MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 2290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016861	AGG	2	6	22235	22240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987295
502	NC_016861	AGG	2	6	22339	22344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987296
503	NC_016861	GGT	2	6	22348	22353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987296
504	NC_016861	GCTG	2	8	22374	22381	0 %	25 %	50 %	25 %	378987296
505	NC_016861	CTG	2	6	22397	22402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987296
506	NC_016861	CGG	2	6	22444	22449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987296
507	NC_016861	GCT	2	6	22453	22458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987296
508	NC_016861	CGA	2	6	22471	22476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987296
509	NC_016861	GCCG	2	8	22511	22518	0 %	0 %	50 %	50 %	378987296
510	NC_016861	TGA	3	9	22524	22532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987296
511	NC_016861	AGCCTG	2	12	22544	22555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378987296
512	NC_016861	CGC	2	6	22563	22568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987296
513	NC_016861	TCCG	2	8	22572	22579	0 %	25 %	25 %	50 %	378987296
514	NC_016861	CTG	2	6	22583	22588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987296
515	NC_016861	GGC	2	6	22672	22677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987296
516	NC_016861	GCC	2	6	22694	22699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987296
517	NC_016861	G	6	6	22700	22705	0 %	0 %	100 %	0 %	378987296
518	NC_016861	GAC	2	6	22721	22726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987296
519	NC_016861	GAT	2	6	22771	22776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987296
520	NC_016861	GC	3	6	22778	22783	0 %	0 %	50 %	50 %	378987296
521	NC_016861	GGC	2	6	22849	22854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016861	GC	3	6	22853	22858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_016861	G	6	6	22870	22875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016861	GCG	2	6	22899	22904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016861	A	6	6	22944	22949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016861	GTT	2	6	23005	23010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987297
527	NC_016861	GGCA	2	8	23027	23034	25 %	0 %	50 %	25 %	378987297
528	NC_016861	CCCTGT	2	12	23085	23096	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378987297
529	NC_016861	TGG	2	6	23111	23116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987297
530	NC_016861	CCG	2	6	23179	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987297
531	NC_016861	GAC	3	9	23225	23233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987297
532	NC_016861	GTG	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987297
533	NC_016861	CCCG	2	8	23310	23317	0 %	0 %	25 %	75 %	378987297
534	NC_016861	CCG	2	6	23326	23331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987297
535	NC_016861	CCGG	2	8	23344	23351	0 %	0 %	50 %	50 %	378987297
536	NC_016861	GTGA	2	8	23360	23367	25 %	25 %	50 %	0 %	378987297
537	NC_016861	GCT	2	6	23398	23403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987297
538	NC_016861	CCCG	2	8	23406	23413	0 %	0 %	25 %	75 %	378987297
539	NC_016861	CGG	2	6	23416	23421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987297
540	NC_016861	GCC	2	6	23438	23443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987297
541	NC_016861	GGCA	2	8	23445	23452	25 %	0 %	50 %	25 %	378987297
542	NC_016861	CAT	2	6	23472	23477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987297
543	NC_016861	GGT	2	6	23567	23572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987298
544	NC_016861	CGC	2	6	23582	23587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987298
545	NC_016861	GGCA	2	8	23589	23596	25 %	0 %	50 %	25 %	378987298
546	NC_016861	TGC	2	6	23603	23608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987298
547	NC_016861	GGC	2	6	23610	23615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987298
548	NC_016861	GCT	2	6	23688	23693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987298
549	NC_016861	AGG	2	6	23700	23705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987298
550	NC_016861	CTGC	2	8	23745	23752	0 %	25 %	25 %	50 %	378987298
551	NC_016861	CAG	2	6	23793	23798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987298
552	NC_016861	GGC	2	6	23822	23827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987298
553	NC_016861	CGA	2	6	23831	23836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987298
554	NC_016861	TC	3	6	23844	23849	0 %	50 %	0 %	50 %	378987298
555	NC_016861	GCGA	2	8	23855	23862	25 %	0 %	50 %	25 %	378987298
556	NC_016861	TG	3	6	23870	23875	0 %	50 %	50 %	0 %	378987298
557	NC_016861	CG	3	6	23895	23900	0 %	0 %	50 %	50 %	378987298
558	NC_016861	CGC	2	6	23946	23951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987298
559	NC_016861	GC	3	6	23953	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	378987298
560	NC_016861	GCT	2	6	23972	23977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016861	GCCT	2	8	23995	24002	0 %	25 %	25 %	50 %	378987299
562	NC_016861	GCG	2	6	24009	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987299
563	NC_016861	ATG	2	6	24024	24029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987299
564	NC_016861	CGC	2	6	24043	24048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987299
565	NC_016861	CAG	2	6	24056	24061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987299
566	NC_016861	GAC	2	6	24065	24070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987299
567	NC_016861	AC	3	6	24123	24128	50 %	0 %	0 %	50 %	378987299
568	NC_016861	TCC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_016861	CCA	2	6	24221	24226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987300
570	NC_016861	GCC	2	6	24319	24324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987300
571	NC_016861	GGCGCA	2	12	24375	24386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378987300
572	NC_016861	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	378987300
573	NC_016861	ACC	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987300
574	NC_016861	CGA	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987300
575	NC_016861	CGG	2	6	24482	24487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987300
576	NC_016861	CGG	2	6	24498	24503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987300
577	NC_016861	TGC	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987300
578	NC_016861	GCA	2	6	24576	24581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987300
579	NC_016861	GCCA	2	8	24619	24626	25 %	0 %	25 %	50 %	378987300
580	NC_016861	GCC	3	9	24640	24648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987300
581	NC_016861	CGG	2	6	24743	24748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987300
582	NC_016861	GGA	2	6	24827	24832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987301
583	NC_016861	CGT	2	6	24886	24891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987301
584	NC_016861	AGA	2	6	24970	24975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987301
585	NC_016861	CCG	2	6	24991	24996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987301
586	NC_016861	GCT	2	6	25019	25024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987301
587	NC_016861	AGC	2	6	25039	25044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987301
588	NC_016861	GC	3	6	25043	25048	0 %	0 %	50 %	50 %	378987301
589	NC_016861	CAGC	2	8	25118	25125	25 %	0 %	25 %	50 %	378987301
590	NC_016861	CTGA	2	8	25179	25186	25 %	25 %	25 %	25 %	378987301
591	NC_016861	AGG	2	6	25222	25227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987301
592	NC_016861	ATC	2	6	25265	25270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016861	T	6	6	25470	25475	0 %	100 %	0 %	0 %	378987302
594	NC_016861	AT	3	6	25629	25634	50 %	50 %	0 %	0 %	378987302
595	NC_016861	AT	3	6	25674	25679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016861	TATT	2	8	25682	25689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016861	CAC	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_016861	TTC	2	6	25746	25751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_016861	GTAA	2	8	25766	25773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016861	GATG	2	8	25896	25903	25 %	25 %	50 %	0 %	378987303
601	NC_016861	CTG	2	6	25924	25929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987303
602	NC_016861	AAT	2	6	25969	25974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987303
603	NC_016861	TCG	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987303
604	NC_016861	CAG	2	6	26005	26010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987303
605	NC_016861	GCT	2	6	26043	26048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987303
606	NC_016861	GGT	2	6	26080	26085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987303
607	NC_016861	CAGA	2	8	26118	26125	50 %	0 %	25 %	25 %	378987303
608	NC_016861	CCCG	2	8	26177	26184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
609	NC_016861	CT	3	6	26220	26225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_016861	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016861	TCA	2	6	26279	26284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987304
612	NC_016861	TGA	3	9	26308	26316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987304
613	NC_016861	T	7	7	26323	26329	0 %	100 %	0 %	0 %	378987304
614	NC_016861	T	6	6	26392	26397	0 %	100 %	0 %	0 %	378987304
615	NC_016861	ATT	2	6	26447	26452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987304
616	NC_016861	CAA	2	6	26592	26597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987304
617	NC_016861	TTC	2	6	26633	26638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987304
618	NC_016861	AT	3	6	26646	26651	50 %	50 %	0 %	0 %	378987304
619	NC_016861	ATGT	2	8	26662	26669	25 %	50 %	25 %	0 %	378987304
620	NC_016861	ATA	2	6	26688	26693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987304
621	NC_016861	GTAT	2	8	26719	26726	25 %	50 %	25 %	0 %	378987304
622	NC_016861	TC	3	6	26788	26793	0 %	50 %	0 %	50 %	378987304
623	NC_016861	ATT	3	9	26845	26853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987304
624	NC_016861	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	378987304
625	NC_016861	ATA	2	6	26960	26965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016861	A	6	6	26972	26977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016861	G	6	6	27069	27074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016861	TAA	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016861	TACT	2	8	27174	27181	25 %	50 %	0 %	25 %	378987305
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631	NC_016861	CCA	2	6	27235	27240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987305
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