MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 9757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016860	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016860	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
3	NC_016860	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378982543
4	NC_016860	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378982543
5	NC_016860	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
6	NC_016860	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378982543
7	NC_016860	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378982543
8	NC_016860	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
9	NC_016860	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
10	NC_016860	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378982544
11	NC_016860	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378982544
12	NC_016860	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378982545
13	NC_016860	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378982545
14	NC_016860	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	378982545
15	NC_016860	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	378982545
16	NC_016860	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378982546
17	NC_016860	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378982546
18	NC_016860	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378982546
19	NC_016860	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378982546
20	NC_016860	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378982547
21	NC_016860	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	378982547
22	NC_016860	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	378982548
23	NC_016860	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	378982548
24	NC_016860	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	378982548
25	NC_016860	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	378982548
26	NC_016860	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	378982548
27	NC_016860	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	378982549
28	NC_016860	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	378982550
29	NC_016860	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	378982551
30	NC_016860	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	378982553
31	NC_016860	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	378982554
32	NC_016860	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	378982554
33	NC_016860	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	378982555
34	NC_016860	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	378982555
35	NC_016860	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	378982555
36	NC_016860	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	378982558
37	NC_016860	GC	3	6	18366	18371	0 %	0 %	50 %	50 %	378982559
38	NC_016860	CT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	0 %	50 %	378982560
39	NC_016860	GC	3	6	20656	20661	0 %	0 %	50 %	50 %	378982560
40	NC_016860	GC	3	6	20776	20781	0 %	0 %	50 %	50 %	378982560
41	NC_016860	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	378982560
42	NC_016860	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	378982560
43	NC_016860	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	378982560
44	NC_016860	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	378982561
45	NC_016860	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	378982561
46	NC_016860	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	378982561
47	NC_016860	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016860	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016860	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	378982563
50	NC_016860	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	378982563
51	NC_016860	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
52	NC_016860	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
53	NC_016860	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
54	NC_016860	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
55	NC_016860	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	378982564
56	NC_016860	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	378982565
57	NC_016860	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	378982565
58	NC_016860	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	378982567
59	NC_016860	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	378982567
60	NC_016860	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	378982567
61	NC_016860	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016860	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	378982568
63	NC_016860	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	378982568
64	NC_016860	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016860	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	378982572
66	NC_016860	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	378982572
67	NC_016860	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	378982572
68	NC_016860	AT	3	6	34434	34439	50 %	50 %	0 %	0 %	378982573
69	NC_016860	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	378982573
70	NC_016860	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	378982574
71	NC_016860	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	378982574
72	NC_016860	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	378982574
73	NC_016860	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	378982575
74	NC_016860	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	378982576
75	NC_016860	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016860	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016860	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016860	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016860	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	378982577
80	NC_016860	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	378982577
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82	NC_016860	TG	3	6	42801	42806	0 %	50 %	50 %	0 %	378982578
83	NC_016860	CG	3	6	43316	43321	0 %	0 %	50 %	50 %	378982579
84	NC_016860	TA	3	6	43689	43694	50 %	50 %	0 %	0 %	378982579
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86	NC_016860	CA	3	6	45002	45007	50 %	0 %	0 %	50 %	378982580
87	NC_016860	GC	3	6	45705	45710	0 %	0 %	50 %	50 %	378982580
88	NC_016860	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016860	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016860	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	378982581
91	NC_016860	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	378982581
92	NC_016860	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	378982581
93	NC_016860	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016860	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	378982582
95	NC_016860	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	378982583
96	NC_016860	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	378982583
97	NC_016860	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	378982583
98	NC_016860	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	378982584
99	NC_016860	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	378982584
100	NC_016860	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_016860	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	378982587
103	NC_016860	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	378982588
104	NC_016860	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	378982588
105	NC_016860	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	378982588
106	NC_016860	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	378982588
107	NC_016860	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	378982588
108	NC_016860	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	378982589
109	NC_016860	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	378982591
110	NC_016860	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	378982591
111	NC_016860	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	378982592
112	NC_016860	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	378982593
113	NC_016860	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	378982594
114	NC_016860	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	378982595
115	NC_016860	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	378982595
116	NC_016860	GC	3	6	64585	64590	0 %	0 %	50 %	50 %	378982596
117	NC_016860	GC	3	6	66229	66234	0 %	0 %	50 %	50 %	378982597
118	NC_016860	CG	3	6	66326	66331	0 %	0 %	50 %	50 %	378982597
119	NC_016860	GC	3	6	66733	66738	0 %	0 %	50 %	50 %	378982598
120	NC_016860	AT	3	6	68157	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	378982599
121	NC_016860	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	378982600
122	NC_016860	GC	3	6	69610	69615	0 %	0 %	50 %	50 %	378982600
123	NC_016860	AC	3	6	69662	69667	50 %	0 %	0 %	50 %	378982600
124	NC_016860	AG	3	6	69808	69813	50 %	0 %	50 %	0 %	378982601
125	NC_016860	CG	3	6	69887	69892	0 %	0 %	50 %	50 %	378982601
126	NC_016860	GC	3	6	69915	69920	0 %	0 %	50 %	50 %	378982601
127	NC_016860	CG	3	6	70544	70549	0 %	0 %	50 %	50 %	378982602
128	NC_016860	CG	3	6	70824	70829	0 %	0 %	50 %	50 %	378982602
129	NC_016860	TG	3	6	71465	71470	0 %	50 %	50 %	0 %	378982603
130	NC_016860	GC	3	6	71976	71981	0 %	0 %	50 %	50 %	378982603
131	NC_016860	CG	3	6	72211	72216	0 %	0 %	50 %	50 %	378982603
132	NC_016860	GC	3	6	72283	72288	0 %	0 %	50 %	50 %	378982603
133	NC_016860	GC	3	6	72460	72465	0 %	0 %	50 %	50 %	378982604
134	NC_016860	CG	3	6	73321	73326	0 %	0 %	50 %	50 %	378982605
135	NC_016860	GC	3	6	73467	73472	0 %	0 %	50 %	50 %	378982605
136	NC_016860	TC	3	6	73854	73859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016860	GC	3	6	73963	73968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016860	AT	3	6	74898	74903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016860	AT	3	6	75464	75469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016860	CT	3	6	76171	76176	0 %	50 %	0 %	50 %	378982608
141	NC_016860	GC	3	6	77339	77344	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
142	NC_016860	CG	3	6	77475	77480	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
143	NC_016860	CG	3	6	77951	77956	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
144	NC_016860	GC	5	10	78997	79006	0 %	0 %	50 %	50 %	378982609
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