MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016863	CGG	2	6	22995	23000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987423
502	NC_016863	CTGG	2	8	23001	23008	0 %	25 %	50 %	25 %	378987423
503	NC_016863	TAT	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987423
504	NC_016863	ATA	2	6	23052	23057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987423
505	NC_016863	TTA	2	6	23167	23172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016863	TCTTAA	2	12	23204	23215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_016863	TTAT	2	8	23266	23273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016863	A	7	7	23339	23345	100 %	0 %	0 %	0 %	378987424
509	NC_016863	TGA	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987424
510	NC_016863	ACG	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987424
511	NC_016863	ATA	2	6	23370	23375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987424
512	NC_016863	CTTTT	2	10	23394	23403	0 %	80 %	0 %	20 %	378987424
513	NC_016863	T	6	6	23400	23405	0 %	100 %	0 %	0 %	378987424
514	NC_016863	CAG	2	6	23408	23413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987424
515	NC_016863	TTG	2	6	23453	23458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987424
516	NC_016863	TTTA	2	8	23499	23506	25 %	75 %	0 %	0 %	378987424
517	NC_016863	GTT	2	6	23549	23554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987424
518	NC_016863	ATG	2	6	23565	23570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987424
519	NC_016863	AT	3	6	23583	23588	50 %	50 %	0 %	0 %	378987424
520	NC_016863	CG	3	6	23653	23658	0 %	0 %	50 %	50 %	378987424
521	NC_016863	ACG	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987424
522	NC_016863	TGA	2	6	23790	23795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987424
523	NC_016863	GC	4	8	23796	23803	0 %	0 %	50 %	50 %	378987424
524	NC_016863	GCT	2	6	23848	23853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987424
525	NC_016863	TCTG	2	8	23956	23963	0 %	50 %	25 %	25 %	378987424
526	NC_016863	A	7	7	23968	23974	100 %	0 %	0 %	0 %	378987424
527	NC_016863	GGC	2	6	24000	24005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987424
528	NC_016863	AT	3	6	24057	24062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016863	GTT	2	6	24117	24122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016863	ACA	2	6	24196	24201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016863	GAT	2	6	24233	24238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016863	TAA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016863	TAA	2	6	24267	24272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016863	ACG	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016863	AAG	2	6	24354	24359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016863	T	7	7	24364	24370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016863	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016863	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016863	A	6	6	24426	24431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016863	TGAA	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	378987425
541	NC_016863	TGT	2	6	24522	24527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987425
542	NC_016863	TAC	2	6	24544	24549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987425
543	NC_016863	CGGTA	2	10	24562	24571	20 %	20 %	40 %	20 %	378987425
544	NC_016863	CGC	2	6	24595	24600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987425
545	NC_016863	CTGTT	2	10	24601	24610	0 %	60 %	20 %	20 %	378987425
546	NC_016863	TGG	2	6	24681	24686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987425
547	NC_016863	AGA	2	6	24697	24702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987425
548	NC_016863	CCAG	2	8	24738	24745	25 %	0 %	25 %	50 %	378987425
549	NC_016863	GCG	2	6	24749	24754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987425
550	NC_016863	CGA	2	6	24825	24830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987425
551	NC_016863	ATG	2	6	24906	24911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987425
552	NC_016863	T	7	7	25026	25032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016863	CG	3	6	25065	25070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_016863	A	8	8	25116	25123	100 %	0 %	0 %	0 %	378987426
555	NC_016863	ATT	2	6	25142	25147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987426
556	NC_016863	CTG	2	6	25152	25157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987426
557	NC_016863	CGG	2	6	25159	25164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987426
558	NC_016863	CCT	2	6	25246	25251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987426
559	NC_016863	ATT	2	6	25257	25262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987426
560	NC_016863	TTC	2	6	25265	25270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987426
561	NC_016863	T	7	7	25282	25288	0 %	100 %	0 %	0 %	378987426
562	NC_016863	CGC	2	6	25345	25350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987426
563	NC_016863	CT	3	6	25351	25356	0 %	50 %	0 %	50 %	378987426
564	NC_016863	A	6	6	25371	25376	100 %	0 %	0 %	0 %	378987426
565	NC_016863	AT	3	6	25381	25386	50 %	50 %	0 %	0 %	378987426
566	NC_016863	TAT	2	6	25391	25396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987426
567	NC_016863	ACCG	2	8	25415	25422	25 %	0 %	25 %	50 %	378987426
568	NC_016863	TATTT	2	10	25435	25444	20 %	80 %	0 %	0 %	378987426
569	NC_016863	AAAT	2	8	25475	25482	75 %	25 %	0 %	0 %	378987426
570	NC_016863	TAC	2	6	25632	25637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987426
571	NC_016863	A	6	6	25668	25673	100 %	0 %	0 %	0 %	378987426
572	NC_016863	CCG	2	6	25692	25697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987426
573	NC_016863	ACG	2	6	25767	25772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987426
574	NC_016863	ATG	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987426
575	NC_016863	TCTG	2	8	25932	25939	0 %	50 %	25 %	25 %	378987427
576	NC_016863	GGC	2	6	25989	25994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
577	NC_016863	ACG	2	6	26071	26076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
578	NC_016863	GC	3	6	26084	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
579	NC_016863	GCCT	2	8	26113	26120	0 %	25 %	25 %	50 %	378987427
580	NC_016863	GGC	3	9	26181	26189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
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582	NC_016863	GCA	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
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584	NC_016863	GGC	2	6	26398	26403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
585	NC_016863	ACT	2	6	26471	26476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987427
586	NC_016863	GCG	2	6	26495	26500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
587	NC_016863	AGCGAC	2	12	26509	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
588	NC_016863	GCA	2	6	26523	26528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
589	NC_016863	ATT	2	6	26607	26612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987427
590	NC_016863	CCTT	2	8	26619	26626	0 %	50 %	0 %	50 %	378987427
591	NC_016863	GAC	2	6	26650	26655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
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593	NC_016863	GCC	2	6	26769	26774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
594	NC_016863	CCG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
595	NC_016863	GCG	2	6	26816	26821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
596	NC_016863	CCG	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
597	NC_016863	GGC	2	6	26909	26914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
598	NC_016863	GCG	2	6	26923	26928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
599	NC_016863	TAG	2	6	26952	26957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
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601	NC_016863	GCG	2	6	27074	27079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
602	NC_016863	ATA	2	6	27143	27148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987427
603	NC_016863	GAT	2	6	27262	27267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
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608	NC_016863	TTA	2	6	27425	27430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987427
609	NC_016863	CAGC	2	8	27435	27442	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
610	NC_016863	TGA	2	6	27459	27464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
611	NC_016863	TTG	2	6	27475	27480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987427
612	NC_016863	ACA	2	6	27530	27535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987427
613	NC_016863	TGA	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
614	NC_016863	CTG	2	6	27718	27723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987427
615	NC_016863	ACA	2	6	27743	27748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987427
616	NC_016863	GCG	2	6	27785	27790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
617	NC_016863	CAG	2	6	27865	27870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
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619	NC_016863	TGG	2	6	27896	27901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987427
620	NC_016863	AGCC	2	8	27925	27932	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
621	NC_016863	CG	3	6	28014	28019	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
622	NC_016863	GGT	2	6	28029	28034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987427
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624	NC_016863	GAT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
625	NC_016863	TGA	2	6	28107	28112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
626	NC_016863	CCGA	2	8	28132	28139	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
627	NC_016863	GC	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
628	NC_016863	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
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630	NC_016863	TTG	2	6	28268	28273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987427
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