19991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016942	TAT	2	6	20035	20040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_016942	AAT	2	6	20202	20207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_016942	AAC	2	6	24776	24781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
366	NC_016942	ACC	2	6	24816	24821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.