MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016860	GC	3	6	254125	254130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_016860	AC	3	6	254156	254161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_016860	AAC	2	6	254194	254199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_016860	AC	4	8	254198	254205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_016860	GC	3	6	254395	254400	0 %	0 %	50 %	50 %	378982758
5506	NC_016860	CAT	2	6	254414	254419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982758
5507	NC_016860	CTGAA	2	10	254461	254470	40 %	20 %	20 %	20 %	378982758
5508	NC_016860	AAGCG	2	10	254525	254534	40 %	0 %	40 %	20 %	378982758
5509	NC_016860	GCT	2	6	254544	254549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982758
5510	NC_016860	TTC	2	6	254565	254570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982758
5511	NC_016860	GCTG	2	8	254581	254588	0 %	25 %	50 %	25 %	378982758
5512	NC_016860	AAGA	2	8	254688	254695	75 %	0 %	25 %	0 %	378982758
5513	NC_016860	AAC	2	6	254826	254831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982758
5514	NC_016860	GAA	2	6	254997	255002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982758
5515	NC_016860	TAA	2	6	255021	255026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982758
5516	NC_016860	GGC	2	6	255065	255070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_016860	GTA	2	6	255178	255183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_016860	ATG	2	6	255338	255343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982759
5519	NC_016860	A	6	6	255350	255355	100 %	0 %	0 %	0 %	378982759
5520	NC_016860	CTGA	2	8	255359	255366	25 %	25 %	25 %	25 %	378982759
5521	NC_016860	GCG	2	6	255425	255430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982759
5522	NC_016860	A	6	6	255431	255436	100 %	0 %	0 %	0 %	378982759
5523	NC_016860	GCT	2	6	255449	255454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982759
5524	NC_016860	GACT	2	8	255517	255524	25 %	25 %	25 %	25 %	378982759
5525	NC_016860	CGC	2	6	255574	255579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982759
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5529	NC_016860	GCAA	2	8	255803	255810	50 %	0 %	25 %	25 %	378982759
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5534	NC_016860	GACT	2	8	256087	256094	25 %	25 %	25 %	25 %	378982759
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5537	NC_016860	GAG	2	6	256140	256145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016860	CTT	2	6	256160	256165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016860	CT	3	6	256173	256178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_016860	GAAA	2	8	256268	256275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_016860	GCG	2	6	256326	256331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982760
5542	NC_016860	TGGTG	2	10	256429	256438	0 %	40 %	60 %	0 %	378982760
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5551	NC_016860	CGT	2	6	256955	256960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982760
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5555	NC_016860	TTA	2	6	257051	257056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016860	TG	3	6	257101	257106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_016860	GTCTG	2	10	257110	257119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_016860	CTG	2	6	257254	257259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982761
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5572	NC_016860	GCG	2	6	257802	257807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_016860	ATGGC	2	10	258696	258705	20 %	20 %	40 %	20 %	378982762
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5595	NC_016860	GC	3	6	258754	258759	0 %	0 %	50 %	50 %	378982762
5596	NC_016860	GC	3	6	258769	258774	0 %	0 %	50 %	50 %	378982762
5597	NC_016860	GGC	2	6	258833	258838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982762
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5600	NC_016860	CG	3	6	258998	259003	0 %	0 %	50 %	50 %	378982762
5601	NC_016860	AGA	2	6	259059	259064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5603	NC_016860	T	6	6	259166	259171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_016860	CG	3	6	259260	259265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5609	NC_016860	GTCC	2	8	259496	259503	0 %	25 %	25 %	50 %	378982763
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5620	NC_016860	ACTTT	2	10	259991	260000	20 %	60 %	0 %	20 %	378982763
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5989	NC_016860	GCA	2	6	279016	279021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982778
5990	NC_016860	CTG	2	6	279047	279052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982778
5991	NC_016860	CCGG	2	8	279074	279081	0 %	0 %	50 %	50 %	378982778
5992	NC_016860	CTT	2	6	279125	279130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982778
5993	NC_016860	GA	3	6	279142	279147	50 %	0 %	50 %	0 %	378982778
5994	NC_016860	T	6	6	279238	279243	0 %	100 %	0 %	0 %	378982778
5995	NC_016860	GC	4	8	279250	279257	0 %	0 %	50 %	50 %	378982778
5996	NC_016860	CAG	2	6	279269	279274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982778
5997	NC_016860	GCG	2	6	279293	279298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982778
5998	NC_016860	GCT	2	6	279337	279342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982778
5999	NC_016860	ACTG	2	8	279368	279375	25 %	25 %	25 %	25 %	378982778
6000	NC_016860	CGG	2	6	279381	279386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982778

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