MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	G	9	9	914	922	0 %	0 %	100 %	0 %	378987267
2	NC_016861	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	378987269
3	NC_016861	A	6	6	3642	3647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016861	T	6	6	4134	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	378987272
5	NC_016861	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	378987272
6	NC_016861	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	378987272
7	NC_016861	A	7	7	4696	4702	100 %	0 %	0 %	0 %	378987272
8	NC_016861	C	7	7	4774	4780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_016861	A	6	6	4903	4908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016861	T	7	7	5539	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	378987273
11	NC_016861	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	378987274
12	NC_016861	A	6	6	7265	7270	100 %	0 %	0 %	0 %	378987276
13	NC_016861	A	6	6	7464	7469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016861	T	6	6	8482	8487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016861	C	6	6	9382	9387	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_016861	C	6	6	9913	9918	0 %	0 %	0 %	100 %	378987279
17	NC_016861	C	6	6	11009	11014	0 %	0 %	0 %	100 %	378987281
18	NC_016861	T	6	6	12279	12284	0 %	100 %	0 %	0 %	378987281
19	NC_016861	C	6	6	13346	13351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_016861	T	6	6	14109	14114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016861	A	6	6	14889	14894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016861	A	6	6	14944	14949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016861	A	6	6	14951	14956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016861	A	6	6	14980	14985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016861	A	6	6	15004	15009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016861	A	6	6	15129	15134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016861	T	7	7	15361	15367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016861	A	6	6	15386	15391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016861	A	6	6	15530	15535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016861	A	6	6	15739	15744	100 %	0 %	0 %	0 %	378987285
31	NC_016861	A	6	6	15945	15950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016861	T	6	6	17626	17631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016861	T	7	7	18087	18093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016861	A	6	6	19021	19026	100 %	0 %	0 %	0 %	378987290
35	NC_016861	A	6	6	19569	19574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016861	A	6	6	19767	19772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016861	A	6	6	20079	20084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016861	A	6	6	21420	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	378987294
39	NC_016861	G	6	6	22700	22705	0 %	0 %	100 %	0 %	378987296
40	NC_016861	G	6	6	22870	22875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016861	A	6	6	22944	22949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016861	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	378987300
43	NC_016861	T	6	6	25470	25475	0 %	100 %	0 %	0 %	378987302
44	NC_016861	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016861	T	7	7	26323	26329	0 %	100 %	0 %	0 %	378987304
46	NC_016861	T	6	6	26392	26397	0 %	100 %	0 %	0 %	378987304
47	NC_016861	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	378987304
48	NC_016861	A	6	6	26972	26977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016861	G	6	6	27069	27074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016861	T	9	9	27960	27968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016861	T	6	6	28000	28005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016861	A	6	6	28014	28019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016861	A	7	7	31690	31696	100 %	0 %	0 %	0 %	378987310
54	NC_016861	T	6	6	31795	31800	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
55	NC_016861	T	6	6	31953	31958	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
56	NC_016861	T	6	6	31991	31996	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
57	NC_016861	T	6	6	32290	32295	0 %	100 %	0 %	0 %	378987310
58	NC_016861	T	10	10	32323	32332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016861	A	6	6	32346	32351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016861	A	6	6	32614	32619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016861	C	6	6	33996	34001	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_016861	T	6	6	34754	34759	0 %	100 %	0 %	0 %	378987312
63	NC_016861	A	6	6	39444	39449	100 %	0 %	0 %	0 %	378987318
64	NC_016861	T	7	7	39663	39669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016861	A	6	6	39682	39687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016861	A	6	6	39809	39814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016861	T	6	6	42725	42730	0 %	100 %	0 %	0 %	378987322
68	NC_016861	A	7	7	44018	44024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_016861	A	6	6	46799	46804	100 %	0 %	0 %	0 %	378987329
71	NC_016861	A	7	7	47591	47597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016861	A	6	6	50058	50063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016861	T	6	6	50277	50282	0 %	100 %	0 %	0 %	378987335
74	NC_016861	G	6	6	51187	51192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016861	T	6	6	55677	55682	0 %	100 %	0 %	0 %	378987342
76	NC_016861	A	6	6	56062	56067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016861	T	6	6	56123	56128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016861	A	6	6	56411	56416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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96	NC_016861	A	6	6	72296	72301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_016861	A	6	6	73577	73582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016861	A	7	7	74086	74092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_016861	A	6	6	80329	80334	100 %	0 %	0 %	0 %	378987379
112	NC_016861	A	8	8	81679	81686	100 %	0 %	0 %	0 %	378987382
113	NC_016861	A	6	6	82930	82935	100 %	0 %	0 %	0 %	378987382
114	NC_016861	T	6	6	83970	83975	0 %	100 %	0 %	0 %	378987383
115	NC_016861	A	6	6	83991	83996	100 %	0 %	0 %	0 %	378987383
116	NC_016861	G	6	6	85871	85876	0 %	0 %	100 %	0 %	378987386
117	NC_016861	G	6	6	89257	89262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_016861	G	6	6	93019	93024	0 %	0 %	100 %	0 %	378987395
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131	NC_016861	A	6	6	97392	97397	100 %	0 %	0 %	0 %	378987398
132	NC_016861	A	6	6	97894	97899	100 %	0 %	0 %	0 %	378987398
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135	NC_016861	T	6	6	99397	99402	0 %	100 %	0 %	0 %	378987399
136	NC_016861	T	6	6	99495	99500	0 %	100 %	0 %	0 %	378987399
137	NC_016861	C	6	6	103799	103804	0 %	0 %	0 %	100 %	378987401
138	NC_016861	T	6	6	105814	105819	0 %	100 %	0 %	0 %	378987402
139	NC_016861	A	8	8	106089	106096	100 %	0 %	0 %	0 %	378987403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.