MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016860	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378982543
2	NC_016860	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378982544
3	NC_016860	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378982545
4	NC_016860	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378982547
5	NC_016860	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016860	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	378982549
7	NC_016860	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016860	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016860	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016860	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	378982554
11	NC_016860	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016860	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	378982555
13	NC_016860	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016860	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	378982559
15	NC_016860	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	378982559
16	NC_016860	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	378982559
17	NC_016860	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	378982560
18	NC_016860	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	378982560
19	NC_016860	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	378982561
20	NC_016860	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	378982562
21	NC_016860	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	378982562
22	NC_016860	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	378982563
23	NC_016860	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378982564
24	NC_016860	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	378982568
25	NC_016860	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	378982568
26	NC_016860	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	378982569
27	NC_016860	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	378982570
28	NC_016860	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	378982571
29	NC_016860	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016860	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	378982572
31	NC_016860	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016860	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016860	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016860	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	378982574
35	NC_016860	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	378982574
36	NC_016860	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	378982575
37	NC_016860	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	378982576
38	NC_016860	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	378982577
39	NC_016860	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016860	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	378982580
41	NC_016860	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	378982580
42	NC_016860	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	378982581
43	NC_016860	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	378982583
44	NC_016860	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	378982583
45	NC_016860	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	378982583
46	NC_016860	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	378982583
47	NC_016860	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	378982587
48	NC_016860	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	378982588
49	NC_016860	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	378982588
50	NC_016860	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	378982589
51	NC_016860	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016860	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378982590
53	NC_016860	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	378982592
54	NC_016860	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	378982592
55	NC_016860	CGCTG	2	10	60229	60238	0 %	20 %	40 %	40 %	378982593
56	NC_016860	GCCTG	2	10	64788	64797	0 %	20 %	40 %	40 %	378982596
57	NC_016860	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	378982597
58	NC_016860	CGTGC	2	10	71365	71374	0 %	20 %	40 %	40 %	378982603
59	NC_016860	TTGAT	2	10	71535	71544	20 %	60 %	20 %	0 %	378982603
60	NC_016860	ACCGC	2	10	72095	72104	20 %	0 %	20 %	60 %	378982603
61	NC_016860	ATTTG	2	10	75439	75448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016860	CGATG	2	10	77757	77766	20 %	20 %	40 %	20 %	378982609
63	NC_016860	GCGAA	2	10	78698	78707	40 %	0 %	40 %	20 %	378982609
64	NC_016860	CGTAC	2	10	79588	79597	20 %	20 %	20 %	40 %	378982609
65	NC_016860	TTGCC	2	10	81224	81233	0 %	40 %	20 %	40 %	378982611
66	NC_016860	CGTCC	2	10	81334	81343	0 %	20 %	20 %	60 %	378982611
67	NC_016860	AAGCG	2	10	81697	81706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016860	TTCAG	2	10	84451	84460	20 %	40 %	20 %	20 %	378982614
69	NC_016860	GGCCA	2	10	84600	84609	20 %	0 %	40 %	40 %	378982614
70	NC_016860	GTACG	2	10	87171	87180	20 %	20 %	40 %	20 %	378982616
71	NC_016860	CAGAA	2	10	87884	87893	60 %	0 %	20 %	20 %	378982616
72	NC_016860	CCGCA	2	10	90003	90012	20 %	0 %	20 %	60 %	378982619
73	NC_016860	CGGTT	2	10	90508	90517	0 %	40 %	40 %	20 %	378982620
74	NC_016860	GCTCC	2	10	91644	91653	0 %	20 %	20 %	60 %	378982620
75	NC_016860	TGGCG	2	10	92288	92297	0 %	20 %	60 %	20 %	378982622
76	NC_016860	TAAAA	2	10	95763	95772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016860	TTTCC	2	10	96202	96211	0 %	60 %	0 %	40 %	378982626
78	NC_016860	GTGGC	2	10	96771	96780	0 %	20 %	60 %	20 %	378982626
79	NC_016860	GCGCT	2	10	97923	97932	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016860	AGCGC	2	10	97990	97999	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016860	TGCAC	2	10	98688	98697	20 %	20 %	20 %	40 %	378982627
82	NC_016860	TGGCA	2	10	98757	98766	20 %	20 %	40 %	20 %	378982627
83	NC_016860	TCTGT	2	10	99083	99092	0 %	60 %	20 %	20 %	378982628
84	NC_016860	GCGCT	2	10	99393	99402	0 %	20 %	40 %	40 %	378982628
85	NC_016860	GGCGC	2	10	99807	99816	0 %	0 %	60 %	40 %	378982628
86	NC_016860	GCGAC	2	10	100120	100129	20 %	0 %	40 %	40 %	378982628
87	NC_016860	AACGT	2	10	102577	102586	40 %	20 %	20 %	20 %	378982631
88	NC_016860	CCCAA	2	10	104727	104736	40 %	0 %	0 %	60 %	378982634
89	NC_016860	TTGTT	2	10	105434	105443	0 %	80 %	20 %	0 %	378982634
90	NC_016860	GCTTC	2	10	106814	106823	0 %	40 %	20 %	40 %	378982635
91	NC_016860	TGCGT	2	10	107101	107110	0 %	40 %	40 %	20 %	378982635
92	NC_016860	TGATC	2	10	108801	108810	20 %	40 %	20 %	20 %	378982636
93	NC_016860	AAGCG	2	10	109297	109306	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016860	TGGCG	2	10	111961	111970	0 %	20 %	60 %	20 %	378982638
95	NC_016860	AGCGC	2	10	112521	112530	20 %	0 %	40 %	40 %	378982638
96	NC_016860	ACGTT	2	10	113338	113347	20 %	40 %	20 %	20 %	378982639
97	NC_016860	CCGCG	2	10	113606	113615	0 %	0 %	40 %	60 %	378982639
98	NC_016860	TAATT	2	10	116724	116733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016860	ATTTT	2	10	116750	116759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016860	ACAGA	2	10	116933	116942	60 %	0 %	20 %	20 %	378982641
101	NC_016860	CAGCG	2	10	118108	118117	20 %	0 %	40 %	40 %	378982643
102	NC_016860	GCCGG	2	10	118408	118417	0 %	0 %	60 %	40 %	378982643
103	NC_016860	CGAGC	2	10	118533	118542	20 %	0 %	40 %	40 %	378982643
104	NC_016860	ATTTG	2	10	118976	118985	20 %	60 %	20 %	0 %	378982643
105	NC_016860	TTGCC	2	10	123480	123489	0 %	40 %	20 %	40 %	378982647
106	NC_016860	AGCAG	2	10	124157	124166	40 %	0 %	40 %	20 %	378982648
107	NC_016860	AGTTT	2	10	126387	126396	20 %	60 %	20 %	0 %	378982649
108	NC_016860	TAGTG	2	10	126805	126814	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016860	TCGAT	2	10	128235	128244	20 %	40 %	20 %	20 %	378982650
110	NC_016860	CGGCG	2	10	130546	130555	0 %	0 %	60 %	40 %	378982653
111	NC_016860	CGTTT	2	10	131008	131017	0 %	60 %	20 %	20 %	378982653
112	NC_016860	GACCG	2	10	132452	132461	20 %	0 %	40 %	40 %	378982655
113	NC_016860	GGTTT	2	10	134164	134173	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016860	ATTCC	2	10	136109	136118	20 %	40 %	0 %	40 %	378982657
115	NC_016860	CCCAA	2	10	138178	138187	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016860	AAAGC	2	10	138406	138415	60 %	0 %	20 %	20 %	378982659
117	NC_016860	CCGCA	2	10	138939	138948	20 %	0 %	20 %	60 %	378982659
118	NC_016860	TTGTT	2	10	139525	139534	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016860	AGTTC	2	10	141310	141319	20 %	40 %	20 %	20 %	378982661
120	NC_016860	TGCCT	2	10	141410	141419	0 %	40 %	20 %	40 %	378982662
121	NC_016860	AAGCG	2	10	146063	146072	40 %	0 %	40 %	20 %	378982665
122	NC_016860	GTTTG	2	10	147966	147975	0 %	60 %	40 %	0 %	378982667
123	NC_016860	CGTAT	2	10	149437	149446	20 %	40 %	20 %	20 %	378982668
124	NC_016860	ATCAG	2	10	151273	151282	40 %	20 %	20 %	20 %	378982670
125	NC_016860	CTGCC	2	10	153282	153291	0 %	20 %	20 %	60 %	378982671
126	NC_016860	CGGCG	2	10	156012	156021	0 %	0 %	60 %	40 %	378982674
127	NC_016860	CGCGG	2	10	158661	158670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016860	CCGGC	2	10	159365	159374	0 %	0 %	40 %	60 %	378982677
129	NC_016860	GATCA	2	10	162683	162692	40 %	20 %	20 %	20 %	378982681
130	NC_016860	CGTCA	2	10	163429	163438	20 %	20 %	20 %	40 %	378982682
131	NC_016860	ATCCC	2	10	165129	165138	20 %	20 %	0 %	60 %	378982684
132	NC_016860	AGCGC	2	10	165837	165846	20 %	0 %	40 %	40 %	378982684
133	NC_016860	TGAGC	2	10	167686	167695	20 %	20 %	40 %	20 %	378982685
134	NC_016860	CGCAT	2	10	167948	167957	20 %	20 %	20 %	40 %	378982686
135	NC_016860	CGAAC	2	10	168677	168686	40 %	0 %	20 %	40 %	378982687
136	NC_016860	GTTCA	2	10	168943	168952	20 %	40 %	20 %	20 %	378982687
137	NC_016860	ATGAC	2	10	169909	169918	40 %	20 %	20 %	20 %	378982688
138	NC_016860	CTGGA	2	10	170499	170508	20 %	20 %	40 %	20 %	378982689
139	NC_016860	CAGAA	2	10	172618	172627	60 %	0 %	20 %	20 %	378982691
140	NC_016860	CGAAG	2	10	175489	175498	40 %	0 %	40 %	20 %	378982693
141	NC_016860	GGCAT	2	10	182768	182777	20 %	20 %	40 %	20 %	378982697
142	NC_016860	GGCCA	2	10	183190	183199	20 %	0 %	40 %	40 %	378982698
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145	NC_016860	GGGGA	2	10	183757	183766	20 %	0 %	80 %	0 %	378982698
146	NC_016860	TCTGG	2	10	187390	187399	0 %	40 %	40 %	20 %	378982700
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150	NC_016860	GCGCA	2	10	193998	194007	20 %	0 %	40 %	40 %	378982706
151	NC_016860	ATCGG	2	10	195389	195398	20 %	20 %	40 %	20 %	378982708
152	NC_016860	TATTG	2	10	196426	196435	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_016860	GCCAG	2	10	216056	216065	20 %	0 %	40 %	40 %	378982727
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176	NC_016860	TTCAA	2	10	224328	224337	40 %	40 %	0 %	20 %	378982733
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249	NC_016860	TATGT	2	10	329702	329711	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_016860	AGCGC	2	10	331010	331019	20 %	0 %	40 %	40 %	378982825
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256	NC_016860	TGATT	2	10	338246	338255	20 %	60 %	20 %	0 %	378982830
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262	NC_016860	TCTGT	2	10	348171	348180	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_016860	GTTGA	2	10	350480	350489	20 %	40 %	40 %	0 %	378982847
265	NC_016860	TTTCA	2	10	350608	350617	20 %	60 %	0 %	20 %	378982847
266	NC_016860	CTGCG	2	10	353459	353468	0 %	20 %	40 %	40 %	378982850
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