MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016863	TGC	2	6	209702	209707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987583
4502	NC_016863	GAC	2	6	209739	209744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_016863	T	6	6	209766	209771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016863	AT	3	6	209785	209790	50 %	50 %	0 %	0 %	378987584
4505	NC_016863	GTT	2	6	209801	209806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987584
4506	NC_016863	ACG	2	6	209870	209875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987584
4507	NC_016863	GCC	2	6	209882	209887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987584
4508	NC_016863	ATT	2	6	209973	209978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987584
4509	NC_016863	TGG	2	6	210168	210173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987584
4510	NC_016863	ATT	2	6	210191	210196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987584
4511	NC_016863	GGCT	2	8	210252	210259	0 %	25 %	50 %	25 %	378987584
4512	NC_016863	ATC	2	6	210312	210317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987584
4513	NC_016863	TGA	2	6	210328	210333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987584
4514	NC_016863	CCA	2	6	210360	210365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987584
4515	NC_016863	TTCGG	2	10	210370	210379	0 %	40 %	40 %	20 %	378987584
4516	NC_016863	GGA	2	6	210445	210450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987584
4517	NC_016863	GC	4	8	210479	210486	0 %	0 %	50 %	50 %	378987584
4518	NC_016863	TGA	2	6	210502	210507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987584
4519	NC_016863	TAT	2	6	210577	210582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987584
4520	NC_016863	T	6	6	210697	210702	0 %	100 %	0 %	0 %	378987584
4521	NC_016863	CGC	2	6	210722	210727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987584
4522	NC_016863	TA	3	6	210735	210740	50 %	50 %	0 %	0 %	378987584
4523	NC_016863	ATA	2	6	210753	210758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987584
4524	NC_016863	CGG	2	6	210782	210787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987584
4525	NC_016863	TCTT	2	8	210820	210827	0 %	75 %	0 %	25 %	378987584
4526	NC_016863	AGC	2	6	210862	210867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987584
4527	NC_016863	TGC	2	6	210936	210941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987584
4528	NC_016863	CTT	2	6	211114	211119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987585
4529	NC_016863	GCC	2	6	211179	211184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987585
4530	NC_016863	GAT	2	6	211199	211204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987585
4531	NC_016863	CTTGC	2	10	211379	211388	0 %	40 %	20 %	40 %	378987585
4532	NC_016863	CTT	2	6	211408	211413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_016863	GGC	2	6	211554	211559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987586
4534	NC_016863	CAG	2	6	211599	211604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4535	NC_016863	GTC	2	6	211629	211634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4536	NC_016863	TTCA	2	8	211650	211657	25 %	50 %	0 %	25 %	378987586
4537	NC_016863	GGCAAT	2	12	211668	211679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378987586
4538	NC_016863	TCA	2	6	211730	211735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987586
4539	NC_016863	GCT	2	6	211763	211768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4540	NC_016863	TGAGC	2	10	211791	211800	20 %	20 %	40 %	20 %	378987586
4541	NC_016863	AAT	2	6	211821	211826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987586
4542	NC_016863	CGA	2	6	211835	211840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4543	NC_016863	CCA	2	6	211865	211870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987586
4544	NC_016863	CGC	2	6	211967	211972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987586
4545	NC_016863	AG	3	6	212010	212015	50 %	0 %	50 %	0 %	378987586
4546	NC_016863	ACGT	2	8	212029	212036	25 %	25 %	25 %	25 %	378987586
4547	NC_016863	CAC	2	6	212202	212207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987586
4548	NC_016863	CGT	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4549	NC_016863	TGG	2	6	212267	212272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987586
4550	NC_016863	GAC	2	6	212306	212311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4551	NC_016863	GCA	2	6	212324	212329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987586
4552	NC_016863	CAA	2	6	212354	212359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987586
4553	NC_016863	TGA	2	6	212376	212381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016863	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4555	NC_016863	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4556	NC_016863	TTC	2	6	212495	212500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987587
4557	NC_016863	CTG	2	6	212537	212542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4558	NC_016863	CGG	2	6	212545	212550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987587
4559	NC_016863	CCG	2	6	212604	212609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987587
4560	NC_016863	GCCGAT	2	12	212666	212677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4561	NC_016863	GCAC	2	8	212725	212732	25 %	0 %	25 %	50 %	378987587
4562	NC_016863	CCAGCA	2	12	212734	212745	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378987587
4563	NC_016863	CAG	2	6	212783	212788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4564	NC_016863	GCC	2	6	212825	212830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987587
4565	NC_016863	CCAG	2	8	212914	212921	25 %	0 %	25 %	50 %	378987587
4566	NC_016863	GCC	2	6	212924	212929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987587
4567	NC_016863	CGCA	2	8	212954	212961	25 %	0 %	25 %	50 %	378987587
4568	NC_016863	GC	3	6	213043	213048	0 %	0 %	50 %	50 %	378987587
4569	NC_016863	CG	3	6	213059	213064	0 %	0 %	50 %	50 %	378987587
4570	NC_016863	CAGG	2	8	213094	213101	25 %	0 %	50 %	25 %	378987587
4571	NC_016863	AG	3	6	213132	213137	50 %	0 %	50 %	0 %	378987587
4572	NC_016863	TCG	2	6	213165	213170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4573	NC_016863	T	6	6	213221	213226	0 %	100 %	0 %	0 %	378987587
4574	NC_016863	CTTG	2	8	213229	213236	0 %	50 %	25 %	25 %	378987587
4575	NC_016863	GCA	2	6	213244	213249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987587
4576	NC_016863	TGG	3	9	213256	213264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987587
4577	NC_016863	G	6	6	213326	213331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016863	GCA	2	6	213411	213416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987588
4579	NC_016863	AGATC	2	10	213460	213469	40 %	20 %	20 %	20 %	378987588
4580	NC_016863	CGGT	2	8	213540	213547	0 %	25 %	50 %	25 %	378987588
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4586	NC_016863	CGCGG	2	10	213882	213891	0 %	0 %	60 %	40 %	378987589
4587	NC_016863	CG	3	6	213892	213897	0 %	0 %	50 %	50 %	378987589
4588	NC_016863	ACG	2	6	213913	213918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987589
4589	NC_016863	GCG	2	6	213919	213924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987589
4590	NC_016863	TCG	2	6	213935	213940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987589
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4593	NC_016863	TAT	2	6	214026	214031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987589
4594	NC_016863	GC	3	6	214043	214048	0 %	0 %	50 %	50 %	378987589
4595	NC_016863	CGCGG	2	10	214066	214075	0 %	0 %	60 %	40 %	378987589
4596	NC_016863	CAT	2	6	214212	214217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987589
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4599	NC_016863	CAG	2	6	214285	214290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987589
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4604	NC_016863	GGT	2	6	214455	214460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987589
4605	NC_016863	GTT	2	6	214470	214475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987589
4606	NC_016863	GC	3	6	214531	214536	0 %	0 %	50 %	50 %	378987589
4607	NC_016863	GGA	2	6	214538	214543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987589
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4609	NC_016863	CTT	2	6	214698	214703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987589
4610	NC_016863	CCG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987589
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4612	NC_016863	TCT	2	6	214796	214801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987589
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4994	NC_016863	T	6	6	230386	230391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_016863	TAT	2	6	230408	230413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_016863	TAAA	2	8	230432	230439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4998	NC_016863	TTAT	2	8	230494	230501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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