MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 93072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_016901	TGT	2	6	5284460	5284465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710831
93002	NC_016901	GAC	2	6	5284540	5284545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710831
93003	NC_016901	CAC	2	6	5284553	5284558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710831
93004	NC_016901	CTTG	2	8	5284585	5284592	0 %	50 %	25 %	25 %	378710831
93005	NC_016901	GAT	2	6	5284622	5284627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710831
93006	NC_016901	CTT	2	6	5284672	5284677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710831
93007	NC_016901	CCA	2	6	5284732	5284737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710831
93008	NC_016901	TGG	2	6	5284804	5284809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710831
93009	NC_016901	GCC	2	6	5284955	5284960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710831
93010	NC_016901	A	6	6	5285012	5285017	100 %	0 %	0 %	0 %	378710831
93011	NC_016901	AAT	2	6	5285068	5285073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378710831
93012	NC_016901	ATG	2	6	5285148	5285153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710831
93013	NC_016901	CGC	2	6	5285158	5285163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710831
93014	NC_016901	CCA	2	6	5285218	5285223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93015	NC_016901	CTA	2	6	5285233	5285238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93016	NC_016901	GGC	2	6	5285256	5285261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93017	NC_016901	GCC	2	6	5285269	5285274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93018	NC_016901	T	6	6	5285349	5285354	0 %	100 %	0 %	0 %	378710832
93019	NC_016901	ATAA	2	8	5285367	5285374	75 %	25 %	0 %	0 %	378710832
93020	NC_016901	TCT	2	6	5285375	5285380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710832
93021	NC_016901	CAGTA	2	10	5285413	5285422	40 %	20 %	20 %	20 %	378710832
93022	NC_016901	GAA	2	6	5285445	5285450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710832
93023	NC_016901	CAT	2	6	5285478	5285483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710832
93024	NC_016901	TCT	2	6	5285525	5285530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710832
93025	NC_016901	GTA	2	6	5285571	5285576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710832
93026	NC_016901	ATA	2	6	5285686	5285691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378710832
93027	NC_016901	TCTT	2	8	5285722	5285729	0 %	75 %	0 %	25 %	378710832
93028	NC_016901	CAT	2	6	5285739	5285744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710832
93029	NC_016901	TCA	2	6	5285767	5285772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710832
93030	NC_016901	AGTC	2	8	5285789	5285796	25 %	25 %	25 %	25 %	378710832
93031	NC_016901	AAT	2	6	5285889	5285894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378710832
93032	NC_016901	CGA	2	6	5285912	5285917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710832
93033	NC_016901	TGAT	2	8	5285919	5285926	25 %	50 %	25 %	0 %	378710832
93034	NC_016901	ACC	2	6	5285960	5285965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710832
93035	NC_016901	CCGCG	2	10	5286092	5286101	0 %	0 %	40 %	60 %	378710832
93036	NC_016901	CCGC	2	8	5286121	5286128	0 %	0 %	25 %	75 %	378710832
93037	NC_016901	TGG	2	6	5286165	5286170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710832
93038	NC_016901	TGT	2	6	5286193	5286198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710832
93039	NC_016901	TCA	2	6	5286253	5286258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710832
93040	NC_016901	CAC	3	9	5286299	5286307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710832
93041	NC_016901	GGTA	2	8	5286308	5286315	25 %	25 %	50 %	0 %	378710832
93042	NC_016901	TGC	2	6	5286326	5286331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710832
93043	NC_016901	GTTT	2	8	5286349	5286356	0 %	75 %	25 %	0 %	378710832
93044	NC_016901	GTT	2	6	5286399	5286404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710832
93045	NC_016901	TA	3	6	5286615	5286620	50 %	50 %	0 %	0 %	378710832
93046	NC_016901	TG	3	6	5286680	5286685	0 %	50 %	50 %	0 %	378710832
93047	NC_016901	GCA	2	6	5286694	5286699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710832
93048	NC_016901	CTG	2	6	5286782	5286787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710832
93049	NC_016901	TG	3	6	5286824	5286829	0 %	50 %	50 %	0 %	378710832
93050	NC_016901	AGT	2	6	5286925	5286930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710832
93051	NC_016901	AT	3	6	5286941	5286946	50 %	50 %	0 %	0 %	378710832
93052	NC_016901	TATT	2	8	5286967	5286974	25 %	75 %	0 %	0 %	378710833
93053	NC_016901	G	6	6	5286991	5286996	0 %	0 %	100 %	0 %	378710833
93054	NC_016901	CCG	2	6	5287009	5287014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710833
93055	NC_016901	CAA	2	6	5287057	5287062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710833
93056	NC_016901	GCG	2	6	5287199	5287204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710833
93057	NC_016901	TTG	2	6	5287236	5287241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710834
93058	NC_016901	TTTCCA	2	12	5287252	5287263	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378710834
93059	NC_016901	CAA	2	6	5287285	5287290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710834
93060	NC_016901	TGT	2	6	5287413	5287418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710834
93061	NC_016901	CAG	2	6	5287450	5287455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710834
93062	NC_016901	TTA	2	6	5287556	5287561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378710835
93063	NC_016901	ACG	3	9	5287589	5287597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710835
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93065	NC_016901	ATG	2	6	5287695	5287700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710835
93066	NC_016901	A	6	6	5287759	5287764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93067	NC_016901	CAA	2	6	5287799	5287804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93068	NC_016901	AGTA	2	8	5287809	5287816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93069	NC_016901	TAG	2	6	5287904	5287909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93070	NC_016901	TAA	2	6	5287967	5287972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93071	NC_016901	TGA	2	6	5288020	5288025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93072	NC_016901	CA	3	6	5288037	5288042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.