MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	TA	3	6	1237	1242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016864	GA	3	6	1530	1535	50 %	0 %	50 %	0 %	378991863
3	NC_016864	GC	3	6	2061	2066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016864	TG	3	6	3036	3041	0 %	50 %	50 %	0 %	378991866
5	NC_016864	GC	3	6	3583	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	378991867
6	NC_016864	GA	3	6	3821	3826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016864	GC	3	6	4305	4310	0 %	0 %	50 %	50 %	378991868
8	NC_016864	GC	3	6	5144	5149	0 %	0 %	50 %	50 %	378991869
9	NC_016864	GC	3	6	5219	5224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016864	TC	3	6	6210	6215	0 %	50 %	0 %	50 %	378991870
11	NC_016864	TG	3	6	6236	6241	0 %	50 %	50 %	0 %	378991870
12	NC_016864	CG	3	6	6261	6266	0 %	0 %	50 %	50 %	378991870
13	NC_016864	GC	3	6	6319	6324	0 %	0 %	50 %	50 %	378991870
14	NC_016864	AC	3	6	6489	6494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016864	AT	3	6	7417	7422	50 %	50 %	0 %	0 %	378991871
16	NC_016864	AT	3	6	7462	7467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016864	CT	3	6	8008	8013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016864	AT	3	6	8434	8439	50 %	50 %	0 %	0 %	378991873
19	NC_016864	TC	3	6	8576	8581	0 %	50 %	0 %	50 %	378991873
20	NC_016864	TA	3	6	9214	9219	50 %	50 %	0 %	0 %	378991874
21	NC_016864	AT	3	6	9714	9719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016864	TA	3	6	10394	10399	50 %	50 %	0 %	0 %	378991875
23	NC_016864	CT	3	6	13960	13965	0 %	50 %	0 %	50 %	378991877
24	NC_016864	AT	3	6	16298	16303	50 %	50 %	0 %	0 %	378991879
25	NC_016864	AC	4	8	17917	17924	50 %	0 %	0 %	50 %	378991880
26	NC_016864	GT	3	6	19590	19595	0 %	50 %	50 %	0 %	378991882
27	NC_016864	TG	3	6	20383	20388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016864	GC	4	8	22262	22269	0 %	0 %	50 %	50 %	378991884
29	NC_016864	CA	3	6	22396	22401	50 %	0 %	0 %	50 %	378991884
30	NC_016864	GC	3	6	22903	22908	0 %	0 %	50 %	50 %	378991885
31	NC_016864	CT	3	6	23197	23202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016864	TC	3	6	23716	23721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016864	TC	3	6	24043	24048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016864	TA	3	6	24525	24530	50 %	50 %	0 %	0 %	378991887
35	NC_016864	AT	3	6	24943	24948	50 %	50 %	0 %	0 %	378991887
36	NC_016864	TA	3	6	25726	25731	50 %	50 %	0 %	0 %	378991888
37	NC_016864	TG	3	6	26245	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	378991888
38	NC_016864	AC	3	6	26495	26500	50 %	0 %	0 %	50 %	378991888
39	NC_016864	GA	3	6	26804	26809	50 %	0 %	50 %	0 %	378991889
40	NC_016864	CG	3	6	27649	27654	0 %	0 %	50 %	50 %	378991889
41	NC_016864	GA	3	6	27749	27754	50 %	0 %	50 %	0 %	378991889
42	NC_016864	TC	3	6	28451	28456	0 %	50 %	0 %	50 %	378991890
43	NC_016864	CG	3	6	28496	28501	0 %	0 %	50 %	50 %	378991890
44	NC_016864	GC	3	6	28678	28683	0 %	0 %	50 %	50 %	378991890
45	NC_016864	GC	3	6	29006	29011	0 %	0 %	50 %	50 %	378991890
46	NC_016864	TA	3	6	29574	29579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016864	GC	3	6	31312	31317	0 %	0 %	50 %	50 %	378991894
48	NC_016864	CA	4	8	31738	31745	50 %	0 %	0 %	50 %	378991894
49	NC_016864	AT	3	6	31819	31824	50 %	50 %	0 %	0 %	378991894
50	NC_016864	GC	3	6	31885	31890	0 %	0 %	50 %	50 %	378991894
51	NC_016864	GC	3	6	32007	32012	0 %	0 %	50 %	50 %	378991895
52	NC_016864	TG	3	6	33472	33477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016864	GC	3	6	34611	34616	0 %	0 %	50 %	50 %	378991898
54	NC_016864	CG	3	6	34995	35000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016864	GA	3	6	35278	35283	50 %	0 %	50 %	0 %	378991899
56	NC_016864	GT	3	6	35448	35453	0 %	50 %	50 %	0 %	378991899
57	NC_016864	GC	3	6	35751	35756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016864	AC	3	6	36338	36343	50 %	0 %	0 %	50 %	378991900
59	NC_016864	AG	3	6	37249	37254	50 %	0 %	50 %	0 %	378991902
60	NC_016864	CG	3	6	37517	37522	0 %	0 %	50 %	50 %	378991902
61	NC_016864	GC	3	6	38209	38214	0 %	0 %	50 %	50 %	378991902
62	NC_016864	TG	3	6	38379	38384	0 %	50 %	50 %	0 %	378991902
63	NC_016864	GC	3	6	38977	38982	0 %	0 %	50 %	50 %	378991902
64	NC_016864	CG	3	6	39873	39878	0 %	0 %	50 %	50 %	378991904
65	NC_016864	CG	3	6	40062	40067	0 %	0 %	50 %	50 %	378991904
66	NC_016864	TA	3	6	40768	40773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016864	CA	3	6	41198	41203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016864	TC	3	6	42299	42304	0 %	50 %	0 %	50 %	378991905
69	NC_016864	TA	4	8	42815	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	378991906
70	NC_016864	GA	3	6	42882	42887	50 %	0 %	50 %	0 %	378991906
71	NC_016864	TC	3	6	43063	43068	0 %	50 %	0 %	50 %	378991906
72	NC_016864	TC	4	8	43792	43799	0 %	50 %	0 %	50 %	378991907
73	NC_016864	GC	3	6	44071	44076	0 %	0 %	50 %	50 %	378991908
74	NC_016864	AG	3	6	44170	44175	50 %	0 %	50 %	0 %	378991908
75	NC_016864	AT	3	6	45424	45429	50 %	50 %	0 %	0 %	378991911
76	NC_016864	TG	3	6	46232	46237	0 %	50 %	50 %	0 %	378991912
77	NC_016864	CG	3	6	47249	47254	0 %	0 %	50 %	50 %	378991913
78	NC_016864	GC	3	6	48685	48690	0 %	0 %	50 %	50 %	378991916
79	NC_016864	TC	3	6	49009	49014	0 %	50 %	0 %	50 %	378991916
80	NC_016864	TG	3	6	49470	49475	0 %	50 %	50 %	0 %	378991917
81	NC_016864	TG	3	6	49684	49689	0 %	50 %	50 %	0 %	378991918
82	NC_016864	CG	3	6	50649	50654	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
83	NC_016864	TG	3	6	50664	50669	0 %	50 %	50 %	0 %	378991919
84	NC_016864	GC	3	6	50871	50876	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
85	NC_016864	CA	3	6	50965	50970	50 %	0 %	0 %	50 %	378991919
86	NC_016864	CG	3	6	51166	51171	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
87	NC_016864	CG	3	6	52616	52621	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
88	NC_016864	GC	3	6	53323	53328	0 %	0 %	50 %	50 %	378991920
89	NC_016864	GC	3	6	53614	53619	0 %	0 %	50 %	50 %	378991921
90	NC_016864	TG	3	6	54032	54037	0 %	50 %	50 %	0 %	378991922
91	NC_016864	AG	3	6	55017	55022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016864	GC	3	6	56805	56810	0 %	0 %	50 %	50 %	378991925
93	NC_016864	GA	4	8	56908	56915	50 %	0 %	50 %	0 %	378991925
94	NC_016864	CA	3	6	57037	57042	50 %	0 %	0 %	50 %	378991925
95	NC_016864	GC	3	6	58173	58178	0 %	0 %	50 %	50 %	378991925
96	NC_016864	AT	3	6	59404	59409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016864	TC	3	6	59718	59723	0 %	50 %	0 %	50 %	378991928
98	NC_016864	AC	3	6	60157	60162	50 %	0 %	0 %	50 %	378991929
99	NC_016864	CA	3	6	60387	60392	50 %	0 %	0 %	50 %	378991930
100	NC_016864	TG	3	6	62121	62126	0 %	50 %	50 %	0 %	378991931
101	NC_016864	CT	3	6	62820	62825	0 %	50 %	0 %	50 %	378991931
102	NC_016864	TC	3	6	62870	62875	0 %	50 %	0 %	50 %	378991931
103	NC_016864	GC	3	6	63370	63375	0 %	0 %	50 %	50 %	378991931
104	NC_016864	TC	3	6	65824	65829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016864	TG	3	6	66456	66461	0 %	50 %	50 %	0 %	378991934
106	NC_016864	CG	3	6	66833	66838	0 %	0 %	50 %	50 %	378991934
107	NC_016864	AC	3	6	67273	67278	50 %	0 %	0 %	50 %	378991934
108	NC_016864	GA	3	6	67345	67350	50 %	0 %	50 %	0 %	378991934
109	NC_016864	CA	3	6	69299	69304	50 %	0 %	0 %	50 %	378991938
110	NC_016864	CG	3	6	69586	69591	0 %	0 %	50 %	50 %	378991938
111	NC_016864	GC	3	6	70616	70621	0 %	0 %	50 %	50 %	378991938
112	NC_016864	AG	3	6	70767	70772	50 %	0 %	50 %	0 %	378991938
113	NC_016864	GA	3	6	71045	71050	50 %	0 %	50 %	0 %	378991938
114	NC_016864	CA	3	6	71358	71363	50 %	0 %	0 %	50 %	378991938
115	NC_016864	AG	3	6	74352	74357	50 %	0 %	50 %	0 %	378991939
116	NC_016864	CA	3	6	75405	75410	50 %	0 %	0 %	50 %	378991940
117	NC_016864	CG	3	6	75596	75601	0 %	0 %	50 %	50 %	378991940
118	NC_016864	GC	3	6	75882	75887	0 %	0 %	50 %	50 %	378991941
119	NC_016864	GT	3	6	76661	76666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016864	GA	3	6	77630	77635	50 %	0 %	50 %	0 %	378991945
121	NC_016864	TC	3	6	78536	78541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016864	TC	3	6	78740	78745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016864	GT	3	6	79806	79811	0 %	50 %	50 %	0 %	378991947
124	NC_016864	TC	3	6	80040	80045	0 %	50 %	0 %	50 %	378991947
125	NC_016864	GT	3	6	81554	81559	0 %	50 %	50 %	0 %	378991949
126	NC_016864	AC	3	6	83118	83123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016864	GC	3	6	83689	83694	0 %	0 %	50 %	50 %	378991952
128	NC_016864	TA	3	6	84700	84705	50 %	50 %	0 %	0 %	378991953
129	NC_016864	CA	4	8	85830	85837	50 %	0 %	0 %	50 %	378991954
130	NC_016864	GC	3	6	86679	86684	0 %	0 %	50 %	50 %	378991956
131	NC_016864	GC	3	6	86751	86756	0 %	0 %	50 %	50 %	378991956
132	NC_016864	GC	3	6	87022	87027	0 %	0 %	50 %	50 %	378991956
133	NC_016864	AC	3	6	87429	87434	50 %	0 %	0 %	50 %	378991956
134	NC_016864	TA	3	6	89731	89736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016864	AT	3	6	89882	89887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016864	GC	3	6	89911	89916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016864	AC	3	6	90120	90125	50 %	0 %	0 %	50 %	378991958
138	NC_016864	TA	3	6	90378	90383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016864	AT	3	6	90580	90585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016864	TA	3	6	92045	92050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016864	AT	3	6	92072	92077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016864	TA	3	6	92186	92191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016864	CT	3	6	92621	92626	0 %	50 %	0 %	50 %	378991960
144	NC_016864	GA	3	6	93079	93084	50 %	0 %	50 %	0 %	378991960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.