MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016860	T	6	6	209772	209777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016860	AT	3	6	209791	209796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016860	GTT	2	6	209807	209812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982721
4504	NC_016860	ACG	2	6	209876	209881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982721
4505	NC_016860	GCC	2	6	209888	209893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982721
4506	NC_016860	ATT	2	6	209979	209984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982721
4507	NC_016860	TGG	2	6	210174	210179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982721
4508	NC_016860	ATT	2	6	210197	210202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982721
4509	NC_016860	GGCT	2	8	210258	210265	0 %	25 %	50 %	25 %	378982721
4510	NC_016860	ATC	2	6	210318	210323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982721
4511	NC_016860	TGA	2	6	210334	210339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982721
4512	NC_016860	CCA	2	6	210366	210371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982721
4513	NC_016860	TTCGG	2	10	210376	210385	0 %	40 %	40 %	20 %	378982721
4514	NC_016860	GGA	2	6	210451	210456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982721
4515	NC_016860	GC	4	8	210485	210492	0 %	0 %	50 %	50 %	378982721
4516	NC_016860	TGA	2	6	210508	210513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982721
4517	NC_016860	TAT	2	6	210583	210588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982721
4518	NC_016860	T	6	6	210703	210708	0 %	100 %	0 %	0 %	378982721
4519	NC_016860	CGC	2	6	210728	210733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982721
4520	NC_016860	TA	3	6	210741	210746	50 %	50 %	0 %	0 %	378982721
4521	NC_016860	ATA	2	6	210759	210764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982721
4522	NC_016860	CGG	2	6	210788	210793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982721
4523	NC_016860	TCTT	2	8	210826	210833	0 %	75 %	0 %	25 %	378982721
4524	NC_016860	AGC	2	6	210868	210873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982721
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4529	NC_016860	CTTGC	2	10	211385	211394	0 %	40 %	20 %	40 %	378982722
4530	NC_016860	CTT	2	6	211414	211419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_016860	GGC	2	6	211560	211565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982723
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4533	NC_016860	GTC	2	6	211635	211640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982723
4534	NC_016860	TTCA	2	8	211656	211663	25 %	50 %	0 %	25 %	378982723
4535	NC_016860	GGCAAT	2	12	211674	211685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378982723
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4544	NC_016860	ACGT	2	8	212035	212042	25 %	25 %	25 %	25 %	378982723
4545	NC_016860	CAC	2	6	212208	212213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982723
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4551	NC_016860	TGA	2	6	212382	212387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_016860	GCGCT	2	10	212400	212409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4553	NC_016860	CGCGT	2	10	212452	212461	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4554	NC_016860	TTC	2	6	212501	212506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982724
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4557	NC_016860	CCG	2	6	212610	212615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982724
4558	NC_016860	GCCGAT	2	12	212672	212683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982724
4559	NC_016860	GCAC	2	8	212731	212738	25 %	0 %	25 %	50 %	378982724
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4564	NC_016860	GCC	2	6	212930	212935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982724
4565	NC_016860	CGCA	2	8	212960	212967	25 %	0 %	25 %	50 %	378982724
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4567	NC_016860	CG	3	6	213065	213070	0 %	0 %	50 %	50 %	378982724
4568	NC_016860	CAGG	2	8	213100	213107	25 %	0 %	50 %	25 %	378982724
4569	NC_016860	AG	3	6	213138	213143	50 %	0 %	50 %	0 %	378982724
4570	NC_016860	TCG	2	6	213171	213176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982724
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4572	NC_016860	CTTG	2	8	213235	213242	0 %	50 %	25 %	25 %	378982724
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4585	NC_016860	CG	3	6	213898	213903	0 %	0 %	50 %	50 %	378982726
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4592	NC_016860	GC	3	6	214049	214054	0 %	0 %	50 %	50 %	378982726
4593	NC_016860	CGCGG	2	10	214072	214081	0 %	0 %	60 %	40 %	378982726
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4605	NC_016860	GGA	2	6	214544	214549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982726
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4607	NC_016860	CTT	2	6	214704	214709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982726
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4620	NC_016860	AG	3	6	215347	215352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016860	CAT	2	6	215374	215379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016860	CGC	2	6	215383	215388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_016860	GCA	2	6	215516	215521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982727
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4741	NC_016860	CG	3	6	220647	220652	0 %	0 %	50 %	50 %	378982731
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4745	NC_016860	GTC	2	6	220864	220869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4746	NC_016860	GAA	2	6	220875	220880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4747	NC_016860	CGT	2	6	220996	221001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982732
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4986	NC_016860	AAAT	2	8	230279	230286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4991	NC_016860	TTTG	2	8	230385	230392	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_016860	T	6	6	230393	230398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_016860	TAT	2	6	230415	230420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_016860	TAAA	2	8	230439	230446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_016860	A	6	6	230444	230449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_016860	TTAT	2	8	230501	230508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_016860	GTT	2	6	230515	230520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_016860	CTT	2	6	230523	230528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_016860	ATATA	2	10	230562	230571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_016860	CTA	2	6	230575	230580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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