MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 11393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016857	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016857	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	379699219
3	NC_016857	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	379699219
4	NC_016857	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	379699220
5	NC_016857	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	379699221
6	NC_016857	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	379699221
7	NC_016857	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	379699221
8	NC_016857	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	379699221
9	NC_016857	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	379699223
10	NC_016857	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	379699223
11	NC_016857	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	379699224
12	NC_016857	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	379699224
13	NC_016857	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016857	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	379699226
15	NC_016857	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	379699227
16	NC_016857	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	379699228
17	NC_016857	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	379699228
18	NC_016857	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	379699228
19	NC_016857	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	379699229
20	NC_016857	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	379699230
21	NC_016857	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	379699230
22	NC_016857	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	379699230
23	NC_016857	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	379699230
24	NC_016857	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	379699230
25	NC_016857	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	379699230
26	NC_016857	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	379699230
27	NC_016857	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	379699231
28	NC_016857	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	379699232
29	NC_016857	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	379699232
30	NC_016857	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	379699232
31	NC_016857	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	379699232
32	NC_016857	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	379699233
33	NC_016857	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	379699234
34	NC_016857	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	379699236
35	NC_016857	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	379699236
36	NC_016857	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	379699236
37	NC_016857	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	379699237
38	NC_016857	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	379699237
39	NC_016857	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	379699237
40	NC_016857	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	379699237
41	NC_016857	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	379699237
42	NC_016857	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	379699237
43	NC_016857	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016857	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	379699238
45	NC_016857	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	379699238
46	NC_016857	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	379699239
47	NC_016857	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	379699239
48	NC_016857	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	379699240
49	NC_016857	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	379699240
50	NC_016857	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	379699241
51	NC_016857	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	379699241
52	NC_016857	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	379699241
53	NC_016857	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	379699241
54	NC_016857	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	379699241
55	NC_016857	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	379699241
56	NC_016857	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	379699241
57	NC_016857	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	379699241
58	NC_016857	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	379699242
59	NC_016857	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	379699242
60	NC_016857	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	379699243
61	NC_016857	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	379699245
62	NC_016857	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	379699245
63	NC_016857	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	379699245
64	NC_016857	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	379699245
65	NC_016857	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	379699246
66	NC_016857	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	379699247
67	NC_016857	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	379699247
68	NC_016857	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	379699248
69	NC_016857	CGCA	2	8	32890	32897	25 %	0 %	25 %	50 %	379699248
70	NC_016857	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	379699248
71	NC_016857	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016857	TTAT	2	8	33529	33536	25 %	75 %	0 %	0 %	379699249
73	NC_016857	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	379699249
74	NC_016857	CTTT	2	8	34293	34300	0 %	75 %	0 %	25 %	379699249
75	NC_016857	GAAG	2	8	34333	34340	50 %	0 %	50 %	0 %	379699249
76	NC_016857	TAAA	2	8	34385	34392	75 %	25 %	0 %	0 %	379699250
77	NC_016857	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	379699250
78	NC_016857	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	379699250
79	NC_016857	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	379699250
80	NC_016857	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016857	TGGA	2	8	35549	35556	25 %	25 %	50 %	0 %	379699251
82	NC_016857	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	379699251
83	NC_016857	TAAC	2	8	37171	37178	50 %	25 %	0 %	25 %	379699252
84	NC_016857	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	379699252
85	NC_016857	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	379699252
86	NC_016857	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	379699252
87	NC_016857	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	379699252
88	NC_016857	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	379699252
89	NC_016857	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016857	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016857	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	379699254
92	NC_016857	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	379699254
93	NC_016857	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	379699254
94	NC_016857	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	379699254
95	NC_016857	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	379699254
96	NC_016857	ACCG	2	8	41758	41765	25 %	0 %	25 %	50 %	379699255
97	NC_016857	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	379699255
98	NC_016857	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	379699255
99	NC_016857	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	379699255
100	NC_016857	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	379699256
101	NC_016857	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	379699256
102	NC_016857	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	379699257
103	NC_016857	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	379699257
104	NC_016857	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016857	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	379699258
106	NC_016857	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	379699258
107	NC_016857	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	379699258
108	NC_016857	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	379699259
109	NC_016857	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	379699259
110	NC_016857	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	379699259
111	NC_016857	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016857	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	379699260
113	NC_016857	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	379699260
114	NC_016857	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	379699260
115	NC_016857	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	379699260
116	NC_016857	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	379699261
117	NC_016857	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	379699261
118	NC_016857	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	379699261
119	NC_016857	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	379699261
120	NC_016857	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016857	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016857	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016857	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016857	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	379699264
125	NC_016857	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	379699264
126	NC_016857	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	379699264
127	NC_016857	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	379699265
128	NC_016857	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	379699267
129	NC_016857	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	379699267
130	NC_016857	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	379699267
131	NC_016857	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	379699268
132	NC_016857	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	379699269
133	NC_016857	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	379699269
134	NC_016857	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	379699269
135	NC_016857	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	379699269
136	NC_016857	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	379699270
137	NC_016857	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	379699270
138	NC_016857	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	379699271
139	NC_016857	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	379699272
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141	NC_016857	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	379699272
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