MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016863	GCG	2	6	279284	279289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987641
6002	NC_016863	GCT	2	6	279328	279333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987641
6003	NC_016863	ACTG	2	8	279359	279366	25 %	25 %	25 %	25 %	378987641
6004	NC_016863	CGG	2	6	279372	279377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987641
6005	NC_016863	CT	3	6	279392	279397	0 %	50 %	0 %	50 %	378987641
6006	NC_016863	CGG	2	6	279422	279427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987641
6007	NC_016863	GCG	2	6	279428	279433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987641
6008	NC_016863	GCTG	2	8	279444	279451	0 %	25 %	50 %	25 %	378987641
6009	NC_016863	AGG	2	6	279504	279509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987641
6010	NC_016863	TGGCGC	2	12	279510	279521	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378987641
6011	NC_016863	CGA	2	6	279523	279528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987641
6012	NC_016863	TGG	2	6	279587	279592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987641
6013	NC_016863	ACA	2	6	279610	279615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987641
6014	NC_016863	ACG	2	6	279620	279625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987641
6015	NC_016863	CTGC	2	8	279659	279666	0 %	25 %	25 %	50 %	378987641
6016	NC_016863	TGG	2	6	279694	279699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987641
6017	NC_016863	GAA	2	6	279722	279727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987641
6018	NC_016863	CGA	2	6	279833	279838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987641
6019	NC_016863	CGC	2	6	279846	279851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987641
6020	NC_016863	TGT	2	6	279852	279857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987641
6021	NC_016863	AGC	2	6	279910	279915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987641
6022	NC_016863	AGA	2	6	279916	279921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987641
6023	NC_016863	AAG	2	6	279924	279929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987641
6024	NC_016863	GCGCT	2	10	279958	279967	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6025	NC_016863	CAC	2	6	280015	280020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_016863	CAA	2	6	280028	280033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_016863	ATG	2	6	280225	280230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987642
6028	NC_016863	TCAT	2	8	280286	280293	25 %	50 %	0 %	25 %	378987642
6029	NC_016863	GCA	2	6	280323	280328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987643
6030	NC_016863	GCC	2	6	280371	280376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987643
6031	NC_016863	CCT	2	6	280491	280496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987643
6032	NC_016863	CGT	2	6	280713	280718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987644
6033	NC_016863	ATG	2	6	280801	280806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987644
6034	NC_016863	TGA	2	6	280836	280841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987644
6035	NC_016863	ATC	2	6	280904	280909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987644
6036	NC_016863	GCGA	2	8	280978	280985	25 %	0 %	50 %	25 %	378987644
6037	NC_016863	GCG	2	6	281014	281019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987644
6038	NC_016863	TGG	2	6	281026	281031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987644
6039	NC_016863	CAG	2	6	281032	281037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987644
6040	NC_016863	GC	3	6	281051	281056	0 %	0 %	50 %	50 %	378987644
6041	NC_016863	CGA	2	6	281144	281149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987644
6042	NC_016863	AAT	2	6	281185	281190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987644
6043	NC_016863	GGT	2	6	281301	281306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987645
6044	NC_016863	TAT	2	6	281376	281381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987645
6045	NC_016863	GCCA	2	8	281400	281407	25 %	0 %	25 %	50 %	378987645
6046	NC_016863	GAT	2	6	281421	281426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987645
6047	NC_016863	TCATTA	2	12	281431	281442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378987645
6048	NC_016863	TCT	2	6	281601	281606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987645
6049	NC_016863	TCG	2	6	281630	281635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987645
6050	NC_016863	TAA	2	6	281742	281747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987646
6051	NC_016863	GGC	2	6	281781	281786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987646
6052	NC_016863	GCA	2	6	281802	281807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987646
6053	NC_016863	GCG	2	6	281816	281821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987646
6054	NC_016863	TGC	2	6	281822	281827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987646
6055	NC_016863	TGA	2	6	281888	281893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987646
6056	NC_016863	GAA	2	6	281917	281922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987646
6057	NC_016863	CGG	2	6	281960	281965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987646
6058	NC_016863	TAT	2	6	282004	282009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987646
6059	NC_016863	CG	3	6	282010	282015	0 %	0 %	50 %	50 %	378987646
6060	NC_016863	GTAT	3	12	282131	282142	25 %	50 %	25 %	0 %	378987646
6061	NC_016863	GCG	2	6	282154	282159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987646
6062	NC_016863	GGC	2	6	282231	282236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987646
6063	NC_016863	TGC	2	6	282260	282265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987646
6064	NC_016863	CACT	2	8	282372	282379	25 %	25 %	0 %	50 %	378987646
6065	NC_016863	CAA	2	6	282441	282446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_016863	ACG	2	6	282524	282529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987647
6067	NC_016863	TCG	2	6	282546	282551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987647
6068	NC_016863	GTC	2	6	282641	282646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987647
6069	NC_016863	GC	4	8	282667	282674	0 %	0 %	50 %	50 %	378987647
6070	NC_016863	AGC	2	6	282809	282814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987647
6071	NC_016863	AGC	2	6	282844	282849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987647
6072	NC_016863	CAA	2	6	283021	283026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987647
6073	NC_016863	AGT	2	6	283063	283068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987647
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6075	NC_016863	CGAT	2	8	283122	283129	25 %	25 %	25 %	25 %	378987647
6076	NC_016863	ATTA	2	8	283178	283185	50 %	50 %	0 %	0 %	378987647
6077	NC_016863	TCT	2	6	283197	283202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987647
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6079	NC_016863	CGC	2	6	283273	283278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987647
6080	NC_016863	CAG	2	6	283283	283288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987647
6081	NC_016863	CCA	2	6	283291	283296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987647
6082	NC_016863	CAG	2	6	283328	283333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987647
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6084	NC_016863	CCA	2	6	283372	283377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987647
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6087	NC_016863	GCG	2	6	283450	283455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987647
6088	NC_016863	CGC	2	6	283522	283527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987647
6089	NC_016863	GCC	2	6	283562	283567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987647
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6091	NC_016863	TCA	2	6	283702	283707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987647
6092	NC_016863	CG	3	6	283714	283719	0 %	0 %	50 %	50 %	378987647
6093	NC_016863	TCA	2	6	283749	283754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987647
6094	NC_016863	GAA	2	6	283775	283780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987647
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6096	NC_016863	GCA	2	6	283891	283896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987647
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6098	NC_016863	GGCT	2	8	283943	283950	0 %	25 %	50 %	25 %	378987647
6099	NC_016863	GTT	2	6	283985	283990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987647
6100	NC_016863	CACG	2	8	283999	284006	25 %	0 %	25 %	50 %	378987647
6101	NC_016863	T	6	6	284018	284023	0 %	100 %	0 %	0 %	378987647
6102	NC_016863	TA	3	6	284053	284058	50 %	50 %	0 %	0 %	378987647
6103	NC_016863	ATC	2	6	284079	284084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987647
6104	NC_016863	GC	3	6	284088	284093	0 %	0 %	50 %	50 %	378987647
6105	NC_016863	TGG	2	6	284103	284108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987647
6106	NC_016863	TGT	2	6	284173	284178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987647
6107	NC_016863	A	7	7	284226	284232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016863	AAAT	2	8	284430	284437	75 %	25 %	0 %	0 %	378987648
6109	NC_016863	CGT	2	6	284467	284472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987648
6110	NC_016863	GGC	3	9	284542	284550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987648
6111	NC_016863	CCA	2	6	284592	284597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987648
6112	NC_016863	CCA	2	6	284610	284615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987648
6113	NC_016863	CT	3	6	284645	284650	0 %	50 %	0 %	50 %	378987648
6114	NC_016863	GCC	2	6	284775	284780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987648
6115	NC_016863	GCC	2	6	284782	284787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987648
6116	NC_016863	TGA	2	6	284798	284803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987648
6117	NC_016863	CGC	2	6	284889	284894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987648
6118	NC_016863	GACCA	2	10	284905	284914	40 %	0 %	20 %	40 %	378987648
6119	NC_016863	GCT	2	6	284983	284988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987648
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6122	NC_016863	GC	3	6	285126	285131	0 %	0 %	50 %	50 %	378987649
6123	NC_016863	CGC	2	6	285179	285184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987649
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6499	NC_016863	CGGG	2	8	305194	305201	0 %	0 %	75 %	25 %	378987664
6500	NC_016863	CG	3	6	305212	305217	0 %	0 %	50 %	50 %	378987664

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