MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016863	CTTG	2	8	139863	139870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_016863	TCC	2	6	139880	139885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_016863	AAG	2	6	139930	139935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016863	G	6	6	139956	139961	0 %	0 %	100 %	0 %	378987525
3005	NC_016863	CATC	2	8	140065	140072	25 %	25 %	0 %	50 %	378987525
3006	NC_016863	CTG	2	6	140081	140086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987525
3007	NC_016863	CCTG	2	8	140095	140102	0 %	25 %	25 %	50 %	378987525
3008	NC_016863	ATT	2	6	140111	140116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987525
3009	NC_016863	GATG	2	8	140203	140210	25 %	25 %	50 %	0 %	378987525
3010	NC_016863	AAG	2	6	140265	140270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987525
3011	NC_016863	CAA	2	6	140290	140295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987525
3012	NC_016863	GAT	2	6	140408	140413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987526
3013	NC_016863	AC	3	6	140426	140431	50 %	0 %	0 %	50 %	378987526
3014	NC_016863	CGG	2	6	140510	140515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987526
3015	NC_016863	CGAT	2	8	140566	140573	25 %	25 %	25 %	25 %	378987526
3016	NC_016863	CAT	2	6	140627	140632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987526
3017	NC_016863	GCTG	2	8	140651	140658	0 %	25 %	50 %	25 %	378987526
3018	NC_016863	TCT	2	6	140721	140726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987526
3019	NC_016863	CG	3	6	140800	140805	0 %	0 %	50 %	50 %	378987526
3020	NC_016863	GCC	2	6	140814	140819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987526
3021	NC_016863	CGG	2	6	140833	140838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987526
3022	NC_016863	GAG	2	6	140877	140882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987526
3023	NC_016863	TTG	2	6	140911	140916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987526
3024	NC_016863	GCG	3	9	140970	140978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987526
3025	NC_016863	GGA	2	6	141056	141061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987526
3026	NC_016863	GCTC	2	8	141082	141089	0 %	25 %	25 %	50 %	378987526
3027	NC_016863	GGCG	2	8	141105	141112	0 %	0 %	75 %	25 %	378987526
3028	NC_016863	ATC	2	6	141120	141125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987526
3029	NC_016863	CGG	2	6	141196	141201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987526
3030	NC_016863	A	6	6	141228	141233	100 %	0 %	0 %	0 %	378987526
3031	NC_016863	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	378987526
3032	NC_016863	AG	3	6	141332	141337	50 %	0 %	50 %	0 %	378987526
3033	NC_016863	CAG	2	6	141352	141357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987527
3034	NC_016863	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	378987527
3035	NC_016863	CAT	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987527
3036	NC_016863	CGG	2	6	141492	141497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987527
3037	NC_016863	GGT	2	6	141502	141507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987527
3038	NC_016863	ACG	2	6	141509	141514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987527
3039	NC_016863	GAA	2	6	141605	141610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987527
3040	NC_016863	GCA	2	6	141667	141672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987527
3041	NC_016863	AGC	2	6	141733	141738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987528
3042	NC_016863	GAA	2	6	141767	141772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987528
3043	NC_016863	TCA	2	6	141783	141788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987528
3044	NC_016863	T	7	7	141834	141840	0 %	100 %	0 %	0 %	378987528
3045	NC_016863	CG	3	6	141848	141853	0 %	0 %	50 %	50 %	378987528
3046	NC_016863	ACCG	2	8	141950	141957	25 %	0 %	25 %	50 %	378987528
3047	NC_016863	AAG	2	6	142014	142019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987528
3048	NC_016863	CGG	2	6	142030	142035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987528
3049	NC_016863	TTTA	2	8	142133	142140	25 %	75 %	0 %	0 %	378987528
3050	NC_016863	GC	3	6	142145	142150	0 %	0 %	50 %	50 %	378987528
3051	NC_016863	A	6	6	142181	142186	100 %	0 %	0 %	0 %	378987528
3052	NC_016863	CGC	2	6	142223	142228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987528
3053	NC_016863	TAC	2	6	142229	142234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987528
3054	NC_016863	GCGA	2	8	142341	142348	25 %	0 %	50 %	25 %	378987528
3055	NC_016863	TCC	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987528
3056	NC_016863	TGA	2	6	142435	142440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987528
3057	NC_016863	AAC	2	6	142472	142477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987528
3058	NC_016863	TGGCGA	2	12	142545	142556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378987528
3059	NC_016863	CAA	2	6	142576	142581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987528
3060	NC_016863	TGG	2	6	142662	142667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987528
3061	NC_016863	TGA	2	6	142668	142673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987528
3062	NC_016863	GC	3	6	142760	142765	0 %	0 %	50 %	50 %	378987528
3063	NC_016863	TAG	2	6	142854	142859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987528
3064	NC_016863	TACT	2	8	142861	142868	25 %	50 %	0 %	25 %	378987528
3065	NC_016863	GGT	2	6	142944	142949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987528
3066	NC_016863	AG	3	6	142957	142962	50 %	0 %	50 %	0 %	378987528
3067	NC_016863	GTG	2	6	143126	143131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987528
3068	NC_016863	ATG	2	6	143135	143140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987528
3069	NC_016863	GCG	4	12	143160	143171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987528
3070	NC_016863	A	6	6	143222	143227	100 %	0 %	0 %	0 %	378987528
3071	NC_016863	CAA	2	6	143251	143256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987528
3072	NC_016863	TGG	2	6	143310	143315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987528
3073	NC_016863	TCA	2	6	143319	143324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987528
3074	NC_016863	TAC	2	6	143345	143350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987528
3075	NC_016863	GGC	2	6	143351	143356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987528
3076	NC_016863	CAT	2	6	143383	143388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987528
3077	NC_016863	GCG	2	6	143391	143396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987528
3078	NC_016863	A	7	7	143442	143448	100 %	0 %	0 %	0 %	378987528
3079	NC_016863	TAAT	2	8	143457	143464	50 %	50 %	0 %	0 %	378987528
3080	NC_016863	CTT	2	6	143505	143510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987529
3081	NC_016863	GTGG	2	8	143516	143523	0 %	25 %	75 %	0 %	378987529
3082	NC_016863	CG	3	6	143534	143539	0 %	0 %	50 %	50 %	378987529
3083	NC_016863	GA	3	6	143548	143553	50 %	0 %	50 %	0 %	378987529
3084	NC_016863	GCG	2	6	143577	143582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987529
3085	NC_016863	GTG	2	6	143601	143606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987529
3086	NC_016863	TCA	2	6	143609	143614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987529
3087	NC_016863	AT	3	6	143630	143635	50 %	50 %	0 %	0 %	378987529
3088	NC_016863	ATT	2	6	143667	143672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987529
3089	NC_016863	GCGA	2	8	143691	143698	25 %	0 %	50 %	25 %	378987529
3090	NC_016863	GTC	2	6	143730	143735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987529
3091	NC_016863	CAGC	2	8	143741	143748	25 %	0 %	25 %	50 %	378987529
3092	NC_016863	TGG	2	6	143812	143817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987529
3093	NC_016863	ACC	4	12	143841	143852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987529
3094	NC_016863	ACT	2	6	143855	143860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987529
3095	NC_016863	TCT	2	6	144033	144038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987529
3096	NC_016863	GCA	2	6	144050	144055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987529
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3098	NC_016863	GCC	2	6	144078	144083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987529
3099	NC_016863	GGC	2	6	144146	144151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987529
3100	NC_016863	CCAC	2	8	144169	144176	25 %	0 %	0 %	75 %	378987529
3101	NC_016863	CAT	2	6	144177	144182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987529
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3104	NC_016863	TGGC	2	8	144225	144232	0 %	25 %	50 %	25 %	378987529
3105	NC_016863	CGA	2	6	144337	144342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987529
3106	NC_016863	CTG	2	6	144417	144422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987529
3107	NC_016863	CCG	2	6	144475	144480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987529
3108	NC_016863	CG	3	6	144479	144484	0 %	0 %	50 %	50 %	378987529
3109	NC_016863	GGT	3	9	144539	144547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987529
3110	NC_016863	GGC	2	6	144590	144595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987529
3111	NC_016863	GAA	2	6	144687	144692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987529
3112	NC_016863	TCG	2	6	144703	144708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987529
3113	NC_016863	TGAC	2	8	144712	144719	25 %	25 %	25 %	25 %	378987529
3114	NC_016863	GAG	2	6	144735	144740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987529
3115	NC_016863	CG	3	6	144742	144747	0 %	0 %	50 %	50 %	378987529
3116	NC_016863	CGT	2	6	144857	144862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987529
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3118	NC_016863	AC	3	6	145053	145058	50 %	0 %	0 %	50 %	378987530
3119	NC_016863	CTG	2	6	145157	145162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987530
3120	NC_016863	GTC	2	6	145167	145172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987530
3121	NC_016863	GCC	2	6	145235	145240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987530
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3123	NC_016863	CCG	2	6	145317	145322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987530
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3487	NC_016863	CTG	2	6	162929	162934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987545
3488	NC_016863	GCT	2	6	162997	163002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987545
3489	NC_016863	CAG	2	6	163019	163024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987545
3490	NC_016863	A	6	6	163080	163085	100 %	0 %	0 %	0 %	378987545
3491	NC_016863	TCT	2	6	163168	163173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987545
3492	NC_016863	TTA	2	6	163304	163309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987546
3493	NC_016863	GC	3	6	163336	163341	0 %	0 %	50 %	50 %	378987546
3494	NC_016863	CG	3	6	163383	163388	0 %	0 %	50 %	50 %	378987546
3495	NC_016863	CAT	2	6	163392	163397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987546
3496	NC_016863	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	378987546
3497	NC_016863	ACC	2	6	163442	163447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987546
3498	NC_016863	CAG	2	6	163486	163491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987546
3499	NC_016863	CTG	2	6	163525	163530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987546
3500	NC_016863	CTG	2	6	163549	163554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987546

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