MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 93812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016940	TTGGC	2	10	133821	133830	0 %	40 %	40 %	20 %	379728285
3003	NC_016940	TGA	2	6	133897	133902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728285
3004	NC_016940	TGA	2	6	133927	133932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728285
3005	NC_016940	TGC	2	6	133942	133947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728285
3006	NC_016940	GGA	2	6	133952	133957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728285
3007	NC_016940	TTAT	2	8	134024	134031	25 %	75 %	0 %	0 %	379728285
3008	NC_016940	TTG	2	6	134043	134048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728285
3009	NC_016940	TGC	2	6	134065	134070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728285
3010	NC_016940	T	6	6	134129	134134	0 %	100 %	0 %	0 %	379728285
3011	NC_016940	CTT	2	6	134159	134164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728285
3012	NC_016940	GAG	2	6	134172	134177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728285
3013	NC_016940	TAGCCA	2	12	134201	134212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379728285
3014	NC_016940	TGC	2	6	134252	134257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728285
3015	NC_016940	CGG	3	9	134290	134298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728285
3016	NC_016940	T	6	6	134322	134327	0 %	100 %	0 %	0 %	379728285
3017	NC_016940	T	6	6	134539	134544	0 %	100 %	0 %	0 %	379728285
3018	NC_016940	T	6	6	134569	134574	0 %	100 %	0 %	0 %	379728285
3019	NC_016940	GGCG	2	8	134591	134598	0 %	0 %	75 %	25 %	379728285
3020	NC_016940	CT	3	6	134603	134608	0 %	50 %	0 %	50 %	379728285
3021	NC_016940	CTTT	2	8	134634	134641	0 %	75 %	0 %	25 %	379728285
3022	NC_016940	T	6	6	134670	134675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016940	GCC	2	6	134683	134688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_016940	GGC	2	6	134692	134697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728286
3025	NC_016940	GCTG	2	8	134744	134751	0 %	25 %	50 %	25 %	379728286
3026	NC_016940	TCGCT	2	10	134794	134803	0 %	40 %	20 %	40 %	379728286
3027	NC_016940	GCG	2	6	134809	134814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728286
3028	NC_016940	CGC	2	6	134819	134824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728286
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3030	NC_016940	ACA	2	6	134862	134867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_016940	TCTATA	2	12	134875	134886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3032	NC_016940	GTT	2	6	134927	134932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016940	TTC	2	6	134934	134939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016940	T	7	7	134955	134961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016940	A	6	6	135012	135017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016940	AACCAA	2	12	135130	135141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_016940	TC	4	8	135169	135176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_016940	CCCT	2	8	135177	135184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3039	NC_016940	GGC	2	6	135219	135224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_016940	GCC	2	6	135330	135335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728287
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3042	NC_016940	A	6	6	135354	135359	100 %	0 %	0 %	0 %	379728287
3043	NC_016940	CAA	2	6	135376	135381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728287
3044	NC_016940	CGA	2	6	135400	135405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728287
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3046	NC_016940	CGACC	2	10	135484	135493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3047	NC_016940	CCAGC	2	10	135624	135633	20 %	0 %	20 %	60 %	379728288
3048	NC_016940	T	6	6	135687	135692	0 %	100 %	0 %	0 %	379728288
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3050	NC_016940	AC	4	8	135719	135726	50 %	0 %	0 %	50 %	379728288
3051	NC_016940	GCG	2	6	135738	135743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728288
3052	NC_016940	ATG	2	6	135768	135773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728288
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3054	NC_016940	ATT	2	6	135807	135812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728288
3055	NC_016940	A	6	6	135879	135884	100 %	0 %	0 %	0 %	379728288
3056	NC_016940	ACA	2	6	135953	135958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728288
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3058	NC_016940	A	7	7	136022	136028	100 %	0 %	0 %	0 %	379728288
3059	NC_016940	AGG	2	6	136041	136046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728288
3060	NC_016940	A	7	7	136085	136091	100 %	0 %	0 %	0 %	379728288
3061	NC_016940	TGC	2	6	136144	136149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_016940	AGT	2	6	136222	136227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728289
3063	NC_016940	AAC	2	6	136281	136286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728289
3064	NC_016940	CGA	2	6	136303	136308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728289
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3066	NC_016940	CAT	2	6	136316	136321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728289
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3068	NC_016940	CTG	2	6	136458	136463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728289
3069	NC_016940	TTC	2	6	136464	136469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728289
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3071	NC_016940	A	6	6	136627	136632	100 %	0 %	0 %	0 %	379728289
3072	NC_016940	TA	3	6	136638	136643	50 %	50 %	0 %	0 %	379728289
3073	NC_016940	GTT	2	6	136691	136696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016940	AAG	2	6	136707	136712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016940	T	6	6	136732	136737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016940	ATA	2	6	136772	136777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_016940	T	6	6	136793	136798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016940	TGA	3	9	136848	136856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728290
3079	NC_016940	ATAG	2	8	136888	136895	50 %	25 %	25 %	0 %	379728290
3080	NC_016940	AAT	2	6	136930	136935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728290
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3083	NC_016940	A	7	7	137029	137035	100 %	0 %	0 %	0 %	379728290
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3085	NC_016940	A	7	7	137181	137187	100 %	0 %	0 %	0 %	379728290
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3089	NC_016940	ATA	2	6	137350	137355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728290
3090	NC_016940	GCT	2	6	137373	137378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728290
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3092	NC_016940	TCA	2	6	137490	137495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728290
3093	NC_016940	CTA	2	6	137591	137596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_016940	T	7	7	137597	137603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016940	GCT	2	6	137614	137619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_016940	CTG	2	6	137627	137632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_016940	CAA	2	6	137659	137664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_016940	T	7	7	137692	137698	0 %	100 %	0 %	0 %	379728291
3099	NC_016940	AGT	2	6	137701	137706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728291
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3101	NC_016940	TTTCC	2	10	137733	137742	0 %	60 %	0 %	40 %	379728291
3102	NC_016940	AGT	2	6	137782	137787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728291
3103	NC_016940	TCC	2	6	137814	137819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728291
3104	NC_016940	AGCT	2	8	137849	137856	25 %	25 %	25 %	25 %	379728291
3105	NC_016940	AGA	2	6	137864	137869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728291
3106	NC_016940	T	7	7	137888	137894	0 %	100 %	0 %	0 %	379728291
3107	NC_016940	CCT	2	6	137899	137904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728291
3108	NC_016940	TAT	2	6	137923	137928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728291
3109	NC_016940	TTC	2	6	137929	137934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728291
3110	NC_016940	AGAC	2	8	138008	138015	50 %	0 %	25 %	25 %	379728291
3111	NC_016940	CTA	2	6	138019	138024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728291
3112	NC_016940	AGAC	2	8	138062	138069	50 %	0 %	25 %	25 %	379728291
3113	NC_016940	GTT	2	6	138099	138104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728291
3114	NC_016940	TTC	2	6	138120	138125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728291
3115	NC_016940	AGCT	2	8	138136	138143	25 %	25 %	25 %	25 %	379728291
3116	NC_016940	CTT	2	6	138146	138151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728291
3117	NC_016940	CTA	2	6	138258	138263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728291
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3120	NC_016940	CAG	2	6	138375	138380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_016940	TGG	2	6	138432	138437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728292
3122	NC_016940	T	7	7	138452	138458	0 %	100 %	0 %	0 %	379728292
3123	NC_016940	GCC	2	6	138466	138471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728292
3124	NC_016940	GCG	2	6	138473	138478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728292
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3126	NC_016940	TCGCT	2	10	138577	138586	0 %	40 %	20 %	40 %	379728292
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3257	NC_016940	TGC	2	6	143426	143431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_016940	TGC	2	6	143566	143571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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