MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p1

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016858	GAA	2	6	23850	23855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699123
502	NC_016858	CAG	2	6	23895	23900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699123
503	NC_016858	CGG	2	6	23903	23908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699123
504	NC_016858	CCA	2	6	23927	23932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699123
505	NC_016858	CCGC	2	8	23963	23970	0 %	0 %	25 %	75 %	379699123
506	NC_016858	CAC	2	6	23973	23978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699123
507	NC_016858	CTTC	2	8	23984	23991	0 %	50 %	0 %	50 %	379699123
508	NC_016858	GCT	2	6	23993	23998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699123
509	NC_016858	GCAG	2	8	24026	24033	25 %	0 %	50 %	25 %	379699123
510	NC_016858	GCG	2	6	24062	24067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699123
511	NC_016858	TTG	2	6	24136	24141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699123
512	NC_016858	ACC	2	6	24178	24183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699123
513	NC_016858	CTTC	2	8	24233	24240	0 %	50 %	0 %	50 %	379699123
514	NC_016858	ACGG	2	8	24244	24251	25 %	0 %	50 %	25 %	379699123
515	NC_016858	AGG	2	6	24266	24271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699123
516	NC_016858	CTT	2	6	24279	24284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699123
517	NC_016858	TTCGC	2	10	24307	24316	0 %	40 %	20 %	40 %	379699123
518	NC_016858	CCA	3	9	24338	24346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699123
519	NC_016858	CAG	2	6	24393	24398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699123
520	NC_016858	CCG	2	6	24413	24418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699123
521	NC_016858	ATG	2	6	24466	24471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699123
522	NC_016858	CG	3	6	24472	24477	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
523	NC_016858	CCTG	2	8	24521	24528	0 %	25 %	25 %	50 %	379699123
524	NC_016858	GTC	2	6	24546	24551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699123
525	NC_016858	GGAT	3	12	24601	24612	25 %	25 %	50 %	0 %	379699123
526	NC_016858	ATC	2	6	24628	24633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699123
527	NC_016858	TAA	2	6	24647	24652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699123
528	NC_016858	TG	3	6	24673	24678	0 %	50 %	50 %	0 %	379699123
529	NC_016858	T	8	8	24752	24759	0 %	100 %	0 %	0 %	379699123
530	NC_016858	GC	3	6	24767	24772	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
531	NC_016858	TTCC	2	8	24821	24828	0 %	50 %	0 %	50 %	379699123
532	NC_016858	GTA	2	6	24861	24866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699123
533	NC_016858	GCTG	2	8	24953	24960	0 %	25 %	50 %	25 %	379699123
534	NC_016858	AC	3	6	24973	24978	50 %	0 %	0 %	50 %	379699123
535	NC_016858	CG	3	6	24989	24994	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
536	NC_016858	GCA	2	6	25007	25012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699123
537	NC_016858	TCAT	2	8	25090	25097	25 %	50 %	0 %	25 %	379699123
538	NC_016858	GCA	2	6	25133	25138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699123
539	NC_016858	CAG	2	6	25218	25223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699123
540	NC_016858	GCC	2	6	25231	25236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699123
541	NC_016858	TTC	2	6	25258	25263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699123
542	NC_016858	ACCTTA	2	12	25272	25283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699124
543	NC_016858	ACAG	2	8	25316	25323	50 %	0 %	25 %	25 %	379699124
544	NC_016858	AGA	2	6	25351	25356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699124
545	NC_016858	CCACTG	2	12	25368	25379	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379699124
546	NC_016858	AAC	2	6	25384	25389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699124
547	NC_016858	CAG	2	6	25404	25409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699124
548	NC_016858	ATG	2	6	25444	25449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699124
549	NC_016858	CAC	2	6	25467	25472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699124
550	NC_016858	GCA	2	6	25493	25498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699124
551	NC_016858	CAC	2	6	25503	25508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699124
552	NC_016858	CAG	2	6	25524	25529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699124
553	NC_016858	CAG	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016858	ATTC	2	8	25589	25596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_016858	CCG	2	6	25677	25682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699125
556	NC_016858	CTC	2	6	25727	25732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699125
557	NC_016858	CCA	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699125
558	NC_016858	GTC	2	6	25769	25774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699125
559	NC_016858	CAG	2	6	25805	25810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699125
560	NC_016858	GCG	2	6	25811	25816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699125
561	NC_016858	AGC	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699125
562	NC_016858	CAG	2	6	25868	25873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699125
563	NC_016858	GAC	2	6	25879	25884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699125
564	NC_016858	AGA	2	6	25909	25914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699125
565	NC_016858	AC	3	6	25953	25958	50 %	0 %	0 %	50 %	379699125
566	NC_016858	CGG	2	6	26014	26019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699125
567	NC_016858	ATT	2	6	26022	26027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699125
568	NC_016858	GTC	2	6	26062	26067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699125
569	NC_016858	AAT	2	6	26090	26095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699125
570	NC_016858	T	6	6	26104	26109	0 %	100 %	0 %	0 %	379699125
571	NC_016858	TGCC	2	8	26131	26138	0 %	25 %	25 %	50 %	379699126
572	NC_016858	AC	3	6	26167	26172	50 %	0 %	0 %	50 %	379699126
573	NC_016858	CGC	2	6	26197	26202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699126
574	NC_016858	GTT	2	6	26300	26305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699126
575	NC_016858	CAGG	2	8	26413	26420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
576	NC_016858	GCCG	2	8	26436	26443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016858	CTGA	2	8	26461	26468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_016858	TTAA	2	8	26477	26484	50 %	50 %	0 %	0 %	379699127
579	NC_016858	ACGG	2	8	26502	26509	25 %	0 %	50 %	25 %	379699127
580	NC_016858	A	6	6	26519	26524	100 %	0 %	0 %	0 %	379699127
581	NC_016858	CGC	2	6	26582	26587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699127
582	NC_016858	CAC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699127
583	NC_016858	GA	3	6	26629	26634	50 %	0 %	50 %	0 %	379699127
584	NC_016858	GCC	2	6	26646	26651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699127
585	NC_016858	GTG	2	6	26689	26694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699127
586	NC_016858	CGG	2	6	26696	26701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699127
587	NC_016858	GGC	2	6	26720	26725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699127
588	NC_016858	CGT	2	6	26774	26779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699127
589	NC_016858	GTG	2	6	26898	26903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699127
590	NC_016858	GTTC	2	8	26924	26931	0 %	50 %	25 %	25 %	379699127
591	NC_016858	CAG	2	6	26945	26950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699127
592	NC_016858	GC	3	6	26953	26958	0 %	0 %	50 %	50 %	379699127
593	NC_016858	GCA	2	6	27018	27023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699128
594	NC_016858	CAGA	2	8	27039	27046	50 %	0 %	25 %	25 %	379699128
595	NC_016858	TAT	2	6	27133	27138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699128
596	NC_016858	ATC	2	6	27175	27180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699128
597	NC_016858	TCA	2	6	27191	27196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699128
598	NC_016858	T	6	6	27239	27244	0 %	100 %	0 %	0 %	379699129
599	NC_016858	TTA	2	6	27252	27257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699129
600	NC_016858	GTT	2	6	27332	27337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699129
601	NC_016858	ACA	2	6	27415	27420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699129
602	NC_016858	TTC	2	6	27485	27490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699129
603	NC_016858	GAC	2	6	27543	27548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699129
604	NC_016858	CCGGA	2	10	27575	27584	20 %	0 %	40 %	40 %	379699129
605	NC_016858	TGT	2	6	27636	27641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699129
606	NC_016858	ACA	2	6	27678	27683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699129
607	NC_016858	TGT	2	6	27689	27694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699129
608	NC_016858	CAGC	2	8	27734	27741	25 %	0 %	25 %	50 %	379699129
609	NC_016858	AGA	2	6	27744	27749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699129
610	NC_016858	GTT	2	6	27785	27790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699129
611	NC_016858	TCC	2	6	27816	27821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699130
612	NC_016858	CTG	2	6	27840	27845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699130
613	NC_016858	GCT	2	6	27863	27868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699130
614	NC_016858	TCC	2	6	27949	27954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699130
615	NC_016858	TTC	2	6	27984	27989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699130
616	NC_016858	TAA	2	6	28087	28092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699130
617	NC_016858	CAC	3	9	28121	28129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699130
618	NC_016858	CTG	2	6	28191	28196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699130
619	NC_016858	CAC	2	6	28278	28283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699130
620	NC_016858	GTAC	2	8	28378	28385	25 %	25 %	25 %	25 %	379699130
621	NC_016858	CG	3	6	28389	28394	0 %	0 %	50 %	50 %	379699130
622	NC_016858	C	6	6	28409	28414	0 %	0 %	0 %	100 %	379699130
623	NC_016858	AGGG	2	8	28594	28601	25 %	0 %	75 %	0 %	379699130
624	NC_016858	TTC	2	6	28606	28611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699130
625	NC_016858	CGGCAC	2	12	28653	28664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379699130
626	NC_016858	GGA	2	6	28726	28731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699130
627	NC_016858	GTC	2	6	28834	28839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699130
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629	NC_016858	ACG	2	6	28908	28913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699130
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