MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p1

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016858	ATT	2	6	45081	45086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699151
1002	NC_016858	CAT	2	6	45150	45155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699152
1003	NC_016858	CGC	2	6	45178	45183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699152
1004	NC_016858	GCCA	2	8	45233	45240	25 %	0 %	25 %	50 %	379699152
1005	NC_016858	GCA	2	6	45250	45255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699152
1006	NC_016858	CAT	2	6	45261	45266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699152
1007	NC_016858	TCA	2	6	45371	45376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699152
1008	NC_016858	CGC	2	6	45465	45470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699152
1009	NC_016858	AGG	2	6	45578	45583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016858	TCG	2	6	45622	45627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016858	TCG	2	6	45680	45685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016858	ACG	2	6	45755	45760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016858	CCCGT	2	10	45767	45776	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1014	NC_016858	ACA	2	6	45846	45851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016858	AGG	2	6	45873	45878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016858	CTC	2	6	45908	45913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_016858	TTA	2	6	45921	45926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016858	AAT	2	6	46024	46029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016858	TA	3	6	46034	46039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016858	CGG	2	6	46136	46141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699153
1021	NC_016858	GCCG	2	8	46152	46159	0 %	0 %	50 %	50 %	379699153
1022	NC_016858	AGG	2	6	46172	46177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699153
1023	NC_016858	TTC	2	6	46222	46227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699153
1024	NC_016858	GAAA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	379699153
1025	NC_016858	CTG	2	6	46387	46392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699153
1026	NC_016858	GAA	2	6	46426	46431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699153
1027	NC_016858	GTG	2	6	46447	46452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699153
1028	NC_016858	TGG	2	6	46567	46572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699154
1029	NC_016858	AAC	2	6	46581	46586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699154
1030	NC_016858	CG	3	6	46601	46606	0 %	0 %	50 %	50 %	379699154
1031	NC_016858	A	7	7	46619	46625	100 %	0 %	0 %	0 %	379699154
1032	NC_016858	CGTT	2	8	46865	46872	0 %	50 %	25 %	25 %	379699154
1033	NC_016858	GACC	2	8	46906	46913	25 %	0 %	25 %	50 %	379699154
1034	NC_016858	GC	3	6	46930	46935	0 %	0 %	50 %	50 %	379699154
1035	NC_016858	AACG	2	8	46999	47006	50 %	0 %	25 %	25 %	379699154
1036	NC_016858	CTG	2	6	47013	47018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699154
1037	NC_016858	GGA	2	6	47033	47038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699154
1038	NC_016858	AAG	2	6	47067	47072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699154
1039	NC_016858	CAC	2	6	47090	47095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699154
1040	NC_016858	CG	3	6	47112	47117	0 %	0 %	50 %	50 %	379699154
1041	NC_016858	TCA	2	6	47128	47133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699154
1042	NC_016858	GA	3	6	47157	47162	50 %	0 %	50 %	0 %	379699154
1043	NC_016858	GGA	2	6	47201	47206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699154
1044	NC_016858	C	6	6	47214	47219	0 %	0 %	0 %	100 %	379699154
1045	NC_016858	CAG	2	6	47223	47228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699154
1046	NC_016858	GCA	2	6	47236	47241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699154
1047	NC_016858	GGCA	2	8	47281	47288	25 %	0 %	50 %	25 %	379699154
1048	NC_016858	GCC	2	6	47310	47315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699154
1049	NC_016858	CTA	2	6	47396	47401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699154
1050	NC_016858	CAT	2	6	47453	47458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699154
1051	NC_016858	AGGC	2	8	47515	47522	25 %	0 %	50 %	25 %	379699154
1052	NC_016858	TTTG	2	8	47567	47574	0 %	75 %	25 %	0 %	379699154
1053	NC_016858	GAGC	2	8	47597	47604	25 %	0 %	50 %	25 %	379699154
1054	NC_016858	ACT	2	6	47702	47707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699154
1055	NC_016858	ATT	2	6	47843	47848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699155
1056	NC_016858	TC	3	6	47859	47864	0 %	50 %	0 %	50 %	379699155
1057	NC_016858	GC	3	6	47958	47963	0 %	0 %	50 %	50 %	379699155
1058	NC_016858	TTC	2	6	47976	47981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699155
1059	NC_016858	AGG	2	6	48018	48023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699155
1060	NC_016858	TCG	2	6	48082	48087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699155
1061	NC_016858	CAT	2	6	48116	48121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699155
1062	NC_016858	CTG	2	6	48263	48268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699155
1063	NC_016858	TTGA	2	8	48330	48337	25 %	50 %	25 %	0 %	379699155
1064	NC_016858	TCA	2	6	48430	48435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699155
1065	NC_016858	GAA	2	6	48558	48563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699155
1066	NC_016858	CTG	2	6	48564	48569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699155
1067	NC_016858	ATA	2	6	48586	48591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699155
1068	NC_016858	CTT	2	6	48736	48741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699155
1069	NC_016858	GTCA	2	8	48747	48754	25 %	25 %	25 %	25 %	379699155
1070	NC_016858	TCT	2	6	48801	48806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699155
1071	NC_016858	GCT	2	6	48882	48887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699156
1072	NC_016858	CAT	2	6	48919	48924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699156
1073	NC_016858	CTT	2	6	49027	49032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699156
1074	NC_016858	GT	3	6	49113	49118	0 %	50 %	50 %	0 %	379699156
1075	NC_016858	TCGA	2	8	49128	49135	25 %	25 %	25 %	25 %	379699156
1076	NC_016858	GGCT	2	8	49153	49160	0 %	25 %	50 %	25 %	379699156
1077	NC_016858	GAA	2	6	49173	49178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699156
1078	NC_016858	GGA	2	6	49197	49202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699156
1079	NC_016858	CA	3	6	49363	49368	50 %	0 %	0 %	50 %	379699156
1080	NC_016858	GAC	2	6	49440	49445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699156
1081	NC_016858	TTC	2	6	49466	49471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699156
1082	NC_016858	AGC	2	6	49499	49504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699156
1083	NC_016858	TACA	2	8	49681	49688	50 %	25 %	0 %	25 %	379699156
1084	NC_016858	TA	3	6	49882	49887	50 %	50 %	0 %	0 %	379699156
1085	NC_016858	GGC	2	6	49889	49894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699156
1086	NC_016858	ATG	2	6	50034	50039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016858	T	6	6	50040	50045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016858	AAAT	2	8	50078	50085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016858	ATA	2	6	50087	50092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016858	AGG	2	6	50111	50116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016858	CAG	2	6	50271	50276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_016858	GCAA	2	8	50310	50317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_016858	TGA	2	6	50320	50325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016858	A	6	6	50328	50333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016858	T	6	6	50389	50394	0 %	100 %	0 %	0 %	379699157
1096	NC_016858	TGA	2	6	50436	50441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699157
1097	NC_016858	ACG	2	6	50469	50474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699157
1098	NC_016858	GAT	2	6	50603	50608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699158
1099	NC_016858	AT	3	6	50665	50670	50 %	50 %	0 %	0 %	379699158
1100	NC_016858	GCC	2	6	50741	50746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699158
1101	NC_016858	A	6	6	50774	50779	100 %	0 %	0 %	0 %	379699158
1102	NC_016858	GTT	2	6	50800	50805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699158
1103	NC_016858	GCTG	2	8	50844	50851	0 %	25 %	50 %	25 %	379699158
1104	NC_016858	CAG	2	6	50890	50895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699158
1105	NC_016858	GAT	2	6	50930	50935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699158
1106	NC_016858	GCC	2	6	50960	50965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699158
1107	NC_016858	TCA	2	6	50989	50994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699158
1108	NC_016858	TA	3	6	51083	51088	50 %	50 %	0 %	0 %	379699158
1109	NC_016858	GCAG	2	8	51091	51098	25 %	0 %	50 %	25 %	379699158
1110	NC_016858	AAC	2	6	51228	51233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699158
1111	NC_016858	CTGA	2	8	51344	51351	25 %	25 %	25 %	25 %	379699158
1112	NC_016858	GAC	2	6	51353	51358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699158
1113	NC_016858	TGG	2	6	51422	51427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699159
1114	NC_016858	GCCA	2	8	51449	51456	25 %	0 %	25 %	50 %	379699159
1115	NC_016858	GA	3	6	51565	51570	50 %	0 %	50 %	0 %	379699159
1116	NC_016858	CCGG	2	8	51609	51616	0 %	0 %	50 %	50 %	379699159
1117	NC_016858	CAG	2	6	51633	51638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699159
1118	NC_016858	GCCA	2	8	51853	51860	25 %	0 %	25 %	50 %	379699159
1119	NC_016858	GA	3	6	51892	51897	50 %	0 %	50 %	0 %	379699159
1120	NC_016858	CCA	2	6	51901	51906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699159
1121	NC_016858	CCTG	2	8	51908	51915	0 %	25 %	25 %	50 %	379699159
1122	NC_016858	CCA	2	6	51929	51934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699159
1123	NC_016858	CAC	2	6	51940	51945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699159
1124	NC_016858	ATG	2	6	52001	52006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016858	TCA	2	6	52011	52016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_016858	CGC	2	6	52059	52064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699160
1127	NC_016858	GCT	2	6	52078	52083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699160
1128	NC_016858	TCT	2	6	52084	52089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699160
1129	NC_016858	AAT	2	6	52106	52111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699160
1130	NC_016858	CTC	2	6	52122	52127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699160
1131	NC_016858	GGA	2	6	52132	52137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699160
1132	NC_016858	CGA	2	6	52150	52155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699160
1133	NC_016858	CCT	2	6	52165	52170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699160
1134	NC_016858	GCCA	2	8	52189	52196	25 %	0 %	25 %	50 %	379699160
1135	NC_016858	GCC	2	6	52200	52205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699160
1136	NC_016858	CGTCC	2	10	52265	52274	0 %	20 %	20 %	60 %	379699160
1137	NC_016858	CAC	2	6	52316	52321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699160
1138	NC_016858	CCAG	2	8	52405	52412	25 %	0 %	25 %	50 %	379699160
1139	NC_016858	AG	3	6	52411	52416	50 %	0 %	50 %	0 %	379699160
1140	NC_016858	TCA	2	6	52444	52449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699160
1141	NC_016858	ACC	2	6	52495	52500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_016858	CGG	2	6	52526	52531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_016858	CTGA	2	8	52563	52570	25 %	25 %	25 %	25 %	379699161
1144	NC_016858	GCT	2	6	52614	52619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699161
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1146	NC_016858	TCTG	2	8	52851	52858	0 %	50 %	25 %	25 %	379699161
1147	NC_016858	CAGC	2	8	52888	52895	25 %	0 %	25 %	50 %	379699162
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1151	NC_016858	TCC	2	6	53010	53015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699162
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1157	NC_016858	CAT	2	6	53189	53194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699163
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1159	NC_016858	GAG	2	6	53269	53274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699163
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1182	NC_016858	CAA	2	6	54220	54225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1183	NC_016858	ACTA	2	8	54230	54237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1184	NC_016858	ACAA	2	8	54238	54245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1185	NC_016858	CCG	2	6	54292	54297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1186	NC_016858	CGGG	2	8	54329	54336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1187	NC_016858	CAC	2	6	54340	54345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1188	NC_016858	AGAC	2	8	54421	54428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1189	NC_016858	GTC	2	6	54447	54452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699164
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1201	NC_016858	CCAGA	2	10	55105	55114	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1224	NC_016858	T	6	6	56393	56398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1240	NC_016858	AAAT	2	8	57338	57345	75 %	25 %	0 %	0 %	379699168
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1244	NC_016858	CGG	2	6	57514	57519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699168
1245	NC_016858	GT	4	8	57689	57696	0 %	50 %	50 %	0 %	379699168
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1253	NC_016858	GGTG	2	8	58175	58182	0 %	25 %	75 %	0 %	379699168
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1500	NC_016858	GCA	2	6	70086	70091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699185

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