MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 9654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016856	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
3	NC_016856	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378448276
4	NC_016856	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378448276
5	NC_016856	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
6	NC_016856	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378448276
7	NC_016856	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378448276
8	NC_016856	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
9	NC_016856	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
10	NC_016856	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378448277
11	NC_016856	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378448277
12	NC_016856	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378448278
13	NC_016856	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378448278
14	NC_016856	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	378448278
15	NC_016856	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	378448278
16	NC_016856	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378448279
17	NC_016856	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378448279
18	NC_016856	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378448279
19	NC_016856	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378448279
20	NC_016856	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378448280
21	NC_016856	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	378448280
22	NC_016856	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	378448281
23	NC_016856	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	378448281
24	NC_016856	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	378448281
25	NC_016856	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	378448281
26	NC_016856	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	378448281
27	NC_016856	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	378448282
28	NC_016856	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	378448283
29	NC_016856	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	378448284
30	NC_016856	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	378448287
31	NC_016856	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	378448288
32	NC_016856	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	378448288
33	NC_016856	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	378448290
34	NC_016856	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	378448290
35	NC_016856	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	378448290
36	NC_016856	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	378448293
37	NC_016856	GC	3	6	18366	18371	0 %	0 %	50 %	50 %	378448296
38	NC_016856	CT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	0 %	50 %	378448297
39	NC_016856	GC	3	6	20656	20661	0 %	0 %	50 %	50 %	378448297
40	NC_016856	GC	3	6	20776	20781	0 %	0 %	50 %	50 %	378448297
41	NC_016856	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	378448297
42	NC_016856	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	378448297
43	NC_016856	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	378448297
44	NC_016856	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	378448299
45	NC_016856	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	378448299
46	NC_016856	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	378448299
47	NC_016856	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016856	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016856	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	410023154
50	NC_016856	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	410023154
51	NC_016856	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
52	NC_016856	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
53	NC_016856	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
54	NC_016856	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378448304
55	NC_016856	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	378448304
56	NC_016856	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	378448305
57	NC_016856	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	378448305
58	NC_016856	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	378448307
59	NC_016856	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	378448307
60	NC_016856	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	378448307
61	NC_016856	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	378448308
62	NC_016856	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	378448308
63	NC_016856	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	378448308
64	NC_016856	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016856	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	378448312
66	NC_016856	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	378448312
67	NC_016856	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	378448312
68	NC_016856	AT	3	6	34434	34439	50 %	50 %	0 %	0 %	378448313
69	NC_016856	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	378448313
70	NC_016856	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	378448315
71	NC_016856	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	378448315
72	NC_016856	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	378448315
73	NC_016856	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	378448316
74	NC_016856	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	378448317
75	NC_016856	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016856	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016856	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016856	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016856	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	378448318
80	NC_016856	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	378448318
81	NC_016856	GT	3	6	41771	41776	0 %	50 %	50 %	0 %	378448319
82	NC_016856	TG	3	6	42801	42806	0 %	50 %	50 %	0 %	378448319
83	NC_016856	CG	3	6	43316	43321	0 %	0 %	50 %	50 %	378448320
84	NC_016856	TA	3	6	43689	43694	50 %	50 %	0 %	0 %	378448320
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86	NC_016856	CA	3	6	45002	45007	50 %	0 %	0 %	50 %	378448321
87	NC_016856	GC	3	6	45705	45710	0 %	0 %	50 %	50 %	378448321
88	NC_016856	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016856	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016856	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	378448322
91	NC_016856	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	378448322
92	NC_016856	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	378448322
93	NC_016856	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016856	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	378448323
95	NC_016856	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	378448324
96	NC_016856	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	378448324
97	NC_016856	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	378448324
98	NC_016856	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	378448325
99	NC_016856	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	378448325
100	NC_016856	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	378448326
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102	NC_016856	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	378448328
103	NC_016856	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
104	NC_016856	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
105	NC_016856	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
106	NC_016856	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
107	NC_016856	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	378448329
108	NC_016856	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	378448330
109	NC_016856	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	378448333
110	NC_016856	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	378448333
111	NC_016856	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	378448334
112	NC_016856	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	378448335
113	NC_016856	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	378448336
114	NC_016856	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	378448337
115	NC_016856	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	378448337
116	NC_016856	GC	3	6	64585	64590	0 %	0 %	50 %	50 %	378448338
117	NC_016856	GC	3	6	66229	66234	0 %	0 %	50 %	50 %	378448339
118	NC_016856	GC	3	6	66733	66738	0 %	0 %	50 %	50 %	378448340
119	NC_016856	AT	3	6	68157	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	378448341
120	NC_016856	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	378448343
121	NC_016856	GC	3	6	69610	69615	0 %	0 %	50 %	50 %	378448343
122	NC_016856	AC	3	6	69662	69667	50 %	0 %	0 %	50 %	378448343
123	NC_016856	AG	3	6	69808	69813	50 %	0 %	50 %	0 %	378448344
124	NC_016856	CG	3	6	69887	69892	0 %	0 %	50 %	50 %	378448344
125	NC_016856	GC	3	6	69915	69920	0 %	0 %	50 %	50 %	378448344
126	NC_016856	CG	3	6	70544	70549	0 %	0 %	50 %	50 %	378448345
127	NC_016856	CG	3	6	70824	70829	0 %	0 %	50 %	50 %	378448345
128	NC_016856	TG	3	6	71465	71470	0 %	50 %	50 %	0 %	378448346
129	NC_016856	GC	3	6	71976	71981	0 %	0 %	50 %	50 %	378448346
130	NC_016856	CG	3	6	72211	72216	0 %	0 %	50 %	50 %	378448346
131	NC_016856	GC	3	6	72283	72288	0 %	0 %	50 %	50 %	378448346
132	NC_016856	GC	3	6	72460	72465	0 %	0 %	50 %	50 %	378448347
133	NC_016856	CG	3	6	73321	73326	0 %	0 %	50 %	50 %	378448348
134	NC_016856	GC	3	6	73467	73472	0 %	0 %	50 %	50 %	378448348
135	NC_016856	TC	3	6	73854	73859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016856	GC	3	6	73963	73968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016856	AT	3	6	74898	74903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016856	AT	3	6	75465	75470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016856	CT	3	6	76172	76177	0 %	50 %	0 %	50 %	378448351
140	NC_016856	GC	3	6	77340	77345	0 %	0 %	50 %	50 %	378448352
141	NC_016856	CG	3	6	77476	77481	0 %	0 %	50 %	50 %	378448352
142	NC_016856	CG	3	6	77952	77957	0 %	0 %	50 %	50 %	378448352
143	NC_016856	GC	5	10	78998	79007	0 %	0 %	50 %	50 %	378448352
144	NC_016856	CG	3	6	79058	79063	0 %	0 %	50 %	50 %	378448352
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