MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016863	GCT	2	6	45872	45877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987443
1003	NC_016863	TAC	2	6	45942	45947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987443
1004	NC_016863	AACG	2	8	45959	45966	50 %	0 %	25 %	25 %	378987443
1005	NC_016863	ATC	2	6	46035	46040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016863	TGAC	2	8	46043	46050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_016863	A	6	6	46057	46062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016863	A	6	6	46091	46096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016863	TCA	2	6	46105	46110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016863	TA	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016863	TAG	2	6	46151	46156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016863	GAA	2	6	46161	46166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016863	GA	3	6	46178	46183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016863	T	6	6	46209	46214	0 %	100 %	0 %	0 %	378987444
1015	NC_016863	AGC	2	6	46215	46220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987444
1016	NC_016863	CAT	2	6	46235	46240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987444
1017	NC_016863	TCA	2	6	46243	46248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987444
1018	NC_016863	CGC	2	6	46250	46255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987444
1019	NC_016863	CAA	2	6	46355	46360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987444
1020	NC_016863	TGT	2	6	46369	46374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987444
1021	NC_016863	GCC	2	6	46488	46493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987444
1022	NC_016863	CGG	2	6	46496	46501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987444
1023	NC_016863	GAT	2	6	46502	46507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987444
1024	NC_016863	ACT	2	6	46537	46542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987444
1025	NC_016863	GGGCT	2	10	46562	46571	0 %	20 %	60 %	20 %	378987444
1026	NC_016863	ATC	2	6	46671	46676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987444
1027	NC_016863	GAT	2	6	46677	46682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987444
1028	NC_016863	TTA	2	6	46696	46701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987444
1029	NC_016863	GGC	2	6	46748	46753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987444
1030	NC_016863	GCT	2	6	46775	46780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987444
1031	NC_016863	GCG	2	6	46789	46794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987444
1032	NC_016863	TA	3	6	46810	46815	50 %	50 %	0 %	0 %	378987444
1033	NC_016863	CGG	2	6	46840	46845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987444
1034	NC_016863	GAAA	2	8	46907	46914	75 %	0 %	25 %	0 %	378987444
1035	NC_016863	TCGC	2	8	46922	46929	0 %	25 %	25 %	50 %	378987444
1036	NC_016863	TGC	2	6	47050	47055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987444
1037	NC_016863	ATT	2	6	47064	47069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987444
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1039	NC_016863	GCTG	2	8	47113	47120	0 %	25 %	50 %	25 %	378987444
1040	NC_016863	TG	3	6	47191	47196	0 %	50 %	50 %	0 %	378987444
1041	NC_016863	TTA	2	6	47260	47265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987444
1042	NC_016863	GTG	2	6	47310	47315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987444
1043	NC_016863	GC	4	8	47330	47337	0 %	0 %	50 %	50 %	378987444
1044	NC_016863	GA	3	6	47412	47417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016863	TAT	2	6	47452	47457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987445
1046	NC_016863	AAG	2	6	47474	47479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987445
1047	NC_016863	CGC	2	6	47516	47521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987445
1048	NC_016863	TGT	2	6	47702	47707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987445
1049	NC_016863	CAG	2	6	47748	47753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987445
1050	NC_016863	GCG	2	6	47764	47769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987445
1051	NC_016863	GTG	3	9	47770	47778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987445
1052	NC_016863	CACG	2	8	47811	47818	25 %	0 %	25 %	50 %	378987445
1053	NC_016863	CAGC	2	8	47838	47845	25 %	0 %	25 %	50 %	378987445
1054	NC_016863	GCA	2	6	47889	47894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987445
1055	NC_016863	CTGC	2	8	47975	47982	0 %	25 %	25 %	50 %	378987445
1056	NC_016863	GTT	2	6	48036	48041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987445
1057	NC_016863	TGA	2	6	48090	48095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987445
1058	NC_016863	GAA	2	6	48220	48225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987445
1059	NC_016863	GA	3	6	48244	48249	50 %	0 %	50 %	0 %	378987445
1060	NC_016863	CGG	2	6	48263	48268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987445
1061	NC_016863	ACT	2	6	48290	48295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987445
1062	NC_016863	TACC	2	8	48322	48329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_016863	CAG	2	6	48382	48387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987446
1064	NC_016863	GCGTA	2	10	48438	48447	20 %	20 %	40 %	20 %	378987446
1065	NC_016863	CCT	2	6	48461	48466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987446
1066	NC_016863	CATG	2	8	48543	48550	25 %	25 %	25 %	25 %	378987446
1067	NC_016863	CAG	2	6	48562	48567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987446
1068	NC_016863	TCC	2	6	48671	48676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987446
1069	NC_016863	CCA	2	6	48929	48934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987446
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1071	NC_016863	CGT	2	6	48952	48957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987446
1072	NC_016863	CCA	2	6	48958	48963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987446
1073	NC_016863	GCA	2	6	48995	49000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987446
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1076	NC_016863	A	6	6	49135	49140	100 %	0 %	0 %	0 %	378987446
1077	NC_016863	CCGGC	2	10	49185	49194	0 %	0 %	40 %	60 %	378987446
1078	NC_016863	GTCGTA	2	12	49210	49221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378987446
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1081	NC_016863	CCAG	2	8	49395	49402	25 %	0 %	25 %	50 %	378987446
1082	NC_016863	CG	3	6	49524	49529	0 %	0 %	50 %	50 %	378987446
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1085	NC_016863	CAG	2	6	49627	49632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987446
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1088	NC_016863	AGT	2	6	49764	49769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987446
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1093	NC_016863	TTGA	2	8	50176	50183	25 %	50 %	25 %	0 %	378987446
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1097	NC_016863	TTG	2	6	50395	50400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987446
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1101	NC_016863	AGT	2	6	50519	50524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987447
1102	NC_016863	GCA	2	6	50594	50599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987447
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1107	NC_016863	CAT	2	6	50860	50865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987447
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1109	NC_016863	CAG	2	6	50887	50892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987447
1110	NC_016863	AAG	2	6	50933	50938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987447
1111	NC_016863	GAT	2	6	50947	50952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987447
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1118	NC_016863	GC	3	6	51210	51215	0 %	0 %	50 %	50 %	378987447
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1127	NC_016863	GC	3	6	51510	51515	0 %	0 %	50 %	50 %	378987447
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1132	NC_016863	CAG	2	6	51724	51729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987447
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1239	NC_016863	TGT	2	6	57049	57054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987452
1240	NC_016863	CGGCG	2	10	57127	57136	0 %	0 %	60 %	40 %	378987452
1241	NC_016863	AGCGC	2	10	57235	57244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1242	NC_016863	GTG	2	6	57257	57262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_016863	TTCAC	2	10	57382	57391	20 %	40 %	0 %	40 %	378987453
1244	NC_016863	GAT	2	6	57402	57407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987453
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1246	NC_016863	AGCC	2	8	57442	57449	25 %	0 %	25 %	50 %	378987453
1247	NC_016863	AGC	3	9	57490	57498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987453
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1249	NC_016863	AAAG	2	8	57521	57528	75 %	0 %	25 %	0 %	378987453
1250	NC_016863	CGC	2	6	57548	57553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987453
1251	NC_016863	GGC	2	6	57608	57613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987453
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1253	NC_016863	TTG	2	6	57858	57863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987454
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