MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_016860	CAG	2	6	230665	230670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982737
5004	NC_016860	TGC	2	6	230684	230689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982737
5005	NC_016860	TGC	2	6	230723	230728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982737
5006	NC_016860	CGA	2	6	230798	230803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982737
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5009	NC_016860	CGG	3	9	230993	231001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982737
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5011	NC_016860	GCG	3	9	231102	231110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982737
5012	NC_016860	CTG	2	6	231151	231156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982737
5013	NC_016860	CCA	2	6	231157	231162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982737
5014	NC_016860	CAG	2	6	231182	231187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982737
5015	NC_016860	ATC	2	6	231226	231231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_016860	GAT	2	6	231251	231256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016860	A	7	7	231266	231272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016860	TA	3	6	231278	231283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016860	A	6	6	231316	231321	100 %	0 %	0 %	0 %	378982738
5020	NC_016860	GTG	2	6	231346	231351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982738
5021	NC_016860	GAT	2	6	231433	231438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982738
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5023	NC_016860	ATC	2	6	231494	231499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982738
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5033	NC_016860	GGC	2	6	232126	232131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982738
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5110	NC_016860	CAGTT	2	10	236723	236732	20 %	40 %	20 %	20 %	378982743
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5120	NC_016860	GTT	2	6	237191	237196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_016860	TAT	2	6	237250	237255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982744
5123	NC_016860	GTC	2	6	237260	237265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5124	NC_016860	TG	3	6	237271	237276	0 %	50 %	50 %	0 %	378982744
5125	NC_016860	CGAC	2	8	237277	237284	25 %	0 %	25 %	50 %	378982744
5126	NC_016860	TCC	2	6	237327	237332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982744
5127	NC_016860	GAA	2	6	237344	237349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982744
5128	NC_016860	GAA	2	6	237416	237421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982744
5129	NC_016860	GCC	2	6	237434	237439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982744
5130	NC_016860	GAC	2	6	237449	237454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5131	NC_016860	CCT	2	6	237469	237474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982744
5132	NC_016860	GTG	2	6	237507	237512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982744
5133	NC_016860	TTCA	2	8	237551	237558	25 %	50 %	0 %	25 %	378982744
5134	NC_016860	GCC	2	6	237573	237578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982744
5135	NC_016860	CGA	2	6	237654	237659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5136	NC_016860	CGC	2	6	237685	237690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982744
5137	NC_016860	GAT	2	6	237692	237697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982744
5138	NC_016860	CAGGT	2	10	237708	237717	20 %	20 %	40 %	20 %	378982744
5139	NC_016860	ACG	2	6	237723	237728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5140	NC_016860	GTA	2	6	237731	237736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982744
5141	NC_016860	TCG	2	6	237780	237785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5142	NC_016860	CAG	2	6	237791	237796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5143	NC_016860	GC	3	6	237819	237824	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
5144	NC_016860	GCG	2	6	237847	237852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982744
5145	NC_016860	CGA	2	6	237883	237888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5146	NC_016860	CG	3	6	237926	237931	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
5147	NC_016860	GC	3	6	238021	238026	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
5148	NC_016860	CAG	2	6	238043	238048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5149	NC_016860	AGC	2	6	238069	238074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5150	NC_016860	TCG	2	6	238135	238140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982744
5151	NC_016860	GC	3	6	238231	238236	0 %	0 %	50 %	50 %	378982744
5152	NC_016860	CAT	2	6	238354	238359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982744
5153	NC_016860	GCC	2	6	238400	238405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982744
5154	NC_016860	CGC	2	6	238438	238443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982744
5155	NC_016860	TCT	2	6	238655	238660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_016860	CGC	2	6	238753	238758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982745
5157	NC_016860	GGC	2	6	238775	238780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5158	NC_016860	GC	3	6	238858	238863	0 %	0 %	50 %	50 %	378982745
5159	NC_016860	CGG	2	6	238973	238978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5160	NC_016860	GGA	2	6	239009	239014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982745
5161	NC_016860	TGG	2	6	239031	239036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982745
5162	NC_016860	CGG	2	6	239060	239065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5163	NC_016860	CGGCG	2	10	239201	239210	0 %	0 %	60 %	40 %	378982745
5164	NC_016860	CT	3	6	239217	239222	0 %	50 %	0 %	50 %	378982745
5165	NC_016860	GCG	2	6	239223	239228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5166	NC_016860	CGC	2	6	239236	239241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982745
5167	NC_016860	TAT	2	6	239258	239263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982745
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5170	NC_016860	TAT	2	6	239438	239443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982745
5171	NC_016860	TGC	2	6	239479	239484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982745
5172	NC_016860	GGC	2	6	239514	239519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5173	NC_016860	A	6	6	239526	239531	100 %	0 %	0 %	0 %	378982745
5174	NC_016860	GCG	2	6	239545	239550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5175	NC_016860	CGG	2	6	239555	239560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5176	NC_016860	TTGA	2	8	239580	239587	25 %	50 %	25 %	0 %	378982745
5177	NC_016860	GCCG	2	8	239588	239595	0 %	0 %	50 %	50 %	378982745
5178	NC_016860	GGC	2	6	239601	239606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5179	NC_016860	CGC	2	6	239627	239632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982745
5180	NC_016860	CTG	2	6	239658	239663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982745
5181	NC_016860	TTA	2	6	239671	239676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982745
5182	NC_016860	ACG	2	6	239688	239693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982745
5183	NC_016860	TGCTT	2	10	239695	239704	0 %	60 %	20 %	20 %	378982745
5184	NC_016860	TTC	2	6	239705	239710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982745
5185	NC_016860	GC	3	6	239713	239718	0 %	0 %	50 %	50 %	378982745
5186	NC_016860	G	6	6	239720	239725	0 %	0 %	100 %	0 %	378982745
5187	NC_016860	GCT	2	6	239756	239761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982745
5188	NC_016860	GGC	3	9	239780	239788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5189	NC_016860	GGC	2	6	239855	239860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982745
5190	NC_016860	GC	3	6	239867	239872	0 %	0 %	50 %	50 %	378982745
5191	NC_016860	TGCTGG	2	12	239890	239901	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378982745
5192	NC_016860	GC	3	6	240009	240014	0 %	0 %	50 %	50 %	378982745
5193	NC_016860	TGA	2	6	240170	240175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982746
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5195	NC_016860	CGG	2	6	240278	240283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982746
5196	NC_016860	TGG	2	6	240370	240375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982746
5197	NC_016860	TGG	2	6	240400	240405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982746
5198	NC_016860	AACC	2	8	240455	240462	50 %	0 %	0 %	50 %	378982746
5199	NC_016860	CTTC	2	8	240493	240500	0 %	50 %	0 %	50 %	378982746
5200	NC_016860	GCC	2	6	240665	240670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982747
5201	NC_016860	ACC	2	6	240689	240694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982747
5202	NC_016860	CAT	2	6	240700	240705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982747
5203	NC_016860	ATA	2	6	240767	240772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982747
5204	NC_016860	AAT	2	6	240835	240840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982747
5205	NC_016860	CGC	2	6	240843	240848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982747
5206	NC_016860	ACAG	2	8	240871	240878	50 %	0 %	25 %	25 %	378982747
5207	NC_016860	TGGC	2	8	240988	240995	0 %	25 %	50 %	25 %	378982747
5208	NC_016860	CGA	2	6	241032	241037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982747
5209	NC_016860	CGC	2	6	241104	241109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982747
5210	NC_016860	ACG	2	6	241121	241126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982747
5211	NC_016860	GTT	2	6	241299	241304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982748
5212	NC_016860	GCG	2	6	241307	241312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982748
5213	NC_016860	ATA	2	6	241316	241321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982748
5214	NC_016860	CCG	2	6	241517	241522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982748
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5218	NC_016860	CTGC	2	8	241665	241672	0 %	25 %	25 %	50 %	378982748
5219	NC_016860	GGC	2	6	241699	241704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982748
5220	NC_016860	CCAC	2	8	241749	241756	25 %	0 %	0 %	75 %	378982748
5221	NC_016860	CCG	2	6	241808	241813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982748
5222	NC_016860	CGA	2	6	241821	241826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982748
5223	NC_016860	ATTC	2	8	241861	241868	25 %	50 %	0 %	25 %	378982748
5224	NC_016860	T	6	6	241893	241898	0 %	100 %	0 %	0 %	378982748
5225	NC_016860	CGGG	2	8	241905	241912	0 %	0 %	75 %	25 %	378982748
5226	NC_016860	GCT	2	6	241924	241929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982748
5227	NC_016860	CGG	2	6	241950	241955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982748
5228	NC_016860	GA	3	6	241980	241985	50 %	0 %	50 %	0 %	378982748
5229	NC_016860	CG	3	6	241995	242000	0 %	0 %	50 %	50 %	378982748
5230	NC_016860	AGC	2	6	242030	242035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982748
5231	NC_016860	CGC	2	6	242117	242122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982749
5232	NC_016860	ACC	2	6	242187	242192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982749
5233	NC_016860	TAA	2	6	242305	242310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982749
5234	NC_016860	CGC	2	6	242317	242322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982749
5235	NC_016860	CT	3	6	242357	242362	0 %	50 %	0 %	50 %	378982749
5236	NC_016860	CGG	2	6	242377	242382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982749
5237	NC_016860	CCGG	2	8	242409	242416	0 %	0 %	50 %	50 %	378982749
5238	NC_016860	CGT	2	6	242464	242469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982749
5239	NC_016860	GAC	2	6	242489	242494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982749
5240	NC_016860	TGA	2	6	242545	242550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982749
5241	NC_016860	GCC	2	6	242595	242600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982749
5242	NC_016860	GCC	2	6	242672	242677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982749
5243	NC_016860	GCA	2	6	242713	242718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982749
5244	NC_016860	CTT	3	9	242725	242733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982749
5245	NC_016860	ATG	2	6	242745	242750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982749
5246	NC_016860	ATCG	2	8	242851	242858	25 %	25 %	25 %	25 %	378982750
5247	NC_016860	TCG	2	6	242884	242889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982750
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5342	NC_016860	AT	3	6	247265	247270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5343	NC_016860	AC	3	6	247310	247315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5344	NC_016860	CTTA	2	8	247318	247325	25 %	50 %	0 %	25 %	378982753
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5349	NC_016860	CGAT	2	8	247653	247660	25 %	25 %	25 %	25 %	378982753
5350	NC_016860	CATA	2	8	247699	247706	50 %	25 %	0 %	25 %	378982753
5351	NC_016860	TCA	2	6	247717	247722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5352	NC_016860	AAT	2	6	247737	247742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_016860	CCA	2	6	247764	247769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5354	NC_016860	A	7	7	247778	247784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_016860	AGA	2	6	247799	247804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_016860	GCG	2	6	247832	247837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5357	NC_016860	CTA	2	6	247971	247976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982754
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5361	NC_016860	T	8	8	248073	248080	0 %	100 %	0 %	0 %	378982754
5362	NC_016860	TCT	2	6	248111	248116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982754
5363	NC_016860	GC	3	6	248157	248162	0 %	0 %	50 %	50 %	378982754
5364	NC_016860	T	6	6	248165	248170	0 %	100 %	0 %	0 %	378982754
5365	NC_016860	TTA	2	6	248207	248212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982754
5366	NC_016860	G	6	6	248222	248227	0 %	0 %	100 %	0 %	378982754
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5368	NC_016860	GC	3	6	248280	248285	0 %	0 %	50 %	50 %	378982754
5369	NC_016860	TGC	2	6	248377	248382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982754
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