MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 plasmid unnamed

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016888	CGGA	2	8	568	575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016888	CCCG	2	8	593	600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016888	CCGA	2	8	937	944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016888	TCGG	2	8	1712	1719	0 %	25 %	50 %	25 %	379009186
5	NC_016888	ACCA	2	8	1900	1907	50 %	0 %	0 %	50 %	379009186
6	NC_016888	GACG	2	8	2172	2179	25 %	0 %	50 %	25 %	379009186
7	NC_016888	CGGT	2	8	2217	2224	0 %	25 %	50 %	25 %	379009186
8	NC_016888	CGGA	2	8	2445	2452	25 %	0 %	50 %	25 %	379009186
9	NC_016888	CCGT	2	8	2959	2966	0 %	25 %	25 %	50 %	379009187
10	NC_016888	TGAT	2	8	3229	3236	25 %	50 %	25 %	0 %	379009187
11	NC_016888	GGCA	2	8	3375	3382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016888	CTGG	2	8	3727	3734	0 %	25 %	50 %	25 %	379009188
13	NC_016888	TTGG	2	8	4417	4424	0 %	50 %	50 %	0 %	379009189
14	NC_016888	GACC	2	8	4435	4442	25 %	0 %	25 %	50 %	379009189
15	NC_016888	GCAT	2	8	5411	5418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016888	CGTC	2	8	5940	5947	0 %	25 %	25 %	50 %	379009193
17	NC_016888	GCTC	2	8	6569	6576	0 %	25 %	25 %	50 %	379009193
18	NC_016888	GCGG	2	8	7934	7941	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016888	GGCC	2	8	8379	8386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016888	GCCG	2	8	8856	8863	0 %	0 %	50 %	50 %	379009194
21	NC_016888	CGGC	2	8	8865	8872	0 %	0 %	50 %	50 %	379009194
22	NC_016888	TCCT	2	8	8991	8998	0 %	50 %	0 %	50 %	379009194
23	NC_016888	ATGA	2	8	9396	9403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016888	CCAC	2	8	9574	9581	25 %	0 %	0 %	75 %	379009195
25	NC_016888	GGCG	2	8	10166	10173	0 %	0 %	75 %	25 %	379009196
26	NC_016888	CCAG	2	8	10196	10203	25 %	0 %	25 %	50 %	379009196
27	NC_016888	GGCC	2	8	10637	10644	0 %	0 %	50 %	50 %	379009196
28	NC_016888	ATGA	2	8	10647	10654	50 %	25 %	25 %	0 %	379009196
29	NC_016888	ACTC	2	8	10999	11006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016888	TCGC	2	8	11117	11124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016888	GAAA	2	8	11508	11515	75 %	0 %	25 %	0 %	379009197
32	NC_016888	CTGG	2	8	11694	11701	0 %	25 %	50 %	25 %	379009197
33	NC_016888	CAGA	2	8	12451	12458	50 %	0 %	25 %	25 %	379009197
34	NC_016888	ATCC	2	8	14213	14220	25 %	25 %	0 %	50 %	379009199
35	NC_016888	TCCG	2	8	14570	14577	0 %	25 %	25 %	50 %	379009199
36	NC_016888	GGCG	2	8	15528	15535	0 %	0 %	75 %	25 %	379009200
37	NC_016888	GAAC	2	8	16208	16215	50 %	0 %	25 %	25 %	379009200
38	NC_016888	TCCA	2	8	16618	16625	25 %	25 %	0 %	50 %	379009200
39	NC_016888	TTTC	2	8	16742	16749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016888	GGTA	2	8	16754	16761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016888	CGAA	2	8	17167	17174	50 %	0 %	25 %	25 %	379009201
42	NC_016888	CGGT	2	8	17392	17399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016888	ATGA	2	8	17564	17571	50 %	25 %	25 %	0 %	379009202
44	NC_016888	CTGG	2	8	17641	17648	0 %	25 %	50 %	25 %	379009202
45	NC_016888	CCCA	2	8	18234	18241	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_016888	GCCG	2	8	18765	18772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016888	GTCC	2	8	18914	18921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016888	CACC	2	8	19691	19698	25 %	0 %	0 %	75 %	379009203
49	NC_016888	GTTG	2	8	21462	21469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016888	CACC	2	8	21479	21486	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_016888	TGGG	2	8	21881	21888	0 %	25 %	75 %	0 %	379009206
52	NC_016888	CGGT	2	8	22578	22585	0 %	25 %	50 %	25 %	379009207
53	NC_016888	TGGC	2	8	22775	22782	0 %	25 %	50 %	25 %	379009207
54	NC_016888	GAAA	2	8	22884	22891	75 %	0 %	25 %	0 %	379009208
55	NC_016888	TGCA	2	8	23282	23289	25 %	25 %	25 %	25 %	379009210
56	NC_016888	TGGT	2	8	24290	24297	0 %	50 %	50 %	0 %	379009211
57	NC_016888	GCAC	2	8	24366	24373	25 %	0 %	25 %	50 %	379009211
58	NC_016888	ACGG	2	8	24534	24541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016888	GGGA	2	8	24770	24777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016888	TAGA	2	8	25076	25083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016888	GATC	2	8	25201	25208	25 %	25 %	25 %	25 %	379009212
62	NC_016888	GATG	2	8	25585	25592	25 %	25 %	50 %	0 %	379009212
63	NC_016888	GAAC	2	8	25718	25725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016888	GCTT	2	8	25775	25782	0 %	50 %	25 %	25 %	379009213
65	NC_016888	TCGG	2	8	25952	25959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016888	TGTC	2	8	26599	26606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016888	GTCT	2	8	27436	27443	0 %	50 %	25 %	25 %	379009215
68	NC_016888	GCGT	2	8	28699	28706	0 %	25 %	50 %	25 %	379009215
69	NC_016888	CGCC	2	8	28956	28963	0 %	0 %	25 %	75 %	379009215
70	NC_016888	TTGG	2	8	29175	29182	0 %	50 %	50 %	0 %	379009216
71	NC_016888	TCAT	2	8	29328	29335	25 %	50 %	0 %	25 %	379009216
72	NC_016888	TGGC	2	8	29375	29382	0 %	25 %	50 %	25 %	379009216
73	NC_016888	TCCA	2	8	29546	29553	25 %	25 %	0 %	50 %	379009216
74	NC_016888	TCGG	2	8	30158	30165	0 %	25 %	50 %	25 %	379009217
75	NC_016888	TCAT	2	8	30250	30257	25 %	50 %	0 %	25 %	379009217
76	NC_016888	CCGG	2	8	30372	30379	0 %	0 %	50 %	50 %	379009217
77	NC_016888	GCAG	2	8	30834	30841	25 %	0 %	50 %	25 %	379009218
78	NC_016888	ACGG	2	8	31551	31558	25 %	0 %	50 %	25 %	379009219
79	NC_016888	GGTG	2	8	32170	32177	0 %	25 %	75 %	0 %	379009220
80	NC_016888	GTCG	2	8	32288	32295	0 %	25 %	50 %	25 %	379009220
81	NC_016888	GGAG	2	8	32468	32475	25 %	0 %	75 %	0 %	379009220
82	NC_016888	GCCA	2	8	32624	32631	25 %	0 %	25 %	50 %	379009220
83	NC_016888	GAAG	2	8	32909	32916	50 %	0 %	50 %	0 %	379009221
84	NC_016888	ATCT	2	8	33560	33567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016888	TGCC	2	8	33805	33812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016888	GTTC	2	8	35186	35193	0 %	50 %	25 %	25 %	379009224
87	NC_016888	GACA	2	8	35199	35206	50 %	0 %	25 %	25 %	379009224
88	NC_016888	CGAT	2	8	35799	35806	25 %	25 %	25 %	25 %	379009225
89	NC_016888	ACCG	2	8	36014	36021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016888	GACA	2	8	36192	36199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016888	ATAC	2	8	36211	36218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016888	GGCC	2	8	36764	36771	0 %	0 %	50 %	50 %	379009226
93	NC_016888	ATGC	2	8	37221	37228	25 %	25 %	25 %	25 %	379009226
94	NC_016888	ACCA	2	8	38138	38145	50 %	0 %	0 %	50 %	379009227
95	NC_016888	GGTT	2	8	39435	39442	0 %	50 %	50 %	0 %	379009229
96	NC_016888	AAAG	2	8	39830	39837	75 %	0 %	25 %	0 %	379009229
97	NC_016888	GTTT	2	8	40133	40140	0 %	75 %	25 %	0 %	379009230
98	NC_016888	CTAT	2	8	40283	40290	25 %	50 %	0 %	25 %	379009230
99	NC_016888	CGGT	2	8	40927	40934	0 %	25 %	50 %	25 %	379009230
100	NC_016888	AAAG	2	8	41290	41297	75 %	0 %	25 %	0 %	379009231
101	NC_016888	CCGG	2	8	41356	41363	0 %	0 %	50 %	50 %	379009231
102	NC_016888	GAGG	2	8	41992	41999	25 %	0 %	75 %	0 %	379009231
103	NC_016888	CATT	2	8	45226	45233	25 %	50 %	0 %	25 %	379009236
104	NC_016888	TGCG	2	8	45749	45756	0 %	25 %	50 %	25 %	379009236
105	NC_016888	GCGA	2	8	46646	46653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016888	AGGG	2	8	47140	47147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016888	GGGA	2	8	47290	47297	25 %	0 %	75 %	0 %	379009237
108	NC_016888	CGGG	2	8	47582	47589	0 %	0 %	75 %	25 %	379009238
109	NC_016888	ATGC	2	8	47886	47893	25 %	25 %	25 %	25 %	379009238
110	NC_016888	TCGT	2	8	48824	48831	0 %	50 %	25 %	25 %	379009238
111	NC_016888	CTCA	2	8	49014	49021	25 %	25 %	0 %	50 %	379009238
112	NC_016888	GTGG	2	8	49062	49069	0 %	25 %	75 %	0 %	379009238
113	NC_016888	ATCG	2	8	49686	49693	25 %	25 %	25 %	25 %	379009238
114	NC_016888	CTCA	2	8	49795	49802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016888	GAAT	2	8	49854	49861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016888	CCCA	2	8	50183	50190	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_016888	CCGA	2	8	50664	50671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016888	GTCC	2	8	50838	50845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016888	GCGG	2	8	51808	51815	0 %	0 %	75 %	25 %	379009239
120	NC_016888	GCCA	2	8	53182	53189	25 %	0 %	25 %	50 %	379009240
121	NC_016888	GGTC	2	8	53594	53601	0 %	25 %	50 %	25 %	379009240
122	NC_016888	TCGA	2	8	54063	54070	25 %	25 %	25 %	25 %	379009240
123	NC_016888	CGAT	2	8	54379	54386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016888	TCCA	2	8	54468	54475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016888	ACTA	2	8	54553	54560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016888	TTTC	2	8	54782	54789	0 %	75 %	0 %	25 %	379009241
127	NC_016888	TGGG	2	8	55222	55229	0 %	25 %	75 %	0 %	379009241
128	NC_016888	ATTG	2	8	55880	55887	25 %	50 %	25 %	0 %	379009241
129	NC_016888	TTTG	2	8	55987	55994	0 %	75 %	25 %	0 %	379009241
130	NC_016888	ATAA	2	8	56028	56035	75 %	25 %	0 %	0 %	379009241
131	NC_016888	CGGT	2	8	56088	56095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016888	GGCA	2	8	56185	56192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016888	GCCT	2	8	56247	56254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016888	GAAG	2	8	56457	56464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016888	GCTG	2	8	56716	56723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016888	CGGG	2	8	57058	57065	0 %	0 %	75 %	25 %	379009242
137	NC_016888	ACCG	2	8	57108	57115	25 %	0 %	25 %	50 %	379009242
138	NC_016888	CGCA	2	8	57454	57461	25 %	0 %	25 %	50 %	379009242
139	NC_016888	ACCG	2	8	57802	57809	25 %	0 %	25 %	50 %	379009242
140	NC_016888	TGGG	2	8	57868	57875	0 %	25 %	75 %	0 %	379009242
141	NC_016888	GTAC	2	8	58189	58196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016888	CGGC	2	8	58297	58304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016888	CGGA	2	8	58369	58376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016888	GGGC	2	8	59113	59120	0 %	0 %	75 %	25 %	379009244
145	NC_016888	GGCG	2	8	59204	59211	0 %	0 %	75 %	25 %	379009244
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188	NC_016888	GACA	2	8	82428	82435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_016888	AGAA	2	8	83072	83079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_016888	CAGC	2	8	83197	83204	25 %	0 %	25 %	50 %	379009269
193	NC_016888	GGGT	2	8	83841	83848	0 %	25 %	75 %	0 %	379009269

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.