MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 2034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016864	ATT	2	6	23502	23507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016864	GAA	2	6	23525	23530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016864	GCG	2	6	23549	23554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016864	TGA	2	6	23597	23602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016864	CAT	2	6	23607	23612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016864	GTG	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016864	TGG	2	6	23679	23684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016864	CAGG	2	8	23698	23705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_016864	TGG	2	6	23707	23712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016864	TC	3	6	23716	23721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_016864	GCTG	2	8	23751	23758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_016864	CTG	2	6	23975	23980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016864	CCGG	2	8	23997	24004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_016864	TC	3	6	24043	24048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_016864	TGGC	2	8	24157	24164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_016864	CCA	2	6	24186	24191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_016864	GTC	2	6	24255	24260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991887
518	NC_016864	TCAG	2	8	24262	24269	25 %	25 %	25 %	25 %	378991887
519	NC_016864	GTT	2	6	24380	24385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991887
520	NC_016864	TGT	2	6	24427	24432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991887
521	NC_016864	GCCT	2	8	24513	24520	0 %	25 %	25 %	50 %	378991887
522	NC_016864	TA	3	6	24525	24530	50 %	50 %	0 %	0 %	378991887
523	NC_016864	TGA	2	6	24619	24624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991887
524	NC_016864	GGC	2	6	24648	24653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991887
525	NC_016864	TCA	2	6	24676	24681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991887
526	NC_016864	CTG	2	6	24718	24723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991887
527	NC_016864	CCAG	2	8	24761	24768	25 %	0 %	25 %	50 %	378991887
528	NC_016864	AAC	2	6	24808	24813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991887
529	NC_016864	T	6	6	24834	24839	0 %	100 %	0 %	0 %	378991887
530	NC_016864	GGC	2	6	24867	24872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991887
531	NC_016864	AT	3	6	24943	24948	50 %	50 %	0 %	0 %	378991887
532	NC_016864	ATC	2	6	25005	25010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991887
533	NC_016864	CAA	2	6	25013	25018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991887
534	NC_016864	CGT	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991887
535	NC_016864	TTTTTC	2	12	25162	25173	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378991887
536	NC_016864	A	6	6	25219	25224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016864	CTTT	2	8	25275	25282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_016864	T	6	6	25280	25285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016864	ATC	2	6	25287	25292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016864	GCTT	2	8	25294	25301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_016864	CTG	2	6	25337	25342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016864	CCT	2	6	25497	25502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_016864	CAAAAT	2	12	25510	25521	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
544	NC_016864	ATTT	2	8	25528	25535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016864	A	6	6	25568	25573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016864	CAT	2	6	25574	25579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016864	GCC	2	6	25719	25724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991888
548	NC_016864	TA	3	6	25726	25731	50 %	50 %	0 %	0 %	378991888
549	NC_016864	TGTA	2	8	25925	25932	25 %	50 %	25 %	0 %	378991888
550	NC_016864	GCT	2	6	26109	26114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991888
551	NC_016864	GAA	2	6	26142	26147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991888
552	NC_016864	GTC	2	6	26168	26173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991888
553	NC_016864	TG	3	6	26245	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	378991888
554	NC_016864	TCC	2	6	26411	26416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991888
555	NC_016864	TTC	2	6	26435	26440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991888
556	NC_016864	AGCC	2	8	26453	26460	25 %	0 %	25 %	50 %	378991888
557	NC_016864	TCGA	2	8	26478	26485	25 %	25 %	25 %	25 %	378991888
558	NC_016864	AC	3	6	26495	26500	50 %	0 %	0 %	50 %	378991888
559	NC_016864	AAG	2	6	26581	26586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991888
560	NC_016864	ATG	2	6	26689	26694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991888
561	NC_016864	CAG	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991888
562	NC_016864	GA	3	6	26804	26809	50 %	0 %	50 %	0 %	378991889
563	NC_016864	TGAC	2	8	26859	26866	25 %	25 %	25 %	25 %	378991889
564	NC_016864	AAG	2	6	26872	26877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991889
565	NC_016864	TAT	2	6	27022	27027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991889
566	NC_016864	CAG	2	6	27044	27049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991889
567	NC_016864	TTC	2	6	27050	27055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991889
568	NC_016864	TGA	2	6	27178	27183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991889
569	NC_016864	TCAA	2	8	27276	27283	50 %	25 %	0 %	25 %	378991889
570	NC_016864	GGC	2	6	27340	27345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991889
571	NC_016864	GTCT	2	8	27475	27482	0 %	50 %	25 %	25 %	378991889
572	NC_016864	ATG	2	6	27492	27497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991889
573	NC_016864	GAC	2	6	27524	27529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991889
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575	NC_016864	GAA	2	6	27632	27637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991889
576	NC_016864	CG	3	6	27649	27654	0 %	0 %	50 %	50 %	378991889
577	NC_016864	GA	3	6	27749	27754	50 %	0 %	50 %	0 %	378991889
578	NC_016864	AAT	2	6	27765	27770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991889
579	NC_016864	AGT	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991890
580	NC_016864	GCT	2	6	28006	28011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991890
581	NC_016864	TCA	2	6	28035	28040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991890
582	NC_016864	GCCT	2	8	28091	28098	0 %	25 %	25 %	50 %	378991890
583	NC_016864	ATG	2	6	28155	28160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991890
584	NC_016864	GTA	2	6	28211	28216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991890
585	NC_016864	CGG	2	6	28297	28302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991890
586	NC_016864	CTGC	2	8	28324	28331	0 %	25 %	25 %	50 %	378991890
587	NC_016864	CTG	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991890
588	NC_016864	CTG	2	6	28385	28390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991890
589	NC_016864	G	6	6	28394	28399	0 %	0 %	100 %	0 %	378991890
590	NC_016864	TCC	2	6	28407	28412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991890
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592	NC_016864	TGA	2	6	28480	28485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991890
593	NC_016864	CG	3	6	28496	28501	0 %	0 %	50 %	50 %	378991890
594	NC_016864	CTT	2	6	28541	28546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991890
595	NC_016864	TCC	2	6	28575	28580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991890
596	NC_016864	CAG	2	6	28595	28600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991890
597	NC_016864	CGTT	2	8	28607	28614	0 %	50 %	25 %	25 %	378991890
598	NC_016864	GC	3	6	28678	28683	0 %	0 %	50 %	50 %	378991890
599	NC_016864	GGTC	2	8	28700	28707	0 %	25 %	50 %	25 %	378991890
600	NC_016864	GAAC	2	8	28740	28747	50 %	0 %	25 %	25 %	378991890
601	NC_016864	T	7	7	28988	28994	0 %	100 %	0 %	0 %	378991890
602	NC_016864	GC	3	6	29006	29011	0 %	0 %	50 %	50 %	378991890
603	NC_016864	GTT	2	6	29027	29032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991890
604	NC_016864	ACC	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991890
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608	NC_016864	TTTC	2	8	29355	29362	0 %	75 %	0 %	25 %	378991891
609	NC_016864	GAA	2	6	29386	29391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991891
610	NC_016864	TCC	2	6	29435	29440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991891
611	NC_016864	CGG	2	6	29451	29456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991891
612	NC_016864	CCG	2	6	29472	29477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991891
613	NC_016864	TA	3	6	29574	29579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016864	ATT	2	6	29584	29589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016864	TAA	2	6	29687	29692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016864	GGA	2	6	29699	29704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016864	TCC	2	6	29734	29739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_016864	TGT	2	6	29762	29767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016864	ACGGG	2	10	29837	29846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
620	NC_016864	CGT	2	6	29853	29858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016864	CGA	2	6	29928	29933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016864	CGA	2	6	29986	29991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016864	CCT	2	6	30030	30035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_016864	GCG	2	6	30143	30148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991892
625	NC_016864	TGA	2	6	30237	30242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991892
626	NC_016864	TGA	2	6	30345	30350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991892
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629	NC_016864	GCG	2	6	30430	30435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991892
630	NC_016864	ATG	2	6	30458	30463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991892
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632	NC_016864	TTG	2	6	30555	30560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991893
633	NC_016864	ATG	2	6	30590	30595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991893
634	NC_016864	TGG	2	6	30665	30670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991893
635	NC_016864	CAT	2	6	30739	30744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991893
636	NC_016864	TGAA	2	8	30913	30920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016864	ATG	2	6	30923	30928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016864	CTC	2	6	30937	30942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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640	NC_016864	CGG	2	6	30961	30966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_016864	ACGGG	2	10	31014	31023	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
643	NC_016864	TAT	2	6	31055	31060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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664	NC_016864	GCC	2	6	32187	32192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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666	NC_016864	GAACT	2	10	32237	32246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
667	NC_016864	ACG	2	6	32271	32276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_016864	CTG	2	6	32288	32293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_016864	CTG	2	6	32483	32488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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749	NC_016864	CGC	2	6	35740	35745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
750	NC_016864	GC	3	6	35751	35756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
751	NC_016864	CGG	2	6	35780	35785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_016864	GCG	2	6	35841	35846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_016864	CGC	2	6	35923	35928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
754	NC_016864	GCG	2	6	36045	36050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_016864	GAACA	2	10	36085	36094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
756	NC_016864	AAC	2	6	36162	36167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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760	NC_016864	AC	3	6	36338	36343	50 %	0 %	0 %	50 %	378991900
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762	NC_016864	GGC	2	6	36504	36509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991900
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