MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 8446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016912	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016912	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	379013366
4	NC_016912	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	379013366
5	NC_016912	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
6	NC_016912	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
7	NC_016912	CAAA	2	8	2600	2607	75 %	0 %	0 %	25 %	379013367
8	NC_016912	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	379013367
9	NC_016912	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	379013367
10	NC_016912	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	379013367
11	NC_016912	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	379013367
12	NC_016912	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	379013367
13	NC_016912	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
14	NC_016912	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016912	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016912	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	379013368
17	NC_016912	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	379013368
18	NC_016912	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	379013368
19	NC_016912	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	379013370
20	NC_016912	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	379013370
21	NC_016912	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	379013370
22	NC_016912	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	379013370
23	NC_016912	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	379013370
24	NC_016912	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	379013371
25	NC_016912	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	379013371
26	NC_016912	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	379013371
27	NC_016912	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	379013371
28	NC_016912	TCGT	2	8	7843	7850	0 %	50 %	25 %	25 %	379013371
29	NC_016912	ACAA	2	8	7969	7976	75 %	0 %	0 %	25 %	379013371
30	NC_016912	AGTT	2	8	8404	8411	25 %	50 %	25 %	0 %	379013371
31	NC_016912	GTCA	2	8	8640	8647	25 %	25 %	25 %	25 %	379013371
32	NC_016912	AATA	2	8	8906	8913	75 %	25 %	0 %	0 %	379013371
33	NC_016912	TGTA	2	8	9266	9273	25 %	50 %	25 %	0 %	379013371
34	NC_016912	TGAT	2	8	9565	9572	25 %	50 %	25 %	0 %	379013371
35	NC_016912	GTCA	2	8	10298	10305	25 %	25 %	25 %	25 %	379013372
36	NC_016912	AATG	2	8	11804	11811	50 %	25 %	25 %	0 %	379013373
37	NC_016912	CCAT	2	8	12312	12319	25 %	25 %	0 %	50 %	379013373
38	NC_016912	CAAT	2	8	12375	12382	50 %	25 %	0 %	25 %	379013373
39	NC_016912	CTAC	2	8	12570	12577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016912	ACGT	2	8	12734	12741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016912	ATTA	2	8	12905	12912	50 %	50 %	0 %	0 %	379013374
42	NC_016912	ATTT	2	8	13435	13442	25 %	75 %	0 %	0 %	379013374
43	NC_016912	GCAA	2	8	13776	13783	50 %	0 %	25 %	25 %	379013374
44	NC_016912	TAAA	2	8	14066	14073	75 %	25 %	0 %	0 %	379013374
45	NC_016912	TAAA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016912	ATTT	2	8	15137	15144	25 %	75 %	0 %	0 %	379013375
47	NC_016912	GCAA	2	8	16510	16517	50 %	0 %	25 %	25 %	379013377
48	NC_016912	AAGG	2	8	16643	16650	50 %	0 %	50 %	0 %	379013377
49	NC_016912	GTAA	2	8	17067	17074	50 %	25 %	25 %	0 %	379013377
50	NC_016912	AAAG	2	8	17650	17657	75 %	0 %	25 %	0 %	379013378
51	NC_016912	AAAG	2	8	17665	17672	75 %	0 %	25 %	0 %	379013378
52	NC_016912	TTAA	2	8	17914	17921	50 %	50 %	0 %	0 %	379013378
53	NC_016912	TAGA	2	8	18697	18704	50 %	25 %	25 %	0 %	379013379
54	NC_016912	ACAA	2	8	18803	18810	75 %	0 %	0 %	25 %	379013379
55	NC_016912	ATGA	2	8	18885	18892	50 %	25 %	25 %	0 %	379013379
56	NC_016912	TAAA	2	8	19609	19616	75 %	25 %	0 %	0 %	379013379
57	NC_016912	CAAC	2	8	19743	19750	50 %	0 %	0 %	50 %	379013379
58	NC_016912	AATT	2	8	19942	19949	50 %	50 %	0 %	0 %	379013379
59	NC_016912	AGTA	2	8	20563	20570	50 %	25 %	25 %	0 %	379013380
60	NC_016912	ATTC	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	379013380
61	NC_016912	GTCT	2	8	20819	20826	0 %	50 %	25 %	25 %	379013381
62	NC_016912	TGAA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	25 %	0 %	379013381
63	NC_016912	GCAT	2	8	21098	21105	25 %	25 %	25 %	25 %	379013381
64	NC_016912	GATT	2	8	21115	21122	25 %	50 %	25 %	0 %	379013381
65	NC_016912	GGTA	2	8	21605	21612	25 %	25 %	50 %	0 %	379013381
66	NC_016912	GGTT	2	8	23362	23369	0 %	50 %	50 %	0 %	379013382
67	NC_016912	AACA	2	8	23696	23703	75 %	0 %	0 %	25 %	379013382
68	NC_016912	TGCT	2	8	23802	23809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016912	ATCT	2	8	24136	24143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016912	GCCT	2	8	24264	24271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016912	ATTT	2	8	24596	24603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016912	GTAC	2	8	25513	25520	25 %	25 %	25 %	25 %	379013383
73	NC_016912	AATC	2	8	25980	25987	50 %	25 %	0 %	25 %	379013384
74	NC_016912	ATCT	2	8	27414	27421	25 %	50 %	0 %	25 %	379013384
75	NC_016912	ACAA	2	8	28073	28080	75 %	0 %	0 %	25 %	379013385
76	NC_016912	AATG	2	8	28177	28184	50 %	25 %	25 %	0 %	379013385
77	NC_016912	TCGT	2	8	28209	28216	0 %	50 %	25 %	25 %	379013385
78	NC_016912	AACA	2	8	28654	28661	75 %	0 %	0 %	25 %	379013385
79	NC_016912	CAAT	2	8	29306	29313	50 %	25 %	0 %	25 %	379013386
80	NC_016912	GATG	2	8	29314	29321	25 %	25 %	50 %	0 %	379013386
81	NC_016912	TGAA	2	8	29460	29467	50 %	25 %	25 %	0 %	379013386
82	NC_016912	TACT	2	8	29536	29543	25 %	50 %	0 %	25 %	379013386
83	NC_016912	GAAA	2	8	30083	30090	75 %	0 %	25 %	0 %	379013387
84	NC_016912	GGCA	2	8	30236	30243	25 %	0 %	50 %	25 %	379013387
85	NC_016912	AAAG	2	8	30249	30256	75 %	0 %	25 %	0 %	379013387
86	NC_016912	GAAC	2	8	30693	30700	50 %	0 %	25 %	25 %	379013387
87	NC_016912	TTGA	2	8	30879	30886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016912	ATCA	2	8	30939	30946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016912	CAAC	2	8	31204	31211	50 %	0 %	0 %	50 %	379013388
90	NC_016912	TACA	2	8	31459	31466	50 %	25 %	0 %	25 %	379013388
91	NC_016912	AATG	2	8	31634	31641	50 %	25 %	25 %	0 %	379013388
92	NC_016912	GACT	2	8	32432	32439	25 %	25 %	25 %	25 %	379013388
93	NC_016912	ATAA	2	8	32685	32692	75 %	25 %	0 %	0 %	379013388
94	NC_016912	TAAA	2	8	32728	32735	75 %	25 %	0 %	0 %	379013388
95	NC_016912	ATGA	2	8	32787	32794	50 %	25 %	25 %	0 %	379013388
96	NC_016912	CAAG	2	8	33154	33161	50 %	0 %	25 %	25 %	379013388
97	NC_016912	AGCT	2	8	33314	33321	25 %	25 %	25 %	25 %	379013388
98	NC_016912	AAGC	2	8	33739	33746	50 %	0 %	25 %	25 %	379013389
99	NC_016912	TTCA	2	8	34238	34245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016912	ATAA	2	8	34444	34451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016912	ATAA	2	8	34454	34461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016912	ATCA	2	8	34579	34586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016912	ATTT	2	8	34950	34957	25 %	75 %	0 %	0 %	379013390
104	NC_016912	ATAA	2	8	35060	35067	75 %	25 %	0 %	0 %	379013390
105	NC_016912	TGAT	2	8	35070	35077	25 %	50 %	25 %	0 %	379013390
106	NC_016912	GATA	2	8	35707	35714	50 %	25 %	25 %	0 %	379013390
107	NC_016912	GAAA	2	8	35781	35788	75 %	0 %	25 %	0 %	379013390
108	NC_016912	TATT	2	8	35789	35796	25 %	75 %	0 %	0 %	379013390
109	NC_016912	AATA	2	8	35995	36002	75 %	25 %	0 %	0 %	379013390
110	NC_016912	ATTG	2	8	36621	36628	25 %	50 %	25 %	0 %	379013391
111	NC_016912	CATA	2	8	37149	37156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016912	AAAT	2	8	37665	37672	75 %	25 %	0 %	0 %	379013392
113	NC_016912	ATAA	2	8	37878	37885	75 %	25 %	0 %	0 %	379013392
114	NC_016912	TTAC	2	8	37973	37980	25 %	50 %	0 %	25 %	379013392
115	NC_016912	ATTA	2	8	38006	38013	50 %	50 %	0 %	0 %	379013393
116	NC_016912	TCCT	2	8	38150	38157	0 %	50 %	0 %	50 %	379013393
117	NC_016912	TCCA	2	8	38320	38327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016912	CAAG	2	8	38432	38439	50 %	0 %	25 %	25 %	379013394
119	NC_016912	AATT	2	8	38443	38450	50 %	50 %	0 %	0 %	379013394
120	NC_016912	AAAC	2	8	38865	38872	75 %	0 %	0 %	25 %	379013394
121	NC_016912	ATCA	2	8	39276	39283	50 %	25 %	0 %	25 %	379013394
122	NC_016912	AGAA	2	8	39346	39353	75 %	0 %	25 %	0 %	379013394
123	NC_016912	ATTT	2	8	39424	39431	25 %	75 %	0 %	0 %	379013394
124	NC_016912	ATCA	2	8	40246	40253	50 %	25 %	0 %	25 %	379013395
125	NC_016912	CAAT	2	8	40342	40349	50 %	25 %	0 %	25 %	379013395
126	NC_016912	TTGG	2	8	40381	40388	0 %	50 %	50 %	0 %	379013395
127	NC_016912	AATT	2	8	40462	40469	50 %	50 %	0 %	0 %	379013395
128	NC_016912	ACGT	2	8	40570	40577	25 %	25 %	25 %	25 %	379013395
129	NC_016912	GTCA	2	8	40690	40697	25 %	25 %	25 %	25 %	379013395
130	NC_016912	GTTG	2	8	40970	40977	0 %	50 %	50 %	0 %	379013396
131	NC_016912	AAGA	2	8	41461	41468	75 %	0 %	25 %	0 %	379013396
132	NC_016912	AAAG	2	8	41619	41626	75 %	0 %	25 %	0 %	379013396
133	NC_016912	AAGC	2	8	41757	41764	50 %	0 %	25 %	25 %	379013396
134	NC_016912	GTAT	2	8	41944	41951	25 %	50 %	25 %	0 %	379013396
135	NC_016912	AAGA	2	8	41958	41965	75 %	0 %	25 %	0 %	379013396
136	NC_016912	TAAT	2	8	42292	42299	50 %	50 %	0 %	0 %	379013397
137	NC_016912	TGAC	2	8	42327	42334	25 %	25 %	25 %	25 %	379013397
138	NC_016912	ATTG	2	8	42750	42757	25 %	50 %	25 %	0 %	379013399
139	NC_016912	CTTG	2	8	42911	42918	0 %	50 %	25 %	25 %	379013399
140	NC_016912	TATG	2	8	43495	43502	25 %	50 %	25 %	0 %	379013399
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142	NC_016912	AAGA	2	8	44236	44243	75 %	0 %	25 %	0 %	379013401
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