MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 3326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016901	AGCCG	2	10	415	424	20 %	0 %	40 %	40 %	378706363
2	NC_016901	AGTGA	2	10	4912	4921	40 %	20 %	40 %	0 %	378706366
3	NC_016901	ACCCA	2	10	5585	5594	40 %	0 %	0 %	60 %	378706366
4	NC_016901	TGAAT	2	10	10762	10771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016901	ATGGC	2	10	14226	14235	20 %	20 %	40 %	20 %	378706375
6	NC_016901	TGATG	2	10	15753	15762	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016901	CATTC	2	10	19029	19038	20 %	40 %	0 %	40 %	378706377
8	NC_016901	GCATC	2	10	22933	22942	20 %	20 %	20 %	40 %	378706382
9	NC_016901	ACATC	2	10	23317	23326	40 %	20 %	0 %	40 %	378706382
10	NC_016901	AGTTT	2	10	24618	24627	20 %	60 %	20 %	0 %	378706382
11	NC_016901	CTATT	2	10	28581	28590	20 %	60 %	0 %	20 %	378706385
12	NC_016901	CATGG	2	10	31561	31570	20 %	20 %	40 %	20 %	378706389
13	NC_016901	TTGTC	2	10	33688	33697	0 %	60 %	20 %	20 %	378706391
14	NC_016901	GCGCC	2	10	34241	34250	0 %	0 %	40 %	60 %	378706391
15	NC_016901	GCGAG	2	10	34946	34955	20 %	0 %	60 %	20 %	378706392
16	NC_016901	GTGAT	2	10	37017	37026	20 %	40 %	40 %	0 %	378706394
17	NC_016901	CTGGG	2	10	37706	37715	0 %	20 %	60 %	20 %	378706395
18	NC_016901	CGAAA	2	10	38294	38303	60 %	0 %	20 %	20 %	378706395
19	NC_016901	TTCGT	2	10	38966	38975	0 %	60 %	20 %	20 %	378706396
20	NC_016901	GGTCA	2	10	44026	44035	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016901	AGTCG	2	10	47535	47544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016901	AGGCT	2	10	47862	47871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016901	ATCCC	2	10	49514	49523	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016901	TCCGC	2	10	49700	49709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016901	CCGTC	2	10	49785	49794	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_016901	CTTGC	2	10	50696	50705	0 %	40 %	20 %	40 %	378706405
27	NC_016901	GATTG	2	10	53742	53751	20 %	40 %	40 %	0 %	378706408
28	NC_016901	GATAG	2	10	56393	56402	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016901	AAGTT	2	10	56537	56546	40 %	40 %	20 %	0 %	378706411
30	NC_016901	TGTGA	2	10	57710	57719	20 %	40 %	40 %	0 %	378706412
31	NC_016901	AGAAA	2	10	57889	57898	80 %	0 %	20 %	0 %	378706412
32	NC_016901	GGATG	2	10	59626	59635	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016901	CCAGC	2	10	63077	63086	20 %	0 %	20 %	60 %	378706418
34	NC_016901	TGGTG	2	10	63956	63965	0 %	40 %	60 %	0 %	378706419
35	NC_016901	AGCGC	2	10	65293	65302	20 %	0 %	40 %	40 %	378706421
36	NC_016901	TTGCA	2	10	65877	65886	20 %	40 %	20 %	20 %	378706421
37	NC_016901	CTTTA	2	10	67499	67508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016901	ACCTT	2	10	68423	68432	20 %	40 %	0 %	40 %	378706423
39	NC_016901	GGCGG	2	10	69798	69807	0 %	0 %	80 %	20 %	378706424
40	NC_016901	GGCTG	2	10	75948	75957	0 %	20 %	60 %	20 %	378706430
41	NC_016901	TTGAT	2	10	76213	76222	20 %	60 %	20 %	0 %	378706430
42	NC_016901	GATTT	2	10	76308	76317	20 %	60 %	20 %	0 %	378706430
43	NC_016901	ATGGT	2	10	77513	77522	20 %	40 %	40 %	0 %	378706431
44	NC_016901	GTTTG	2	10	77649	77658	0 %	60 %	40 %	0 %	378706431
45	NC_016901	ACCTG	2	10	81025	81034	20 %	20 %	20 %	40 %	378706432
46	NC_016901	TTAAT	2	10	81160	81169	40 %	60 %	0 %	0 %	378706432
47	NC_016901	AAAGC	2	10	82380	82389	60 %	0 %	20 %	20 %	378706433
48	NC_016901	ATAGC	2	10	82584	82593	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016901	AGCAA	2	10	82751	82760	60 %	0 %	20 %	20 %	378706434
50	NC_016901	ATTTA	2	10	85585	85594	40 %	60 %	0 %	0 %	378706435
51	NC_016901	GTGAG	2	10	85707	85716	20 %	20 %	60 %	0 %	378706435
52	NC_016901	TGAGT	2	10	91509	91518	20 %	40 %	40 %	0 %	378706437
53	NC_016901	CTTCA	2	10	92664	92673	20 %	40 %	0 %	40 %	378706438
54	NC_016901	TGCGC	2	10	96073	96082	0 %	20 %	40 %	40 %	378706442
55	NC_016901	CTGTG	2	10	99323	99332	0 %	40 %	40 %	20 %	378706444
56	NC_016901	GCCGA	2	10	100372	100381	20 %	0 %	40 %	40 %	378706445
57	NC_016901	TAAAT	2	10	101753	101762	60 %	40 %	0 %	0 %	378706445
58	NC_016901	CTGTC	2	10	103145	103154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016901	GTTCT	2	10	108922	108931	0 %	60 %	20 %	20 %	378706455
60	NC_016901	AGTGC	2	10	109524	109533	20 %	20 %	40 %	20 %	378706456
61	NC_016901	TGGGT	2	10	111147	111156	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016901	CTTTT	2	10	113652	113661	0 %	80 %	0 %	20 %	378706459
63	NC_016901	AATTT	2	10	114259	114268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016901	GTTGT	2	10	114560	114569	0 %	60 %	40 %	0 %	378706460
65	NC_016901	CTAAG	2	10	115852	115861	40 %	20 %	20 %	20 %	378706460
66	NC_016901	ATCCA	2	10	116373	116382	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016901	TTATT	2	10	118217	118226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016901	GCCAA	2	10	119365	119374	40 %	0 %	20 %	40 %	378706463
69	NC_016901	GCCGC	2	10	120750	120759	0 %	0 %	40 %	60 %	378706465
70	NC_016901	GTGAA	2	10	126193	126202	40 %	20 %	40 %	0 %	378706467
71	NC_016901	AAGCC	2	10	126487	126496	40 %	0 %	20 %	40 %	378706467
72	NC_016901	TGGTG	2	10	127939	127948	0 %	40 %	60 %	0 %	378706468
73	NC_016901	GATGT	2	10	128773	128782	20 %	40 %	40 %	0 %	378706469
74	NC_016901	TTACT	2	10	132874	132883	20 %	60 %	0 %	20 %	378706472
75	NC_016901	ATGAC	2	10	134645	134654	40 %	20 %	20 %	20 %	378706474
76	NC_016901	TTGCT	2	10	136304	136313	0 %	60 %	20 %	20 %	378706476
77	NC_016901	GCTTC	2	10	136364	136373	0 %	40 %	20 %	40 %	378706476
78	NC_016901	GCAAC	2	10	136653	136662	40 %	0 %	20 %	40 %	378706476
79	NC_016901	AGTGA	2	10	137587	137596	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016901	AGGTT	2	10	138751	138760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016901	GCGAA	2	10	139398	139407	40 %	0 %	40 %	20 %	378706478
82	NC_016901	TGGAT	2	10	140888	140897	20 %	40 %	40 %	0 %	378706480
83	NC_016901	CGAGC	2	10	142282	142291	20 %	0 %	40 %	40 %	378706482
84	NC_016901	CCGCA	2	10	144802	144811	20 %	0 %	20 %	60 %	378706485
85	NC_016901	AGCGC	2	10	148268	148277	20 %	0 %	40 %	40 %	378706489
86	NC_016901	CTGTG	2	10	148340	148349	0 %	40 %	40 %	20 %	378706489
87	NC_016901	CTGAG	2	10	148552	148561	20 %	20 %	40 %	20 %	378706489
88	NC_016901	TTCAA	2	10	149295	149304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016901	ACAGC	2	10	152663	152672	40 %	0 %	20 %	40 %	378706491
90	NC_016901	CGCGA	2	10	153797	153806	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016901	CATCG	2	10	156625	156634	20 %	20 %	20 %	40 %	378706497
92	NC_016901	CGGCG	2	10	160331	160340	0 %	0 %	60 %	40 %	378706500
93	NC_016901	CGTGG	2	10	160719	160728	0 %	20 %	60 %	20 %	378706500
94	NC_016901	CTGCA	2	10	162618	162627	20 %	20 %	20 %	40 %	378706500
95	NC_016901	CACTC	2	10	162778	162787	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_016901	ATCTA	2	10	162911	162920	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016901	TGTGA	2	10	163013	163022	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016901	TCACT	2	10	163968	163977	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016901	GTTGT	2	10	165221	165230	0 %	60 %	40 %	0 %	378706502
100	NC_016901	TGAAG	2	10	167474	167483	40 %	20 %	40 %	0 %	378706505
101	NC_016901	TTGAA	2	10	168479	168488	40 %	40 %	20 %	0 %	378706507
102	NC_016901	TGAGC	2	10	170499	170508	20 %	20 %	40 %	20 %	378706509
103	NC_016901	ATTGG	2	10	174685	174694	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016901	GTGCG	2	10	174901	174910	0 %	20 %	60 %	20 %	378706512
105	NC_016901	ACAGC	2	10	174979	174988	40 %	0 %	20 %	40 %	378706512
106	NC_016901	ATTTG	2	10	178194	178203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016901	ATTTT	2	10	178234	178243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016901	GCCGA	2	10	187617	187626	20 %	0 %	40 %	40 %	378706523
109	NC_016901	TGCGC	2	10	192553	192562	0 %	20 %	40 %	40 %	378706529
110	NC_016901	GCTTG	2	10	193651	193660	0 %	40 %	40 %	20 %	378706530
111	NC_016901	AACAA	2	10	194837	194846	80 %	0 %	0 %	20 %	378706530
112	NC_016901	AACTG	2	10	195809	195818	40 %	20 %	20 %	20 %	378706531
113	NC_016901	CTATG	2	10	196662	196671	20 %	40 %	20 %	20 %	378706532
114	NC_016901	TTTGT	2	10	196759	196768	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016901	ATTTA	2	10	201542	201551	40 %	60 %	0 %	0 %	378706534
116	NC_016901	ACCAA	2	10	201963	201972	60 %	0 %	0 %	40 %	378706534
117	NC_016901	ACCAA	2	10	202239	202248	60 %	0 %	0 %	40 %	378706534
118	NC_016901	ACCAA	2	10	203619	203628	60 %	0 %	0 %	40 %	378706534
119	NC_016901	CTTAT	2	10	208061	208070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016901	TTGTC	2	10	209313	209322	0 %	60 %	20 %	20 %	378706536
121	NC_016901	AGTCA	2	10	211010	211019	40 %	20 %	20 %	20 %	378706539
122	NC_016901	CGGTC	2	10	211264	211273	0 %	20 %	40 %	40 %	378706539
123	NC_016901	TTGCA	2	10	213246	213255	20 %	40 %	20 %	20 %	378706540
124	NC_016901	GCAGG	2	10	215706	215715	20 %	0 %	60 %	20 %	378706542
125	NC_016901	ATATT	2	10	217448	217457	40 %	60 %	0 %	0 %	378706544
126	NC_016901	ATCGC	2	10	217975	217984	20 %	20 %	20 %	40 %	378706544
127	NC_016901	CAATG	2	10	218630	218639	40 %	20 %	20 %	20 %	378706545
128	NC_016901	TAAAC	2	10	222231	222240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016901	AGTCG	2	10	223862	223871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016901	AGGCT	2	10	224189	224198	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016901	ATCCC	2	10	225836	225845	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_016901	GCATG	2	10	226421	226430	20 %	20 %	40 %	20 %	378706547
133	NC_016901	TGAAT	2	10	229055	229064	40 %	40 %	20 %	0 %	378706549
134	NC_016901	CGTAC	2	10	230174	230183	20 %	20 %	20 %	40 %	378706550
135	NC_016901	AGCAA	2	10	239015	239024	60 %	0 %	20 %	20 %	378706558
136	NC_016901	CTGAT	2	10	239066	239075	20 %	40 %	20 %	20 %	378706558
137	NC_016901	TCTGT	2	10	239151	239160	0 %	60 %	20 %	20 %	378706558
138	NC_016901	GAAAA	2	10	243993	244002	80 %	0 %	20 %	0 %	378706560
139	NC_016901	GTTCT	2	10	244476	244485	0 %	60 %	20 %	20 %	378706561
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151	NC_016901	TTGAT	2	10	271157	271166	20 %	60 %	20 %	0 %	378706602
152	NC_016901	AGTCG	2	10	275212	275221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_016901	AGGCT	2	10	275539	275548	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016901	ATCCC	2	10	277190	277199	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
155	NC_016901	TCCGC	2	10	277376	277385	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_016901	CCGTC	2	10	277461	277470	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
157	NC_016901	TAATT	2	10	278644	278653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016901	TTGAT	2	10	281150	281159	20 %	60 %	20 %	0 %	378706607
159	NC_016901	GGCTG	2	10	285354	285363	0 %	20 %	60 %	20 %	378706614
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258	NC_016901	ATGTT	3	15	452230	452244	20 %	60 %	20 %	0 %	378706764
259	NC_016901	TTACC	2	10	452964	452973	20 %	40 %	0 %	40 %	378706765
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262	NC_016901	TATTG	2	10	454876	454885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016901	GATAG	2	10	456704	456713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_016901	TCGCG	2	10	458520	458529	0 %	20 %	40 %	40 %	378706769
265	NC_016901	ATCCA	2	10	458671	458680	40 %	20 %	0 %	40 %	378706769
266	NC_016901	ATCCC	2	10	459321	459330	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
267	NC_016901	ATCCA	2	10	459565	459574	40 %	20 %	0 %	40 %	378706770
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282	NC_016901	ATCCC	2	10	486920	486929	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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