MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016857	G	6	6	139957	139962	0 %	0 %	100 %	0 %	379699340
3002	NC_016857	CATC	2	8	140066	140073	25 %	25 %	0 %	50 %	379699340
3003	NC_016857	CTG	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699340
3004	NC_016857	CCTG	2	8	140096	140103	0 %	25 %	25 %	50 %	379699340
3005	NC_016857	ATT	2	6	140112	140117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699340
3006	NC_016857	GATG	2	8	140204	140211	25 %	25 %	50 %	0 %	379699340
3007	NC_016857	AAG	2	6	140266	140271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699340
3008	NC_016857	CAA	2	6	140291	140296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699340
3009	NC_016857	GAT	2	6	140409	140414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699341
3010	NC_016857	AC	3	6	140427	140432	50 %	0 %	0 %	50 %	379699341
3011	NC_016857	CGG	2	6	140511	140516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699341
3012	NC_016857	CGAT	2	8	140567	140574	25 %	25 %	25 %	25 %	379699341
3013	NC_016857	CAT	2	6	140628	140633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699341
3014	NC_016857	GCTG	2	8	140652	140659	0 %	25 %	50 %	25 %	379699341
3015	NC_016857	TCT	2	6	140722	140727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699341
3016	NC_016857	CG	3	6	140801	140806	0 %	0 %	50 %	50 %	379699341
3017	NC_016857	GCC	2	6	140815	140820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699341
3018	NC_016857	CGG	2	6	140834	140839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699341
3019	NC_016857	GAG	2	6	140878	140883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699341
3020	NC_016857	TTG	2	6	140912	140917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699341
3021	NC_016857	GCG	3	9	140971	140979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699341
3022	NC_016857	GGA	2	6	141057	141062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699341
3023	NC_016857	GCTC	2	8	141083	141090	0 %	25 %	25 %	50 %	379699341
3024	NC_016857	GGCG	2	8	141106	141113	0 %	0 %	75 %	25 %	379699341
3025	NC_016857	ATC	2	6	141121	141126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699341
3026	NC_016857	CGG	2	6	141197	141202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699341
3027	NC_016857	A	6	6	141229	141234	100 %	0 %	0 %	0 %	379699341
3028	NC_016857	AGTTC	2	10	141313	141322	20 %	40 %	20 %	20 %	379699341
3029	NC_016857	AG	3	6	141333	141338	50 %	0 %	50 %	0 %	379699341
3030	NC_016857	CAG	2	6	141353	141358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699342
3031	NC_016857	TGCCT	2	10	141413	141422	0 %	40 %	20 %	40 %	379699342
3032	NC_016857	CAT	2	6	141482	141487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699342
3033	NC_016857	CGG	2	6	141493	141498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699342
3034	NC_016857	GGT	2	6	141503	141508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699342
3035	NC_016857	ACG	2	6	141510	141515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699342
3036	NC_016857	GAA	2	6	141606	141611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699342
3037	NC_016857	GCA	2	6	141668	141673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699342
3038	NC_016857	AGC	2	6	141734	141739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699343
3039	NC_016857	GAA	2	6	141768	141773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699343
3040	NC_016857	TCA	2	6	141784	141789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699343
3041	NC_016857	T	7	7	141835	141841	0 %	100 %	0 %	0 %	379699343
3042	NC_016857	CG	3	6	141849	141854	0 %	0 %	50 %	50 %	379699343
3043	NC_016857	ACCG	2	8	141951	141958	25 %	0 %	25 %	50 %	379699343
3044	NC_016857	AAG	2	6	142015	142020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699343
3045	NC_016857	CGG	2	6	142031	142036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699343
3046	NC_016857	TTTA	2	8	142134	142141	25 %	75 %	0 %	0 %	379699343
3047	NC_016857	GC	3	6	142146	142151	0 %	0 %	50 %	50 %	379699343
3048	NC_016857	A	6	6	142182	142187	100 %	0 %	0 %	0 %	379699343
3049	NC_016857	CGC	2	6	142224	142229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699343
3050	NC_016857	TAC	2	6	142230	142235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699343
3051	NC_016857	GCGA	2	8	142342	142349	25 %	0 %	50 %	25 %	379699343
3052	NC_016857	TCC	2	6	142392	142397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699343
3053	NC_016857	TGA	2	6	142436	142441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699343
3054	NC_016857	AAC	2	6	142473	142478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699343
3055	NC_016857	TGGCGA	2	12	142546	142557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379699343
3056	NC_016857	CAA	2	6	142577	142582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699343
3057	NC_016857	TGG	2	6	142663	142668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699343
3058	NC_016857	TGA	2	6	142669	142674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699343
3059	NC_016857	GC	3	6	142761	142766	0 %	0 %	50 %	50 %	379699343
3060	NC_016857	TAG	2	6	142855	142860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699343
3061	NC_016857	TACT	2	8	142862	142869	25 %	50 %	0 %	25 %	379699343
3062	NC_016857	GGT	2	6	142945	142950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699343
3063	NC_016857	AG	3	6	142958	142963	50 %	0 %	50 %	0 %	379699343
3064	NC_016857	GTG	2	6	143127	143132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699343
3065	NC_016857	ATG	2	6	143136	143141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699343
3066	NC_016857	GCG	4	12	143161	143172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699343
3067	NC_016857	A	6	6	143223	143228	100 %	0 %	0 %	0 %	379699343
3068	NC_016857	CAA	2	6	143252	143257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699343
3069	NC_016857	TGG	2	6	143311	143316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699343
3070	NC_016857	TCA	2	6	143320	143325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699343
3071	NC_016857	TAC	2	6	143346	143351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699343
3072	NC_016857	GGC	2	6	143352	143357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699343
3073	NC_016857	CAT	2	6	143384	143389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699343
3074	NC_016857	GCG	2	6	143392	143397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699343
3075	NC_016857	A	7	7	143443	143449	100 %	0 %	0 %	0 %	379699343
3076	NC_016857	TAAT	2	8	143458	143465	50 %	50 %	0 %	0 %	379699343
3077	NC_016857	CTT	2	6	143506	143511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699344
3078	NC_016857	GTGG	2	8	143517	143524	0 %	25 %	75 %	0 %	379699344
3079	NC_016857	CG	3	6	143535	143540	0 %	0 %	50 %	50 %	379699344
3080	NC_016857	GA	3	6	143549	143554	50 %	0 %	50 %	0 %	379699344
3081	NC_016857	GCG	2	6	143578	143583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699344
3082	NC_016857	GTG	2	6	143602	143607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699344
3083	NC_016857	TCA	2	6	143610	143615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699344
3084	NC_016857	AT	3	6	143631	143636	50 %	50 %	0 %	0 %	379699344
3085	NC_016857	ATT	2	6	143668	143673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699344
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3087	NC_016857	GTC	2	6	143731	143736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699344
3088	NC_016857	CAGC	2	8	143742	143749	25 %	0 %	25 %	50 %	379699344
3089	NC_016857	TGG	2	6	143813	143818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699344
3090	NC_016857	ACC	4	12	143842	143853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699344
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3092	NC_016857	TCT	2	6	144034	144039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699344
3093	NC_016857	GCA	2	6	144051	144056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699344
3094	NC_016857	GGC	2	6	144063	144068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699344
3095	NC_016857	GCC	2	6	144079	144084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699344
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3098	NC_016857	CAT	2	6	144178	144183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699344
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3100	NC_016857	CGC	2	6	144220	144225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699344
3101	NC_016857	TGGC	2	8	144226	144233	0 %	25 %	50 %	25 %	379699344
3102	NC_016857	CGA	2	6	144338	144343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699344
3103	NC_016857	CTG	2	6	144418	144423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699344
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3105	NC_016857	CG	3	6	144480	144485	0 %	0 %	50 %	50 %	379699344
3106	NC_016857	GGT	3	9	144540	144548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699344
3107	NC_016857	GGC	2	6	144591	144596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699344
3108	NC_016857	GAA	2	6	144688	144693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699344
3109	NC_016857	TCG	2	6	144704	144709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699344
3110	NC_016857	TGAC	2	8	144713	144720	25 %	25 %	25 %	25 %	379699344
3111	NC_016857	GAG	2	6	144736	144741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699344
3112	NC_016857	CG	3	6	144743	144748	0 %	0 %	50 %	50 %	379699344
3113	NC_016857	CGT	2	6	144858	144863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699344
3114	NC_016857	ATT	2	6	144920	144925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699344
3115	NC_016857	AC	3	6	145054	145059	50 %	0 %	0 %	50 %	379699345
3116	NC_016857	CTG	2	6	145158	145163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699345
3117	NC_016857	GTC	2	6	145168	145173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699345
3118	NC_016857	GCC	2	6	145236	145241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699345
3119	NC_016857	GTG	2	6	145269	145274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699345
3120	NC_016857	CCG	2	6	145318	145323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699345
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3122	NC_016857	GCT	2	6	145397	145402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699345
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3489	NC_016857	TTA	2	6	163305	163310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699361
3490	NC_016857	GC	3	6	163337	163342	0 %	0 %	50 %	50 %	379699361
3491	NC_016857	CG	3	6	163384	163389	0 %	0 %	50 %	50 %	379699361
3492	NC_016857	CAT	2	6	163393	163398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699361
3493	NC_016857	CGTCA	2	10	163433	163442	20 %	20 %	20 %	40 %	379699361
3494	NC_016857	ACC	2	6	163443	163448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699361
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3496	NC_016857	CTG	2	6	163526	163531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699361
3497	NC_016857	CTG	2	6	163550	163555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699361
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3499	NC_016857	A	6	6	163606	163611	100 %	0 %	0 %	0 %	379699361
3500	NC_016857	CGG	2	6	163648	163653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699361

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