MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016912	TA	3	6	100261	100266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016912	ACA	2	6	100273	100278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_016912	ATTA	2	8	100281	100288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_016912	TAAA	2	8	100305	100312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016912	ATT	2	6	100328	100333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016912	A	7	7	100358	100364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016912	TTG	2	6	100383	100388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016912	AATGTA	2	12	100412	100423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016912	GACAA	2	10	100444	100453	60 %	0 %	20 %	20 %	379013447
2510	NC_016912	A	6	6	100456	100461	100 %	0 %	0 %	0 %	379013447
2511	NC_016912	AATG	2	8	100548	100555	50 %	25 %	25 %	0 %	379013447
2512	NC_016912	ATC	2	6	100586	100591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013447
2513	NC_016912	AGT	2	6	100605	100610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013447
2514	NC_016912	ATG	2	6	100709	100714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013447
2515	NC_016912	TGG	2	6	100872	100877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013447
2516	NC_016912	CAA	2	6	100915	100920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013447
2517	NC_016912	AC	3	6	100937	100942	50 %	0 %	0 %	50 %	379013447
2518	NC_016912	CA	3	6	100956	100961	50 %	0 %	0 %	50 %	379013447
2519	NC_016912	CAA	2	6	100964	100969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013447
2520	NC_016912	ATC	2	6	100981	100986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013447
2521	NC_016912	ATG	2	6	100997	101002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013447
2522	NC_016912	TCA	2	6	101024	101029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013447
2523	NC_016912	ATC	2	6	101031	101036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013447
2524	NC_016912	A	6	6	101054	101059	100 %	0 %	0 %	0 %	379013448
2525	NC_016912	GCT	2	6	101069	101074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013448
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2529	NC_016912	ATAA	2	8	101169	101176	75 %	25 %	0 %	0 %	379013448
2530	NC_016912	ATA	2	6	101179	101184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_016912	TAA	2	6	101189	101194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016912	GAGC	2	8	101217	101224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_016912	AGT	2	6	101270	101275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_016912	TGAA	2	8	101280	101287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_016912	TCA	2	6	101336	101341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_016912	A	6	6	101341	101346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_016912	TAA	2	6	101359	101364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016912	TAA	2	6	101369	101374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013449
2539	NC_016912	TTA	2	6	101432	101437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013449
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2541	NC_016912	CAA	2	6	101486	101491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013449
2542	NC_016912	TGAT	2	8	101563	101570	25 %	50 %	25 %	0 %	379013449
2543	NC_016912	GTC	2	6	101611	101616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013449
2544	NC_016912	GCTT	2	8	101687	101694	0 %	50 %	25 %	25 %	379013449
2545	NC_016912	T	7	7	101708	101714	0 %	100 %	0 %	0 %	379013449
2546	NC_016912	ATA	2	6	101716	101721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013449
2547	NC_016912	CAAA	2	8	101757	101764	75 %	0 %	0 %	25 %	379013449
2548	NC_016912	TAAT	2	8	101798	101805	50 %	50 %	0 %	0 %	379013449
2549	NC_016912	TGA	2	6	101806	101811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013449
2550	NC_016912	TTTG	2	8	101885	101892	0 %	75 %	25 %	0 %	379013449
2551	NC_016912	TCCCT	2	10	101908	101917	0 %	40 %	0 %	60 %	379013449
2552	NC_016912	CT	3	6	101924	101929	0 %	50 %	0 %	50 %	379013449
2553	NC_016912	GC	3	6	101992	101997	0 %	0 %	50 %	50 %	379013449
2554	NC_016912	TA	3	6	102060	102065	50 %	50 %	0 %	0 %	379013449
2555	NC_016912	TAT	2	6	102069	102074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013449
2556	NC_016912	TCA	2	6	102142	102147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_016912	AAT	2	6	102151	102156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_016912	ATAG	2	8	102192	102199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016912	TAG	2	6	102227	102232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016912	CTGTAA	2	12	102233	102244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2561	NC_016912	A	6	6	102289	102294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_016912	TAT	3	9	102295	102303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_016912	GGA	2	6	102346	102351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016912	CA	3	6	102372	102377	50 %	0 %	0 %	50 %	379013450
2565	NC_016912	AATG	2	8	102385	102392	50 %	25 %	25 %	0 %	379013450
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2568	NC_016912	GGTATG	2	12	102554	102565	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379013450
2569	NC_016912	AATT	2	8	102591	102598	50 %	50 %	0 %	0 %	379013450
2570	NC_016912	A	6	6	102614	102619	100 %	0 %	0 %	0 %	379013450
2571	NC_016912	ATG	2	6	102669	102674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013450
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2579	NC_016912	CAA	2	6	102999	103004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013450
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2584	NC_016912	GTA	2	6	103259	103264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013451
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2587	NC_016912	TAT	2	6	103390	103395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013451
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2592	NC_016912	GTA	2	6	103592	103597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013451
2593	NC_016912	ATT	2	6	103621	103626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013451
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2597	NC_016912	TTA	2	6	103713	103718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013451
2598	NC_016912	TA	3	6	103734	103739	50 %	50 %	0 %	0 %	379013451
2599	NC_016912	TA	3	6	103776	103781	50 %	50 %	0 %	0 %	379013451
2600	NC_016912	TAAA	2	8	103806	103813	75 %	25 %	0 %	0 %	379013451
2601	NC_016912	TTTA	2	8	103846	103853	25 %	75 %	0 %	0 %	379013451
2602	NC_016912	ATC	2	6	103923	103928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013451
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2604	NC_016912	TTA	2	6	103952	103957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013451
2605	NC_016912	TA	3	6	103967	103972	50 %	50 %	0 %	0 %	379013451
2606	NC_016912	TTG	2	6	103983	103988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013451
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2608	NC_016912	GCTTT	2	10	104142	104151	0 %	60 %	20 %	20 %	379013451
2609	NC_016912	TAATT	2	10	104227	104236	40 %	60 %	0 %	0 %	379013451
2610	NC_016912	TGC	2	6	104269	104274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013451
2611	NC_016912	ATG	2	6	104313	104318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013451
2612	NC_016912	TAT	2	6	104338	104343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013451
2613	NC_016912	ATT	2	6	104348	104353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013451
2614	NC_016912	AAAT	2	8	104420	104427	75 %	25 %	0 %	0 %	379013451
2615	NC_016912	AT	3	6	104445	104450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_016912	TAAA	2	8	104469	104476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_016912	TA	3	6	104482	104487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016912	GAG	2	6	104492	104497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_016912	AGTA	2	8	104499	104506	50 %	25 %	25 %	0 %	379013452
2620	NC_016912	AT	3	6	104520	104525	50 %	50 %	0 %	0 %	379013452
2621	NC_016912	ATC	2	6	104575	104580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013452
2622	NC_016912	TG	3	6	104614	104619	0 %	50 %	50 %	0 %	379013452
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2625	NC_016912	TCA	2	6	104777	104782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013452
2626	NC_016912	TGA	2	6	104811	104816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013452
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2628	NC_016912	CA	3	6	104860	104865	50 %	0 %	0 %	50 %	379013452
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2632	NC_016912	CGTA	2	8	105057	105064	25 %	25 %	25 %	25 %	379013452
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2662	NC_016912	CTG	2	6	106434	106439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2732	NC_016912	TAA	2	6	110172	110177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2733	NC_016912	CTTT	2	8	110178	110185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2735	NC_016912	A	7	7	110294	110300	100 %	0 %	0 %	0 %	379013458
2736	NC_016912	TA	3	6	110301	110306	50 %	50 %	0 %	0 %	379013458
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2740	NC_016912	GCA	2	6	110621	110626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013458
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2744	NC_016912	A	6	6	110781	110786	100 %	0 %	0 %	0 %	379013458
2745	NC_016912	TGCAA	2	10	110794	110803	40 %	20 %	20 %	20 %	379013458
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2753	NC_016912	ATG	2	6	111207	111212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013458
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