MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 93072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016901	CAT	2	6	169584	169589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706508
3002	NC_016901	CCG	2	6	169607	169612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706508
3003	NC_016901	TGA	3	9	169614	169622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706508
3004	NC_016901	CTG	2	6	169653	169658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706508
3005	NC_016901	TTG	2	6	169664	169669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706508
3006	NC_016901	ATT	2	6	169753	169758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706508
3007	NC_016901	TTG	2	6	169796	169801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706508
3008	NC_016901	TGT	2	6	169830	169835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706508
3009	NC_016901	CGA	2	6	169866	169871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706508
3010	NC_016901	CTGC	2	8	169913	169920	0 %	25 %	25 %	50 %	378706508
3011	NC_016901	GTT	2	6	169974	169979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706508
3012	NC_016901	GCG	2	6	170003	170008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706508
3013	NC_016901	TAA	2	6	170016	170021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706508
3014	NC_016901	GTC	2	6	170145	170150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016901	TG	3	6	170239	170244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016901	TTA	2	6	170296	170301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016901	A	6	6	170351	170356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016901	AAG	2	6	170369	170374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016901	ATT	2	6	170387	170392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706509
3020	NC_016901	ACG	2	6	170395	170400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706509
3021	NC_016901	GC	3	6	170419	170424	0 %	0 %	50 %	50 %	378706509
3022	NC_016901	TGAGC	2	10	170499	170508	20 %	20 %	40 %	20 %	378706509
3023	NC_016901	TGC	2	6	170534	170539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706509
3024	NC_016901	GC	3	6	170578	170583	0 %	0 %	50 %	50 %	378706509
3025	NC_016901	TGA	2	6	170628	170633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706509
3026	NC_016901	GCA	2	6	170649	170654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706509
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3028	NC_016901	TG	3	6	170751	170756	0 %	50 %	50 %	0 %	378706509
3029	NC_016901	GTT	2	6	170788	170793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706509
3030	NC_016901	CGG	2	6	170808	170813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706509
3031	NC_016901	TGA	2	6	170928	170933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706509
3032	NC_016901	CA	3	6	170957	170962	50 %	0 %	0 %	50 %	378706509
3033	NC_016901	TTC	2	6	171013	171018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706509
3034	NC_016901	AC	3	6	171091	171096	50 %	0 %	0 %	50 %	378706509
3035	NC_016901	GTA	2	6	171218	171223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706510
3036	NC_016901	CGG	2	6	171265	171270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706510
3037	NC_016901	ATC	2	6	171320	171325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706510
3038	NC_016901	GCC	2	6	171339	171344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706510
3039	NC_016901	GCA	2	6	171412	171417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706510
3040	NC_016901	CAG	2	6	171440	171445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706510
3041	NC_016901	GTG	2	6	171507	171512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706510
3042	NC_016901	ATCA	2	8	171665	171672	50 %	25 %	0 %	25 %	378706510
3043	NC_016901	CAC	2	6	171788	171793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706510
3044	NC_016901	GTG	2	6	171862	171867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706510
3045	NC_016901	TCT	2	6	171912	171917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706510
3046	NC_016901	TCAA	2	8	172029	172036	50 %	25 %	0 %	25 %	378706510
3047	NC_016901	GC	3	6	172052	172057	0 %	0 %	50 %	50 %	378706510
3048	NC_016901	CTGG	2	8	172221	172228	0 %	25 %	50 %	25 %	378706510
3049	NC_016901	GC	3	6	172335	172340	0 %	0 %	50 %	50 %	378706510
3050	NC_016901	TGC	2	6	172347	172352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706510
3051	NC_016901	ATT	2	6	172397	172402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706510
3052	NC_016901	CGC	2	6	172459	172464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706510
3053	NC_016901	CAG	2	6	172520	172525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706510
3054	NC_016901	AGC	2	6	172557	172562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706510
3055	NC_016901	CTG	2	6	172671	172676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706510
3056	NC_016901	ACT	2	6	172805	172810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706510
3057	NC_016901	CGG	2	6	172886	172891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706510
3058	NC_016901	GCTC	2	8	172920	172927	0 %	25 %	25 %	50 %	378706510
3059	NC_016901	GTG	2	6	172956	172961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706510
3060	NC_016901	AGGC	2	8	173187	173194	25 %	0 %	50 %	25 %	378706510
3061	NC_016901	AT	3	6	173239	173244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016901	TTA	2	6	173252	173257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016901	GCT	2	6	173406	173411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706511
3064	NC_016901	ATAA	2	8	173476	173483	75 %	25 %	0 %	0 %	378706511
3065	NC_016901	GTT	2	6	173552	173557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706511
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3067	NC_016901	GTT	2	6	173673	173678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706511
3068	NC_016901	TCT	2	6	173735	173740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706511
3069	NC_016901	ACA	2	6	173811	173816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706511
3070	NC_016901	T	6	6	173827	173832	0 %	100 %	0 %	0 %	378706511
3071	NC_016901	CTT	2	6	173869	173874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706511
3072	NC_016901	TGAG	2	8	173987	173994	25 %	25 %	50 %	0 %	378706511
3073	NC_016901	AG	3	6	174067	174072	50 %	0 %	50 %	0 %	378706511
3074	NC_016901	TAT	2	6	174130	174135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706511
3075	NC_016901	CAG	2	6	174214	174219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706511
3076	NC_016901	CGC	2	6	174321	174326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706511
3077	NC_016901	TCA	2	6	174342	174347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706511
3078	NC_016901	TGA	2	6	174348	174353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706511
3079	NC_016901	CAA	2	6	174354	174359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706511
3080	NC_016901	GCG	3	9	174384	174392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706511
3081	NC_016901	CGA	2	6	174417	174422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706511
3082	NC_016901	GATA	2	8	174468	174475	50 %	25 %	25 %	0 %	378706511
3083	NC_016901	AGAA	2	8	174601	174608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016901	GA	3	6	174655	174660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016901	ATTGG	2	10	174685	174694	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016901	GT	3	6	174705	174710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016901	GCA	2	6	174733	174738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_016901	A	6	6	174744	174749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016901	AACTTC	2	12	174839	174850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706512
3090	NC_016901	GTGCG	2	10	174901	174910	0 %	20 %	60 %	20 %	378706512
3091	NC_016901	ACAGC	2	10	174979	174988	40 %	0 %	20 %	40 %	378706512
3092	NC_016901	AAGA	2	8	174996	175003	75 %	0 %	25 %	0 %	378706512
3093	NC_016901	GAA	2	6	175103	175108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706512
3094	NC_016901	ATA	2	6	175124	175129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706512
3095	NC_016901	GCA	2	6	175168	175173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706512
3096	NC_016901	TTC	2	6	175281	175286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706512
3097	NC_016901	GC	3	6	175304	175309	0 %	0 %	50 %	50 %	378706512
3098	NC_016901	CAC	2	6	175331	175336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706512
3099	NC_016901	GAA	2	6	175343	175348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706512
3100	NC_016901	ATC	2	6	175476	175481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706512
3101	NC_016901	ATC	2	6	175491	175496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706512
3102	NC_016901	CA	3	6	175497	175502	50 %	0 %	0 %	50 %	378706512
3103	NC_016901	CGA	2	6	175510	175515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706512
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3105	NC_016901	TTGG	2	8	175641	175648	0 %	50 %	50 %	0 %	378706512
3106	NC_016901	GCT	2	6	175721	175726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706512
3107	NC_016901	AAG	2	6	175815	175820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706512
3108	NC_016901	CCG	2	6	175846	175851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706512
3109	NC_016901	TGA	2	6	175882	175887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706512
3110	NC_016901	GTG	2	6	175948	175953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706512
3111	NC_016901	GC	3	6	175993	175998	0 %	0 %	50 %	50 %	378706512
3112	NC_016901	TAA	2	6	176039	176044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706512
3113	NC_016901	GCA	2	6	176083	176088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_016901	T	7	7	176177	176183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016901	AAT	2	6	176283	176288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016901	TTTA	2	8	176321	176328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016901	TGA	2	6	176353	176358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_016901	TA	3	6	176391	176396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016901	CCA	2	6	176413	176418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_016901	ATG	2	6	176436	176441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016901	TCCA	2	8	176462	176469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_016901	GCA	2	6	176507	176512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_016901	T	6	6	176602	176607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016901	CGA	2	6	176876	176881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706513
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3247	NC_016901	CTGA	2	8	183867	183874	25 %	25 %	25 %	25 %	378706518
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3249	NC_016901	TGA	2	6	184024	184029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706518
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3251	NC_016901	ATC	2	6	184175	184180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706518
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3336	NC_016901	ATA	2	6	188996	189001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3337	NC_016901	GACTGG	2	12	189027	189038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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3362	NC_016901	TGGA	2	8	190570	190577	25 %	25 %	50 %	0 %	378706526
3363	NC_016901	TTG	2	6	190597	190602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706526
3364	NC_016901	TGAG	2	8	190610	190617	25 %	25 %	50 %	0 %	378706526
3365	NC_016901	A	6	6	190627	190632	100 %	0 %	0 %	0 %	378706526
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3367	NC_016901	TCA	2	6	190750	190755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706527
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3490	NC_016901	GTA	2	6	198559	198564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3491	NC_016901	AAC	2	6	198684	198689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706534
3492	NC_016901	ACCTTG	2	12	198693	198704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378706534
3493	NC_016901	GTG	2	6	198855	198860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706534
3494	NC_016901	AGTGGT	2	12	198927	198938	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378706534
3495	NC_016901	GCC	2	6	199002	199007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706534
3496	NC_016901	CTA	2	6	199051	199056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706534
3497	NC_016901	AAT	2	6	199107	199112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706534
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3499	NC_016901	GAT	2	6	199242	199247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
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