MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104501	NC_016860	TCTGT	2	10	4950863	4950872	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104502	NC_016860	GGC	2	6	4950882	4950887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104503	NC_016860	TAA	2	6	4950974	4950979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104504	NC_016860	AAG	2	6	4950990	4950995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104505	NC_016860	TGA	2	6	4951002	4951007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104506	NC_016860	T	6	6	4951031	4951036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104507	NC_016860	ATA	2	6	4951038	4951043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104508	NC_016860	TTA	2	6	4951045	4951050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104509	NC_016860	GGA	2	6	4951057	4951062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104510	NC_016860	TTTA	2	8	4951063	4951070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104511	NC_016860	TAA	2	6	4951091	4951096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104512	NC_016860	ACG	2	6	4951100	4951105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104513	NC_016860	TA	3	6	4951169	4951174	50 %	50 %	0 %	0 %	378987261
104514	NC_016860	CTG	2	6	4951235	4951240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987261
104515	NC_016860	TCA	2	6	4951416	4951421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987261
104516	NC_016860	ATA	2	6	4951454	4951459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987261
104517	NC_016860	GGT	2	6	4951466	4951471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987261
104518	NC_016860	A	6	6	4951481	4951486	100 %	0 %	0 %	0 %	378987261
104519	NC_016860	TCT	2	6	4951500	4951505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987261
104520	NC_016860	GATT	2	8	4951632	4951639	25 %	50 %	25 %	0 %	378987261
104521	NC_016860	T	7	7	4951734	4951740	0 %	100 %	0 %	0 %	378987261
104522	NC_016860	CCG	2	6	4951767	4951772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987261
104523	NC_016860	ATT	2	6	4951796	4951801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104524	NC_016860	CAA	2	6	4951886	4951891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104525	NC_016860	TGA	2	6	4951968	4951973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104526	NC_016860	AGCGA	2	10	4952045	4952054	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104527	NC_016860	GGA	2	6	4952069	4952074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104528	NC_016860	GA	3	6	4952082	4952087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104529	NC_016860	GGCG	2	8	4952103	4952110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104530	NC_016860	CGC	2	6	4952130	4952135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104531	NC_016860	CTC	2	6	4952145	4952150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104532	NC_016860	CGG	2	6	4952152	4952157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104533	NC_016860	GAT	2	6	4952206	4952211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104534	NC_016860	TCA	2	6	4952248	4952253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104535	NC_016860	ATT	2	6	4952303	4952308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104536	NC_016860	AGC	2	6	4952414	4952419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104537	NC_016860	TGA	2	6	4952429	4952434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104538	NC_016860	AGC	2	6	4952461	4952466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104539	NC_016860	T	6	6	4952477	4952482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104540	NC_016860	T	6	6	4952521	4952526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104541	NC_016860	AGG	2	6	4952654	4952659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104542	NC_016860	CGC	2	6	4952766	4952771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987262
104543	NC_016860	TGG	2	6	4952796	4952801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987262
104544	NC_016860	GAT	2	6	4952803	4952808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987262
104545	NC_016860	ACG	2	6	4952848	4952853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987262
104546	NC_016860	TTC	2	6	4952906	4952911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987262
104547	NC_016860	GC	3	6	4952921	4952926	0 %	0 %	50 %	50 %	378987262
104548	NC_016860	GCA	2	6	4952958	4952963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987262
104549	NC_016860	CG	3	6	4952965	4952970	0 %	0 %	50 %	50 %	378987262
104550	NC_016860	ACG	2	6	4953073	4953078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987262
104551	NC_016860	CAG	2	6	4953115	4953120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987262
104552	NC_016860	ATC	2	6	4953172	4953177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987262
104553	NC_016860	AG	3	6	4953337	4953342	50 %	0 %	50 %	0 %	378987262
104554	NC_016860	CAT	2	6	4953381	4953386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987262
104555	NC_016860	CCTG	2	8	4953523	4953530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104556	NC_016860	CAA	2	6	4953611	4953616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104557	NC_016860	CAT	2	6	4953617	4953622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104558	NC_016860	TAA	2	6	4953728	4953733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104559	NC_016860	AT	3	6	4953751	4953756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104560	NC_016860	TGA	2	6	4953785	4953790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104561	NC_016860	ATC	2	6	4953792	4953797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104562	NC_016860	TCA	2	6	4953816	4953821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104563	NC_016860	TAA	2	6	4953859	4953864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104564	NC_016860	TGA	2	6	4953868	4953873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104565	NC_016860	TAAAT	2	10	4953896	4953905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104566	NC_016860	TAAA	2	8	4953911	4953918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104567	NC_016860	GCC	2	6	4954158	4954163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987263
104568	NC_016860	ATT	2	6	4954263	4954268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987263
104569	NC_016860	ATA	2	6	4954270	4954275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987263
104570	NC_016860	CGA	2	6	4954330	4954335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987263
104571	NC_016860	TAC	2	6	4954362	4954367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987263
104572	NC_016860	TTA	2	6	4954392	4954397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987263
104573	NC_016860	GCTGGC	2	12	4954472	4954483	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378987263
104574	NC_016860	GGC	2	6	4954508	4954513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987263
104575	NC_016860	TGA	2	6	4954610	4954615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987263
104576	NC_016860	CG	4	8	4954635	4954642	0 %	0 %	50 %	50 %	378987263
104577	NC_016860	GGC	2	6	4954670	4954675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987263
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104579	NC_016860	CTG	2	6	4954719	4954724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987263
104580	NC_016860	A	8	8	4954771	4954778	100 %	0 %	0 %	0 %	378987263
104581	NC_016860	ATA	2	6	4954809	4954814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.