MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 93072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016901	TGA	2	6	283430	283435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706611
5003	NC_016901	CTT	2	6	283457	283462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706611
5004	NC_016901	GC	3	6	283488	283493	0 %	0 %	50 %	50 %	378706611
5005	NC_016901	CAG	2	6	283518	283523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706611
5006	NC_016901	CGA	2	6	283622	283627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706611
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5008	NC_016901	TGA	2	6	283686	283691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706611
5009	NC_016901	TGG	2	6	283785	283790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016901	GC	3	6	283800	283805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_016901	CCG	2	6	283918	283923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706612
5012	NC_016901	TCA	2	6	283936	283941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706612
5013	NC_016901	T	6	6	283965	283970	0 %	100 %	0 %	0 %	378706612
5014	NC_016901	TAT	2	6	283984	283989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706612
5015	NC_016901	TGG	2	6	284059	284064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706612
5016	NC_016901	GC	3	6	284085	284090	0 %	0 %	50 %	50 %	378706612
5017	NC_016901	GCA	2	6	284127	284132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706612
5018	NC_016901	A	6	6	284132	284137	100 %	0 %	0 %	0 %	378706612
5019	NC_016901	TGGC	2	8	284175	284182	0 %	25 %	50 %	25 %	378706612
5020	NC_016901	GCC	2	6	284362	284367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706612
5021	NC_016901	TG	3	6	284405	284410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016901	CTT	2	6	284624	284629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706613
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5024	NC_016901	TGA	2	6	284670	284675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706613
5025	NC_016901	CGA	2	6	284693	284698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706613
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5036	NC_016901	GGCTG	2	10	285354	285363	0 %	20 %	60 %	20 %	378706614
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5043	NC_016901	GC	3	6	285723	285728	0 %	0 %	50 %	50 %	378706614
5044	NC_016901	CCA	2	6	285752	285757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706614
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5046	NC_016901	GT	3	6	285907	285912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016901	TAA	2	6	285932	285937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016901	TG	3	6	285940	285945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016901	CGA	2	6	285984	285989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5052	NC_016901	TGC	2	6	286118	286123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706615
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5060	NC_016901	ATTT	2	8	286785	286792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016901	AAAG	2	8	286810	286817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016901	TTAT	2	8	286834	286841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016901	GCA	2	6	286853	286858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_016901	TA	3	6	288606	288611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_016901	ATG	2	6	288749	288754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016901	GA	3	6	288797	288802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016901	GT	3	6	288804	288809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016901	GCAGC	2	10	288937	288946	20 %	0 %	40 %	40 %	378706617
5100	NC_016901	CAAG	2	8	289255	289262	50 %	0 %	25 %	25 %	378706617
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5104	NC_016901	AGC	2	6	289380	289385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706617
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5113	NC_016901	GC	3	6	289786	289791	0 %	0 %	50 %	50 %	378706617
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5125	NC_016901	GCA	2	6	290467	290472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706617
5126	NC_016901	AC	3	6	290547	290552	50 %	0 %	0 %	50 %	378706617
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5130	NC_016901	TCG	2	6	290809	290814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706617
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5132	NC_016901	TTG	2	6	290987	290992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_016901	GCAG	2	8	291081	291088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5154	NC_016901	AGCA	2	8	292466	292473	50 %	0 %	25 %	25 %	378706618
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5247	NC_016901	GCA	2	6	298185	298190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706625
5248	NC_016901	A	6	6	298240	298245	100 %	0 %	0 %	0 %	378706625
5249	NC_016901	GAT	2	6	298329	298334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706625
5250	NC_016901	GAT	2	6	298342	298347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706625
5251	NC_016901	GCA	2	6	298349	298354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706625
5252	NC_016901	GCG	2	6	298361	298366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706625
5253	NC_016901	TAT	2	6	298378	298383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706625
5254	NC_016901	CAAA	2	8	298440	298447	75 %	0 %	0 %	25 %	378706625
5255	NC_016901	GCT	2	6	298483	298488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706625
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5257	NC_016901	CGG	2	6	298666	298671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706626
5258	NC_016901	GCA	2	6	298774	298779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706626
5259	NC_016901	CG	3	6	298790	298795	0 %	0 %	50 %	50 %	378706626
5260	NC_016901	ATCGAT	2	12	298835	298846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378706626
5261	NC_016901	CGG	2	6	299029	299034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706626
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5263	NC_016901	T	6	6	299045	299050	0 %	100 %	0 %	0 %	378706626
5264	NC_016901	GGGCGA	2	12	299053	299064	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378706626
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5271	NC_016901	ATTGA	2	10	299444	299453	40 %	40 %	20 %	0 %	378706626
5272	NC_016901	GTT	2	6	299497	299502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706626
5273	NC_016901	TTC	2	6	299504	299509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706626
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5277	NC_016901	GTG	2	6	299722	299727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706626
5278	NC_016901	GCA	2	6	299746	299751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706626
5279	NC_016901	GACC	2	8	299761	299768	25 %	0 %	25 %	50 %	378706626
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5282	NC_016901	GCC	2	6	299898	299903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706627
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5284	NC_016901	T	6	6	299977	299982	0 %	100 %	0 %	0 %	378706627
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5292	NC_016901	ATC	2	6	300247	300252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706627
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5295	NC_016901	CGC	2	6	300291	300296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706627
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5297	NC_016901	AGATC	2	10	300390	300399	40 %	20 %	20 %	20 %	378706627
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5300	NC_016901	GTC	2	6	300775	300780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5348	NC_016901	TAAT	2	8	303551	303558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5350	NC_016901	AT	3	6	303596	303601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5351	NC_016901	TGA	2	6	303615	303620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5352	NC_016901	TAA	2	6	303622	303627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_016901	TAA	2	6	303648	303653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_016901	TTATT	2	10	303656	303665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5359	NC_016901	TCAG	2	8	303856	303863	25 %	25 %	25 %	25 %	378706632
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5368	NC_016901	GC	3	6	304726	304731	0 %	0 %	50 %	50 %	378706632
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5370	NC_016901	ACTG	2	8	304803	304810	25 %	25 %	25 %	25 %	378706632
5371	NC_016901	CGG	3	9	304970	304978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706632
5372	NC_016901	TCG	2	6	305047	305052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706632
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5481	NC_016901	TGGCT	2	10	311232	311241	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5487	NC_016901	ATTG	2	8	311463	311470	25 %	50 %	25 %	0 %	378706640
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5491	NC_016901	A	6	6	311648	311653	100 %	0 %	0 %	0 %	378706640
5492	NC_016901	TGA	2	6	311676	311681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706640
5493	NC_016901	TCA	2	6	311726	311731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706640
5494	NC_016901	CCG	2	6	311759	311764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706640
5495	NC_016901	CAA	2	6	311835	311840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706640
5496	NC_016901	TGC	2	6	311867	311872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706640
5497	NC_016901	GCA	2	6	311911	311916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706640
5498	NC_016901	ATTCA	2	10	311932	311941	40 %	40 %	0 %	20 %	378706640
5499	NC_016901	GTG	2	6	311956	311961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706640
5500	NC_016901	AAT	2	6	312052	312057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706640

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