MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 1347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	AGC	2	6	55	60	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016864	AAC	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016864	GAA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016864	ATA	2	6	191	196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016864	ATC	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016864	AGA	2	6	284	289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016864	TCT	2	6	297	302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016864	TTA	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016864	CTG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016864	AAT	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016864	TTA	2	6	510	515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991862
12	NC_016864	CAG	2	6	580	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991862
13	NC_016864	TCT	2	6	608	613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991862
14	NC_016864	GCT	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991862
15	NC_016864	CAT	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016864	CAG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016864	TCC	2	6	822	827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016864	AAC	2	6	865	870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016864	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016864	AGA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016864	ATC	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991863
22	NC_016864	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991863
23	NC_016864	GTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991863
24	NC_016864	CCT	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991863
25	NC_016864	TGC	3	9	1538	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991863
26	NC_016864	CAT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991863
27	NC_016864	GAC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016864	TCT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016864	CTG	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016864	TGT	2	6	2031	2036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016864	GGC	2	6	2336	2341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016864	AGC	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991864
33	NC_016864	GCT	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991864
34	NC_016864	ACG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991864
35	NC_016864	CCG	2	6	2568	2573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991864
36	NC_016864	GAA	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991864
37	NC_016864	GAC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991864
38	NC_016864	CAT	2	6	2749	2754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991865
39	NC_016864	CGG	2	6	2768	2773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991865
40	NC_016864	CTG	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991865
41	NC_016864	CTG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991865
42	NC_016864	TGC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991866
43	NC_016864	AGT	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991866
44	NC_016864	GGT	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991866
45	NC_016864	CGG	2	6	3227	3232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991866
46	NC_016864	ACC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991866
47	NC_016864	GAC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991867
48	NC_016864	CTG	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991867
49	NC_016864	ACG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991867
50	NC_016864	CGT	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991867
51	NC_016864	GCT	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991867
52	NC_016864	GCG	2	6	3729	3734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991867
53	NC_016864	ATG	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991867
54	NC_016864	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
55	NC_016864	CTG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
56	NC_016864	CGG	2	6	3904	3909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991868
57	NC_016864	GCA	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991868
58	NC_016864	GAC	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991868
59	NC_016864	CTG	2	6	3960	3965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
60	NC_016864	TGC	2	6	4018	4023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
61	NC_016864	CAC	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991868
62	NC_016864	GGC	2	6	4148	4153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991868
63	NC_016864	GAT	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991868
64	NC_016864	CGT	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
65	NC_016864	GAC	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991868
66	NC_016864	TGC	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
67	NC_016864	AGG	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991868
68	NC_016864	AGG	2	6	4705	4710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991869
69	NC_016864	GGT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991869
70	NC_016864	CTG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991869
71	NC_016864	CGG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991869
72	NC_016864	GCT	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991869
73	NC_016864	CGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991869
74	NC_016864	TGA	3	9	4890	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991869
75	NC_016864	CGC	2	6	4929	4934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991869
76	NC_016864	CTG	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991869
77	NC_016864	GGC	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991869
78	NC_016864	GCC	2	6	5060	5065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991869
79	NC_016864	GAC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991869
80	NC_016864	GAT	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991869
81	NC_016864	GGC	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016864	GCG	2	6	5265	5270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016864	GTT	2	6	5371	5376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016864	TGG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016864	CCG	2	6	5545	5550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016864	GAC	3	9	5591	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016864	GTG	2	6	5651	5656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016864	CCG	2	6	5692	5697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016864	GCT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016864	CGG	2	6	5782	5787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016864	GCC	2	6	5804	5809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016864	CAT	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991870
93	NC_016864	GGT	2	6	5933	5938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991870
94	NC_016864	CGC	2	6	5948	5953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991870
95	NC_016864	TGC	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991870
96	NC_016864	GGC	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991870
97	NC_016864	GCT	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991870
98	NC_016864	AGG	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991870
99	NC_016864	CAG	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991870
100	NC_016864	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991870
101	NC_016864	CGA	2	6	6197	6202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991870
102	NC_016864	CGC	2	6	6312	6317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991870
103	NC_016864	GCT	2	6	6338	6343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016864	GCG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016864	ATG	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016864	CGC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016864	CAG	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016864	GAC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016864	TCC	2	6	6530	6535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016864	CCA	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016864	GCC	2	6	6685	6690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016864	ACC	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016864	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016864	CGG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016864	CGG	2	6	6864	6869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016864	TGC	2	6	6909	6914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016864	AGG	2	6	7010	7015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016864	CAC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016864	TTC	2	6	7534	7539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016864	CTG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991872
121	NC_016864	AAT	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991872
122	NC_016864	TCG	2	6	7775	7780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991872
123	NC_016864	CAG	2	6	7793	7798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991872
124	NC_016864	GCT	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991872
125	NC_016864	GGT	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991872
126	NC_016864	TCA	2	6	8067	8072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991873
127	NC_016864	TGA	3	9	8096	8104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991873
128	NC_016864	ATT	2	6	8235	8240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991873
129	NC_016864	CAA	2	6	8380	8385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991873
130	NC_016864	TTC	2	6	8421	8426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991873
131	NC_016864	ATA	2	6	8476	8481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991873
132	NC_016864	ATT	3	9	8633	8641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991873
133	NC_016864	ATA	2	6	8748	8753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016864	TAA	2	6	8894	8899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016864	TCA	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991874
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137	NC_016864	ACG	2	6	9177	9182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991874
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141	NC_016864	CAT	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991874
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144	NC_016864	ATT	2	6	9726	9731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016864	AAG	2	6	9839	9844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016864	ACT	2	6	9868	9873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_016864	TCT	2	6	18620	18625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991881
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265	NC_016864	TGC	2	6	18881	18886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991881
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