MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	GTAA	2	8	1292	1299	50 %	25 %	25 %	0 %	378715494
2	NC_016905	CTTG	2	8	1429	1436	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
3	NC_016905	GAGT	2	8	1454	1461	25 %	25 %	50 %	0 %	378715494
4	NC_016905	GTTC	2	8	1585	1592	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
5	NC_016905	GTTA	2	8	2087	2094	25 %	50 %	25 %	0 %	378715494
6	NC_016905	TGAT	2	8	2817	2824	25 %	50 %	25 %	0 %	378715494
7	NC_016905	ATTG	2	8	3008	3015	25 %	50 %	25 %	0 %	378715494
8	NC_016905	TCAA	2	8	3111	3118	50 %	25 %	0 %	25 %	378715494
9	NC_016905	GTCT	2	8	3562	3569	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
10	NC_016905	TTTG	2	8	4261	4268	0 %	75 %	25 %	0 %	378715494
11	NC_016905	TTTG	2	8	4777	4784	0 %	75 %	25 %	0 %	378715494
12	NC_016905	CTTG	2	8	4855	4862	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
13	NC_016905	CTTT	2	8	5245	5252	0 %	75 %	0 %	25 %	378715494
14	NC_016905	GGTT	2	8	5344	5351	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
15	NC_016905	CAAA	2	8	5848	5855	75 %	0 %	0 %	25 %	378715494
16	NC_016905	GTGA	2	8	6048	6055	25 %	25 %	50 %	0 %	378715494
17	NC_016905	GCGT	2	8	7314	7321	0 %	25 %	50 %	25 %	378715496
18	NC_016905	CATC	2	8	7686	7693	25 %	25 %	0 %	50 %	378715496
19	NC_016905	CCAT	2	8	9048	9055	25 %	25 %	0 %	50 %	378715497
20	NC_016905	GGGT	2	8	9215	9222	0 %	25 %	75 %	0 %	378715497
21	NC_016905	GCAA	2	8	9261	9268	50 %	0 %	25 %	25 %	378715497
22	NC_016905	GGCT	2	8	9500	9507	0 %	25 %	50 %	25 %	378715497
23	NC_016905	CTTT	2	8	9738	9745	0 %	75 %	0 %	25 %	378715498
24	NC_016905	TAAG	2	8	9796	9803	50 %	25 %	25 %	0 %	378715498
25	NC_016905	TTGA	2	8	10303	10310	25 %	50 %	25 %	0 %	378715499
26	NC_016905	GATT	2	8	10920	10927	25 %	50 %	25 %	0 %	378715499
27	NC_016905	TGCG	2	8	10967	10974	0 %	25 %	50 %	25 %	378715499
28	NC_016905	CTTG	2	8	11584	11591	0 %	50 %	25 %	25 %	378715499
29	NC_016905	GTGA	2	8	12033	12040	25 %	25 %	50 %	0 %	378715499
30	NC_016905	TATT	2	8	12564	12571	25 %	75 %	0 %	0 %	378715499
31	NC_016905	CATA	2	8	12757	12764	50 %	25 %	0 %	25 %	378715499
32	NC_016905	GCAA	2	8	12879	12886	50 %	0 %	25 %	25 %	378715499
33	NC_016905	CTTG	2	8	13045	13052	0 %	50 %	25 %	25 %	378715499
34	NC_016905	AAGG	2	8	13774	13781	50 %	0 %	50 %	0 %	378715500
35	NC_016905	TCTT	2	8	13847	13854	0 %	75 %	0 %	25 %	378715500
36	NC_016905	GCAA	2	8	14561	14568	50 %	0 %	25 %	25 %	378715501
37	NC_016905	ATGC	2	8	14582	14589	25 %	25 %	25 %	25 %	378715501
38	NC_016905	GGAA	2	8	14855	14862	50 %	0 %	50 %	0 %	378715502
39	NC_016905	GAAA	2	8	14986	14993	75 %	0 %	25 %	0 %	378715502
40	NC_016905	AGCG	2	8	15195	15202	25 %	0 %	50 %	25 %	378715503
41	NC_016905	TAAC	2	8	15227	15234	50 %	25 %	0 %	25 %	378715503
42	NC_016905	TGGC	2	8	15293	15300	0 %	25 %	50 %	25 %	378715503
43	NC_016905	GTCT	2	8	15512	15519	0 %	50 %	25 %	25 %	378715503
44	NC_016905	GCTT	2	8	15766	15773	0 %	50 %	25 %	25 %	378715503
45	NC_016905	AGTT	2	8	16933	16940	25 %	50 %	25 %	0 %	378715504
46	NC_016905	TGAG	2	8	17032	17039	25 %	25 %	50 %	0 %	378715504
47	NC_016905	TCCT	2	8	17081	17088	0 %	50 %	0 %	50 %	378715504
48	NC_016905	AAGT	2	8	17863	17870	50 %	25 %	25 %	0 %	378715505
49	NC_016905	AATG	2	8	18458	18465	50 %	25 %	25 %	0 %	378715505
50	NC_016905	ATCT	2	8	19061	19068	25 %	50 %	0 %	25 %	378715506
51	NC_016905	TTGT	2	8	19579	19586	0 %	75 %	25 %	0 %	378715506
52	NC_016905	GCTT	2	8	19648	19655	0 %	50 %	25 %	25 %	378715507
53	NC_016905	GCCC	2	8	20852	20859	0 %	0 %	25 %	75 %	378715509
54	NC_016905	TGAG	2	8	21730	21737	25 %	25 %	50 %	0 %	378715509
55	NC_016905	TGCC	2	8	22109	22116	0 %	25 %	25 %	50 %	378715509
56	NC_016905	GATT	2	8	22484	22491	25 %	50 %	25 %	0 %	378715509
57	NC_016905	ATAG	2	8	22875	22882	50 %	25 %	25 %	0 %	378715509
58	NC_016905	GACT	2	8	23358	23365	25 %	25 %	25 %	25 %	378715510
59	NC_016905	CACT	2	8	23615	23622	25 %	25 %	0 %	50 %	378715510
60	NC_016905	AATT	2	8	23706	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	378715511
61	NC_016905	ATCA	2	8	25013	25020	50 %	25 %	0 %	25 %	378715511
62	NC_016905	CAAT	2	8	25865	25872	50 %	25 %	0 %	25 %	378715512
63	NC_016905	CCAT	2	8	26492	26499	25 %	25 %	0 %	50 %	378715513
64	NC_016905	CATC	2	8	26877	26884	25 %	25 %	0 %	50 %	378715514
65	NC_016905	TAAT	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016905	TTTA	2	8	27720	27727	25 %	75 %	0 %	0 %	378715517
67	NC_016905	TTTA	2	8	27930	27937	25 %	75 %	0 %	0 %	378715517
68	NC_016905	CGAT	2	8	28492	28499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016905	TGCT	2	8	29072	29079	0 %	50 %	25 %	25 %	378715519
70	NC_016905	ATAA	2	8	29476	29483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016905	GTAT	2	8	29598	29605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016905	CTTA	2	8	29676	29683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016905	ATGG	2	8	30917	30924	25 %	25 %	50 %	0 %	378715521
74	NC_016905	GGTT	2	8	31121	31128	0 %	50 %	50 %	0 %	378715521
75	NC_016905	CCCT	2	8	31231	31238	0 %	25 %	0 %	75 %	378715521
76	NC_016905	GTCA	2	8	31521	31528	25 %	25 %	25 %	25 %	378715521
77	NC_016905	AGCA	2	8	31671	31678	50 %	0 %	25 %	25 %	378715521
78	NC_016905	AAAT	2	8	31742	31749	75 %	25 %	0 %	0 %	378715522
79	NC_016905	AAGT	2	8	31805	31812	50 %	25 %	25 %	0 %	378715522
80	NC_016905	GTAA	2	8	32326	32333	50 %	25 %	25 %	0 %	378715522
81	NC_016905	TCAT	2	8	32464	32471	25 %	50 %	0 %	25 %	378715522
82	NC_016905	AATG	2	8	33232	33239	50 %	25 %	25 %	0 %	378715523
83	NC_016905	TAAA	2	8	33393	33400	75 %	25 %	0 %	0 %	378715523
84	NC_016905	TATT	2	8	34094	34101	25 %	75 %	0 %	0 %	378715523
85	NC_016905	ACAA	2	8	34376	34383	75 %	0 %	0 %	25 %	378715523
86	NC_016905	ATGC	2	8	34529	34536	25 %	25 %	25 %	25 %	378715523
87	NC_016905	GCAA	2	8	34609	34616	50 %	0 %	25 %	25 %	378715523
88	NC_016905	GTAC	2	8	34637	34644	25 %	25 %	25 %	25 %	378715523
89	NC_016905	TCAA	2	8	35932	35939	50 %	25 %	0 %	25 %	378715523
90	NC_016905	ACTT	2	8	36436	36443	25 %	50 %	0 %	25 %	378715523
91	NC_016905	CCAT	2	8	36799	36806	25 %	25 %	0 %	50 %	378715523
92	NC_016905	AATG	2	8	37792	37799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016905	ACGA	2	8	39591	39598	50 %	0 %	25 %	25 %	378715525
94	NC_016905	CCTT	2	8	39619	39626	0 %	50 %	0 %	50 %	378715525
95	NC_016905	TTTC	2	8	39883	39890	0 %	75 %	0 %	25 %	378715526
96	NC_016905	TTCC	2	8	39986	39993	0 %	50 %	0 %	50 %	378715526
97	NC_016905	ATCA	2	8	41012	41019	50 %	25 %	0 %	25 %	378715527
98	NC_016905	AAGC	2	8	41032	41039	50 %	0 %	25 %	25 %	378715527
99	NC_016905	GGGT	2	8	41108	41115	0 %	25 %	75 %	0 %	378715527
100	NC_016905	TGAA	2	8	41393	41400	50 %	25 %	25 %	0 %	378715527
101	NC_016905	AAGA	2	8	41505	41512	75 %	0 %	25 %	0 %	378715527
102	NC_016905	ACTT	2	8	42031	42038	25 %	50 %	0 %	25 %	378715528
103	NC_016905	TGGG	2	8	42469	42476	0 %	25 %	75 %	0 %	378715528
104	NC_016905	AATA	2	8	42683	42690	75 %	25 %	0 %	0 %	378715528
105	NC_016905	AGCG	2	8	42803	42810	25 %	0 %	50 %	25 %	378715528
106	NC_016905	CAAC	2	8	42963	42970	50 %	0 %	0 %	50 %	378715528
107	NC_016905	GCAT	2	8	43569	43576	25 %	25 %	25 %	25 %	378715528
108	NC_016905	TTAG	2	8	43701	43708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016905	ATTA	2	8	44280	44287	50 %	50 %	0 %	0 %	378715529
110	NC_016905	ATCG	2	8	44300	44307	25 %	25 %	25 %	25 %	378715529
111	NC_016905	ACCT	2	8	45631	45638	25 %	25 %	0 %	50 %	378715529
112	NC_016905	AGCT	2	8	45748	45755	25 %	25 %	25 %	25 %	378715529
113	NC_016905	GGCA	2	8	46180	46187	25 %	0 %	50 %	25 %	378715529
114	NC_016905	TAAT	2	8	47152	47159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016905	GTCA	2	8	47543	47550	25 %	25 %	25 %	25 %	378715530
116	NC_016905	CGAG	2	8	47570	47577	25 %	0 %	50 %	25 %	378715530
117	NC_016905	AGCG	2	8	47799	47806	25 %	0 %	50 %	25 %	378715531
118	NC_016905	CAGC	2	8	48101	48108	25 %	0 %	25 %	50 %	378715531
119	NC_016905	CAAG	2	8	48425	48432	50 %	0 %	25 %	25 %	378715531
120	NC_016905	TTTG	2	8	48998	49005	0 %	75 %	25 %	0 %	378715531
121	NC_016905	TGGC	2	8	49044	49051	0 %	25 %	50 %	25 %	378715531
122	NC_016905	GGCA	2	8	49417	49424	25 %	0 %	50 %	25 %	378715531
123	NC_016905	CCAG	2	8	50243	50250	25 %	0 %	25 %	50 %	378715531
124	NC_016905	ATAG	2	8	50259	50266	50 %	25 %	25 %	0 %	378715531
125	NC_016905	AAGA	2	8	50541	50548	75 %	0 %	25 %	0 %	378715531
126	NC_016905	ACGA	2	8	52102	52109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016905	CCTT	2	8	52130	52137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016905	TTTC	2	8	52394	52401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016905	TTCC	2	8	52497	52504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016905	TGAA	2	8	52818	52825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016905	TTAG	2	8	53045	53052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016905	CAAT	2	8	53282	53289	50 %	25 %	0 %	25 %	378715532
133	NC_016905	AGTT	2	8	54555	54562	25 %	50 %	25 %	0 %	378715532
134	NC_016905	CATC	2	8	54648	54655	25 %	25 %	0 %	50 %	378715532
135	NC_016905	AAAT	2	8	55303	55310	75 %	25 %	0 %	0 %	378715532
136	NC_016905	TGAT	2	8	55329	55336	25 %	50 %	25 %	0 %	378715532
137	NC_016905	TTTG	2	8	55361	55368	0 %	75 %	25 %	0 %	378715532
138	NC_016905	AAAC	2	8	56517	56524	75 %	0 %	0 %	25 %	378715533
139	NC_016905	TGTT	2	8	56722	56729	0 %	75 %	25 %	0 %	378715533
140	NC_016905	ATTA	2	8	57023	57030	50 %	50 %	0 %	0 %	378715533
141	NC_016905	AAAG	2	8	57227	57234	75 %	0 %	25 %	0 %	378715533
142	NC_016905	TATT	2	8	58499	58506	25 %	75 %	0 %	0 %	378715534
143	NC_016905	CTTG	2	8	58527	58534	0 %	50 %	25 %	25 %	378715534
144	NC_016905	ACTT	2	8	58694	58701	25 %	50 %	0 %	25 %	378715534
145	NC_016905	TTGA	2	8	58710	58717	25 %	50 %	25 %	0 %	378715534
146	NC_016905	CTTA	2	8	58812	58819	25 %	50 %	0 %	25 %	378715534
147	NC_016905	ATCA	2	8	59151	59158	50 %	25 %	0 %	25 %	378715534
148	NC_016905	AGAT	2	8	59717	59724	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
149	NC_016905	TCAT	2	8	59838	59845	25 %	50 %	0 %	25 %	378715535
150	NC_016905	TCAA	2	8	59883	59890	50 %	25 %	0 %	25 %	378715535
151	NC_016905	AGTA	2	8	60212	60219	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
152	NC_016905	GCTT	2	8	60450	60457	0 %	50 %	25 %	25 %	378715535
153	NC_016905	TTTG	2	8	61224	61231	0 %	75 %	25 %	0 %	378715535
154	NC_016905	AGTT	2	8	61946	61953	25 %	50 %	25 %	0 %	378715535
155	NC_016905	ATAG	2	8	62414	62421	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
156	NC_016905	ATCA	2	8	62504	62511	50 %	25 %	0 %	25 %	378715535
157	NC_016905	TTGA	2	8	62666	62673	25 %	50 %	25 %	0 %	378715536
158	NC_016905	GCTT	2	8	62723	62730	0 %	50 %	25 %	25 %	378715536
159	NC_016905	ATTC	2	8	63534	63541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_016905	AATC	2	8	63911	63918	50 %	25 %	0 %	25 %	378715538
161	NC_016905	ATTC	2	8	64082	64089	25 %	50 %	0 %	25 %	378715538
162	NC_016905	TTTG	2	8	64121	64128	0 %	75 %	25 %	0 %	378715538
163	NC_016905	ATTA	2	8	64472	64479	50 %	50 %	0 %	0 %	378715539
164	NC_016905	CTAT	2	8	65124	65131	25 %	50 %	0 %	25 %	378715539
165	NC_016905	GTTG	2	8	65787	65794	0 %	50 %	50 %	0 %	378715540
166	NC_016905	CACC	2	8	66004	66011	25 %	0 %	0 %	75 %	378715540
167	NC_016905	TTGA	2	8	66285	66292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016905	GTGG	2	8	66657	66664	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016905	ACTC	2	8	66880	66887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_016905	GCTG	2	8	66954	66961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_016905	GGAA	2	8	67704	67711	50 %	0 %	50 %	0 %	378715541
172	NC_016905	GAAA	2	8	67807	67814	75 %	0 %	25 %	0 %	378715541
173	NC_016905	AAGG	2	8	68071	68078	50 %	0 %	50 %	0 %	378715541
174	NC_016905	TCGT	2	8	68099	68106	0 %	50 %	25 %	25 %	378715541
175	NC_016905	CAAC	2	8	68587	68594	50 %	0 %	0 %	50 %	378715541
176	NC_016905	ACTG	2	8	69515	69522	25 %	25 %	25 %	25 %	378715542
177	NC_016905	CGAA	2	8	69611	69618	50 %	0 %	25 %	25 %	378715542
178	NC_016905	GCTT	2	8	69976	69983	0 %	50 %	25 %	25 %	378715542
179	NC_016905	TTGT	2	8	70411	70418	0 %	75 %	25 %	0 %	378715543
180	NC_016905	AAGA	2	8	70451	70458	75 %	0 %	25 %	0 %	378715543
181	NC_016905	TCAT	2	8	70466	70473	25 %	50 %	0 %	25 %	378715543
182	NC_016905	GTTT	2	8	70714	70721	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_016905	TCGG	2	8	71716	71723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_016905	GCAA	2	8	71765	71772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_016905	TGTC	2	8	72016	72023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_016905	GCAA	2	8	72112	72119	50 %	0 %	25 %	25 %	378715546
187	NC_016905	GCCA	2	8	72146	72153	25 %	0 %	25 %	50 %	378715546
188	NC_016905	GCGG	2	8	72917	72924	0 %	0 %	75 %	25 %	378715546
189	NC_016905	AGTT	2	8	73059	73066	25 %	50 %	25 %	0 %	378715546
190	NC_016905	TCTG	2	8	73421	73428	0 %	50 %	25 %	25 %	378715546
191	NC_016905	AGCC	2	8	73558	73565	25 %	0 %	25 %	50 %	378715546
192	NC_016905	AGAA	2	8	73638	73645	75 %	0 %	25 %	0 %	378715546
193	NC_016905	TAAA	2	8	74032	74039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_016905	TGAA	2	8	74293	74300	50 %	25 %	25 %	0 %	378715547
195	NC_016905	TGGC	2	8	74343	74350	0 %	25 %	50 %	25 %	378715547
196	NC_016905	CAAA	2	8	74381	74388	75 %	0 %	0 %	25 %	378715547
197	NC_016905	TGAT	2	8	74876	74883	25 %	50 %	25 %	0 %	378715548
198	NC_016905	TTGA	2	8	74926	74933	25 %	50 %	25 %	0 %	378715548
199	NC_016905	AGCG	2	8	75294	75301	25 %	0 %	50 %	25 %	378715549
200	NC_016905	TCGG	2	8	75618	75625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
201	NC_016905	GCAA	2	8	75667	75674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
202	NC_016905	GCGA	2	8	75909	75916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
203	NC_016905	AGCA	2	8	75959	75966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
204	NC_016905	AAAG	2	8	77744	77751	75 %	0 %	25 %	0 %	378715553
205	NC_016905	ATAA	2	8	78237	78244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_016905	AGCA	2	8	78398	78405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
207	NC_016905	GCAA	2	8	78760	78767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
208	NC_016905	GCGA	2	8	79002	79009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
209	NC_016905	AGCA	2	8	79052	79059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
210	NC_016905	TTAA	2	8	80297	80304	50 %	50 %	0 %	0 %	378715555
211	NC_016905	CAGA	2	8	80367	80374	50 %	0 %	25 %	25 %	378715555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.