MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Saprospira grandis str. Lewin plasmid unnamed

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016936	TA	3	6	1437	1442	50 %	50 %	0 %	0 %	379732331
2	NC_016936	GC	3	6	3415	3420	0 %	0 %	50 %	50 %	379732333
3	NC_016936	CT	3	6	3533	3538	0 %	50 %	0 %	50 %	379732333
4	NC_016936	GC	3	6	6534	6539	0 %	0 %	50 %	50 %	379732336
5	NC_016936	AT	3	6	6987	6992	50 %	50 %	0 %	0 %	379732337
6	NC_016936	CT	3	6	8519	8524	0 %	50 %	0 %	50 %	379732337
7	NC_016936	CT	3	6	8714	8719	0 %	50 %	0 %	50 %	379732337
8	NC_016936	TC	3	6	9974	9979	0 %	50 %	0 %	50 %	379732337
9	NC_016936	TC	3	6	10398	10403	0 %	50 %	0 %	50 %	379732338
10	NC_016936	TC	3	6	10997	11002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016936	TC	3	6	11054	11059	0 %	50 %	0 %	50 %	379732339
12	NC_016936	CT	3	6	12138	12143	0 %	50 %	0 %	50 %	379732339
13	NC_016936	TC	3	6	13758	13763	0 %	50 %	0 %	50 %	379732342
14	NC_016936	GA	3	6	14025	14030	50 %	0 %	50 %	0 %	379732342
15	NC_016936	CT	3	6	14654	14659	0 %	50 %	0 %	50 %	379732342
16	NC_016936	AG	3	6	16525	16530	50 %	0 %	50 %	0 %	379732343
17	NC_016936	TG	3	6	17295	17300	0 %	50 %	50 %	0 %	379732346
18	NC_016936	AT	3	6	17742	17747	50 %	50 %	0 %	0 %	379732346
19	NC_016936	AT	3	6	20039	20044	50 %	50 %	0 %	0 %	379732348
20	NC_016936	AT	3	6	21415	21420	50 %	50 %	0 %	0 %	379732350
21	NC_016936	TA	4	8	22089	22096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016936	TC	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	379732351
23	NC_016936	TC	3	6	24769	24774	0 %	50 %	0 %	50 %	379732354
24	NC_016936	TC	3	6	25418	25423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016936	TA	3	6	26013	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016936	GC	4	8	26269	26276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016936	CG	4	8	26278	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016936	CT	3	6	28962	28967	0 %	50 %	0 %	50 %	379732357
29	NC_016936	AG	3	6	29901	29906	50 %	0 %	50 %	0 %	379732358
30	NC_016936	TA	3	6	30998	31003	50 %	50 %	0 %	0 %	379732360
31	NC_016936	AT	3	6	32180	32185	50 %	50 %	0 %	0 %	379732361
32	NC_016936	GC	3	6	32498	32503	0 %	0 %	50 %	50 %	379732361
33	NC_016936	TC	3	6	32912	32917	0 %	50 %	0 %	50 %	379732361
34	NC_016936	TA	3	6	33818	33823	50 %	50 %	0 %	0 %	379732362
35	NC_016936	TG	3	6	34171	34176	0 %	50 %	50 %	0 %	379732362
36	NC_016936	TA	3	6	35241	35246	50 %	50 %	0 %	0 %	379732363
37	NC_016936	AG	3	6	35273	35278	50 %	0 %	50 %	0 %	379732363
38	NC_016936	AG	3	6	35467	35472	50 %	0 %	50 %	0 %	379732363
39	NC_016936	AT	3	6	36307	36312	50 %	50 %	0 %	0 %	379732364
40	NC_016936	GC	3	6	36575	36580	0 %	0 %	50 %	50 %	379732365
41	NC_016936	AG	3	6	36656	36661	50 %	0 %	50 %	0 %	379732365
42	NC_016936	CT	3	6	39047	39052	0 %	50 %	0 %	50 %	379732369
43	NC_016936	AG	3	6	41585	41590	50 %	0 %	50 %	0 %	379732371
44	NC_016936	TG	3	6	45176	45181	0 %	50 %	50 %	0 %	379732374
45	NC_016936	AG	3	6	45493	45498	50 %	0 %	50 %	0 %	379732374
46	NC_016936	AG	3	6	45704	45709	50 %	0 %	50 %	0 %	379732375
47	NC_016936	TA	3	6	46963	46968	50 %	50 %	0 %	0 %	379732378
48	NC_016936	AT	3	6	47809	47814	50 %	50 %	0 %	0 %	379732379
49	NC_016936	TC	3	6	47872	47877	0 %	50 %	0 %	50 %	379732379
50	NC_016936	CT	3	6	48485	48490	0 %	50 %	0 %	50 %	379732380
51	NC_016936	GA	3	6	49821	49826	50 %	0 %	50 %	0 %	379732381
52	NC_016936	AG	3	6	51255	51260	50 %	0 %	50 %	0 %	379732383
53	NC_016936	CT	3	6	53839	53844	0 %	50 %	0 %	50 %	379732386
54	NC_016936	AT	3	6	54152	54157	50 %	50 %	0 %	0 %	379732386
55	NC_016936	CA	3	6	54750	54755	50 %	0 %	0 %	50 %	379732386

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.