MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 93072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016901	T	6	6	45	50	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016901	GAT	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016901	CAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706363
4	NC_016901	CAG	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706363
5	NC_016901	ATGG	2	8	170	177	25 %	25 %	50 %	0 %	378706363
6	NC_016901	GTC	2	6	312	317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706363
7	NC_016901	ACG	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706363
8	NC_016901	AGCCG	2	10	415	424	20 %	0 %	40 %	40 %	378706363
9	NC_016901	GGT	2	6	542	547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706363
10	NC_016901	ATT	2	6	559	564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706363
11	NC_016901	TTG	2	6	599	604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706363
12	NC_016901	AAT	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706363
13	NC_016901	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706363
14	NC_016901	TAC	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706363
15	NC_016901	GAT	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706363
16	NC_016901	T	6	6	773	778	0 %	100 %	0 %	0 %	378706363
17	NC_016901	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706363
18	NC_016901	TTC	2	6	806	811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706363
19	NC_016901	CTTG	2	8	826	833	0 %	50 %	25 %	25 %	378706363
20	NC_016901	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706363
21	NC_016901	TTGG	2	8	915	922	0 %	50 %	50 %	0 %	378706363
22	NC_016901	CCA	2	6	944	949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706363
23	NC_016901	AG	3	6	991	996	50 %	0 %	50 %	0 %	378706363
24	NC_016901	CTT	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706363
25	NC_016901	CGTG	2	8	1054	1061	0 %	25 %	50 %	25 %	378706363
26	NC_016901	GCC	2	6	1110	1115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706363
27	NC_016901	TAC	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706363
28	NC_016901	TGT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706363
29	NC_016901	CG	3	6	1267	1272	0 %	0 %	50 %	50 %	378706363
30	NC_016901	TAAC	2	8	1308	1315	50 %	25 %	0 %	25 %	378706363
31	NC_016901	TGG	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706363
32	NC_016901	CAC	2	6	1360	1365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706363
33	NC_016901	AG	3	6	1405	1410	50 %	0 %	50 %	0 %	378706363
34	NC_016901	AGA	2	6	1423	1428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706363
35	NC_016901	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706363
36	NC_016901	GT	3	6	1530	1535	0 %	50 %	50 %	0 %	378706364
37	NC_016901	CCT	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378706364
38	NC_016901	AAGT	2	8	1588	1595	50 %	25 %	25 %	0 %	378706364
39	NC_016901	TCAC	2	8	1598	1605	25 %	25 %	0 %	50 %	378706364
40	NC_016901	GAA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
41	NC_016901	TAC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706364
42	NC_016901	GCT	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706364
43	NC_016901	AAC	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706364
44	NC_016901	ATA	2	6	1762	1767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706364
45	NC_016901	TGC	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706364
46	NC_016901	AGA	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
47	NC_016901	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706364
48	NC_016901	GC	3	6	1982	1987	0 %	0 %	50 %	50 %	378706364
49	NC_016901	CGAC	2	8	1993	2000	25 %	0 %	25 %	50 %	378706364
50	NC_016901	AAGC	2	8	2271	2278	50 %	0 %	25 %	25 %	378706364
51	NC_016901	CGAA	2	8	2302	2309	50 %	0 %	25 %	25 %	378706364
52	NC_016901	GTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706364
53	NC_016901	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
54	NC_016901	ATC	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706364
55	NC_016901	ACA	2	6	2410	2415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706364
56	NC_016901	CAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706364
57	NC_016901	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706364
58	NC_016901	GAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
59	NC_016901	ATGT	2	8	2553	2560	25 %	50 %	25 %	0 %	378706364
60	NC_016901	GGC	2	6	2644	2649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016901	GCA	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016901	TAGCCT	2	12	2697	2708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016901	ATTT	2	8	2910	2917	25 %	75 %	0 %	0 %	378706365
64	NC_016901	CGTT	2	8	2931	2938	0 %	50 %	25 %	25 %	378706365
65	NC_016901	TAA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706365
66	NC_016901	CGA	3	9	2972	2980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706365
67	NC_016901	GTG	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706365
68	NC_016901	TCG	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706365
69	NC_016901	CG	3	6	3445	3450	0 %	0 %	50 %	50 %	378706365
70	NC_016901	ACT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706365
71	NC_016901	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706365
72	NC_016901	ACA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706365
73	NC_016901	GAT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706365
74	NC_016901	TCCG	2	8	3695	3702	0 %	25 %	25 %	50 %	378706365
75	NC_016901	CTG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706365
76	NC_016901	AC	3	6	3806	3811	50 %	0 %	0 %	50 %	378706365
77	NC_016901	GA	3	6	3872	3877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016901	ATA	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706366
79	NC_016901	TTC	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706366
80	NC_016901	CGA	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
81	NC_016901	CAT	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706366
82	NC_016901	AGT	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706366
83	NC_016901	GAA	2	6	4138	4143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706366
84	NC_016901	GCA	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
85	NC_016901	CGG	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
86	NC_016901	CGA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
87	NC_016901	TCG	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
88	NC_016901	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706366
89	NC_016901	ACA	2	6	4511	4516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706366
90	NC_016901	GAAT	2	8	4518	4525	50 %	25 %	25 %	0 %	378706366
91	NC_016901	ATT	2	6	4562	4567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706366
92	NC_016901	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706366
93	NC_016901	CAA	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706366
94	NC_016901	CAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706366
95	NC_016901	TGG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706366
96	NC_016901	CGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
97	NC_016901	AGTGA	2	10	4912	4921	40 %	20 %	40 %	0 %	378706366
98	NC_016901	TTG	2	6	4997	5002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
99	NC_016901	GCCCGT	2	12	5020	5031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378706366
100	NC_016901	GCG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
101	NC_016901	CGT	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
102	NC_016901	GGT	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706366
103	NC_016901	CTG	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
104	NC_016901	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
105	NC_016901	AAG	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706366
106	NC_016901	CGA	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
107	NC_016901	CAT	4	12	5361	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706366
108	NC_016901	CTT	3	9	5421	5429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706366
109	NC_016901	ATTG	2	8	5445	5452	25 %	50 %	25 %	0 %	378706366
110	NC_016901	CCA	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706366
111	NC_016901	GCAA	2	8	5504	5511	50 %	0 %	25 %	25 %	378706366
112	NC_016901	ACCCA	2	10	5585	5594	40 %	0 %	0 %	60 %	378706366
113	NC_016901	TTG	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
114	NC_016901	AGC	2	6	5678	5683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
115	NC_016901	ACC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706366
116	NC_016901	TGG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706366
117	NC_016901	AGC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
118	NC_016901	CTG	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
119	NC_016901	ACTA	2	8	5902	5909	50 %	25 %	0 %	25 %	378706366
120	NC_016901	CTT	2	6	5925	5930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706366
121	NC_016901	GCG	2	6	5968	5973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
122	NC_016901	GGC	2	6	5995	6000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
123	NC_016901	AAG	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706366
124	NC_016901	TGA	2	6	6186	6191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706366
125	NC_016901	GTT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
126	NC_016901	TCG	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
127	NC_016901	TCT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706367
128	NC_016901	CAA	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706367
129	NC_016901	TGC	2	6	6507	6512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706367
130	NC_016901	CAT	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706367
131	NC_016901	CG	3	6	6725	6730	0 %	0 %	50 %	50 %	378706367
132	NC_016901	GCA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706367
133	NC_016901	AGT	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706367
134	NC_016901	TTGT	2	8	7075	7082	0 %	75 %	25 %	0 %	378706367
135	NC_016901	CTA	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016901	TTCG	2	8	7266	7273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016901	TCG	2	6	7281	7286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016901	TGA	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016901	TAA	2	6	7390	7395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706368
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169	NC_016901	GAT	2	6	9635	9640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_016901	TA	4	8	10814	10821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_016901	CTT	2	6	15106	15111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_016901	TA	3	6	15129	15134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_016901	AGC	2	6	21931	21936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706381
396	NC_016901	TGGC	2	8	22008	22015	0 %	25 %	50 %	25 %	378706381
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402	NC_016901	GCA	2	6	22334	22339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706381
403	NC_016901	CAT	2	6	22429	22434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706381
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410	NC_016901	CA	3	6	22696	22701	50 %	0 %	0 %	50 %	378706381
411	NC_016901	GCA	2	6	22749	22754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706381
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424	NC_016901	TGA	2	6	23391	23396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706382
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426	NC_016901	GAA	2	6	23549	23554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706382
427	NC_016901	AAC	2	6	23570	23575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706382
428	NC_016901	TTC	2	6	23627	23632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706382
429	NC_016901	CTT	2	6	23717	23722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706382
430	NC_016901	TTGA	2	8	23742	23749	25 %	50 %	25 %	0 %	378706382
431	NC_016901	TCAC	2	8	23784	23791	25 %	25 %	0 %	50 %	378706382
432	NC_016901	CAA	2	6	23839	23844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706382
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434	NC_016901	T	6	6	23923	23928	0 %	100 %	0 %	0 %	378706382
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450	NC_016901	GCC	2	6	24692	24697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706382
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453	NC_016901	CTTG	2	8	24898	24905	0 %	50 %	25 %	25 %	378706382
454	NC_016901	CGAG	2	8	24925	24932	25 %	0 %	50 %	25 %	378706382
455	NC_016901	TTGC	2	8	25042	25049	0 %	50 %	25 %	25 %	378706382
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457	NC_016901	CT	3	6	25102	25107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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461	NC_016901	ACA	2	6	25175	25180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_016901	TGT	2	6	25453	25458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_016901	AGATTA	2	12	25467	25478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
464	NC_016901	ATT	2	6	25499	25504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_016901	TCA	2	6	25547	25552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706383
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488	NC_016901	GAA	2	6	26925	26930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706384
489	NC_016901	ATT	2	6	27037	27042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706384
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497	NC_016901	TG	3	6	27439	27444	0 %	50 %	50 %	0 %	378706384
498	NC_016901	TCAG	2	8	27460	27467	25 %	25 %	25 %	25 %	378706384
499	NC_016901	ATA	2	6	27590	27595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706385
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