MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016912	CTT	2	6	20371	20376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013380
502	NC_016912	A	6	6	20438	20443	100 %	0 %	0 %	0 %	379013380
503	NC_016912	CAA	2	6	20462	20467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013380
504	NC_016912	TTGAAG	2	12	20511	20522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013380
505	NC_016912	GGT	2	6	20543	20548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013380
506	NC_016912	AGTA	2	8	20563	20570	50 %	25 %	25 %	0 %	379013380
507	NC_016912	ATTC	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	379013380
508	NC_016912	AAG	2	6	20691	20696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013380
509	NC_016912	AC	3	6	20716	20721	50 %	0 %	0 %	50 %	379013380
510	NC_016912	GTCT	2	8	20819	20826	0 %	50 %	25 %	25 %	379013381
511	NC_016912	ATT	2	6	20835	20840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013381
512	NC_016912	TAC	2	6	20861	20866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013381
513	NC_016912	ATG	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
514	NC_016912	ATA	2	6	20947	20952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013381
515	NC_016912	TGT	2	6	20963	20968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013381
516	NC_016912	TGAA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	25 %	0 %	379013381
517	NC_016912	ACG	2	6	21057	21062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013381
518	NC_016912	TAT	2	6	21075	21080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013381
519	NC_016912	GCAT	2	8	21098	21105	25 %	25 %	25 %	25 %	379013381
520	NC_016912	GATT	2	8	21115	21122	25 %	50 %	25 %	0 %	379013381
521	NC_016912	ATG	2	6	21145	21150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
522	NC_016912	ATG	2	6	21157	21162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
523	NC_016912	ATC	2	6	21215	21220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013381
524	NC_016912	CAG	2	6	21355	21360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013381
525	NC_016912	GGTA	2	8	21605	21612	25 %	25 %	50 %	0 %	379013381
526	NC_016912	TGA	2	6	21638	21643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
527	NC_016912	GTC	2	6	21682	21687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013381
528	NC_016912	TGATTG	2	12	21715	21726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379013381
529	NC_016912	ACT	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013381
530	NC_016912	ACA	2	6	21776	21781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013381
531	NC_016912	TC	3	6	21796	21801	0 %	50 %	0 %	50 %	379013381
532	NC_016912	GTG	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013381
533	NC_016912	AAC	2	6	21874	21879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013381
534	NC_016912	ATG	2	6	21897	21902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
535	NC_016912	TGA	2	6	21965	21970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
536	NC_016912	GGC	2	6	21984	21989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379013381
537	NC_016912	GAT	2	6	21996	22001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
538	NC_016912	GAT	2	6	22005	22010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
539	NC_016912	GGT	2	6	22011	22016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013381
540	NC_016912	ATG	2	6	22033	22038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
541	NC_016912	TGAAAT	2	12	22046	22057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013381
542	NC_016912	AGTTA	2	10	22094	22103	40 %	40 %	20 %	0 %	379013381
543	NC_016912	ATA	2	6	22120	22125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013381
544	NC_016912	ATG	2	6	22158	22163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013381
545	NC_016912	A	6	6	22165	22170	100 %	0 %	0 %	0 %	379013381
546	NC_016912	AAT	2	6	22183	22188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016912	GAT	2	6	22195	22200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016912	AT	3	6	22238	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016912	TCA	2	6	22447	22452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013382
550	NC_016912	GTA	2	6	22456	22461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013382
551	NC_016912	AAGGAA	2	12	22484	22495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013382
552	NC_016912	CG	3	6	22533	22538	0 %	0 %	50 %	50 %	379013382
553	NC_016912	GGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013382
554	NC_016912	AAT	2	6	22552	22557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013382
555	NC_016912	GTT	2	6	22660	22665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013382
556	NC_016912	GAA	2	6	22789	22794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013382
557	NC_016912	GTG	2	6	22802	22807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013382
558	NC_016912	A	6	6	22828	22833	100 %	0 %	0 %	0 %	379013382
559	NC_016912	ATT	2	6	22917	22922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013382
560	NC_016912	CAT	2	6	22982	22987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013382
561	NC_016912	TGA	2	6	22989	22994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013382
562	NC_016912	GAA	2	6	23002	23007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013382
563	NC_016912	TAT	2	6	23008	23013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013382
564	NC_016912	GCA	2	6	23014	23019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013382
565	NC_016912	ATT	2	6	23283	23288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013382
566	NC_016912	CAT	2	6	23302	23307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013382
567	NC_016912	AG	3	6	23311	23316	50 %	0 %	50 %	0 %	379013382
568	NC_016912	ACA	3	9	23335	23343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013382
569	NC_016912	CGT	2	6	23353	23358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013382
570	NC_016912	GGTT	2	8	23362	23369	0 %	50 %	50 %	0 %	379013382
571	NC_016912	TCG	2	6	23394	23399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013382
572	NC_016912	AGA	2	6	23574	23579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013382
573	NC_016912	AGA	2	6	23601	23606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013382
574	NC_016912	ATGTA	2	10	23652	23661	40 %	40 %	20 %	0 %	379013382
575	NC_016912	TCT	2	6	23672	23677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013382
576	NC_016912	AACA	2	8	23696	23703	75 %	0 %	0 %	25 %	379013382
577	NC_016912	TA	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016912	AGG	2	6	23787	23792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016912	TGCT	2	8	23802	23809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_016912	TCGAT	2	10	23816	23825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_016912	A	6	6	23835	23840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016912	AGA	2	6	23877	23882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016912	GAT	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016912	AAG	2	6	23926	23931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016912	ATT	2	6	24018	24023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016912	ATA	2	6	24024	24029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016912	TTC	2	6	24069	24074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016912	A	6	6	24075	24080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016912	A	6	6	24098	24103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016912	ATCT	2	8	24136	24143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_016912	CGG	2	6	24194	24199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_016912	T	6	6	24232	24237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016912	GCCT	2	8	24264	24271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_016912	T	7	7	24340	24346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016912	ATATT	2	10	24354	24363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016912	AT	3	6	24372	24377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016912	TTA	2	6	24489	24494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016912	TTC	2	6	24526	24531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_016912	CCA	2	6	24543	24548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_016912	TCC	2	6	24550	24555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_016912	AAT	2	6	24587	24592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016912	ATTT	2	8	24596	24603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016912	TAT	2	6	24648	24653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016912	TCA	2	6	24667	24672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016912	CCG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_016912	TAA	2	6	24712	24717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016912	A	6	6	24716	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016912	AT	3	6	24727	24732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016912	TA	3	6	24778	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016912	T	6	6	24852	24857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016912	A	6	6	24882	24887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016912	ATA	2	6	24895	24900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016912	GTT	2	6	24943	24948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013383
614	NC_016912	TGA	3	9	24954	24962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013383
615	NC_016912	A	7	7	24996	25002	100 %	0 %	0 %	0 %	379013383
616	NC_016912	ATG	2	6	25037	25042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013383
617	NC_016912	GAA	3	9	25060	25068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013383
618	NC_016912	A	6	6	25138	25143	100 %	0 %	0 %	0 %	379013383
619	NC_016912	AAT	3	9	25155	25163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013383
620	NC_016912	CGT	2	6	25282	25287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013383
621	NC_016912	A	6	6	25378	25383	100 %	0 %	0 %	0 %	379013383
622	NC_016912	TGAATT	2	12	25413	25424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013383
623	NC_016912	ATT	2	6	25430	25435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013383
624	NC_016912	TTA	2	6	25474	25479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013383
625	NC_016912	GTAC	2	8	25513	25520	25 %	25 %	25 %	25 %	379013383
626	NC_016912	TCG	2	6	25536	25541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013383
627	NC_016912	GAT	2	6	25561	25566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013383
628	NC_016912	AT	3	6	25581	25586	50 %	50 %	0 %	0 %	379013383
629	NC_016912	TCC	2	6	25613	25618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379013383
630	NC_016912	AAC	2	6	25619	25624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013383
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632	NC_016912	GCT	2	6	25764	25769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013384
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757	NC_016912	CAA	2	6	31152	31157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013388
758	NC_016912	CAA	2	6	31165	31170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013388
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