MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_016857	AGACG	2	10	4870285	4870294	40 %	0 %	40 %	20 %	379703835
103002	NC_016857	ACC	2	6	4870382	4870387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703835
103003	NC_016857	T	6	6	4870436	4870441	0 %	100 %	0 %	0 %	379703835
103004	NC_016857	CGT	2	6	4870450	4870455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703835
103005	NC_016857	ACG	2	6	4870499	4870504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703835
103006	NC_016857	ATG	2	6	4870583	4870588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703835
103007	NC_016857	GTC	2	6	4870591	4870596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703835
103008	NC_016857	CGC	2	6	4870638	4870643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703835
103009	NC_016857	CCG	2	6	4870691	4870696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703835
103010	NC_016857	TGG	2	6	4870743	4870748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703835
103011	NC_016857	GA	3	6	4870787	4870792	50 %	0 %	50 %	0 %	379703835
103012	NC_016857	ATTG	2	8	4870915	4870922	25 %	50 %	25 %	0 %	379703835
103013	NC_016857	TCG	2	6	4870952	4870957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703835
103014	NC_016857	TGT	2	6	4871028	4871033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703835
103015	NC_016857	ATG	2	6	4871049	4871054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703835
103016	NC_016857	TA	3	6	4871085	4871090	50 %	50 %	0 %	0 %	379703835
103017	NC_016857	AGTG	2	8	4871092	4871099	25 %	25 %	50 %	0 %	379703835
103018	NC_016857	TAT	2	6	4871169	4871174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703835
103019	NC_016857	GTA	2	6	4871206	4871211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703835
103020	NC_016857	CAT	2	6	4871424	4871429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703835
103021	NC_016857	CT	3	6	4871441	4871446	0 %	50 %	0 %	50 %	379703835
103022	NC_016857	GCC	2	6	4871467	4871472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703835
103023	NC_016857	TGA	2	6	4871530	4871535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703835
103024	NC_016857	CCG	2	6	4871669	4871674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703835
103025	NC_016857	CCG	2	6	4871706	4871711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703835
103026	NC_016857	GC	3	6	4871760	4871765	0 %	0 %	50 %	50 %	379703835
103027	NC_016857	TCA	2	6	4871828	4871833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703835
103028	NC_016857	AGT	2	6	4871997	4872002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703835
103029	NC_016857	TCCG	2	8	4872062	4872069	0 %	25 %	25 %	50 %	379703835
103030	NC_016857	TCA	2	6	4872074	4872079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703835
103031	NC_016857	A	6	6	4872119	4872124	100 %	0 %	0 %	0 %	379703835
103032	NC_016857	GCCA	2	8	4872244	4872251	25 %	0 %	25 %	50 %	379703835
103033	NC_016857	GTT	2	6	4872330	4872335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703835
103034	NC_016857	TTA	2	6	4872365	4872370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703835
103035	NC_016857	CTG	2	6	4872372	4872377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703835
103036	NC_016857	T	6	6	4872379	4872384	0 %	100 %	0 %	0 %	379703835
103037	NC_016857	T	6	6	4872401	4872406	0 %	100 %	0 %	0 %	379703835
103038	NC_016857	TTA	2	6	4872422	4872427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703835
103039	NC_016857	CTGC	2	8	4872456	4872463	0 %	25 %	25 %	50 %	379703835
103040	NC_016857	C	7	7	4872463	4872469	0 %	0 %	0 %	100 %	379703835
103041	NC_016857	TCA	2	6	4872509	4872514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703835
103042	NC_016857	GTAAAA	2	12	4872649	4872660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103043	NC_016857	GGC	2	6	4872751	4872756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703836
103044	NC_016857	TGA	2	6	4872781	4872786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703836
103045	NC_016857	ATA	2	6	4872853	4872858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703836
103046	NC_016857	TAA	2	6	4872879	4872884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703836
103047	NC_016857	TTG	2	6	4872910	4872915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703836
103048	NC_016857	AT	3	6	4872958	4872963	50 %	50 %	0 %	0 %	379703836
103049	NC_016857	ATC	2	6	4873015	4873020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703836
103050	NC_016857	G	6	6	4873077	4873082	0 %	0 %	100 %	0 %	379703836
103051	NC_016857	ATA	2	6	4873148	4873153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703836
103052	NC_016857	ATTG	2	8	4873237	4873244	25 %	50 %	25 %	0 %	379703836
103053	NC_016857	TCA	2	6	4873250	4873255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703836
103054	NC_016857	CAA	3	9	4873287	4873295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703836
103055	NC_016857	T	6	6	4873359	4873364	0 %	100 %	0 %	0 %	379703836
103056	NC_016857	CCTG	2	8	4873400	4873407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103057	NC_016857	GGC	2	6	4873508	4873513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703837
103058	NC_016857	CTG	2	6	4873528	4873533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703837
103059	NC_016857	CAT	2	6	4873564	4873569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703837
103060	NC_016857	ATC	2	6	4873679	4873684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703837
103061	NC_016857	TGG	2	6	4873831	4873836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703837
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103065	NC_016857	ATAAA	2	10	4874022	4874031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103066	NC_016857	ATATT	2	10	4874032	4874041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103067	NC_016857	CTT	2	6	4874056	4874061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103068	NC_016857	TCTGT	2	10	4874062	4874071	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103069	NC_016857	GGC	2	6	4874081	4874086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103070	NC_016857	TAA	2	6	4874173	4874178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103072	NC_016857	TGA	2	6	4874201	4874206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103073	NC_016857	T	6	6	4874230	4874235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103074	NC_016857	ATA	2	6	4874237	4874242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103075	NC_016857	TTA	2	6	4874244	4874249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103077	NC_016857	TTTA	2	8	4874262	4874269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103078	NC_016857	TAA	2	6	4874290	4874295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103081	NC_016857	CTG	2	6	4874434	4874439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703838
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103085	NC_016857	A	6	6	4874680	4874685	100 %	0 %	0 %	0 %	379703838
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103088	NC_016857	T	7	7	4874933	4874939	0 %	100 %	0 %	0 %	379703838
103089	NC_016857	CCG	2	6	4874966	4874971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703838
103090	NC_016857	ATT	2	6	4874995	4875000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103091	NC_016857	CAA	2	6	4875085	4875090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103092	NC_016857	TGA	2	6	4875167	4875172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103093	NC_016857	AGCGA	2	10	4875244	4875253	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103094	NC_016857	GGA	2	6	4875268	4875273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103095	NC_016857	GA	3	6	4875281	4875286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103096	NC_016857	GGCG	2	8	4875302	4875309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103097	NC_016857	CGC	2	6	4875329	4875334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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103099	NC_016857	CGG	2	6	4875351	4875356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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103102	NC_016857	ATT	2	6	4875502	4875507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703839
103103	NC_016857	AGC	2	6	4875613	4875618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703839
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103105	NC_016857	AGC	2	6	4875660	4875665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703839
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103107	NC_016857	T	6	6	4875720	4875725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103108	NC_016857	AGG	2	6	4875853	4875858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103109	NC_016857	CGC	2	6	4875965	4875970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703840
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103114	NC_016857	GC	3	6	4876120	4876125	0 %	0 %	50 %	50 %	379703840
103115	NC_016857	GCA	2	6	4876157	4876162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703840
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103117	NC_016857	ACG	2	6	4876272	4876277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703840
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