MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016857	AT	3	6	209787	209792	50 %	50 %	0 %	0 %	379699400
4502	NC_016857	GTT	2	6	209803	209808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699400
4503	NC_016857	ACG	2	6	209872	209877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699400
4504	NC_016857	GCC	2	6	209884	209889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699400
4505	NC_016857	ATT	2	6	209975	209980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699400
4506	NC_016857	TGG	2	6	210170	210175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699400
4507	NC_016857	ATT	2	6	210193	210198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699400
4508	NC_016857	GGCT	2	8	210254	210261	0 %	25 %	50 %	25 %	379699400
4509	NC_016857	ATC	2	6	210314	210319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699400
4510	NC_016857	TGA	2	6	210330	210335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699400
4511	NC_016857	CCA	2	6	210362	210367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699400
4512	NC_016857	TTCGG	2	10	210372	210381	0 %	40 %	40 %	20 %	379699400
4513	NC_016857	GGA	2	6	210447	210452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699400
4514	NC_016857	GC	4	8	210481	210488	0 %	0 %	50 %	50 %	379699400
4515	NC_016857	TGA	2	6	210504	210509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699400
4516	NC_016857	TAT	2	6	210579	210584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699400
4517	NC_016857	T	6	6	210699	210704	0 %	100 %	0 %	0 %	379699400
4518	NC_016857	CGC	2	6	210724	210729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699400
4519	NC_016857	TA	3	6	210737	210742	50 %	50 %	0 %	0 %	379699400
4520	NC_016857	ATA	2	6	210755	210760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699400
4521	NC_016857	CGG	2	6	210784	210789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699400
4522	NC_016857	TCTT	2	8	210822	210829	0 %	75 %	0 %	25 %	379699400
4523	NC_016857	AGC	2	6	210864	210869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699400
4524	NC_016857	TGC	2	6	210938	210943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699400
4525	NC_016857	CTT	2	6	211116	211121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699401
4526	NC_016857	GCC	2	6	211181	211186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699401
4527	NC_016857	GAT	2	6	211201	211206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699401
4528	NC_016857	CTTGC	2	10	211381	211390	0 %	40 %	20 %	40 %	379699401
4529	NC_016857	CTT	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_016857	GGC	2	6	211556	211561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699402
4531	NC_016857	CAG	2	6	211601	211606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4532	NC_016857	GTC	2	6	211631	211636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4533	NC_016857	TTCA	2	8	211652	211659	25 %	50 %	0 %	25 %	379699402
4534	NC_016857	GGCAAT	2	12	211670	211681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379699402
4535	NC_016857	TCA	2	6	211732	211737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699402
4536	NC_016857	GCT	2	6	211765	211770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4537	NC_016857	TGAGC	2	10	211793	211802	20 %	20 %	40 %	20 %	379699402
4538	NC_016857	AAT	2	6	211823	211828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699402
4539	NC_016857	CGA	2	6	211837	211842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4540	NC_016857	CCA	2	6	211867	211872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699402
4541	NC_016857	CGC	2	6	211969	211974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699402
4542	NC_016857	AG	3	6	212012	212017	50 %	0 %	50 %	0 %	379699402
4543	NC_016857	ACGT	2	8	212031	212038	25 %	25 %	25 %	25 %	379699402
4544	NC_016857	CAC	2	6	212204	212209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699402
4545	NC_016857	CGT	2	6	212251	212256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4546	NC_016857	TGG	2	6	212269	212274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699402
4547	NC_016857	GAC	2	6	212308	212313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4548	NC_016857	GCA	2	6	212326	212331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699402
4549	NC_016857	CAA	2	6	212356	212361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699402
4550	NC_016857	TGA	2	6	212378	212383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016857	GCGCT	2	10	212396	212405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4552	NC_016857	CGCGT	2	10	212448	212457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4553	NC_016857	TTC	2	6	212497	212502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699403
4554	NC_016857	CTG	2	6	212539	212544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4555	NC_016857	CGG	2	6	212547	212552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699403
4556	NC_016857	CCG	2	6	212606	212611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699403
4557	NC_016857	GCCGAT	2	12	212668	212679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4558	NC_016857	GCAC	2	8	212727	212734	25 %	0 %	25 %	50 %	379699403
4559	NC_016857	CCAGCA	2	12	212736	212747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379699403
4560	NC_016857	CAG	2	6	212785	212790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4561	NC_016857	GCC	2	6	212827	212832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699403
4562	NC_016857	CCAG	2	8	212916	212923	25 %	0 %	25 %	50 %	379699403
4563	NC_016857	GCC	2	6	212926	212931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699403
4564	NC_016857	CGCA	2	8	212956	212963	25 %	0 %	25 %	50 %	379699403
4565	NC_016857	GC	3	6	213045	213050	0 %	0 %	50 %	50 %	379699403
4566	NC_016857	CG	3	6	213061	213066	0 %	0 %	50 %	50 %	379699403
4567	NC_016857	CAGG	2	8	213096	213103	25 %	0 %	50 %	25 %	379699403
4568	NC_016857	AG	3	6	213134	213139	50 %	0 %	50 %	0 %	379699403
4569	NC_016857	TCG	2	6	213167	213172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4570	NC_016857	T	6	6	213223	213228	0 %	100 %	0 %	0 %	379699403
4571	NC_016857	CTTG	2	8	213231	213238	0 %	50 %	25 %	25 %	379699403
4572	NC_016857	GCA	2	6	213246	213251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699403
4573	NC_016857	TGG	3	9	213258	213266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699403
4574	NC_016857	G	6	6	213328	213333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_016857	GCA	2	6	213413	213418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699404
4576	NC_016857	AGATC	2	10	213462	213471	40 %	20 %	20 %	20 %	379699404
4577	NC_016857	CGGT	2	8	213542	213549	0 %	25 %	50 %	25 %	379699404
4578	NC_016857	TTC	2	6	213667	213672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699404
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4580	NC_016857	GAA	2	6	213758	213763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699404
4581	NC_016857	CGA	2	6	213768	213773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699404
4582	NC_016857	GGC	2	6	213808	213813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699404
4583	NC_016857	CGCGG	2	10	213884	213893	0 %	0 %	60 %	40 %	379699405
4584	NC_016857	CG	3	6	213894	213899	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4585	NC_016857	ACG	2	6	213915	213920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4586	NC_016857	GCG	2	6	213921	213926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699405
4587	NC_016857	TCG	2	6	213937	213942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4588	NC_016857	CGG	2	6	213972	213977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699405
4589	NC_016857	CAC	2	6	214000	214005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699405
4590	NC_016857	TAT	2	6	214028	214033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699405
4591	NC_016857	GC	3	6	214045	214050	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4592	NC_016857	CGCGG	2	10	214068	214077	0 %	0 %	60 %	40 %	379699405
4593	NC_016857	CAT	2	6	214214	214219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699405
4594	NC_016857	CGT	2	6	214238	214243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4595	NC_016857	T	6	6	214271	214276	0 %	100 %	0 %	0 %	379699405
4596	NC_016857	CAG	2	6	214287	214292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4597	NC_016857	GGC	2	6	214308	214313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699405
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4601	NC_016857	GGT	2	6	214457	214462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699405
4602	NC_016857	GTT	2	6	214472	214477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699405
4603	NC_016857	GC	3	6	214533	214538	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4604	NC_016857	GGA	2	6	214540	214545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379699405
4605	NC_016857	GC	3	6	214633	214638	0 %	0 %	50 %	50 %	379699405
4606	NC_016857	CTT	2	6	214700	214705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699405
4607	NC_016857	CCG	2	6	214720	214725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699405
4608	NC_016857	GTA	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699405
4609	NC_016857	TCT	2	6	214798	214803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699405
4610	NC_016857	TGT	2	6	214820	214825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699405
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4612	NC_016857	ATG	2	6	214887	214892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699405
4613	NC_016857	ACG	2	6	214953	214958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699405
4614	NC_016857	CCA	2	6	214961	214966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699405
4615	NC_016857	AAT	2	6	214981	214986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699405
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4617	NC_016857	CTC	2	6	215217	215222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699405
4618	NC_016857	TAA	2	6	215293	215298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016857	AG	3	6	215343	215348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_016857	CAT	2	6	215370	215375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4622	NC_016857	GCA	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699406
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4746	NC_016857	CGT	2	6	220992	220997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699411
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4993	NC_016857	TAAA	2	8	230434	230441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_016857	A	6	6	230439	230444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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