MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016857	TAAT	2	8	116598	116605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016857	ATA	2	6	116655	116660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016857	TAAA	2	8	116681	116688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_016857	TCG	2	6	116708	116713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_016857	CT	3	6	116718	116723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_016857	TAATT	2	10	116727	116736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016857	ATTTT	2	10	116753	116762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016857	CGGGTG	2	12	116769	116780	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2509	NC_016857	T	6	6	116915	116920	0 %	100 %	0 %	0 %	379699318
2510	NC_016857	ACAGA	2	10	116936	116945	60 %	0 %	20 %	20 %	379699318
2511	NC_016857	ATT	2	6	116960	116965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699318
2512	NC_016857	T	7	7	116980	116986	0 %	100 %	0 %	0 %	379699318
2513	NC_016857	A	6	6	117007	117012	100 %	0 %	0 %	0 %	379699318
2514	NC_016857	ATT	2	6	117029	117034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699318
2515	NC_016857	CAA	2	6	117066	117071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699318
2516	NC_016857	TTC	2	6	117086	117091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699318
2517	NC_016857	GGAA	2	8	117100	117107	50 %	0 %	50 %	0 %	379699318
2518	NC_016857	ATT	2	6	117134	117139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699318
2519	NC_016857	AT	3	6	117187	117192	50 %	50 %	0 %	0 %	379699318
2520	NC_016857	TCA	2	6	117205	117210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699318
2521	NC_016857	C	6	6	117216	117221	0 %	0 %	0 %	100 %	379699318
2522	NC_016857	CAG	2	6	117295	117300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699319
2523	NC_016857	TGC	2	6	117305	117310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699319
2524	NC_016857	GCG	2	6	117324	117329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699319
2525	NC_016857	GGC	2	6	117336	117341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699319
2526	NC_016857	AGA	2	6	117342	117347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699319
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2528	NC_016857	GCG	2	6	117458	117463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699319
2529	NC_016857	CAA	2	6	117489	117494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699319
2530	NC_016857	GGT	2	6	117589	117594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699319
2531	NC_016857	GT	3	6	117653	117658	0 %	50 %	50 %	0 %	379699319
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2534	NC_016857	GAC	2	6	117716	117721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699319
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2536	NC_016857	CGC	2	6	117828	117833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699319
2537	NC_016857	TCT	2	6	117929	117934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699319
2538	NC_016857	CAGCG	2	10	118111	118120	20 %	0 %	40 %	40 %	379699320
2539	NC_016857	ATCA	2	8	118152	118159	50 %	25 %	0 %	25 %	379699320
2540	NC_016857	GC	3	6	118238	118243	0 %	0 %	50 %	50 %	379699320
2541	NC_016857	GCCA	2	8	118245	118252	25 %	0 %	25 %	50 %	379699320
2542	NC_016857	GCG	2	6	118334	118339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699320
2543	NC_016857	CAG	2	6	118365	118370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2544	NC_016857	CGA	2	6	118403	118408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2545	NC_016857	GCCGG	2	10	118411	118420	0 %	0 %	60 %	40 %	379699320
2546	NC_016857	GCC	2	6	118458	118463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
2547	NC_016857	GGAC	2	8	118512	118519	25 %	0 %	50 %	25 %	379699320
2548	NC_016857	AC	3	6	118518	118523	50 %	0 %	0 %	50 %	379699320
2549	NC_016857	CGAGC	2	10	118536	118545	20 %	0 %	40 %	40 %	379699320
2550	NC_016857	TCC	2	6	118582	118587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699320
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2553	NC_016857	TGC	2	6	118687	118692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2554	NC_016857	GTA	2	6	118750	118755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699320
2555	NC_016857	GCC	2	6	118770	118775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
2556	NC_016857	CGC	2	6	118812	118817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
2557	NC_016857	GGCG	2	8	118857	118864	0 %	0 %	75 %	25 %	379699320
2558	NC_016857	GCT	2	6	118875	118880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2559	NC_016857	TCGCCG	2	12	118909	118920	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379699320
2560	NC_016857	CAC	2	6	118929	118934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699320
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2562	NC_016857	GTCA	2	8	119007	119014	25 %	25 %	25 %	25 %	379699320
2563	NC_016857	GAC	2	6	119142	119147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2564	NC_016857	TGC	2	6	119152	119157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699320
2565	NC_016857	CG	3	6	119167	119172	0 %	0 %	50 %	50 %	379699320
2566	NC_016857	CCG	2	6	119194	119199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699320
2567	NC_016857	GGTTCA	2	12	119210	119221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379699320
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2569	NC_016857	AGT	2	6	119281	119286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699320
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2571	NC_016857	GCTG	2	8	119534	119541	0 %	25 %	50 %	25 %	379699320
2572	NC_016857	TGT	2	6	119657	119662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699321
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2581	NC_016857	GC	5	10	119984	119993	0 %	0 %	50 %	50 %	379699321
2582	NC_016857	GCG	2	6	120097	120102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699321
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2585	NC_016857	CTGG	2	8	120190	120197	0 %	25 %	50 %	25 %	379699321
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2593	NC_016857	CGG	2	6	120707	120712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699321
2594	NC_016857	GTG	2	6	120728	120733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699321
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2603	NC_016857	GAT	2	6	121143	121148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699321
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2605	NC_016857	CTT	2	6	121185	121190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699321
2606	NC_016857	TGG	2	6	121215	121220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699321
2607	NC_016857	TCG	2	6	121226	121231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699321
2608	NC_016857	GC	3	6	121256	121261	0 %	0 %	50 %	50 %	379699321
2609	NC_016857	CAATTG	2	12	121287	121298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379699321
2610	NC_016857	TCCA	2	8	121311	121318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_016857	AG	3	6	121343	121348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016857	CAGG	2	8	121365	121372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_016857	AATGCT	2	12	121395	121406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2614	NC_016857	TCA	2	6	121547	121552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_016857	GTC	2	6	121583	121588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_016857	TCT	2	6	121612	121617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_016857	G	6	6	121627	121632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016857	T	7	7	121741	121747	0 %	100 %	0 %	0 %	379699322
2619	NC_016857	ATCG	2	8	121748	121755	25 %	25 %	25 %	25 %	379699322
2620	NC_016857	AT	3	6	121774	121779	50 %	50 %	0 %	0 %	379699322
2621	NC_016857	TAA	3	9	121813	121821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699322
2622	NC_016857	TGTC	2	8	121834	121841	0 %	50 %	25 %	25 %	379699322
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2624	NC_016857	CCG	2	6	121865	121870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699322
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2993	NC_016857	TTGTT	2	10	139528	139537	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_016857	TCG	2	6	139554	139559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_016857	CGG	2	6	139734	139739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_016857	T	7	7	139751	139757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_016857	T	6	6	139839	139844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_016857	CTTG	2	8	139864	139871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2999	NC_016857	TCC	2	6	139881	139886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3000	NC_016857	AAG	2	6	139931	139936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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