MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 2034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016864	TCC	2	6	46912	46917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991913
1002	NC_016864	GTGCCG	2	12	46979	46990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378991913
1003	NC_016864	GAA	2	6	47032	47037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991913
1004	NC_016864	TCCC	2	8	47041	47048	0 %	25 %	0 %	75 %	378991913
1005	NC_016864	G	6	6	47229	47234	0 %	0 %	100 %	0 %	378991913
1006	NC_016864	CG	3	6	47249	47254	0 %	0 %	50 %	50 %	378991913
1007	NC_016864	GTAC	2	8	47258	47265	25 %	25 %	25 %	25 %	378991913
1008	NC_016864	GTG	2	6	47360	47365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991913
1009	NC_016864	CAG	2	6	47447	47452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991913
1010	NC_016864	TGG	3	9	47512	47520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991913
1011	NC_016864	ATT	2	6	47550	47555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991913
1012	NC_016864	GTG	2	6	47618	47623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991913
1013	NC_016864	GAA	2	6	47654	47659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991913
1014	NC_016864	AGG	2	6	47688	47693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991913
1015	NC_016864	AGC	2	6	47775	47780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991913
1016	NC_016864	CAG	2	6	47798	47803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991913
1017	NC_016864	GGA	2	6	47822	47827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991913
1018	NC_016864	AAC	2	6	47853	47858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991914
1019	NC_016864	TCT	2	6	47894	47899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991914
1020	NC_016864	GCTG	2	8	47902	47909	0 %	25 %	50 %	25 %	378991914
1021	NC_016864	TTG	2	6	47959	47964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991914
1022	NC_016864	ACA	2	6	48002	48007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991914
1023	NC_016864	TCCGG	2	10	48059	48068	0 %	20 %	40 %	40 %	378991914
1024	NC_016864	GTC	2	6	48095	48100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991914
1025	NC_016864	GAA	2	6	48153	48158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991914
1026	NC_016864	TGT	2	6	48223	48228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991914
1027	NC_016864	ACAA	2	8	48303	48310	75 %	0 %	0 %	25 %	378991914
1028	NC_016864	TAA	2	6	48386	48391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991914
1029	NC_016864	A	6	6	48399	48404	100 %	0 %	0 %	0 %	378991914
1030	NC_016864	TGA	2	6	48447	48452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991915
1031	NC_016864	GAT	2	6	48463	48468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991915
1032	NC_016864	ATA	2	6	48505	48510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991915
1033	NC_016864	TCTG	2	8	48597	48604	0 %	50 %	25 %	25 %	378991915
1034	NC_016864	GCT	2	6	48618	48623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991915
1035	NC_016864	GC	3	6	48685	48690	0 %	0 %	50 %	50 %	378991916
1036	NC_016864	CTG	2	6	48693	48698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991916
1037	NC_016864	GAAC	2	8	48712	48719	50 %	0 %	25 %	25 %	378991916
1038	NC_016864	CCA	2	6	48739	48744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991916
1039	NC_016864	ACG	2	6	48864	48869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991916
1040	NC_016864	GCC	2	6	48918	48923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991916
1041	NC_016864	CCG	2	6	48942	48947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991916
1042	NC_016864	CAC	2	6	48949	48954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991916
1043	NC_016864	GGC	2	6	48992	48997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991916
1044	NC_016864	TC	3	6	49009	49014	0 %	50 %	0 %	50 %	378991916
1045	NC_016864	GCC	2	6	49022	49027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991916
1046	NC_016864	CGG	2	6	49054	49059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991916
1047	NC_016864	T	6	6	49119	49124	0 %	100 %	0 %	0 %	378991916
1048	NC_016864	CCGT	2	8	49134	49141	0 %	25 %	25 %	50 %	378991916
1049	NC_016864	ATTA	2	8	49158	49165	50 %	50 %	0 %	0 %	378991916
1050	NC_016864	GTCA	2	8	49174	49181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_016864	GCCG	2	8	49198	49205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_016864	CCTG	2	8	49223	49230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_016864	AAC	2	6	49338	49343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991917
1054	NC_016864	GCG	2	6	49441	49446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991917
1055	NC_016864	TG	3	6	49470	49475	0 %	50 %	50 %	0 %	378991917
1056	NC_016864	GGCA	2	8	49505	49512	25 %	0 %	50 %	25 %	378991917
1057	NC_016864	A	6	6	49534	49539	100 %	0 %	0 %	0 %	378991918
1058	NC_016864	ATT	2	6	49548	49553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991918
1059	NC_016864	CGA	2	6	49575	49580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991918
1060	NC_016864	AAT	2	6	49616	49621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991918
1061	NC_016864	CCG	2	6	49624	49629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991918
1062	NC_016864	TG	3	6	49684	49689	0 %	50 %	50 %	0 %	378991918
1063	NC_016864	TTC	2	6	49728	49733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991918
1064	NC_016864	GTC	2	6	49759	49764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991918
1065	NC_016864	CTG	2	6	49770	49775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991918
1066	NC_016864	GCT	2	6	49820	49825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991918
1067	NC_016864	CCG	2	6	49826	49831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991918
1068	NC_016864	CTG	2	6	49833	49838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991918
1069	NC_016864	GAC	2	6	49869	49874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991918
1070	NC_016864	TGG	2	6	49887	49892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991918
1071	NC_016864	GGA	2	6	49910	49915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991918
1072	NC_016864	CGG	2	6	49961	49966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991918
1073	NC_016864	TGAA	2	8	50046	50053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016864	CTG	2	6	50079	50084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_016864	GCT	2	6	50113	50118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016864	TGC	2	6	50145	50150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016864	GTG	2	6	50171	50176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016864	CAT	2	6	50194	50199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_016864	CTG	2	6	50234	50239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_016864	GTT	2	6	50254	50259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016864	CAGTGG	2	12	50264	50275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1082	NC_016864	TCT	2	6	50287	50292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016864	TCTG	2	8	50319	50326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_016864	TTAAGG	2	12	50359	50370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016864	GAA	2	6	50380	50385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991919
1086	NC_016864	GGC	2	6	50407	50412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991919
1087	NC_016864	GCT	2	6	50419	50424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1088	NC_016864	CTG	2	6	50504	50509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1089	NC_016864	ATGA	2	8	50546	50553	50 %	25 %	25 %	0 %	378991919
1090	NC_016864	CTG	2	6	50630	50635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1091	NC_016864	CG	3	6	50649	50654	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
1092	NC_016864	TG	3	6	50664	50669	0 %	50 %	50 %	0 %	378991919
1093	NC_016864	CCAG	2	8	50682	50689	25 %	0 %	25 %	50 %	378991919
1094	NC_016864	CTA	2	6	50776	50781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991919
1095	NC_016864	GGAA	2	8	50815	50822	50 %	0 %	50 %	0 %	378991919
1096	NC_016864	GC	3	6	50871	50876	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
1097	NC_016864	A	8	8	50884	50891	100 %	0 %	0 %	0 %	378991919
1098	NC_016864	CA	3	6	50965	50970	50 %	0 %	0 %	50 %	378991919
1099	NC_016864	TTA	2	6	50991	50996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991919
1100	NC_016864	GAT	2	6	51010	51015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991919
1101	NC_016864	ATCC	3	12	51031	51042	25 %	25 %	0 %	50 %	378991919
1102	NC_016864	GAC	2	6	51092	51097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1103	NC_016864	CAGG	2	8	51115	51122	25 %	0 %	50 %	25 %	378991919
1104	NC_016864	CG	3	6	51166	51171	0 %	0 %	50 %	50 %	378991919
1105	NC_016864	CAT	2	6	51172	51177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991919
1106	NC_016864	CGG	2	6	51225	51230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991919
1107	NC_016864	CTG	2	6	51245	51250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1108	NC_016864	TGG	3	9	51297	51305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991919
1109	NC_016864	AGCGA	2	10	51326	51335	40 %	0 %	40 %	20 %	378991919
1110	NC_016864	GAA	2	6	51358	51363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991919
1111	NC_016864	CCT	2	6	51372	51377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991919
1112	NC_016864	GAAG	2	8	51403	51410	50 %	0 %	50 %	0 %	378991919
1113	NC_016864	GGT	2	6	51460	51465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991919
1114	NC_016864	ACA	2	6	51501	51506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991919
1115	NC_016864	CGC	2	6	51576	51581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991919
1116	NC_016864	GCCT	2	8	51608	51615	0 %	25 %	25 %	50 %	378991919
1117	NC_016864	AGC	2	6	51645	51650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1118	NC_016864	GAAG	2	8	51652	51659	50 %	0 %	50 %	0 %	378991919
1119	NC_016864	GTG	2	6	51665	51670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991919
1120	NC_016864	GCGG	2	8	51673	51680	0 %	0 %	75 %	25 %	378991919
1121	NC_016864	TGG	2	6	51711	51716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991919
1122	NC_016864	CGCC	2	8	51732	51739	0 %	0 %	25 %	75 %	378991919
1123	NC_016864	GCT	2	6	51742	51747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991919
1124	NC_016864	TTC	2	6	51788	51793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991919
1125	NC_016864	AAC	2	6	51803	51808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991919
1126	NC_016864	ACA	2	6	51816	51821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991919
1127	NC_016864	GGGC	2	8	51843	51850	0 %	0 %	75 %	25 %	378991919
1128	NC_016864	CGG	2	6	51895	51900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991919
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