MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016912	CAT	2	6	121809	121814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013471
3002	NC_016912	ATTT	2	8	121823	121830	25 %	75 %	0 %	0 %	379013471
3003	NC_016912	ATC	2	6	121840	121845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013471
3004	NC_016912	GTGA	2	8	121866	121873	25 %	25 %	50 %	0 %	379013471
3005	NC_016912	GAC	2	6	121898	121903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013471
3006	NC_016912	TTA	2	6	121912	121917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013471
3007	NC_016912	TGG	2	6	121921	121926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013471
3008	NC_016912	T	6	6	121956	121961	0 %	100 %	0 %	0 %	379013471
3009	NC_016912	GAT	2	6	121982	121987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013471
3010	NC_016912	TAA	2	6	122060	122065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013471
3011	NC_016912	GTT	2	6	122079	122084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013471
3012	NC_016912	GAT	2	6	122166	122171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013471
3013	NC_016912	A	7	7	122265	122271	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3014	NC_016912	TCA	2	6	122272	122277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013471
3015	NC_016912	GAAA	2	8	122309	122316	75 %	0 %	25 %	0 %	379013471
3016	NC_016912	TAA	2	6	122318	122323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013471
3017	NC_016912	ATGG	2	8	122334	122341	25 %	25 %	50 %	0 %	379013471
3018	NC_016912	AGA	2	6	122369	122374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013471
3019	NC_016912	A	6	6	122409	122414	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3020	NC_016912	AGA	2	6	122423	122428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013471
3021	NC_016912	GATATG	2	12	122457	122468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013471
3022	NC_016912	GGT	2	6	122514	122519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013471
3023	NC_016912	TAT	2	6	122570	122575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013471
3024	NC_016912	TATT	2	8	122600	122607	25 %	75 %	0 %	0 %	379013471
3025	NC_016912	AATC	2	8	122609	122616	50 %	25 %	0 %	25 %	379013471
3026	NC_016912	A	6	6	122639	122644	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3027	NC_016912	TAT	2	6	122660	122665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013471
3028	NC_016912	GCA	3	9	122736	122744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013471
3029	NC_016912	CA	3	6	122743	122748	50 %	0 %	0 %	50 %	379013471
3030	NC_016912	GAA	2	6	122778	122783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013471
3031	NC_016912	TAA	2	6	122792	122797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013471
3032	NC_016912	CTG	2	6	122818	122823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013471
3033	NC_016912	GCT	2	6	122826	122831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013471
3034	NC_016912	ATT	2	6	122928	122933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013471
3035	NC_016912	ATG	2	6	122944	122949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013471
3036	NC_016912	TTG	2	6	122968	122973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013471
3037	NC_016912	GAA	2	6	123039	123044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013471
3038	NC_016912	GCAG	2	8	123122	123129	25 %	0 %	50 %	25 %	379013471
3039	NC_016912	TAATT	2	10	123203	123212	40 %	60 %	0 %	0 %	379013471
3040	NC_016912	A	6	6	123225	123230	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3041	NC_016912	GAC	2	6	123234	123239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013471
3042	NC_016912	A	6	6	123274	123279	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3043	NC_016912	A	6	6	123331	123336	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3044	NC_016912	ACA	2	6	123353	123358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013471
3045	NC_016912	ATT	2	6	123384	123389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013471
3046	NC_016912	A	6	6	123418	123423	100 %	0 %	0 %	0 %	379013471
3047	NC_016912	TTA	2	6	123424	123429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013471
3048	NC_016912	ATTA	2	8	123480	123487	50 %	50 %	0 %	0 %	379013472
3049	NC_016912	T	6	6	123560	123565	0 %	100 %	0 %	0 %	379013472
3050	NC_016912	A	6	6	123577	123582	100 %	0 %	0 %	0 %	379013472
3051	NC_016912	A	7	7	123597	123603	100 %	0 %	0 %	0 %	379013472
3052	NC_016912	TAA	2	6	123606	123611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013472
3053	NC_016912	GCA	2	6	123697	123702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013472
3054	NC_016912	ATT	2	6	123760	123765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013472
3055	NC_016912	TCA	2	6	123795	123800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013472
3056	NC_016912	A	6	6	123808	123813	100 %	0 %	0 %	0 %	379013472
3057	NC_016912	ATG	2	6	123877	123882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013472
3058	NC_016912	AGA	2	6	124065	124070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013472
3059	NC_016912	GTT	2	6	124084	124089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013472
3060	NC_016912	TAT	2	6	124119	124124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013472
3061	NC_016912	ATT	2	6	124170	124175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013472
3062	NC_016912	GA	3	6	124226	124231	50 %	0 %	50 %	0 %	379013472
3063	NC_016912	A	6	6	124231	124236	100 %	0 %	0 %	0 %	379013472
3064	NC_016912	TTG	2	6	124246	124251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013472
3065	NC_016912	GA	3	6	124254	124259	50 %	0 %	50 %	0 %	379013472
3066	NC_016912	ATT	2	6	124289	124294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013472
3067	NC_016912	ATA	2	6	124388	124393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013472
3068	NC_016912	GA	3	6	124489	124494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016912	A	6	6	124539	124544	100 %	0 %	0 %	0 %	379013473
3070	NC_016912	ATC	2	6	124574	124579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013473
3071	NC_016912	GAA	2	6	124612	124617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013473
3072	NC_016912	TTG	2	6	124630	124635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013473
3073	NC_016912	AT	3	6	124733	124738	50 %	50 %	0 %	0 %	379013473
3074	NC_016912	ATT	2	6	124767	124772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013473
3075	NC_016912	AG	3	6	124843	124848	50 %	0 %	50 %	0 %	379013473
3076	NC_016912	GTG	2	6	124908	124913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013473
3077	NC_016912	GAT	2	6	125020	125025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013473
3078	NC_016912	TCG	2	6	125027	125032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013473
3079	NC_016912	TAT	2	6	125132	125137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013473
3080	NC_016912	TCGA	2	8	125159	125166	25 %	25 %	25 %	25 %	379013473
3081	NC_016912	CTTA	2	8	125253	125260	25 %	50 %	0 %	25 %	379013473
3082	NC_016912	GAT	2	6	125269	125274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013473
3083	NC_016912	CAT	2	6	125368	125373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013473
3084	NC_016912	ATG	3	9	125435	125443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013473
3085	NC_016912	AC	3	6	125504	125509	50 %	0 %	0 %	50 %	379013473
3086	NC_016912	ATA	2	6	125510	125515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013473
3087	NC_016912	TAT	2	6	125547	125552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013473
3088	NC_016912	TGAA	2	8	125558	125565	50 %	25 %	25 %	0 %	379013473
3089	NC_016912	ATC	2	6	125670	125675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013474
3090	NC_016912	AC	3	6	125718	125723	50 %	0 %	0 %	50 %	379013474
3091	NC_016912	TGA	2	6	125763	125768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013474
3092	NC_016912	ACT	2	6	125792	125797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013474
3093	NC_016912	ATT	2	6	125839	125844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013474
3094	NC_016912	ATG	2	6	125855	125860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013474
3095	NC_016912	TTA	2	6	125863	125868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013474
3096	NC_016912	AAC	2	6	125873	125878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013474
3097	NC_016912	GTT	2	6	125912	125917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013474
3098	NC_016912	AGC	2	6	125919	125924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013474
3099	NC_016912	GAA	2	6	126001	126006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013474
3100	NC_016912	TTG	2	6	126020	126025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013474
3101	NC_016912	TTAT	2	8	126072	126079	25 %	75 %	0 %	0 %	379013474
3102	NC_016912	TAAA	2	8	126179	126186	75 %	25 %	0 %	0 %	379013474
3103	NC_016912	CAA	2	6	126202	126207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013474
3104	NC_016912	AGAGA	2	10	126229	126238	60 %	0 %	40 %	0 %	379013474
3105	NC_016912	AATG	2	8	126270	126277	50 %	25 %	25 %	0 %	379013474
3106	NC_016912	AAG	2	6	126333	126338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013474
3107	NC_016912	GAA	2	6	126342	126347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013474
3108	NC_016912	GAA	2	6	126352	126357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013474
3109	NC_016912	ATTTGA	2	12	126363	126374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013474
3110	NC_016912	TGT	2	6	126441	126446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013474
3111	NC_016912	AGA	2	6	126471	126476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013474
3112	NC_016912	GTC	2	6	126477	126482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013474
3113	NC_016912	GGT	2	6	126562	126567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013474
3114	NC_016912	AATCC	2	10	126585	126594	40 %	20 %	0 %	40 %	379013474
3115	NC_016912	AG	3	6	126607	126612	50 %	0 %	50 %	0 %	379013474
3116	NC_016912	GAT	2	6	126633	126638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013474
3117	NC_016912	ATT	2	6	126688	126693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013474
3118	NC_016912	GGA	2	6	126728	126733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379013474
3119	NC_016912	TA	3	6	126858	126863	50 %	50 %	0 %	0 %	379013475
3120	NC_016912	TAA	2	6	126932	126937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013475
3121	NC_016912	AC	3	6	127002	127007	50 %	0 %	0 %	50 %	379013475
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3123	NC_016912	TCA	2	6	127017	127022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013475
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3497	NC_016912	ATG	2	6	143335	143340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013491
3498	NC_016912	TTG	2	6	143344	143349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013491
3499	NC_016912	AGG	2	6	143365	143370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379013491
3500	NC_016912	TAT	2	6	143416	143421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013492

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