MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 1526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	GTTGAA	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
2	NC_016928	ATAAAT	2	12	3318	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016928	TTTAAA	2	12	4238	4249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016928	TGGCGG	2	12	6138	6149	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379019818
5	NC_016928	GTTATC	2	12	8066	8077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019819
6	NC_016928	CAGATA	2	12	8975	8986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019819
7	NC_016928	CAAGCT	2	12	9034	9045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019819
8	NC_016928	GTAATG	2	12	10022	10033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
9	NC_016928	AGATGA	2	12	10416	10427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019819
10	NC_016928	ACAATT	2	12	12019	12030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379019821
11	NC_016928	TTAGCA	2	12	12113	12124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379019821
12	NC_016928	TAAATC	2	12	17927	17938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016928	GCTTTA	2	12	18205	18216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019826
14	NC_016928	TTTGAA	2	12	19026	19037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019826
15	NC_016928	TAAAGG	2	12	21073	21084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019828
16	NC_016928	TTGAAG	2	12	21270	21281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019828
17	NC_016928	TGATTG	2	12	22474	22485	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379019829
18	NC_016928	TGAAAT	2	12	22805	22816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019829
19	NC_016928	AAGGAA	2	12	23244	23255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019830
20	NC_016928	TGAATT	2	12	26166	26177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019831
21	NC_016928	ATTTCA	2	12	28650	28661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019833
22	NC_016928	GTTCTG	2	12	29949	29960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379019834
23	NC_016928	ATCAGC	2	12	31964	31975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019836
24	NC_016928	AAAAGA	2	12	34593	34604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019838
25	NC_016928	TTTAAA	2	12	35123	35134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016928	TTTTGA	2	12	35381	35392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379019839
27	NC_016928	TAAACA	2	12	35801	35812	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379019840
28	NC_016928	TGGTAG	2	12	36467	36478	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379019840
29	NC_016928	ATGCCT	2	12	39121	39132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379019843
30	NC_016928	TGAAGA	2	12	39309	39320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019843
31	NC_016928	GAACAA	2	12	43959	43970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019848
32	NC_016928	CAAACA	2	12	44042	44053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019848
33	NC_016928	GTTTAA	2	12	45075	45086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019850
34	NC_016928	AATGAA	2	12	48041	48052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379019853
35	NC_016928	ACAACT	2	12	50106	50117	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379019854
36	NC_016928	TTAAAC	2	12	50845	50856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016928	CATAAC	2	12	51187	51198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379019855
38	NC_016928	AATTTA	2	12	52621	52632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016928	GTAGTG	2	12	52664	52675	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016928	TAAAAA	2	12	53177	53188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379019857
41	NC_016928	AAATTA	2	12	54645	54656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019860
42	NC_016928	AAAATT	2	12	55034	55045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019860
43	NC_016928	GAACAA	2	12	61868	61879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019866
44	NC_016928	AAGTGA	2	12	62340	62351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019867
45	NC_016928	ATCTAA	2	12	64444	64455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379019869
46	NC_016928	TTCATT	2	12	68433	68444	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019871
47	NC_016928	ATAGTA	2	12	72437	72448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019873
48	NC_016928	TTCCAT	2	12	74878	74889	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379019875
49	NC_016928	ACAAGA	2	12	76476	76487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019876
50	NC_016928	AAATGG	2	12	77842	77853	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019877
51	NC_016928	TAGAAA	2	12	79116	79127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379019878
52	NC_016928	GAAATA	2	12	79691	79702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016928	ACCCTT	2	12	82899	82910	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379019884
54	NC_016928	TTTTAA	2	12	87343	87354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019889
55	NC_016928	AGAAAA	2	12	87547	87558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019889
56	NC_016928	GAATGT	2	12	87580	87591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019889
57	NC_016928	CGAAAT	2	12	88052	88063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019890
58	NC_016928	GATGTC	2	12	89007	89018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379019891
59	NC_016928	GTTAGA	2	12	91501	91512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019892
60	NC_016928	AAAAGA	2	12	91554	91565	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019892
61	NC_016928	TACAAG	2	12	94309	94320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019895
62	NC_016928	GTAGAA	2	12	98231	98242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019899
63	NC_016928	AACCAC	2	12	99066	99077	50 %	0 %	0 %	50 %	379019899
64	NC_016928	AATATA	2	12	100768	100779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016928	AACCGA	2	12	102382	102393	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379019901
66	NC_016928	AGCAAA	2	12	106843	106854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019904
67	NC_016928	ATAGAT	2	12	107283	107294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019904
68	NC_016928	TATCAT	2	12	108050	108061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019905
69	NC_016928	TAAATA	2	12	109977	109988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019906
70	NC_016928	TTTTTC	2	12	112493	112504	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379019908
71	NC_016928	TTAAAT	2	12	112588	112599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016928	TTAACA	2	12	113944	113955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016928	TAAGCC	2	12	114354	114365	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019910
74	NC_016928	ATCGCA	2	12	115569	115580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019911
75	NC_016928	TTTGAA	2	12	116600	116611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019912
76	NC_016928	TGAAGA	2	12	126392	126403	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019919
77	NC_016928	TTTCAT	2	12	127073	127084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019920
78	NC_016928	AGAATG	2	12	129042	129053	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019922
79	NC_016928	ATTTTT	2	12	129287	129298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379019923
80	NC_016928	TGTATA	2	12	131938	131949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019925
81	NC_016928	AATTAT	2	12	132297	132308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016928	TCGAAA	2	12	133439	133450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019927
83	NC_016928	CTATTG	2	12	136025	136036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019929
84	NC_016928	CATATG	2	12	137228	137239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379019930
85	NC_016928	CAGATT	2	12	143934	143945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379019935
86	NC_016928	GTTTTT	2	12	152242	152253	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016928	TGAAAG	2	12	153112	153123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019943
88	NC_016928	GATATG	2	12	160616	160627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019948
89	NC_016928	ATTTGA	2	12	164522	164533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019951
90	NC_016928	TATAAA	2	12	165053	165064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019952
91	NC_016928	GATTTT	2	12	169215	169226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016928	ACAAAG	2	12	173735	173746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019960
93	NC_016928	TGTAAT	2	12	174759	174770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019961
94	NC_016928	AAAGAT	2	12	175748	175759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379019963
95	NC_016928	ATTAAT	2	12	177654	177665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016928	CAATAT	2	12	178218	178229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379019964
97	NC_016928	TTGGTA	2	12	182072	182083	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379019969
98	NC_016928	AATTTA	2	12	182191	182202	50 %	50 %	0 %	0 %	379019969
99	NC_016928	CTATTA	2	12	188490	188501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019972
100	NC_016928	TATGAT	2	12	190024	190035	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019972
101	NC_016928	ATTGAA	2	12	190475	190486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019972
102	NC_016928	AGCAAC	2	12	196426	196437	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379019976
103	NC_016928	CACCTT	2	12	198478	198489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379019978
104	NC_016928	ACCTTT	2	12	198983	198994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379019978
105	NC_016928	TTTATA	2	12	199079	199090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016928	ATTAAT	2	12	199102	199113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016928	GTAAAT	2	12	202715	202726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019981
108	NC_016928	ATTTTA	2	12	204309	204320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019983
109	NC_016928	TATCTT	2	12	208923	208934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019986
110	NC_016928	GAGTTT	2	12	213848	213859	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379019989
111	NC_016928	CCCTGA	2	12	216363	216374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379019991
112	NC_016928	TCCTGA	2	12	217182	217193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379019991
113	NC_016928	AAATAT	2	12	217600	217611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019992
114	NC_016928	TCAATT	2	12	219333	219344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019993
115	NC_016928	AATATG	2	12	220633	220644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019994
116	NC_016928	AGATCA	2	12	221583	221594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019994
117	NC_016928	AAAAAT	2	12	224125	224136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379019996
118	NC_016928	AAAGGA	2	12	225984	225995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019998
119	NC_016928	ACATTT	2	12	226322	226333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019998
120	NC_016928	TTCTTG	2	12	231251	231262	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379020002
121	NC_016928	GGACGT	2	12	241858	241869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379020011
122	NC_016928	ATATGA	2	12	244609	244620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016928	CATAAA	2	12	247982	247993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379020015
124	NC_016928	AAAACT	2	12	248057	248068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379020015
125	NC_016928	AGTGGA	2	12	259550	259561	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016928	TGGTAT	2	12	271134	271145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379020033
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128	NC_016928	ATATAG	2	12	280780	280791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016928	ACGATG	2	12	281116	281127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379020042
130	NC_016928	ATTTTC	2	12	286097	286108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016928	ATAATT	2	12	287047	287058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016928	AGAATC	2	12	288675	288686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379020047
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136	NC_016928	GACATT	2	12	294740	294751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379020054
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143	NC_016928	AAATGC	2	12	303092	303103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379020062
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180	NC_016928	GATGCT	2	12	373075	373086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379020129
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230	NC_016928	TGATTT	2	12	461403	461414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379020219
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235	NC_016928	AAAATG	2	12	465570	465581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_016928	TGATAT	2	12	473294	473305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379020232
237	NC_016928	TCAGAT	2	12	473721	473732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379020232
238	NC_016928	TCATTA	2	12	474556	474567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379020233
239	NC_016928	TTAACA	2	12	476024	476035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379020235
240	NC_016928	AAGTGA	2	12	476327	476338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379020236
241	NC_016928	AGGTGA	2	12	480236	480247	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379020240
242	NC_016928	TTGATT	2	12	481291	481302	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379020240
243	NC_016928	ATGAAG	2	12	484402	484413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379020240
244	NC_016928	TTGATA	2	12	485181	485192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379020241
245	NC_016928	ACGTTG	2	12	485988	485999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_016928	AAAATA	2	12	486712	486723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_016928	GTTGGT	2	12	488066	488077	0 %	50 %	50 %	0 %	379020242
248	NC_016928	GCTATT	2	12	488138	488149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379020242
249	NC_016928	GATCAT	2	12	489734	489745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379020243
250	NC_016928	AATTTA	2	12	490641	490652	50 %	50 %	0 %	0 %	379020244
251	NC_016928	CAAGAA	2	12	493767	493778	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379020247
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254	NC_016928	AGTTGA	2	12	503391	503402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379020251
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256	NC_016928	TTATAA	2	12	505786	505797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_016928	TTTATA	2	12	506703	506714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379020255
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261	NC_016928	AAATTT	2	12	512544	512555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016928	GCAAGA	2	12	518036	518047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379020269
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288	NC_016928	TTATAA	2	12	568736	568747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016928	GTTATA	2	12	569406	569417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016928	ACGATG	2	12	572589	572600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379020314
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311	NC_016928	GACTCA	2	12	597396	597407	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379020333
312	NC_016928	GACTCA	2	12	597432	597443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379020333
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350	NC_016928	TCAGAC	2	12	605686	605697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379020335
351	NC_016928	TCAGAT	2	12	605704	605715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379020335
352	NC_016928	GACTCA	2	12	605737	605748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379020335
353	NC_016928	TCAGAC	2	12	605758	605769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379020335
354	NC_016928	TCAGAT	2	12	605776	605787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379020335
355	NC_016928	GACTCA	2	12	605791	605802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379020335
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