MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 66580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
66501	NC_016928	ATC	2	6	2785010	2785015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022400
66502	NC_016928	AT	3	6	2785029	2785034	50 %	50 %	0 %	0 %	379022400
66503	NC_016928	CTG	2	6	2785114	2785119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022400
66504	NC_016928	CTT	2	6	2785120	2785125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022400
66505	NC_016928	CAT	2	6	2785219	2785224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022400
66506	NC_016928	CAT	2	6	2785247	2785252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022400
66507	NC_016928	ATC	2	6	2785452	2785457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022400
66508	NC_016928	AGAT	2	8	2785472	2785479	50 %	25 %	25 %	0 %	379022400
66509	NC_016928	ATC	2	6	2785487	2785492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022400
66510	NC_016928	TG	3	6	2785501	2785506	0 %	50 %	50 %	0 %	379022400
66511	NC_016928	AT	4	8	2785549	2785556	50 %	50 %	0 %	0 %	379022400
66512	NC_016928	TGT	2	6	2785559	2785564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022400
66513	NC_016928	TGAT	2	8	2785711	2785718	25 %	50 %	25 %	0 %	379022400
66514	NC_016928	CAC	2	6	2785771	2785776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022400
66515	NC_016928	TAA	2	6	2785795	2785800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022400
66516	NC_016928	GTAC	2	8	2785836	2785843	25 %	25 %	25 %	25 %	379022400
66517	NC_016928	TCT	2	6	2785860	2785865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022400
66518	NC_016928	ATA	2	6	2785866	2785871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022400
66519	NC_016928	TCTTCA	2	12	2785908	2785919	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379022400
66520	NC_016928	TTG	2	6	2785937	2785942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022400
66521	NC_016928	CAG	2	6	2785981	2785986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022400
66522	NC_016928	TG	3	6	2786020	2786025	0 %	50 %	50 %	0 %	379022400
66523	NC_016928	AAC	2	6	2786075	2786080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022400
66524	NC_016928	CAC	2	6	2786167	2786172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022400
66525	NC_016928	CAT	2	6	2786230	2786235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022400
66526	NC_016928	CCT	2	6	2786257	2786262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66527	NC_016928	CTT	2	6	2786282	2786287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66528	NC_016928	TCA	2	6	2786358	2786363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022401
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66530	NC_016928	CTG	2	6	2786449	2786454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022401
66531	NC_016928	CTTG	2	8	2786481	2786488	0 %	50 %	25 %	25 %	379022401
66532	NC_016928	TAA	2	6	2786492	2786497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022401
66533	NC_016928	CCA	2	6	2786550	2786555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022401
66534	NC_016928	TCA	2	6	2786586	2786591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022401
66535	NC_016928	CTT	2	6	2786596	2786601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022401
66536	NC_016928	TTA	2	6	2786688	2786693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022401
66537	NC_016928	TCT	2	6	2786742	2786747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022401
66538	NC_016928	TCT	2	6	2786830	2786835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022401
66539	NC_016928	CTA	2	6	2786836	2786841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022401
66540	NC_016928	TCT	2	6	2786844	2786849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022401
66541	NC_016928	CAG	2	6	2786863	2786868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022401
66542	NC_016928	TAT	2	6	2786959	2786964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022401
66543	NC_016928	ATT	2	6	2786975	2786980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022401
66544	NC_016928	GAT	2	6	2786988	2786993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022401
66545	NC_016928	CAA	2	6	2787013	2787018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022401
66546	NC_016928	TAA	2	6	2787068	2787073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022401
66547	NC_016928	AGT	2	6	2787122	2787127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022401
66548	NC_016928	CAT	2	6	2787139	2787144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022401
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66550	NC_016928	T	6	6	2787209	2787214	0 %	100 %	0 %	0 %	379022401
66551	NC_016928	GAC	2	6	2787229	2787234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022401
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66553	NC_016928	AATT	2	8	2787433	2787440	50 %	50 %	0 %	0 %	379022401
66554	NC_016928	CTT	2	6	2787496	2787501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022401
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66556	NC_016928	AAT	2	6	2787527	2787532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022401
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66558	NC_016928	CAT	2	6	2787562	2787567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022401
66559	NC_016928	TA	3	6	2787586	2787591	50 %	50 %	0 %	0 %	379022401
66560	NC_016928	CCT	2	6	2787706	2787711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66561	NC_016928	TTA	2	6	2787741	2787746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66562	NC_016928	CTTA	2	8	2787837	2787844	25 %	50 %	0 %	25 %	379022402
66563	NC_016928	TTA	2	6	2787851	2787856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022402
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66565	NC_016928	GCTG	2	8	2787923	2787930	0 %	25 %	50 %	25 %	379022402
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66567	NC_016928	AT	3	6	2787960	2787965	50 %	50 %	0 %	0 %	379022402
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66571	NC_016928	T	6	6	2788129	2788134	0 %	100 %	0 %	0 %	379022402
66572	NC_016928	AT	3	6	2788135	2788140	50 %	50 %	0 %	0 %	379022402
66573	NC_016928	TTAT	2	8	2788199	2788206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66574	NC_016928	TATT	2	8	2788261	2788268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66575	NC_016928	A	8	8	2788282	2788289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66576	NC_016928	TGA	2	6	2788296	2788301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66577	NC_016928	ACG	3	9	2788339	2788347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022403
66578	NC_016928	GC	3	6	2788348	2788353	0 %	0 %	50 %	50 %	379022403
66579	NC_016928	T	6	6	2788370	2788375	0 %	100 %	0 %	0 %	379022403
66580	NC_016928	ACT	2	6	2788589	2788594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.