MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016912	CAT	2	6	184217	184222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013519
4502	NC_016912	GCA	2	6	184279	184284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013519
4503	NC_016912	AAC	2	6	184392	184397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013519
4504	NC_016912	AGT	2	6	184399	184404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013519
4505	NC_016912	GTA	2	6	184469	184474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013519
4506	NC_016912	ACT	2	6	184475	184480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013519
4507	NC_016912	TAT	2	6	184521	184526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013519
4508	NC_016912	TCG	2	6	184529	184534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013519
4509	NC_016912	GAA	2	6	184615	184620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013520
4510	NC_016912	GCGA	2	8	184725	184732	25 %	0 %	50 %	25 %	379013520
4511	NC_016912	CAA	2	6	184734	184739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013520
4512	NC_016912	CAAG	2	8	184754	184761	50 %	0 %	25 %	25 %	379013520
4513	NC_016912	TGA	2	6	184891	184896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013520
4514	NC_016912	CTATG	2	10	184924	184933	20 %	40 %	20 %	20 %	379013520
4515	NC_016912	ATT	2	6	184939	184944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013520
4516	NC_016912	GTT	2	6	184993	184998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013520
4517	NC_016912	AAAC	2	8	185033	185040	75 %	0 %	0 %	25 %	379013520
4518	NC_016912	A	6	6	185104	185109	100 %	0 %	0 %	0 %	379013520
4519	NC_016912	CAA	2	6	185183	185188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013520
4520	NC_016912	ACA	2	6	185196	185201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013520
4521	NC_016912	TAG	2	6	185203	185208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013520
4522	NC_016912	TGA	2	6	185232	185237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013520
4523	NC_016912	CAA	2	6	185240	185245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013520
4524	NC_016912	AATATG	2	12	185306	185317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013520
4525	NC_016912	TTA	4	12	185327	185338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013520
4526	NC_016912	AAC	2	6	185356	185361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013520
4527	NC_016912	GAT	3	9	185429	185437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013520
4528	NC_016912	TAGA	2	8	185514	185521	50 %	25 %	25 %	0 %	379013520
4529	NC_016912	AAT	2	6	185549	185554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013520
4530	NC_016912	AATC	2	8	185646	185653	50 %	25 %	0 %	25 %	379013520
4531	NC_016912	ATA	2	6	185715	185720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013520
4532	NC_016912	AC	3	6	185789	185794	50 %	0 %	0 %	50 %	379013520
4533	NC_016912	GGCA	2	8	185800	185807	25 %	0 %	50 %	25 %	379013520
4534	NC_016912	A	6	6	185816	185821	100 %	0 %	0 %	0 %	379013520
4535	NC_016912	AAT	2	6	186053	186058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013520
4536	NC_016912	TTAA	2	8	186125	186132	50 %	50 %	0 %	0 %	379013520
4537	NC_016912	ATT	2	6	186152	186157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013520
4538	NC_016912	AGTC	2	8	186174	186181	25 %	25 %	25 %	25 %	379013520
4539	NC_016912	A	6	6	186200	186205	100 %	0 %	0 %	0 %	379013520
4540	NC_016912	AGT	2	6	186241	186246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013520
4541	NC_016912	TTA	2	6	186270	186275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013520
4542	NC_016912	AAT	2	6	186384	186389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013520
4543	NC_016912	AGG	2	6	186413	186418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016912	AAG	2	6	186466	186471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013521
4545	NC_016912	TGG	3	9	186605	186613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013521
4546	NC_016912	TAT	2	6	186627	186632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013521
4547	NC_016912	ACAA	2	8	186694	186701	75 %	0 %	0 %	25 %	379013521
4548	NC_016912	GAT	2	6	186711	186716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4549	NC_016912	T	6	6	186735	186740	0 %	100 %	0 %	0 %	379013521
4550	NC_016912	TAAT	2	8	186838	186845	50 %	50 %	0 %	0 %	379013521
4551	NC_016912	GATTG	2	10	186987	186996	20 %	40 %	40 %	0 %	379013521
4552	NC_016912	TGT	2	6	187088	187093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013521
4553	NC_016912	TGG	2	6	187103	187108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013521
4554	NC_016912	TTA	2	6	187245	187250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013521
4555	NC_016912	CAT	2	6	187299	187304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013521
4556	NC_016912	GAT	2	6	187356	187361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4557	NC_016912	TGA	3	9	187394	187402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4558	NC_016912	GAA	2	6	187500	187505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013521
4559	NC_016912	AAC	2	6	187517	187522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013521
4560	NC_016912	TG	3	6	187530	187535	0 %	50 %	50 %	0 %	379013521
4561	NC_016912	AAGG	2	8	187542	187549	50 %	0 %	50 %	0 %	379013521
4562	NC_016912	GT	3	6	187618	187623	0 %	50 %	50 %	0 %	379013521
4563	NC_016912	ATGG	2	8	187638	187645	25 %	25 %	50 %	0 %	379013521
4564	NC_016912	GTA	2	6	187653	187658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4565	NC_016912	TGG	2	6	187661	187666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013521
4566	NC_016912	CAG	2	6	187833	187838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013521
4567	NC_016912	TAG	2	6	187862	187867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4568	NC_016912	ATTG	2	8	187922	187929	25 %	50 %	25 %	0 %	379013521
4569	NC_016912	CAA	2	6	187999	188004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013521
4570	NC_016912	TGA	2	6	188027	188032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4571	NC_016912	ATG	2	6	188137	188142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4572	NC_016912	GATG	2	8	188173	188180	25 %	25 %	50 %	0 %	379013521
4573	NC_016912	TGA	2	6	188198	188203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4574	NC_016912	GTT	2	6	188208	188213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013521
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4577	NC_016912	TGA	2	6	188357	188362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013521
4578	NC_016912	TGAA	2	8	188477	188484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_016912	GTA	2	6	188521	188526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016912	TAATG	2	10	188626	188635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016912	GAT	2	6	188694	188699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016912	TTATT	2	10	188741	188750	20 %	80 %	0 %	0 %	379013522
4583	NC_016912	TAAG	2	8	188752	188759	50 %	25 %	25 %	0 %	379013522
4584	NC_016912	CTTT	2	8	188761	188768	0 %	75 %	0 %	25 %	379013522
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4586	NC_016912	TGA	2	6	188824	188829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013522
4587	NC_016912	TTG	2	6	188870	188875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013522
4588	NC_016912	TAA	2	6	188956	188961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013522
4589	NC_016912	TG	3	6	188977	188982	0 %	50 %	50 %	0 %	379013522
4590	NC_016912	CAC	2	6	189020	189025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013522
4591	NC_016912	ATTG	2	8	189038	189045	25 %	50 %	25 %	0 %	379013522
4592	NC_016912	T	6	6	189053	189058	0 %	100 %	0 %	0 %	379013522
4593	NC_016912	TAT	2	6	189101	189106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013522
4594	NC_016912	ACT	2	6	189109	189114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013522
4595	NC_016912	T	6	6	189151	189156	0 %	100 %	0 %	0 %	379013522
4596	NC_016912	TG	3	6	189196	189201	0 %	50 %	50 %	0 %	379013522
4597	NC_016912	AAC	2	6	189217	189222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013522
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4600	NC_016912	TA	3	6	189276	189281	50 %	50 %	0 %	0 %	379013522
4601	NC_016912	ATT	2	6	189297	189302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013522
4602	NC_016912	T	6	6	189378	189383	0 %	100 %	0 %	0 %	379013522
4603	NC_016912	ATA	3	9	189454	189462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013522
4604	NC_016912	TGC	2	6	189465	189470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013522
4605	NC_016912	TAA	2	6	189542	189547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016912	ATA	2	6	189609	189614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_016912	A	6	6	189647	189652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_016912	CA	3	6	189673	189678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_016912	GTT	2	6	189700	189705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013523
4610	NC_016912	ATT	2	6	189720	189725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013523
4611	NC_016912	TTC	2	6	189744	189749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013523
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4613	NC_016912	ATG	2	6	189797	189802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013523
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4616	NC_016912	T	6	6	189909	189914	0 %	100 %	0 %	0 %	379013523
4617	NC_016912	CAG	2	6	189941	189946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013523
4618	NC_016912	AT	3	6	189985	189990	50 %	50 %	0 %	0 %	379013523
4619	NC_016912	GAAA	2	8	190008	190015	75 %	0 %	25 %	0 %	379013523
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4622	NC_016912	AAAT	2	8	190185	190192	75 %	25 %	0 %	0 %	379013523
4623	NC_016912	TCA	3	9	190207	190215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013523
4624	NC_016912	TGT	3	9	190219	190227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013523
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4633	NC_016912	AT	3	6	190505	190510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4885	NC_016912	GAAA	2	8	201964	201971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_016912	ATG	2	6	207096	207101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013537
4998	NC_016912	TGT	2	6	207143	207148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013537
4999	NC_016912	TTC	2	6	207182	207187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013537
5000	NC_016912	TGG	2	6	207232	207237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013537

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