MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016860	G	6	6	139954	139959	0 %	0 %	100 %	0 %	378982660
3002	NC_016860	CATC	2	8	140063	140070	25 %	25 %	0 %	50 %	378982660
3003	NC_016860	CTG	2	6	140079	140084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982660
3004	NC_016860	CCTG	2	8	140093	140100	0 %	25 %	25 %	50 %	378982660
3005	NC_016860	ATT	2	6	140109	140114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982660
3006	NC_016860	GATG	2	8	140201	140208	25 %	25 %	50 %	0 %	378982660
3007	NC_016860	AAG	2	6	140263	140268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982660
3008	NC_016860	CAA	2	6	140288	140293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982660
3009	NC_016860	GAT	2	6	140406	140411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982661
3010	NC_016860	AC	3	6	140424	140429	50 %	0 %	0 %	50 %	378982661
3011	NC_016860	CGG	2	6	140508	140513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982661
3012	NC_016860	CGAT	2	8	140564	140571	25 %	25 %	25 %	25 %	378982661
3013	NC_016860	CAT	2	6	140625	140630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982661
3014	NC_016860	GCTG	2	8	140649	140656	0 %	25 %	50 %	25 %	378982661
3015	NC_016860	TCT	2	6	140719	140724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982661
3016	NC_016860	CG	3	6	140798	140803	0 %	0 %	50 %	50 %	378982661
3017	NC_016860	GCC	2	6	140812	140817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982661
3018	NC_016860	CGG	2	6	140831	140836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982661
3019	NC_016860	GAG	2	6	140875	140880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982661
3020	NC_016860	TTG	2	6	140909	140914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982661
3021	NC_016860	GCG	3	9	140968	140976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982661
3022	NC_016860	GGA	2	6	141054	141059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982661
3023	NC_016860	GCTC	2	8	141080	141087	0 %	25 %	25 %	50 %	378982661
3024	NC_016860	GGCG	2	8	141103	141110	0 %	0 %	75 %	25 %	378982661
3025	NC_016860	ATC	2	6	141118	141123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982661
3026	NC_016860	CGG	2	6	141194	141199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982661
3027	NC_016860	A	6	6	141226	141231	100 %	0 %	0 %	0 %	378982661
3028	NC_016860	AGTTC	2	10	141310	141319	20 %	40 %	20 %	20 %	378982661
3029	NC_016860	AG	3	6	141330	141335	50 %	0 %	50 %	0 %	378982661
3030	NC_016860	CAG	2	6	141350	141355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982662
3031	NC_016860	TGCCT	2	10	141410	141419	0 %	40 %	20 %	40 %	378982662
3032	NC_016860	CAT	2	6	141479	141484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982662
3033	NC_016860	CGG	2	6	141490	141495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982662
3034	NC_016860	GGT	2	6	141500	141505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982662
3035	NC_016860	ACG	2	6	141507	141512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982662
3036	NC_016860	GAA	2	6	141603	141608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982662
3037	NC_016860	GCA	2	6	141665	141670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982662
3038	NC_016860	AGC	2	6	141731	141736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982663
3039	NC_016860	GAA	2	6	141765	141770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982663
3040	NC_016860	TCA	2	6	141781	141786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982663
3041	NC_016860	T	7	7	141832	141838	0 %	100 %	0 %	0 %	378982663
3042	NC_016860	CG	3	6	141846	141851	0 %	0 %	50 %	50 %	378982663
3043	NC_016860	ACCG	2	8	141948	141955	25 %	0 %	25 %	50 %	378982663
3044	NC_016860	AAG	2	6	142012	142017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982663
3045	NC_016860	CGG	2	6	142028	142033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982663
3046	NC_016860	TTTA	2	8	142131	142138	25 %	75 %	0 %	0 %	378982663
3047	NC_016860	GC	3	6	142143	142148	0 %	0 %	50 %	50 %	378982663
3048	NC_016860	A	6	6	142179	142184	100 %	0 %	0 %	0 %	378982663
3049	NC_016860	CGC	2	6	142221	142226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982663
3050	NC_016860	TAC	2	6	142227	142232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982663
3051	NC_016860	GCGA	2	8	142339	142346	25 %	0 %	50 %	25 %	378982663
3052	NC_016860	TCC	2	6	142389	142394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982663
3053	NC_016860	TGA	2	6	142433	142438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982663
3054	NC_016860	AAC	2	6	142470	142475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982663
3055	NC_016860	TGGCGA	2	12	142543	142554	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378982663
3056	NC_016860	CAA	2	6	142574	142579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982663
3057	NC_016860	TGG	2	6	142660	142665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982663
3058	NC_016860	TGA	2	6	142666	142671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982663
3059	NC_016860	GC	3	6	142758	142763	0 %	0 %	50 %	50 %	378982663
3060	NC_016860	TAG	2	6	142852	142857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982663
3061	NC_016860	TACT	2	8	142859	142866	25 %	50 %	0 %	25 %	378982663
3062	NC_016860	GGT	2	6	142942	142947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982663
3063	NC_016860	AG	3	6	142955	142960	50 %	0 %	50 %	0 %	378982663
3064	NC_016860	GTG	2	6	143124	143129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982663
3065	NC_016860	ATG	2	6	143133	143138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982663
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3067	NC_016860	A	6	6	143220	143225	100 %	0 %	0 %	0 %	378982663
3068	NC_016860	CAA	2	6	143249	143254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982663
3069	NC_016860	TGG	2	6	143308	143313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982663
3070	NC_016860	TCA	2	6	143317	143322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982663
3071	NC_016860	TAC	2	6	143343	143348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982663
3072	NC_016860	GGC	2	6	143349	143354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982663
3073	NC_016860	CAT	2	6	143381	143386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982663
3074	NC_016860	GCG	2	6	143389	143394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982663
3075	NC_016860	A	7	7	143440	143446	100 %	0 %	0 %	0 %	378982663
3076	NC_016860	TAAT	2	8	143455	143462	50 %	50 %	0 %	0 %	378982663
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3079	NC_016860	CG	3	6	143532	143537	0 %	0 %	50 %	50 %	378982664
3080	NC_016860	GA	3	6	143546	143551	50 %	0 %	50 %	0 %	378982664
3081	NC_016860	GCG	2	6	143575	143580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982664
3082	NC_016860	GTG	2	6	143599	143604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982664
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3089	NC_016860	TGG	2	6	143810	143815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982664
3090	NC_016860	ACC	4	12	143839	143850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982664
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3092	NC_016860	TCT	2	6	144031	144036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982664
3093	NC_016860	GCA	2	6	144048	144053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982664
3094	NC_016860	GGC	2	6	144060	144065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982664
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3098	NC_016860	CAT	2	6	144175	144180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982664
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3101	NC_016860	TGGC	2	8	144223	144230	0 %	25 %	50 %	25 %	378982664
3102	NC_016860	CGA	2	6	144335	144340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982664
3103	NC_016860	CTG	2	6	144415	144420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982664
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3105	NC_016860	CG	3	6	144477	144482	0 %	0 %	50 %	50 %	378982664
3106	NC_016860	GGT	3	9	144537	144545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982664
3107	NC_016860	GGC	2	6	144588	144593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982664
3108	NC_016860	GAA	2	6	144685	144690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982664
3109	NC_016860	TCG	2	6	144701	144706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982664
3110	NC_016860	TGAC	2	8	144710	144717	25 %	25 %	25 %	25 %	378982664
3111	NC_016860	GAG	2	6	144733	144738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982664
3112	NC_016860	CG	3	6	144740	144745	0 %	0 %	50 %	50 %	378982664
3113	NC_016860	CGT	2	6	144855	144860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982664
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3117	NC_016860	GTC	2	6	145165	145170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982665
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3120	NC_016860	CCG	2	6	145315	145320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982665
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3122	NC_016860	GCT	2	6	145394	145399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982665
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3362	NC_016860	GGC	2	6	156774	156779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982674
3363	NC_016860	AAGC	2	8	156820	156827	50 %	0 %	25 %	25 %	378982674
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3487	NC_016860	A	6	6	163077	163082	100 %	0 %	0 %	0 %	378982681
3488	NC_016860	TCT	2	6	163165	163170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982681
3489	NC_016860	TTA	2	6	163301	163306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982682
3490	NC_016860	GC	3	6	163333	163338	0 %	0 %	50 %	50 %	378982682
3491	NC_016860	CG	3	6	163380	163385	0 %	0 %	50 %	50 %	378982682
3492	NC_016860	CAT	2	6	163389	163394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982682
3493	NC_016860	CGTCA	2	10	163429	163438	20 %	20 %	20 %	40 %	378982682
3494	NC_016860	ACC	2	6	163439	163444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982682
3495	NC_016860	CAG	2	6	163483	163488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982682
3496	NC_016860	CTG	2	6	163522	163527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982682
3497	NC_016860	CTG	2	6	163546	163551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982682
3498	NC_016860	TTC	2	6	163588	163593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982682
3499	NC_016860	A	6	6	163602	163607	100 %	0 %	0 %	0 %	378982682
3500	NC_016860	CGG	2	6	163644	163649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982682

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