MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016860	TAAT	2	8	116595	116602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016860	ATA	2	6	116652	116657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016860	TAAA	2	8	116678	116685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_016860	TCG	2	6	116705	116710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_016860	CT	3	6	116715	116720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_016860	TAATT	2	10	116724	116733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016860	ATTTT	2	10	116750	116759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016860	CGGGTG	2	12	116766	116777	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2509	NC_016860	T	6	6	116912	116917	0 %	100 %	0 %	0 %	378982641
2510	NC_016860	ACAGA	2	10	116933	116942	60 %	0 %	20 %	20 %	378982641
2511	NC_016860	ATT	2	6	116957	116962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982641
2512	NC_016860	T	7	7	116977	116983	0 %	100 %	0 %	0 %	378982641
2513	NC_016860	A	6	6	117004	117009	100 %	0 %	0 %	0 %	378982641
2514	NC_016860	ATT	2	6	117026	117031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982641
2515	NC_016860	CAA	2	6	117063	117068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982641
2516	NC_016860	TTC	2	6	117083	117088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982641
2517	NC_016860	GGAA	2	8	117097	117104	50 %	0 %	50 %	0 %	378982641
2518	NC_016860	ATT	2	6	117131	117136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982641
2519	NC_016860	AT	3	6	117184	117189	50 %	50 %	0 %	0 %	378982641
2520	NC_016860	TCA	2	6	117202	117207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982641
2521	NC_016860	C	6	6	117213	117218	0 %	0 %	0 %	100 %	378982641
2522	NC_016860	CAG	2	6	117292	117297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982642
2523	NC_016860	TGC	2	6	117302	117307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982642
2524	NC_016860	GCG	2	6	117321	117326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982642
2525	NC_016860	GGC	2	6	117333	117338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982642
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2528	NC_016860	GCG	2	6	117455	117460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982642
2529	NC_016860	CAA	2	6	117486	117491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982642
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2531	NC_016860	GT	3	6	117650	117655	0 %	50 %	50 %	0 %	378982642
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2534	NC_016860	GAC	2	6	117713	117718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982642
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2538	NC_016860	CAGCG	2	10	118108	118117	20 %	0 %	40 %	40 %	378982643
2539	NC_016860	ATCA	2	8	118149	118156	50 %	25 %	0 %	25 %	378982643
2540	NC_016860	GC	3	6	118235	118240	0 %	0 %	50 %	50 %	378982643
2541	NC_016860	GCCA	2	8	118242	118249	25 %	0 %	25 %	50 %	378982643
2542	NC_016860	GCG	2	6	118331	118336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982643
2543	NC_016860	CAG	2	6	118362	118367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2544	NC_016860	CGA	2	6	118400	118405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2545	NC_016860	GCCGG	2	10	118408	118417	0 %	0 %	60 %	40 %	378982643
2546	NC_016860	GCC	2	6	118455	118460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
2547	NC_016860	GGAC	2	8	118509	118516	25 %	0 %	50 %	25 %	378982643
2548	NC_016860	AC	3	6	118515	118520	50 %	0 %	0 %	50 %	378982643
2549	NC_016860	CGAGC	2	10	118533	118542	20 %	0 %	40 %	40 %	378982643
2550	NC_016860	TCC	2	6	118579	118584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982643
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2553	NC_016860	TGC	2	6	118684	118689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2554	NC_016860	GTA	2	6	118747	118752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982643
2555	NC_016860	GCC	2	6	118767	118772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
2556	NC_016860	CGC	2	6	118809	118814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
2557	NC_016860	GGCG	2	8	118854	118861	0 %	0 %	75 %	25 %	378982643
2558	NC_016860	GCT	2	6	118872	118877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2559	NC_016860	TCGCCG	2	12	118906	118917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378982643
2560	NC_016860	CAC	2	6	118926	118931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982643
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2562	NC_016860	GTCA	2	8	119004	119011	25 %	25 %	25 %	25 %	378982643
2563	NC_016860	GAC	2	6	119139	119144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982643
2564	NC_016860	TGC	2	6	119149	119154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982643
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2566	NC_016860	CCG	2	6	119191	119196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982643
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2569	NC_016860	AGT	2	6	119278	119283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982643
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2571	NC_016860	GCTG	2	8	119531	119538	0 %	25 %	50 %	25 %	378982643
2572	NC_016860	TGT	2	6	119654	119659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982644
2573	NC_016860	CTG	2	6	119677	119682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982644
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2575	NC_016860	GGC	2	6	119770	119775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982644
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2578	NC_016860	CGA	2	6	119850	119855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982644
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2581	NC_016860	GC	5	10	119981	119990	0 %	0 %	50 %	50 %	378982644
2582	NC_016860	GCG	2	6	120094	120099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982644
2583	NC_016860	CAC	2	6	120118	120123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982644
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2585	NC_016860	CTGG	2	8	120187	120194	0 %	25 %	50 %	25 %	378982644
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2588	NC_016860	CGC	2	6	120486	120491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982644
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2593	NC_016860	CGG	2	6	120704	120709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982644
2594	NC_016860	GTG	2	6	120725	120730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982644
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2598	NC_016860	AGT	2	6	120870	120875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982644
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2603	NC_016860	GAT	2	6	121140	121145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982644
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2605	NC_016860	CTT	2	6	121182	121187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982644
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2607	NC_016860	TCG	2	6	121223	121228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982644
2608	NC_016860	GC	3	6	121253	121258	0 %	0 %	50 %	50 %	378982644
2609	NC_016860	CAATTG	2	12	121284	121295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378982644
2610	NC_016860	TCCA	2	8	121308	121315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_016860	AG	3	6	121340	121345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016860	CAGG	2	8	121362	121369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_016860	AATGCT	2	12	121392	121403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2614	NC_016860	TCA	2	6	121544	121549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_016860	GTC	2	6	121580	121585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_016860	TCT	2	6	121609	121614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_016860	G	6	6	121624	121629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016860	T	7	7	121738	121744	0 %	100 %	0 %	0 %	378982645
2619	NC_016860	ATCG	2	8	121745	121752	25 %	25 %	25 %	25 %	378982645
2620	NC_016860	AT	3	6	121771	121776	50 %	50 %	0 %	0 %	378982645
2621	NC_016860	TAA	3	9	121810	121818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982645
2622	NC_016860	TGTC	2	8	121831	121838	0 %	50 %	25 %	25 %	378982645
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2624	NC_016860	CCG	2	6	121862	121867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982645
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2741	NC_016860	GC	4	8	126767	126774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2742	NC_016860	TAGTG	2	10	126805	126814	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2992	NC_016860	CTTT	2	8	139461	139468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2993	NC_016860	TTGTT	2	10	139525	139534	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_016860	TCG	2	6	139551	139556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_016860	CGG	2	6	139731	139736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_016860	T	7	7	139748	139754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_016860	T	6	6	139836	139841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_016860	CTTG	2	8	139861	139868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2999	NC_016860	TCC	2	6	139878	139883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3000	NC_016860	AAG	2	6	139928	139933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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