MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 1524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987265
2	NC_016861	CCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987265
3	NC_016861	AGT	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987265
4	NC_016861	GCG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987265
5	NC_016861	GCC	3	9	274	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987265
6	NC_016861	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016861	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987266
8	NC_016861	AGG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987266
9	NC_016861	GAA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987266
10	NC_016861	GCG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987266
11	NC_016861	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987266
12	NC_016861	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016861	CGT	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016861	TAA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016861	ACT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016861	CTG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987267
17	NC_016861	AGC	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987267
18	NC_016861	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987267
19	NC_016861	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987267
20	NC_016861	CAG	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987267
21	NC_016861	CTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987268
22	NC_016861	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987268
23	NC_016861	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987268
24	NC_016861	GCA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987268
25	NC_016861	GTC	2	6	1130	1135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987268
26	NC_016861	GTA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016861	GAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016861	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987269
29	NC_016861	GAC	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987269
30	NC_016861	GCA	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987269
31	NC_016861	ACT	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987269
32	NC_016861	CTA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987269
33	NC_016861	AAG	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016861	TGA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016861	TCT	2	6	1760	1765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016861	CCA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016861	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987270
38	NC_016861	TGC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987270
39	NC_016861	CGT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987270
40	NC_016861	GCT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987270
41	NC_016861	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987270
42	NC_016861	CGC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987270
43	NC_016861	CAG	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987270
44	NC_016861	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987270
45	NC_016861	CAG	2	6	2639	2644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987270
46	NC_016861	CGG	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987270
47	NC_016861	GCG	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987270
48	NC_016861	ATG	3	9	2729	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987270
49	NC_016861	CCA	2	6	2790	2795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016861	GGA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016861	GCC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016861	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016861	CTG	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016861	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016861	TCA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016861	ACA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016861	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016861	CAC	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016861	GCC	3	9	3325	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016861	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016861	ATG	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016861	CAG	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016861	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016861	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016861	GCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016861	ACG	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016861	ACT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987272
68	NC_016861	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987272
69	NC_016861	CAG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987272
70	NC_016861	CAC	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987272
71	NC_016861	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987272
72	NC_016861	ACC	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987272
73	NC_016861	TCC	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987272
74	NC_016861	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987272
75	NC_016861	AGT	3	9	4820	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016861	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016861	CAC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016861	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016861	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016861	CAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987273
81	NC_016861	ACG	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987273
82	NC_016861	GCG	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987273
83	NC_016861	CAG	3	9	5516	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987273
84	NC_016861	CGC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016861	TCC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987274
86	NC_016861	GTT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987274
87	NC_016861	CCA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987274
88	NC_016861	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987274
89	NC_016861	TGC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987274
90	NC_016861	CCG	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987274
91	NC_016861	GCA	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987274
92	NC_016861	CCA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987274
93	NC_016861	GAG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987274
94	NC_016861	CTG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987274
95	NC_016861	GCC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987274
96	NC_016861	CAG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987274
97	NC_016861	TGC	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987274
98	NC_016861	GTG	3	9	6485	6493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016861	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987275
100	NC_016861	CAG	3	9	6606	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987275
101	NC_016861	GGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987275
102	NC_016861	ATC	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987275
103	NC_016861	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987276
104	NC_016861	ACC	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
105	NC_016861	GCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987276
106	NC_016861	GGC	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987276
107	NC_016861	TTG	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987276
108	NC_016861	CCA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
109	NC_016861	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987276
110	NC_016861	CGG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987276
111	NC_016861	CCA	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
112	NC_016861	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987276
113	NC_016861	TCA	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987276
114	NC_016861	CAG	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987276
115	NC_016861	CCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
116	NC_016861	ACC	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987276
117	NC_016861	ATA	2	6	7275	7280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987276
118	NC_016861	CAG	3	9	7384	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016861	TCA	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016861	GGC	2	6	7424	7429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016861	TAA	2	6	7522	7527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016861	CAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016861	CTT	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987277
124	NC_016861	CAT	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987277
125	NC_016861	GCA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987277
126	NC_016861	GCA	3	9	7786	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987277
127	NC_016861	CCG	2	6	7827	7832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987277
128	NC_016861	GCA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987278
129	NC_016861	AAT	2	6	8086	8091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987278
130	NC_016861	TTA	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016861	TTA	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016861	AGT	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016861	CCT	2	6	8845	8850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016861	GAA	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016861	TCA	2	6	8980	8985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016861	CAA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016861	GCT	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016861	TGA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016861	ATG	3	9	9388	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016861	GTT	2	6	9443	9448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016861	GCA	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016861	GAT	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016861	TCA	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016861	ACC	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987279
145	NC_016861	GTT	2	6	9768	9773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987279
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155	NC_016861	GCC	2	6	10271	10276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987280
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263	NC_016861	ATC	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_016861	AGA	2	6	17918	17923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_016861	TCT	2	6	17931	17936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_016861	TTA	2	6	17967	17972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_016861	CTG	2	6	18003	18008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_016861	AAT	2	6	18037	18042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_016861	TTA	2	6	18144	18149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987288
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287	NC_016861	CTG	2	6	19648	19653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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