MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016857	GGGC	2	8	163693	163700	0 %	0 %	75 %	25 %	379699361
3502	NC_016857	GC	3	6	163721	163726	0 %	0 %	50 %	50 %	379699361
3503	NC_016857	ATA	2	6	163728	163733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699361
3504	NC_016857	CCG	2	6	163803	163808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699361
3505	NC_016857	CTA	2	6	163914	163919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_016857	A	7	7	163951	163957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016857	GAA	2	6	164066	164071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699362
3508	NC_016857	CTG	2	6	164274	164279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699362
3509	NC_016857	GAA	2	6	164300	164305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699362
3510	NC_016857	A	6	6	164388	164393	100 %	0 %	0 %	0 %	379699362
3511	NC_016857	TCG	2	6	164478	164483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699362
3512	NC_016857	ACG	2	6	164615	164620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699362
3513	NC_016857	CGG	2	6	164655	164660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699362
3514	NC_016857	GGC	2	6	164714	164719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699362
3515	NC_016857	GGC	3	9	164753	164761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699362
3516	NC_016857	GGC	2	6	164780	164785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699362
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3518	NC_016857	CGG	2	6	164809	164814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699362
3519	NC_016857	AGA	2	6	164824	164829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699362
3520	NC_016857	CGG	2	6	164893	164898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699362
3521	NC_016857	CG	3	6	164912	164917	0 %	0 %	50 %	50 %	379699362
3522	NC_016857	CAC	2	6	165046	165051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699362
3523	NC_016857	CTGG	2	8	165105	165112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_016857	ATCCC	2	10	165133	165142	20 %	20 %	0 %	60 %	379699363
3525	NC_016857	TGA	2	6	165214	165219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699363
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3529	NC_016857	GAA	2	6	165490	165495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699363
3530	NC_016857	AGA	2	6	165591	165596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699363
3531	NC_016857	CGCTGC	2	12	165597	165608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379699363
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3533	NC_016857	AGA	2	6	165729	165734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699363
3534	NC_016857	GGC	2	6	165764	165769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699363
3535	NC_016857	GCA	2	6	165790	165795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699363
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3537	NC_016857	AAT	2	6	165827	165832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699363
3538	NC_016857	AGCGC	2	10	165841	165850	20 %	0 %	40 %	40 %	379699363
3539	NC_016857	AGC	2	6	165907	165912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699363
3540	NC_016857	ATC	2	6	165948	165953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699363
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3542	NC_016857	ATGA	2	8	166118	166125	50 %	25 %	25 %	0 %	379699363
3543	NC_016857	TGA	2	6	166137	166142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699363
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3545	NC_016857	GCG	2	6	166176	166181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699363
3546	NC_016857	TGA	2	6	166234	166239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699363
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3550	NC_016857	ATC	2	6	166696	166701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699364
3551	NC_016857	TGC	2	6	166720	166725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699364
3552	NC_016857	TGG	2	6	166745	166750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699364
3553	NC_016857	GCC	2	6	166792	166797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699364
3554	NC_016857	ATG	3	9	166843	166851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699364
3555	NC_016857	GC	4	8	166871	166878	0 %	0 %	50 %	50 %	379699364
3556	NC_016857	GGAT	2	8	166909	166916	25 %	25 %	50 %	0 %	379699364
3557	NC_016857	GC	3	6	167003	167008	0 %	0 %	50 %	50 %	379699364
3558	NC_016857	CAA	2	6	167154	167159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699364
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3561	NC_016857	CGCC	2	8	167222	167229	0 %	0 %	25 %	75 %	379699364
3562	NC_016857	GAA	2	6	167351	167356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699364
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3565	NC_016857	ACC	2	6	167620	167625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699364
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3570	NC_016857	GGCG	2	8	167826	167833	0 %	0 %	75 %	25 %	379699365
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3573	NC_016857	TGA	2	6	167921	167926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699365
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3580	NC_016857	GC	4	8	168403	168410	0 %	0 %	50 %	50 %	379699366
3581	NC_016857	GC	3	6	168424	168429	0 %	0 %	50 %	50 %	379699366
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3588	NC_016857	GCG	2	6	168860	168865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699366
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3590	NC_016857	TTGG	2	8	168965	168972	0 %	50 %	50 %	0 %	379699366
3591	NC_016857	CAT	2	6	169015	169020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699366
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3593	NC_016857	CGG	2	6	169192	169197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699366
3594	NC_016857	GTCG	2	8	169237	169244	0 %	25 %	50 %	25 %	379699366
3595	NC_016857	GGC	2	6	169263	169268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699366
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3597	NC_016857	CAC	2	6	169335	169340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_016857	GTTG	2	8	169374	169381	0 %	50 %	50 %	0 %	379699367
3599	NC_016857	TGG	2	6	169449	169454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699367
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3601	NC_016857	C	6	6	169472	169477	0 %	0 %	0 %	100 %	379699367
3602	NC_016857	ATT	2	6	169507	169512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699367
3603	NC_016857	T	7	7	169543	169549	0 %	100 %	0 %	0 %	379699367
3604	NC_016857	TCG	2	6	169591	169596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699367
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3606	NC_016857	CAG	2	6	169748	169753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699367
3607	NC_016857	GCC	2	6	169757	169762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699367
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3609	NC_016857	TCG	2	6	169898	169903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699367
3610	NC_016857	ATGAC	2	10	169913	169922	40 %	20 %	20 %	20 %	379699367
3611	NC_016857	ATC	2	6	169991	169996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699368
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3993	NC_016857	GCT	2	6	186057	186062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699379
3994	NC_016857	ACC	2	6	186078	186083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699379
3995	NC_016857	CTG	2	6	186117	186122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699379
3996	NC_016857	ACA	2	6	186142	186147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699379
3997	NC_016857	TGAT	2	8	186157	186164	25 %	50 %	25 %	0 %	379699379
3998	NC_016857	TGC	2	6	186194	186199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699379
3999	NC_016857	CTG	2	6	186219	186224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699379
4000	NC_016857	ACG	2	6	186241	186246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699379

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