MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016860	CGG	2	6	22994	22999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982560
502	NC_016860	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	378982560
503	NC_016860	TAT	2	6	23025	23030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982560
504	NC_016860	ATA	2	6	23051	23056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982560
505	NC_016860	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016860	TCTTAA	2	12	23203	23214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_016860	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016860	A	7	7	23338	23344	100 %	0 %	0 %	0 %	378982561
509	NC_016860	TGA	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982561
510	NC_016860	ACG	2	6	23351	23356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982561
511	NC_016860	ATA	2	6	23369	23374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982561
512	NC_016860	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	378982561
513	NC_016860	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	378982561
514	NC_016860	CAG	2	6	23407	23412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982561
515	NC_016860	TTG	2	6	23452	23457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982561
516	NC_016860	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	378982561
517	NC_016860	GTT	2	6	23548	23553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982561
518	NC_016860	ATG	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982561
519	NC_016860	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	378982561
520	NC_016860	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	378982561
521	NC_016860	ACG	2	6	23753	23758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982561
522	NC_016860	TGA	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982561
523	NC_016860	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	378982561
524	NC_016860	GCT	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982561
525	NC_016860	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	378982561
526	NC_016860	A	7	7	23967	23973	100 %	0 %	0 %	0 %	378982561
527	NC_016860	GGC	2	6	23999	24004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982561
528	NC_016860	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016860	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016860	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016860	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016860	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016860	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016860	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016860	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016860	T	7	7	24363	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016860	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016860	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016860	A	6	6	24425	24430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016860	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	378982562
541	NC_016860	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982562
542	NC_016860	TAC	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982562
543	NC_016860	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	378982562
544	NC_016860	CGC	2	6	24594	24599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982562
545	NC_016860	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	378982562
546	NC_016860	TGG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982562
547	NC_016860	AGA	2	6	24696	24701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982562
548	NC_016860	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	378982562
549	NC_016860	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982562
550	NC_016860	CGA	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982562
551	NC_016860	ATG	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982562
552	NC_016860	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016860	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_016860	A	8	8	25115	25122	100 %	0 %	0 %	0 %	378982563
555	NC_016860	ATT	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982563
556	NC_016860	CTG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982563
557	NC_016860	CGG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982563
558	NC_016860	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982563
559	NC_016860	ATT	2	6	25256	25261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982563
560	NC_016860	TTC	2	6	25264	25269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982563
561	NC_016860	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	378982563
562	NC_016860	CGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982563
563	NC_016860	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	378982563
564	NC_016860	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	378982563
565	NC_016860	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	378982563
566	NC_016860	TAT	2	6	25390	25395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982563
567	NC_016860	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	378982563
568	NC_016860	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	378982563
569	NC_016860	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	378982563
570	NC_016860	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982563
571	NC_016860	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	378982563
572	NC_016860	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982563
573	NC_016860	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982563
574	NC_016860	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982563
575	NC_016860	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	378982564
576	NC_016860	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
577	NC_016860	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982564
578	NC_016860	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
579	NC_016860	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	378982564
580	NC_016860	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
581	NC_016860	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982564
582	NC_016860	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982564
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584	NC_016860	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
585	NC_016860	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982564
586	NC_016860	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
587	NC_016860	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982564
588	NC_016860	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982564
589	NC_016860	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982564
590	NC_016860	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	378982564
591	NC_016860	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982564
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593	NC_016860	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982564
594	NC_016860	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982564
595	NC_016860	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
596	NC_016860	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982564
597	NC_016860	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
598	NC_016860	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
599	NC_016860	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982564
600	NC_016860	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	378982564
601	NC_016860	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
602	NC_016860	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982564
603	NC_016860	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982564
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605	NC_016860	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982564
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608	NC_016860	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982564
609	NC_016860	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	378982564
610	NC_016860	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982564
611	NC_016860	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982564
612	NC_016860	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982564
613	NC_016860	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982564
614	NC_016860	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982564
615	NC_016860	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982564
616	NC_016860	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982564
617	NC_016860	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982564
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619	NC_016860	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982564
620	NC_016860	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378982564
621	NC_016860	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
622	NC_016860	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982564
623	NC_016860	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982564
624	NC_016860	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982564
625	NC_016860	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982564
626	NC_016860	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	378982564
627	NC_016860	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
628	NC_016860	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378982564
629	NC_016860	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378982564
630	NC_016860	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982564
631	NC_016860	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378982564
632	NC_016860	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982564
633	NC_016860	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	378982564
634	NC_016860	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982564
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638	NC_016860	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	378982565
639	NC_016860	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	378982565
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755	NC_016860	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	378982572
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