MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016860	ACG	2	6	186245	186250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982700
4002	NC_016860	AGA	2	6	186252	186257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982700
4003	NC_016860	CCG	2	6	186334	186339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982700
4004	NC_016860	A	6	6	186347	186352	100 %	0 %	0 %	0 %	378982700
4005	NC_016860	TCACCG	2	12	186353	186364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378982700
4006	NC_016860	CGA	2	6	186393	186398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982700
4007	NC_016860	TC	4	8	186399	186406	0 %	50 %	0 %	50 %	378982700
4008	NC_016860	CAAA	2	8	186516	186523	75 %	0 %	0 %	25 %	378982700
4009	NC_016860	A	6	6	186538	186543	100 %	0 %	0 %	0 %	378982700
4010	NC_016860	GTG	2	6	186571	186576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982700
4011	NC_016860	TTC	2	6	186585	186590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982700
4012	NC_016860	GCG	3	9	186659	186667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982700
4013	NC_016860	GGC	2	6	186679	186684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982700
4014	NC_016860	TCT	2	6	186698	186703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982700
4015	NC_016860	GC	3	6	186725	186730	0 %	0 %	50 %	50 %	378982700
4016	NC_016860	GTGC	2	8	186871	186878	0 %	25 %	50 %	25 %	378982700
4017	NC_016860	GGT	2	6	186880	186885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982700
4018	NC_016860	ACC	2	6	186916	186921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982700
4019	NC_016860	AGC	2	6	186988	186993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982700
4020	NC_016860	GGTC	2	8	187020	187027	0 %	25 %	50 %	25 %	378982700
4021	NC_016860	TCCG	2	8	187049	187056	0 %	25 %	25 %	50 %	378982700
4022	NC_016860	TAC	2	6	187101	187106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982700
4023	NC_016860	CGA	2	6	187122	187127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4025	NC_016860	CAC	2	6	187218	187223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982700
4026	NC_016860	CAC	2	6	187225	187230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982700
4027	NC_016860	TC	3	6	187265	187270	0 %	50 %	0 %	50 %	378982700
4028	NC_016860	TGC	3	9	187313	187321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4030	NC_016860	CGG	2	6	187382	187387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982700
4031	NC_016860	TCTGG	2	10	187390	187399	0 %	40 %	40 %	20 %	378982700
4032	NC_016860	GCC	2	6	187408	187413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982700
4033	NC_016860	CTG	2	6	187540	187545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4035	NC_016860	TCT	2	6	187574	187579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982700
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4037	NC_016860	TTG	2	6	187703	187708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982700
4038	NC_016860	CTG	2	6	187732	187737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982700
4039	NC_016860	GAT	2	6	187743	187748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982700
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4041	NC_016860	CGT	2	6	187783	187788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4043	NC_016860	GCT	2	6	187824	187829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4045	NC_016860	GAC	2	6	187921	187926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4047	NC_016860	CGA	2	6	187962	187967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982700
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4050	NC_016860	CGC	2	6	188088	188093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982700
4051	NC_016860	GAA	2	6	188104	188109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982700
4052	NC_016860	TAC	2	6	188113	188118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982700
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4054	NC_016860	GGC	2	6	188286	188291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982700
4055	NC_016860	GCG	2	6	188296	188301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982700
4056	NC_016860	CGG	2	6	188363	188368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982700
4057	NC_016860	TATTTT	2	12	188536	188547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378982701
4058	NC_016860	CTT	2	6	188550	188555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982701
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4060	NC_016860	TA	3	6	188582	188587	50 %	50 %	0 %	0 %	378982701
4061	NC_016860	GTAT	2	8	188660	188667	25 %	50 %	25 %	0 %	378982701
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4070	NC_016860	ATT	2	6	189100	189105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982701
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4072	NC_016860	TAT	2	6	189145	189150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982701
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4075	NC_016860	T	6	6	189250	189255	0 %	100 %	0 %	0 %	378982701
4076	NC_016860	TGTT	2	8	189284	189291	0 %	75 %	25 %	0 %	378982701
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4079	NC_016860	TAA	2	6	189382	189387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016860	TAC	2	6	189418	189423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4082	NC_016860	T	7	7	189522	189528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_016860	AG	3	6	189887	189892	50 %	0 %	50 %	0 %	378982702
4090	NC_016860	GGA	2	6	189911	189916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982702
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4092	NC_016860	CT	3	6	189968	189973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_016860	T	6	6	190064	190069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016860	T	6	6	190082	190087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016860	TTA	2	6	190093	190098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016860	TTGA	2	8	190140	190147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016860	CAA	2	6	190176	190181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016860	A	6	6	190209	190214	100 %	0 %	0 %	0 %	378982703
4099	NC_016860	CGG	2	6	190232	190237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982703
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4101	NC_016860	CGG	2	6	190304	190309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982703
4102	NC_016860	CTG	2	6	190362	190367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982703
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4105	NC_016860	ATG	2	6	190627	190632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982703
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4107	NC_016860	GAT	2	6	190646	190651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982703
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4109	NC_016860	T	6	6	190763	190768	0 %	100 %	0 %	0 %	378982703
4110	NC_016860	GGC	2	6	190776	190781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982703
4111	NC_016860	GCT	2	6	190784	190789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982703
4112	NC_016860	CTTT	2	8	190795	190802	0 %	75 %	0 %	25 %	378982703
4113	NC_016860	GGGC	2	8	190816	190823	0 %	0 %	75 %	25 %	378982703
4114	NC_016860	CGTT	2	8	190885	190892	0 %	50 %	25 %	25 %	378982703
4115	NC_016860	GCG	2	6	190950	190955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982703
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4118	NC_016860	GCT	2	6	191034	191039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982703
4119	NC_016860	CCGCT	2	10	191041	191050	0 %	20 %	20 %	60 %	378982703
4120	NC_016860	GCC	2	6	191055	191060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982703
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4123	NC_016860	A	6	6	191112	191117	100 %	0 %	0 %	0 %	378982703
4124	NC_016860	CTT	2	6	191131	191136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982703
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4156	NC_016860	TGG	2	6	192514	192519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982705
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4159	NC_016860	CAGGCG	2	12	192687	192698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378982705
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4237	NC_016860	CCG	3	9	197142	197150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982710
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4240	NC_016860	GCA	2	6	197197	197202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982710
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4242	NC_016860	GC	3	6	197252	197257	0 %	0 %	50 %	50 %	378982710
4243	NC_016860	CGC	2	6	197269	197274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982710
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4335	NC_016860	AAGT	2	8	202165	202172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4368	NC_016860	GC	3	6	203446	203451	0 %	0 %	50 %	50 %	378982715
4369	NC_016860	CTG	2	6	203575	203580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982715
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4372	NC_016860	CGG	2	6	203655	203660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982715
4373	NC_016860	GCT	2	6	203679	203684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982715
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4487	NC_016860	GT	3	6	209228	209233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4489	NC_016860	CAT	2	6	209257	209262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4490	NC_016860	GGA	2	6	209281	209286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_016860	AAG	2	6	209356	209361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982720
4492	NC_016860	ATG	2	6	209431	209436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982720
4493	NC_016860	TG	3	6	209435	209440	0 %	50 %	50 %	0 %	378982720
4494	NC_016860	CGGCG	2	10	209496	209505	0 %	0 %	60 %	40 %	378982720
4495	NC_016860	TGA	2	6	209525	209530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982720
4496	NC_016860	GGA	2	6	209583	209588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982720
4497	NC_016860	GC	3	6	209651	209656	0 %	0 %	50 %	50 %	378982720
4498	NC_016860	CAG	3	9	209680	209688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982720
4499	NC_016860	TGC	2	6	209708	209713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982720
4500	NC_016860	GAC	2	6	209745	209750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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