MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016912	ATA	2	6	163898	163903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016912	AATA	2	8	163939	163946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016912	T	6	6	163952	163957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016912	AATA	2	8	163969	163976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016912	T	6	6	163980	163985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016912	GTA	2	6	163988	163993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016912	G	6	6	164107	164112	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016912	AT	3	6	164131	164136	50 %	50 %	0 %	0 %	379013505
4009	NC_016912	TTGT	2	8	164158	164165	0 %	75 %	25 %	0 %	379013505
4010	NC_016912	CGTTT	2	10	164207	164216	0 %	60 %	20 %	20 %	379013505
4011	NC_016912	TCA	2	6	164224	164229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013505
4012	NC_016912	A	6	6	164240	164245	100 %	0 %	0 %	0 %	379013505
4013	NC_016912	ACC	2	6	164309	164314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013505
4014	NC_016912	TC	3	6	164412	164417	0 %	50 %	0 %	50 %	379013505
4015	NC_016912	TAA	2	6	164423	164428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013505
4016	NC_016912	ATG	2	6	164429	164434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013505
4017	NC_016912	GTC	2	6	164447	164452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013505
4018	NC_016912	CTT	2	6	164455	164460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013505
4019	NC_016912	TGG	2	6	164462	164467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013505
4020	NC_016912	CAT	2	6	164506	164511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013505
4021	NC_016912	T	6	6	164547	164552	0 %	100 %	0 %	0 %	379013505
4022	NC_016912	TTA	2	6	164571	164576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013505
4023	NC_016912	CTT	2	6	164632	164637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016912	TTA	2	6	164664	164669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016912	ATC	2	6	164676	164681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_016912	TAA	2	6	164704	164709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016912	ATT	2	6	164746	164751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013506
4028	NC_016912	TGT	2	6	164757	164762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013506
4029	NC_016912	TTC	2	6	164790	164795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013506
4030	NC_016912	TGA	2	6	164885	164890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4031	NC_016912	ACC	2	6	164918	164923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013506
4032	NC_016912	ATT	2	6	165017	165022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013506
4033	NC_016912	ATA	2	6	165031	165036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013506
4034	NC_016912	AGTT	2	8	165080	165087	25 %	50 %	25 %	0 %	379013506
4035	NC_016912	TAA	3	9	165107	165115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013506
4036	NC_016912	ACG	2	6	165119	165124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013506
4037	NC_016912	ATG	2	6	165244	165249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4038	NC_016912	ATG	2	6	165264	165269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4039	NC_016912	CAT	2	6	165271	165276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013506
4040	NC_016912	CAT	2	6	165296	165301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013506
4041	NC_016912	TGT	2	6	165315	165320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013506
4042	NC_016912	GAT	2	6	165364	165369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4043	NC_016912	ATG	2	6	165424	165429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4044	NC_016912	TCA	2	6	165441	165446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013506
4045	NC_016912	TGA	2	6	165474	165479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4046	NC_016912	CAT	2	6	165493	165498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013506
4047	NC_016912	CTG	2	6	165523	165528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013506
4048	NC_016912	TGT	2	6	165574	165579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013506
4049	NC_016912	ATA	2	6	165632	165637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013506
4050	NC_016912	TCT	2	6	165711	165716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013506
4051	NC_016912	ATG	2	6	165759	165764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4052	NC_016912	GCT	2	6	165769	165774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013506
4053	NC_016912	TAA	2	6	165797	165802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013506
4054	NC_016912	TA	3	6	165806	165811	50 %	50 %	0 %	0 %	379013506
4055	NC_016912	GTAAAT	2	12	165892	165903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013506
4056	NC_016912	ATTA	2	8	165932	165939	50 %	50 %	0 %	0 %	379013506
4057	NC_016912	GTT	2	6	165954	165959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013506
4058	NC_016912	GTC	2	6	166019	166024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013506
4059	NC_016912	AGTG	2	8	166041	166048	25 %	25 %	50 %	0 %	379013506
4060	NC_016912	GTA	2	6	166173	166178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013506
4061	NC_016912	ATA	2	6	166278	166283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013506
4062	NC_016912	TAAG	2	8	166361	166368	50 %	25 %	25 %	0 %	379013506
4063	NC_016912	GTT	2	6	166378	166383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013506
4064	NC_016912	A	7	7	166388	166394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016912	TGT	2	6	166466	166471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016912	T	6	6	166502	166507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016912	G	6	6	166524	166529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016912	TGA	2	6	166537	166542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016912	ATG	2	6	166581	166586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013507
4070	NC_016912	A	6	6	166608	166613	100 %	0 %	0 %	0 %	379013507
4071	NC_016912	ATT	2	6	166660	166665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013507
4072	NC_016912	AAT	2	6	166674	166679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013507
4073	NC_016912	AAATG	2	10	166688	166697	60 %	20 %	20 %	0 %	379013508
4074	NC_016912	ATA	2	6	166752	166757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4075	NC_016912	TAA	2	6	166811	166816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4076	NC_016912	CTT	2	6	166831	166836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013508
4077	NC_016912	GTAAA	2	10	166852	166861	60 %	20 %	20 %	0 %	379013508
4078	NC_016912	TTTAA	2	10	166872	166881	40 %	60 %	0 %	0 %	379013508
4079	NC_016912	TTG	2	6	166948	166953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013508
4080	NC_016912	CAT	2	6	167030	167035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013508
4081	NC_016912	T	6	6	167035	167040	0 %	100 %	0 %	0 %	379013508
4082	NC_016912	TGCA	2	8	167096	167103	25 %	25 %	25 %	25 %	379013508
4083	NC_016912	TTG	2	6	167122	167127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013508
4084	NC_016912	TCT	2	6	167136	167141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013508
4085	NC_016912	CAA	3	9	167143	167151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013508
4086	NC_016912	TAG	3	9	167176	167184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
4087	NC_016912	CTA	2	6	167191	167196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013508
4088	NC_016912	TTGC	2	8	167257	167264	0 %	50 %	25 %	25 %	379013508
4089	NC_016912	ATT	2	6	167267	167272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013508
4090	NC_016912	TTTGC	2	10	167388	167397	0 %	60 %	20 %	20 %	379013508
4091	NC_016912	ATTTTA	2	12	167488	167499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013508
4092	NC_016912	AGT	2	6	167521	167526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
4093	NC_016912	ACC	2	6	167563	167568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013508
4094	NC_016912	TTA	2	6	167577	167582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013508
4095	NC_016912	GTA	2	6	167584	167589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
4096	NC_016912	AAG	2	6	167598	167603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013508
4097	NC_016912	ACC	2	6	167615	167620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013508
4098	NC_016912	TAA	2	6	167648	167653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4099	NC_016912	AAT	3	9	167700	167708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4100	NC_016912	ATG	2	6	167761	167766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
4101	NC_016912	AGC	2	6	167771	167776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013508
4102	NC_016912	CTA	2	6	167794	167799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013508
4103	NC_016912	TG	3	6	167822	167827	0 %	50 %	50 %	0 %	379013508
4104	NC_016912	GCT	2	6	167841	167846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013508
4105	NC_016912	CAT	2	6	167861	167866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013508
4106	NC_016912	AAT	2	6	167954	167959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4107	NC_016912	TAA	2	6	168038	168043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4108	NC_016912	TGA	2	6	168049	168054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
4109	NC_016912	TAA	2	6	168092	168097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013508
4110	NC_016912	ATG	2	6	168169	168174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
4111	NC_016912	CAT	2	6	168182	168187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013508
4112	NC_016912	GAA	2	6	168212	168217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013508
4113	NC_016912	CCG	2	6	168291	168296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379013508
4114	NC_016912	AC	3	6	168298	168303	50 %	0 %	0 %	50 %	379013508
4115	NC_016912	TTGTT	2	10	168394	168403	0 %	80 %	20 %	0 %	379013508
4116	NC_016912	CGA	2	6	168418	168423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013508
4117	NC_016912	TGC	2	6	168425	168430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013508
4118	NC_016912	GCT	2	6	168435	168440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013508
4119	NC_016912	ACC	2	6	168512	168517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013508
4120	NC_016912	CCA	2	6	168552	168557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013508
4121	NC_016912	AGT	2	6	168574	168579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013508
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4246	NC_016912	ATT	2	6	173839	173844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4500	NC_016912	ATT	2	6	184189	184194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013519

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