MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Saprospira grandis str. Lewin plasmid unnamed

Total Repeats: 1143

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016936	CT	3	6	48485	48490	0 %	50 %	0 %	50 %	379732380
1002	NC_016936	TTATCT	2	12	48512	48523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379732380
1003	NC_016936	TGC	2	6	48586	48591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732380
1004	NC_016936	TGG	2	6	48614	48619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379732380
1005	NC_016936	CTG	2	6	48681	48686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732380
1006	NC_016936	AAC	2	6	48708	48713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732380
1007	NC_016936	GCC	2	6	48722	48727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732380
1008	NC_016936	A	6	6	48811	48816	100 %	0 %	0 %	0 %	379732380
1009	NC_016936	AGA	2	6	48856	48861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732380
1010	NC_016936	A	6	6	48980	48985	100 %	0 %	0 %	0 %	379732380
1011	NC_016936	CGA	3	9	49015	49023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732380
1012	NC_016936	ATATG	2	10	49027	49036	40 %	40 %	20 %	0 %	379732380
1013	NC_016936	TTA	2	6	49112	49117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732380
1014	NC_016936	CTG	2	6	49164	49169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732380
1015	NC_016936	GCT	2	6	49260	49265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016936	T	6	6	49299	49304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016936	T	6	6	49314	49319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016936	ACT	2	6	49331	49336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016936	TTAA	2	8	49356	49363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016936	TAAA	2	8	49389	49396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016936	T	7	7	49423	49429	0 %	100 %	0 %	0 %	379732381
1022	NC_016936	T	6	6	49438	49443	0 %	100 %	0 %	0 %	379732381
1023	NC_016936	TTTG	2	8	49455	49462	0 %	75 %	25 %	0 %	379732381
1024	NC_016936	GGT	2	6	49486	49491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379732381
1025	NC_016936	GCT	2	6	49519	49524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732381
1026	NC_016936	GGC	2	6	49593	49598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732381
1027	NC_016936	AGGC	2	8	49603	49610	25 %	0 %	50 %	25 %	379732381
1028	NC_016936	TGCG	2	8	49620	49627	0 %	25 %	50 %	25 %	379732381
1029	NC_016936	CTT	2	6	49635	49640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732381
1030	NC_016936	CGG	2	6	49674	49679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732381
1031	NC_016936	TCG	2	6	49721	49726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732381
1032	NC_016936	GCC	2	6	49735	49740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732381
1033	NC_016936	T	6	6	49765	49770	0 %	100 %	0 %	0 %	379732381
1034	NC_016936	GA	3	6	49821	49826	50 %	0 %	50 %	0 %	379732381
1035	NC_016936	GAT	2	6	49837	49842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732381
1036	NC_016936	TTC	2	6	49861	49866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732381
1037	NC_016936	AAT	2	6	49867	49872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732381
1038	NC_016936	CAGC	2	8	49879	49886	25 %	0 %	25 %	50 %	379732381
1039	NC_016936	T	6	6	49898	49903	0 %	100 %	0 %	0 %	379732381
1040	NC_016936	A	6	6	49927	49932	100 %	0 %	0 %	0 %	379732381
1041	NC_016936	TGC	2	6	50045	50050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732381
1042	NC_016936	TGC	2	6	50088	50093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732381
1043	NC_016936	ATT	2	6	50168	50173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732382
1044	NC_016936	TAT	2	6	50184	50189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732382
1045	NC_016936	AAT	2	6	50192	50197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732382
1046	NC_016936	T	7	7	50215	50221	0 %	100 %	0 %	0 %	379732382
1047	NC_016936	GCC	2	6	50251	50256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732382
1048	NC_016936	GCC	2	6	50295	50300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732382
1049	NC_016936	GGC	2	6	50304	50309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732382
1050	NC_016936	T	6	6	50377	50382	0 %	100 %	0 %	0 %	379732382
1051	NC_016936	AGC	2	6	50443	50448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732382
1052	NC_016936	TAAA	2	8	50495	50502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016936	GCC	2	6	50531	50536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_016936	ATC	2	6	50594	50599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016936	CAG	2	6	50657	50662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_016936	GCC	2	6	50682	50687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_016936	GGC	2	6	50691	50696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_016936	CCCG	2	8	50735	50742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1059	NC_016936	A	6	6	50768	50773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016936	CTT	2	6	50809	50814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732383
1061	NC_016936	CCAAAA	2	12	50841	50852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732383
1062	NC_016936	TCGA	2	8	50923	50930	25 %	25 %	25 %	25 %	379732383
1063	NC_016936	GCC	2	6	51009	51014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732383
1064	NC_016936	ATT	2	6	51083	51088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732383
1065	NC_016936	GAT	3	9	51169	51177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732383
1066	NC_016936	GGGC	2	8	51179	51186	0 %	0 %	75 %	25 %	379732383
1067	NC_016936	CAAC	2	8	51189	51196	50 %	0 %	0 %	50 %	379732383
1068	NC_016936	AAG	2	6	51251	51256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732383
1069	NC_016936	AG	3	6	51255	51260	50 %	0 %	50 %	0 %	379732383
1070	NC_016936	CAA	2	6	51355	51360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732383
1071	NC_016936	GAG	2	6	51481	51486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379732383
1072	NC_016936	CCTT	2	8	51519	51526	0 %	50 %	0 %	50 %	379732383
1073	NC_016936	TCC	2	6	51535	51540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379732383
1074	NC_016936	AGA	2	6	51555	51560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732383
1075	NC_016936	CGA	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732383
1076	NC_016936	AGC	2	6	51610	51615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732383
1077	NC_016936	A	7	7	51647	51653	100 %	0 %	0 %	0 %	379732383
1078	NC_016936	A	6	6	51682	51687	100 %	0 %	0 %	0 %	379732383
1079	NC_016936	CCT	2	6	51750	51755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379732383
1080	NC_016936	TGA	3	9	51759	51767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732383
1081	NC_016936	GGC	2	6	51785	51790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732383
1082	NC_016936	ATT	2	6	51806	51811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732383
1083	NC_016936	TTTG	2	8	51907	51914	0 %	75 %	25 %	0 %	379732384
1084	NC_016936	TTGA	2	8	51923	51930	25 %	50 %	25 %	0 %	379732384
1085	NC_016936	TGT	2	6	52062	52067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732384
1086	NC_016936	CTT	2	6	52168	52173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732384
1087	NC_016936	T	6	6	52247	52252	0 %	100 %	0 %	0 %	379732384
1088	NC_016936	TCA	2	6	52257	52262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732384
1089	NC_016936	CCA	2	6	52362	52367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732384
1090	NC_016936	T	6	6	52376	52381	0 %	100 %	0 %	0 %	379732384
1091	NC_016936	TGC	2	6	52531	52536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732384
1092	NC_016936	TCT	2	6	52617	52622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732384
1093	NC_016936	T	7	7	52676	52682	0 %	100 %	0 %	0 %	379732384
1094	NC_016936	ATA	2	6	52734	52739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732384
1095	NC_016936	T	6	6	52755	52760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016936	CGG	2	6	52812	52817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_016936	GGGC	2	8	52824	52831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_016936	ATC	2	6	52862	52867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_016936	T	6	6	52881	52886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016936	GAT	2	6	52902	52907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016936	GTTT	2	8	52989	52996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016936	CTT	2	6	53019	53024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732385
1103	NC_016936	T	6	6	53050	53055	0 %	100 %	0 %	0 %	379732385
1104	NC_016936	CCA	2	6	53139	53144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732385
1105	NC_016936	T	6	6	53153	53158	0 %	100 %	0 %	0 %	379732385
1106	NC_016936	TGC	2	6	53308	53313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732385
1107	NC_016936	TCT	2	6	53394	53399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732385
1108	NC_016936	T	7	7	53453	53459	0 %	100 %	0 %	0 %	379732385
1109	NC_016936	ATA	2	6	53511	53516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732385
1110	NC_016936	T	6	6	53532	53537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016936	CGG	2	6	53589	53594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732386
1112	NC_016936	GGGC	2	8	53601	53608	0 %	0 %	75 %	25 %	379732386
1113	NC_016936	ATC	2	6	53639	53644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732386
1114	NC_016936	T	6	6	53658	53663	0 %	100 %	0 %	0 %	379732386
1115	NC_016936	GAT	2	6	53679	53684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732386
1116	NC_016936	GTTT	2	8	53766	53773	0 %	75 %	25 %	0 %	379732386
1117	NC_016936	CTT	2	6	53796	53801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732386
1118	NC_016936	T	6	6	53827	53832	0 %	100 %	0 %	0 %	379732386
1119	NC_016936	CT	3	6	53839	53844	0 %	50 %	0 %	50 %	379732386
1120	NC_016936	CCA	2	6	53877	53882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732386
1121	NC_016936	GCCA	2	8	53941	53948	25 %	0 %	25 %	50 %	379732386
1122	NC_016936	TTG	3	9	54007	54015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732386
1123	NC_016936	AT	3	6	54152	54157	50 %	50 %	0 %	0 %	379732386
1124	NC_016936	CTT	2	6	54165	54170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732386
1125	NC_016936	GCA	2	6	54180	54185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732386
1126	NC_016936	CAA	2	6	54215	54220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732386
1127	NC_016936	GGTT	2	8	54222	54229	0 %	50 %	50 %	0 %	379732386
1128	NC_016936	ATG	2	6	54242	54247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732386
1129	NC_016936	AGT	2	6	54297	54302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732386
1130	NC_016936	ATC	2	6	54569	54574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732386
1131	NC_016936	ACT	2	6	54583	54588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732386
1132	NC_016936	TCA	2	6	54596	54601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732386
1133	NC_016936	AAC	2	6	54604	54609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732386
1134	NC_016936	CCA	2	6	54639	54644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732386
1135	NC_016936	T	7	7	54645	54651	0 %	100 %	0 %	0 %	379732386
1136	NC_016936	T	6	6	54661	54666	0 %	100 %	0 %	0 %	379732386
1137	NC_016936	ATC	2	6	54686	54691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732386
1138	NC_016936	TGT	2	6	54696	54701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732386
1139	NC_016936	CAT	2	6	54703	54708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732386
1140	NC_016936	CA	3	6	54750	54755	50 %	0 %	0 %	50 %	379732386
1141	NC_016936	CCA	2	6	54828	54833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732386
1142	NC_016936	TTC	2	6	54910	54915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732386
1143	NC_016936	CTT	2	6	54933	54938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732386

< Previous 1 23Next >